检索结果-内蒙古大学图书馆

4种重定位药物对Aβ_(25-35)诱导的SH-SY5Y细胞损伤的保护作用研究

科学技术创新 2018年第10期 14-15页

作者：冯文军解鸿波李文春李殿明解黎雯哈药集团中药二厂黑龙江哈尔滨150078 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室黑龙江哈尔滨150086

阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)属于神经退行性疾病,其发病机制十分复杂。系统生物学研究发现,不同的神经退行性疾病往往共享相同的信号通路,说明神经退行性疾病的发病机制存在一定的关联性。本研究针对AD,利用反向药物筛选... 详细信息

阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)属于神经退行性疾病,其发病机制十分复杂。系统生物学研究发现,不同的神经退行性疾病往往共享相同的信号通路,说明神经退行性疾病的发病机制存在一定的关联性。本研究针对AD,利用反向药物筛选的方法进行药物重定位,从上市药物中预测了4种可以用于治疗AD的药物。并利用Aβ_(25-35)诱导的SH-SY5Y细胞模型对预测的重定位药物进行实验验证。

关键词：阿尔茨海默病分子对接药物重定位

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采用生物信息学方法筛选与肺腺癌患者预后相关的LncRNAs

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国际检验医学杂志 2019年第13期40卷 1541-1544页

作者：陶冶李云慧黄俊杰梁彬中国医科大学生命科学学院生物信息学教研室辽宁沈阳110122 北部战区总医院和平院区检验科辽宁沈阳110003

目的采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系。方法从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信息,采用R语言程序包筛选差异表达的lncRNAs。应用Kaplan-Meier... 详细信息

目的采用生物信息学的方法探讨差异表达长链非编码RNA(lncRNAs)与肺腺癌患者预后的关系。方法从国际肿瘤数据库(TCGA)下载肺腺癌组织及癌旁组织的RNA测序数据和患者的临床信息,采用R语言程序包筛选差异表达的lncRNAs。应用Kaplan-Meier生存曲线(Log-Rank检验)及Cox回归模型进行预后分析。结果筛选出差异表达lncRNAs共计168个,其中上调的lncRNAs有128个,下调的lncRNAs有40个。单因素和多因素回归分析结果显示:RP11-490M8.1(P=0.047)、RP11-132A1.4(P=0.049)、DRAIC(P=0.023)、LINC00942(P=0.033)、TMPO-AS1(P=0.006)、Z83851.4(P=0.032)和LINC01133(P=0.035)是肺腺癌患者的独立预后因素。结论该研究筛选出7个lncRNAs,可作为肺腺癌患者预后的独立标志物,为临床医生对肺腺癌患者的预后判断提供帮助。

关键词：肺腺癌长链非编码RNA 生物信息学国际肿瘤数据库

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人3型腺病毒六邻体基底区重组蛋白的克隆表达和纯化

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哈尔滨医科大学学报 2017年第3期51卷 191-194页

作者：崔奇董妥王迎晨李宇齐彬彬 Vladimir I.Zlobin Yuri P.Dzhioev Oleg N.Reva 曲章义哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生微生物学教研室黑龙江哈尔滨150081 俄罗斯伊尔库茨克国立医科大学生物医学技术研究所俄罗斯伊尔库茨克664003 比勒陀利亚大学生物信息学与计算生物学部生物化学系南非比勒陀利亚市0002

目的克隆、表达人腺病毒六邻体蛋白基底区片段,为后续研究六邻体蛋白的抗原性及蛋白结构,进而研发腺病毒的基因工程疫苗及诊断试剂奠定基础。方法以3型人腺病毒核酸为模板,用PCR法扩增六邻体基底区片段,将该片段定向克隆至p QE32质粒,... 详细信息

目的克隆、表达人腺病毒六邻体蛋白基底区片段,为后续研究六邻体蛋白的抗原性及蛋白结构,进而研发腺病毒的基因工程疫苗及诊断试剂奠定基础。方法以3型人腺病毒核酸为模板,用PCR法扩增六邻体基底区片段,将该片段定向克隆至p QE32质粒,在大肠杆菌表达系统中表达带有组氨酸标签的重组蛋白片段,利用镍亲和层析法对重组蛋白进行纯化。结果构建出重组表达质粒,通过测序验证了克隆结果的正确性;在大肠杆菌表达体系中获得了高效表达。结论成功表达并获得了纯化的人3型腺病毒六邻体基底区重组蛋白片段。

关键词：腺病毒六邻体蛋白表达蛋白纯化

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纤维化性间质性肺疾病预后因素的前瞻性队列研究

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中华老年多器官疾病杂志 2021年第6期20卷 414-418页

作者：赵铁梅刘凯迪段智梅华琳张明月圣朝军吴洁解放军总医院第一医学中心呼吸与危重症医学科北京100853 首都医科大学生物医学工程学院生物医学信息学系数学与生物信息学教研室北京100069

