检索结果-内蒙古大学图书馆

2017年中国肿瘤标志物学术大会暨第十一届肿瘤标志物青年科学家论坛

作者：戚丽霜李天浩石根根李昕王佳圣李颖郭政哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院福建医科大学基础医学院生物信息学系与消化道恶性肿瘤教育部重点实验室

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后... 详细信息

目的:针对基因表达检测值变异高、存在批次效应并难以标准化等问题,本研究利用肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)样本内基因表达相对大小关系(秩次关系),识别个体化多级预后预测标志,可先预测I-II期LUAD患者是否存在微转移风险(即术后复发风险),再预测存在微转移风险的患者是否对铂类耐药。方法:利用单纯接受手术切除治疗的I-II期LUAD样本,识别一组基因对,根据其在样本内基因表达的大小关系可预测术后复发风险与生存预后(1级标志)。然后,在术后接受铂类辅助化疗的I-II期LUAD样本中,先利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本;再利用这些可能存在微转移的样本,识别一组铂类耐药预测基因对标志(2级标志)。结果:识别出一组包含9对基因的预测术后复发及死亡风险的1级预后标志(9-GPS)(图1A),其预后能力在两套芯片平台检测的样本及一套RNA-sequencing平台检测的样本中得到了验证(图1B)。然后,在接受了术后铂类联合辅助化疗的LUAD数据中,利用1级预后标志识别术后复发高风险患者的样本,并利用这些可能存在微转移的样本识别出一组包含三个基因对的铂类耐药预测标志(3-GPS,分类规则同9-GPS)。在一套独立的整合验证数据集中,该标志能够有效预测接受铂类化疗治疗患者是否能够受益于铂类化疗(图1C)。最后,将9-GPS及3-GPS耦联应用于TCGA多维组学数据中,发现九个拷贝数区域的扩增或缺失频率均在对铂类敏感组中显著高(Fisher检验,FDR<0.05),提示敏感患者的基因组更倾向不稳定。结论:该基于基因表达秩次关系的双联标志不受实验批次影响,能够个体化预测I-II期LUAD患者术后复发风险(微转移)及对铂类辅助化疗的敏感性。图1.肺腺癌复发风险及铂类药效预测标志。A. 9-GPS的风险分类规则。当一个样本(黄色示例)内9对基因中,超过5个基因对的秩次关系投票其为高风险,则该样本(n=7)被预测为高风险,反之为低风险。B. 9-GPS在两套芯片平台及一套RNA-sequencing平台检测数据中预测复发风险及整体生存时间的能力。C. 3-GPS在一套验证整合数据集中预测样本能否受益于铂类化疗的能力。

关键词：铂类耐药复发风险术后复发微转移肺腺癌

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PD-L1介导的胰腺癌ceRNA网络机制解析及标志物识别

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国际免疫学杂志 2019年第6期42卷 562-565页

作者：王红黄惠英郑立宇李孔宁海南医学院热带转化医学教育部重点实验室海口571199 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院 150081

目的对胰腺癌中程序性死亡因子配体1(programmed death factor ligand 1,PD-L1)基因介导的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)ceRNA互作网络的机制解析及其预后标志物进行识别.方法构建PD-L1基因相关的ceRNA网络,对网络中的... 详细信息

目的对胰腺癌中程序性死亡因子配体1(programmed death factor ligand 1,PD-L1)基因介导的内源竞争RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)ceRNA互作网络的机制解析及其预后标志物进行识别.方法构建PD-L1基因相关的ceRNA网络,对网络中的基因表达谱和甲基化谱进行聚类分析,识别与生存相关的基因.结果从PD-L1介导的ceRNA网络中识别了12个与生存潜在相关的mRNA以及挖掘出基因甲基化显著影响患者生存的多个mRNAs.结论通过生物信息学分析,在PD-L1介导的ceRNA网络中识别出多个潜在的胰腺癌生物标志物,从而为胰腺癌的临床治疗提供新的预后靶标.

关键词：胰腺癌程序性死亡因子配体内源竞争RNA 生存分析

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医学院校教师开展课程思政教学的现状及影响因素分析

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中华医学教育杂志 2023年第3期43卷 169-172页

作者：孙福川张瑞杰赵霁阳赵春辉王燕萍张淑娥曹德品哈尔滨医科大学教学督导委员会哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150086 哈尔滨医科大学高教研究与教学质量评估中心哈尔滨150081 哈尔滨医科大学学生工作部哈尔滨150081 哈尔滨医科大学卫生管理学院医学教育管理教研室哈尔滨150081

目的评估医学院校教师课程思政教学的现状并识别其影响因素。方法采用问卷调查法,对黑龙江省某医学院校的311名任课教师进行网络问卷调研。运用单因素和多因素logistic回归分析法识别其开展课程思政教学的影响因素。结果311名教师中,197... 详细信息

