检索结果-内蒙古大学图书馆

国际遗传学杂志 2014年第5期37卷 230-235页

作者：李晋陈曦林效宗杨欢张瑞杰王丽美哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院统计遗传学教研室哈尔滨医科大学附属第二医院急诊创伤外科哈尔滨医科大学基础医学院计算机教研室

目的蛋白质相互作用研究对于理解DNA功能、基因组元件作用机制有重要意义。已有大量工作在从蛋白质-蛋白质互作的计算预测方向展开,其中蛋白质-蛋白质互作的特征起着很重要的作用。互作特征的评价及相关数据库构建仍是蛋白质互作预测的... 详细信息

目的蛋白质相互作用研究对于理解DNA功能、基因组元件作用机制有重要意义。已有大量工作在从蛋白质-蛋白质互作的计算预测方向展开,其中蛋白质-蛋白质互作的特征起着很重要的作用。互作特征的评价及相关数据库构建仍是蛋白质互作预测的一项重要工作。方法该文从基因、蛋白质序列、功能信息层面提取出人类蛋白质-蛋白质对的27个特征,并应用于多种分类器,利用ROC曲线对特征的性能给出了科学的评价。结果通过研究发现逻辑回归和贝叶斯网络分类效果最好,生物过程、细胞组分、分子功能、基因表达值、组织、域间互作的可用性明显高于其他特征,同时构建了人类蛋白质互作特征数据库,供广大科研工作者使用。结论从多角度评价了特征可用性,得到了表现较优的特征,但是对于其中一些特征,还需要进一步提高覆盖率,从而达到更好的效果。

关键词：蛋白质-蛋白质互作机器学习特征评价数据库

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VEGF-A和C在人结肠癌淋巴管生成和淋巴道转移中的作用

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解剖科学进展 2014年第5期20卷 425-428页

作者：陈一凡宿菲陈明伟马晶张雅芳刘宝全哈尔滨医科大学解剖学教研室哈尔滨150081 哈尔滨市第五医院哈尔滨150040 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150081

目的分析血管内皮生长因子(VEGF)-A和VEGF-C在人结肠癌组织的表达及与结肠癌淋巴管生成和淋巴道转移的关系。方法取人结肠癌组织91例,应用免疫组化方法检测VEGF-A和VEGF-C在结肠癌组织中的表达。应用D2-40标记结肠癌组织的淋巴管,观察... 详细信息

目的分析血管内皮生长因子(VEGF)-A和VEGF-C在人结肠癌组织的表达及与结肠癌淋巴管生成和淋巴道转移的关系。方法取人结肠癌组织91例,应用免疫组化方法检测VEGF-A和VEGF-C在结肠癌组织中的表达。应用D2-40标记结肠癌组织的淋巴管,观察结肠癌组织的淋巴管生成情况。结果结肠癌组织中VEGF-A和VEGF-C的表达水平明显高于正常组织,VEGF-A和VEGF-C表达阳性的结肠癌组织的淋巴管密度(LVD)明显高于阴性组织,VEGF-A和VEGF-C的表达及LVD均与淋巴结转移及Duke's分期相关。结论结肠癌组织VEGF-A和VEGF-C过表达与结肠癌的淋巴管生成和淋巴道转移相关。

关键词：血管内皮生长因子人结肠癌淋巴管转移

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血管内皮生长因子D在小鼠碱烧伤后角膜的表达及其作用

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解剖科学进展 2013年第6期19卷 542-544页

作者：刘宝全王建堃付志军马晶张雅芳宿菲肖建兵哈尔滨医科大学人体解剖学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081

目的观察血管内皮生长因子D(VEGF-D)在小鼠角膜碱烧伤后不同时间角膜组织内的表达,探讨VEGF-D在小鼠角膜碱烧伤后新生淋巴管形成过程中的作用。方法制作小鼠角膜碱烧伤模型,分别于碱烧伤后1d、3d、5d、7d、12d和18d取材。应用免疫组化S... 详细信息

目的观察血管内皮生长因子D(VEGF-D)在小鼠角膜碱烧伤后不同时间角膜组织内的表达,探讨VEGF-D在小鼠角膜碱烧伤后新生淋巴管形成过程中的作用。方法制作小鼠角膜碱烧伤模型,分别于碱烧伤后1d、3d、5d、7d、12d和18d取材。应用免疫组化SP法观察VEGF-D在正常角膜和碱烧伤后不同时间角膜内的表达,应用淋巴管内皮透明质酸受体1(LYVE-1)标记淋巴管,观察小鼠碱烧伤角膜内新生淋巴管的形成情况。结果碱烧伤后1d、3d、5d,角膜内VEGF-D表达水平明显高于正常角膜(P<0.01),于碱烧伤后3d,表达达到高峰。碱烧伤后7d,VEGF-D的表达下降至正常水平。在碱烧伤角膜内,可见阳性表达LYVE-1的新生淋巴管。结论 VEGF-D过表达可能参与小鼠角膜碱烧伤后新生淋巴管形成过程。

关键词：血管内皮生长因子D 角膜碱烧伤淋巴管新生小鼠

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4种重定位药物对Aβ_(25-35)诱导的SH-SY5Y细胞损伤的保护作用研究