目的探讨纤维化性间质性肺疾病的临床特点和发展为进行性纤维化型及死亡的风险因素。方法选择2019年5月至12月解放军总医院呼吸科收治的58例纤维化性间质性肺疾病患者为研究对象。收集临床资料,行肺CT、肺功能等检查,同时行6 min步行试... 详细信息

目的探讨纤维化性间质性肺疾病的临床特点和发展为进行性纤维化型及死亡的风险因素。方法选择2019年5月至12月解放军总医院呼吸科收治的58例纤维化性间质性肺疾病患者为研究对象。收集临床资料,行肺CT、肺功能等检查,同时行6 min步行试验,应用加利福尼亚大学圣地亚哥分校呼吸困难问卷(SOBQ)进行呼吸困难评分,并随访至1年进行病情评估。应用SPSS 19.0软件和R 3.6.1软件进行统计分析。根据数据类型,分别采用t检验或χ2检验进行组间比较。采用竞争风险模型的生存分析和Fine-Gray回归模型提取发展为进行性纤维化型和死亡风险的影响因素。结果58例患者中,35例(60.34%)诊断为特发性肺纤维化(IPF),14例(24.14%)诊断为结缔组织病相关间质性肺病,9例(15.52%)归为其他原因所致的肺纤维化;12例(20.69%)患者发展为进行性纤维化型,8例(13.79%)患者死亡(6例死于纤维化急性加重)。单因素分析结果显示,发展为进行性纤维化型的风险因素是诊断为IPF、高分辨CT(HRCT)网格影评分和蜂窝影评分高,死亡的风险因素是6 min步行距离短(<300 m的患者死亡率明显增高)、SOBQ评分高。多因素分析结果显示,HRCT网格影评分高是发展为进行性纤维化型的风险因素(RC=0.687,HR=1.99,95%CI 1.03~3.85,P=0.042),未发现死亡的风险因素。结论诊断为IPF、HRCT网格影和蜂窝影评分高的患者发展为进行性纤维化型的风险更高;6 min步行距离<300 m、SOBQ评分高的患者死亡风险更高。

关键词：肺疾病,间质性预后危险性评估

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人腺病毒分子生物学常用检测技术

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微生物前沿 2017年第2期6卷 11-16页

作者：李烨董妥 Vladimir I.Zlobin OlegReva 曲章义哈尔滨医科大学公共卫生学院卫生微生物学教研室黑龙江哈尔滨中俄医学研究中心环境相关疾病研究所自然疫源性疾病研究室黑龙江哈尔滨俄罗斯伊尔库茨克国立医科大学生物医学技术研究所伊尔库茨克俄罗斯南非比勒陀利亚大学生物信息学与计算生物学部生物化学系比勒陀利亚南非

腺病毒是引起人类呼吸道疾病的主要病毒之一,了解目前最有效、快捷的腺病毒检测方法有助于加强腺病毒感染的监测,及时发现疫情并掌握病毒流行趋势,为迅速采取有效措施提供保障。本文对目前实验室、临床常用的人腺病毒分子生物学检测方... 详细信息

腺病毒是引起人类呼吸道疾病的主要病毒之一,了解目前最有效、快捷的腺病毒检测方法有助于加强腺病毒感染的监测,及时发现疫情并掌握病毒流行趋势,为迅速采取有效措施提供保障。本文对目前实验室、临床常用的人腺病毒分子生物学检测方法的原理、特点和应用等进行了综述。

关键词：腺病毒 PCR技术分子生物学检测

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互操作性本体:智能精准医学的基础

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中国医学伦理学 2021年第3期34卷 265-279页

作者：何勇群谢江安万灵杨啸林朱彦周伟李元放陆伟胜吴健民刘开永王海河刘清平余红 University of Michigan Medical School Ann ArborMI 48109 重庆邮电大学生物信息学院重庆400065 南京昂吉网智网络技术有限公司江苏南京211199 中国医学科学院基础医学研究所北京100005 中国中医科学院中医药信息研究所北京100700 国家人口健康科学数据中心北京100700 Faculty of Information Technology Monash UniversityClaytonVic 3800 北京大学肿瘤医院癌症生物信息学中心北京100142 安徽医科大学公共卫生学院安徽合肥230032 哈尔滨医科大学大庆分校黑龙江大庆163319 广州中医药大学广东广州510006 贵州大学医学院/贵州省人民医院/国家卫生健康委员会肺脏免疫性疾病诊治重点实验室贵州贵阳550002

近年来,互联网与物联网等技术的快速发展为探寻精准医学与人工智能之间的关联应用提供了战略机遇。然而,如何组织、集成和共享复杂异构的生物医学数据业已成为阻碍该领域发展的严重技术挑战。本体因其能够提供知识与元数据层面的语义基... 详细信息

近年来,互联网与物联网等技术的快速发展为探寻精准医学与人工智能之间的关联应用提供了战略机遇。然而,如何组织、集成和共享复杂异构的生物医学数据业已成为阻碍该领域发展的严重技术挑战。本体因其能够提供知识与元数据层面的语义基础而推动了生物医学人工智能的发展,而基于互操作性的本体对异构知识与数据的整合和分析发挥着关键性的作用。将人工智能与精准医疗的有机集合称之为智能精准医疗,并提出一个“河马假设”,用以阐明互操作性本体与智能精准医疗之间的正相关关系及如何发挥协同增效作用;同时,提出和展示了使用可扩展本体开发的原理和工具来实现本体的互操作性,进而支持智能精准医疗的应用与发展。此外,还对国内外互操作性本体的研究现状、本体中国的成立与发展以及医学伦理在智能精准医疗中的重要性等进行了综述和深入探讨。

关键词：本体互操作性本体生物医学大数据精准医学人工智能本体中国

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从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

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2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛

作者：张德礼李衍达黄高升方福德季梁朱关福北京大学医学部公共卫生学院营养与食品卫生学系，北京大学人类疾病基因研究中心，北京，100083 清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室，北京，100084 第四军医大学基础部病理学教研室，西京医院病理科，中国癌症研究基金会肿瘤研究所，西安，710032 中国医学科学院基础医学研究所，中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室，北京，710032

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物... 详细信息

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环的选育规律，提出了相关选育机制与方法，初步建立了这种选育作用的理论与技术体系并得到实际应用，它正是联系高效水貂细小病毒疫苗研制、痘苗病毒重组质粒转染技术创新、细胞系致癌毒理学安全性评价、异类肿瘤在体实验转化现象确立与横纹肌样瘤起源之谜初步揭示的纽带与桥梁，具有广泛的科学指导和实用意义。实际应用：(1)安全高效的水貂肠炎病毒细胞培养灭活疫苗的首次研制成功和长期广泛应用;(2)在对痘苗病毒重组质粒转染技术的探索性研究中首次简化了基因转染技术;(3)恶性横纹肌样瘤(MRT)在模型动物体内的首次发现和成功复制，为阐明其起源之谜提供了机会。从染色体遗传变异角度初步阐明了MRT的发生、发展规律，从比较医学角度揭示了MRT的组织细胞起源;(4)解了传代细胞(CCL)致癌毒理实验的难题，揭示了遗传变异率与致癌(瘤)的关系。在基因识别新方法与功能基因分离方面取得重要进展。建立了从计算机软件分析、人工干预分析及与实验生物学相结合角度来发现人类新基因的方法，并证明它是加速基因克隆和鉴定的一条有效途径。电子克隆百余人类新基因(还用合作开发的软件计算机识别800个人类新基因候选对象)，部分基因编码序列已被实验证实和引用，其中几个新克隆基因已在动物实验中显示出明显的生物学功能活性。发现了美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的人类基因模式参考序列(REFSEQ)存在各种类型的多种/处错误，这一结果提示应慎重使用NCBI的REFSEQ数据库。

关键词：病毒细胞生物循环基因识别遗传进化

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人肺癌不同转移表型细胞系的转移相关基因的研究

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哈尔滨医科大学学报 2002年第2期36卷 163-163页

作者：李殿俊李波阎承慧吴晓秋郭正李霞张瑞杰付松滨哈尔滨医科大学免疫学教研室黑龙江哈尔滨150086 哈尔滨医科大学生物教研室黑龙江哈尔滨150086 哈尔滨医科大学生物信息教研室黑龙江哈尔滨150086

肺癌是我国高发肿瘤之一，而肺癌转移又是肺癌死亡的主要原因，因此研究肺癌的转移机制，寻找理想的肿瘤标志物，将为肺癌的预防和治疗的改善提供可靠依据。

关键词：转移表型细胞系转移相关基因肺癌基因芯片

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优劣环境交替性生物循环选育的理论与技术体系和应用

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科技导报 2003年第11期21卷 11-17,10页

作者：张德礼李衍达黄高升朱关福方福德清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室北京100084 第四军医大学基础部病理学教研室中国癌症研究基金会肿瘤学研究所西安710032 中国医学科学院基础医学研究所/中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室北京710032

不同环境条件下的交替选育作用[1-6]虽已有成功的应用,但在恶劣环境下筛选后再回归到同类优越环境下培育,并反复循环选育的优良生物品种,特别是选育强毒高免疫原性的超高增殖病毒株,经体内外环境交替培育获得高变异率肿瘤细胞系并实现... 详细信息

不同环境条件下的交替选育作用[1-6]虽已有成功的应用,但在恶劣环境下筛选后再回归到同类优越环境下培育,并反复循环选育的优良生物品种,特别是选育强毒高免疫原性的超高增殖病毒株,经体内外环境交替培育获得高变异率肿瘤细胞系并实现异类肿瘤在体实验转化的现象,尚未见报道.

关键词：病毒疫苗交替选育恶性横纹肌样瘤制备水貂细小病毒致癌安全性

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计算机辅助药物设计教学实验课的探讨

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神州（中旬刊） 2016年第7期 63-63页

作者：解鸿波张德楠刘磊庞林陈秀杰哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能... 详细信息

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能力的培养同样起到了至关重要的作用,本文探讨了计算机辅助药物设计实验课中的知识结构并在实践使教学效果得到提升.

关键词：计算机辅助药物设计实验课教学方法

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