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科学技术创新 2018年第10期 14-15页

作者：冯文军解鸿波李文春李殿明解黎雯哈药集团中药二厂黑龙江哈尔滨150078 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室黑龙江哈尔滨150086

阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)属于神经退行性疾病,其发病机制十分复杂。系统生物学研究发现,不同的神经退行性疾病往往共享相同的信号通路,说明神经退行性疾病的发病机制存在一定的关联性。本研究针对AD,利用反向药物筛选... 详细信息

阿尔茨海默病(Alzheimer's Disease,AD)属于神经退行性疾病,其发病机制十分复杂。系统生物学研究发现,不同的神经退行性疾病往往共享相同的信号通路,说明神经退行性疾病的发病机制存在一定的关联性。本研究针对AD,利用反向药物筛选的方法进行药物重定位,从上市药物中预测了4种可以用于治疗AD的药物。并利用Aβ_(25-35)诱导的SH-SY5Y细胞模型对预测的重定位药物进行实验验证。

关键词：阿尔茨海默病分子对接药物重定位

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血清miR-34a表达水平预测乳腺癌新辅助化疗疗效

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解剖科学进展 2017年第5期23卷 467-470,474页

作者：何春波宿菲齐秀英游凯刘利华张雅芳张建国刘宝全哈尔滨医科大学附属第四医院放化疗科黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学解剖学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院乳腺外科黑龙江哈尔滨150081 西藏藏医学院现代医药学教研室西藏拉萨850000

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与... 详细信息

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与化疗响应的关系被分析。结果血清miR-34a的表达水平在乳腺癌患者化疗开始前显著高于健康志愿者。在治疗有效组和无效组,血清miR-34a的表达水平在化疗开始前,两周期结束时和化疗结束时均无显著差异。而血清miR-34a表达水平的变化是与治疗反应显著相关的。在治疗有效组,患者的血清miR-34a水平在化疗第二周期后和化疗结束时均低于化疗开始前(P=0.023和P=0.036),而无效组无显著变化。ROC曲线显示血清miR-34a表达水平的变化能准确地预测新辅助化疗的疗效。结论血清miR-34a是一个新的、非侵入性的生物标记物,能够准确地预测乳腺癌新辅助化疗的疗效。

关键词：乳腺癌新辅助化疗血清miR-34a

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从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

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2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛

作者：张德礼李衍达黄高升方福德季梁朱关福北京大学医学部公共卫生学院营养与食品卫生学系，北京大学人类疾病基因研究中心，北京，100083 清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室，北京，100084 第四军医大学基础部病理学教研室，西京医院病理科，中国癌症研究基金会肿瘤研究所，西安，710032 中国医学科学院基础医学研究所，中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室，北京，710032

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物... 详细信息

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环的选育规律，提出了相关选育机制与方法，初步建立了这种选育作用的理论与技术体系并得到实际应用，它正是联系高效水貂细小病毒疫苗研制、痘苗病毒重组质粒转染技术创新、细胞系致癌毒理学安全性评价、异类肿瘤在体实验转化现象确立与横纹肌样瘤起源之谜初步揭示的纽带与桥梁，具有广泛的科学指导和实用意义。实际应用：(1)安全高效的水貂肠炎病毒细胞培养灭活疫苗的首次研制成功和长期广泛应用;(2)在对痘苗病毒重组质粒转染技术的探索性研究中首次简化了基因转染技术;(3)恶性横纹肌样瘤(MRT)在模型动物体内的首次发现和成功复制，为阐明其起源之谜提供了机会。从染色体遗传变异角度初步阐明了MRT的发生、发展规律，从比较医学角度揭示了MRT的组织细胞起源;(4)解了传代细胞(CCL)致癌毒理实验的难题，揭示了遗传变异率与致癌(瘤)的关系。在基因识别新方法与功能基因分离方面取得重要进展。建立了从计算机软件分析、人工干预分析及与实验生物学相结合角度来发现人类新基因的方法，并证明它是加速基因克隆和鉴定的一条有效途径。电子克隆百余人类新基因(还用合作开发的软件计算机识别800个人类新基因候选对象)，部分基因编码序列已被实验证实和引用，其中几个新克隆基因已在动物实验中显示出明显的生物学功能活性。发现了美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的人类基因模式参考序列(REFSEQ)存在各种类型的多种/处错误，这一结果提示应慎重使用NCBI的REFSEQ数据库。

关键词：病毒细胞生物循环基因识别遗传进化

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计算机辅助药物设计教学实验课的探讨

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神州（中旬刊） 2016年第7期 63-63页

作者：解鸿波张德楠刘磊庞林陈秀杰哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能... 详细信息

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能力的培养同样起到了至关重要的作用,本文探讨了计算机辅助药物设计实验课中的知识结构并在实践使教学效果得到提升.

关键词：计算机辅助药物设计实验课教学方法

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刍议化学信息软件在药物设计学教学中的应用

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知音励志 2016年第10期 132-132页

作者：解鸿波张德楠刘磊庞林陈秀杰哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室

药物设计学是药学领域中的一门综合性学科,从药学的基本理论入手开发新型药物。药物化学结构的介绍是药物设计学课程中必不可少的内容,本文介绍了几种主要的化学信息软件,并探讨了这些软件在药物设计学教学中的实际应用。

关键词：化学信息学药物设计化学结构

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