目的评估医学院校教师课程思政教学的现状并识别其影响因素。方法采用问卷调查法,对黑龙江省某医学院校的311名任课教师进行网络问卷调研。运用单因素和多因素logistic回归分析法识别其开展课程思政教学的影响因素。结果311名教师中,197名(63.3%)教师能够在每次教学中开展课程思政教学。回归分析结果显示,教师开展课程思政教学的时间(Waldχ^(2)=12.962,P<0.05,OR<1)和教研室重视程度(Waldχ^(2)=15.471,P<0.05,OR<1)是教师开展课程思政教学的保护因素。结论医学院校教师将思政教育融入医学课程较为普遍。开展时间越早和所在教研室的重视程度越高,教师开展课程思政教学的次数越多。

关键词：教师课程思政教学医学院校影响因素

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血清miR-34a表达水平预测乳腺癌新辅助化疗疗效

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解剖科学进展 2017年第5期23卷 467-470,474页

作者：何春波宿菲齐秀英游凯刘利华张雅芳张建国刘宝全哈尔滨医科大学附属第四医院放化疗科黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学解剖学教研室黑龙江哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院乳腺外科黑龙江哈尔滨150081 西藏藏医学院现代医药学教研室西藏拉萨850000

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与... 详细信息

目的探讨血清miR-34a对乳腺癌新辅助化疗疗效的预测价值。方法本研究包括78名确诊的原发性乳腺癌患者和30名健康志愿者。每位患者在化疗开始前,第二个周期结束和新辅助化疗结束时抽取6ml静脉血。实时定量PCR检测血清miR-34a的表达,其与化疗响应的关系被分析。结果血清miR-34a的表达水平在乳腺癌患者化疗开始前显著高于健康志愿者。在治疗有效组和无效组,血清miR-34a的表达水平在化疗开始前,两周期结束时和化疗结束时均无显著差异。而血清miR-34a表达水平的变化是与治疗反应显著相关的。在治疗有效组,患者的血清miR-34a水平在化疗第二周期后和化疗结束时均低于化疗开始前(P=0.023和P=0.036),而无效组无显著变化。ROC曲线显示血清miR-34a表达水平的变化能准确地预测新辅助化疗的疗效。结论血清miR-34a是一个新的、非侵入性的生物标记物,能够准确地预测乳腺癌新辅助化疗的疗效。

关键词：乳腺癌新辅助化疗血清miR-34a

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二甲双胍在肿瘤细胞代谢中的研究进展

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肿瘤 2021年第1期41卷 65-76页

作者：梁火燕李弘毅朱彦辉翟瑞卿薛文华闫岩丁显飞赵杰李砺锋郑州大学第一附属医院综合ICU 河南省重症医学重点实验室郑州市脓毒症重点实验室河南郑州450052 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院黑龙江哈尔滨150081 郑州大学第一附属医院肿瘤中心河南郑州450052 郑州大学第一附属医院药学部互联网医疗系统与应用国家工程实验室河南郑州450052

二甲双胍是2型糖尿病的一线降糖药物,其机制主要通过抑制肝脏葡萄糖的输出,并提高机体外周组织对胰岛素的敏感程度,从而增加葡萄糖的摄取和利用。不仅如此,现在有研究认为二甲双胍还可能通过激活酶的信号系统而发挥多方面的代谢调节作... 详细信息

二甲双胍是2型糖尿病的一线降糖药物,其机制主要通过抑制肝脏葡萄糖的输出,并提高机体外周组织对胰岛素的敏感程度,从而增加葡萄糖的摄取和利用。不仅如此,现在有研究认为二甲双胍还可能通过激活酶的信号系统而发挥多方面的代谢调节作用。近年来二甲双胍表现出了除降糖以外的多种作用,如抗炎、抗肿瘤、延长寿命、预防脱发以及改善肠道菌群失调等。其中,对于二甲双胍在治疗肿瘤方面的研究越来越多,然而,当前关于二甲双胍在肿瘤细胞代谢方面如何发挥抗肿瘤作用的研究相对较少,本研究将主要从5个方面就二甲双胍在肿瘤细胞代谢中的可能作用和机制进行阐述,包括二甲双胍对肿瘤细胞葡萄糖代谢的作用及机制探讨,二甲双胍对肿瘤细胞脂质代谢的调节作用,二甲双胍对肿瘤细胞胰岛素代谢的调节作用,二甲双胍对肿瘤细胞线粒体的氧化磷酸化的作用及机制探讨,以及二甲双胍对肿瘤细胞免疫功能的调节作用。以期为今后的研究提供理论基础和新思路。

关键词：肿瘤二甲双胍代谢研究进展

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系列RNA-seq数据的表达模式聚类方法研究

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医学分子生物学杂志 2013年第1期10卷 41-46页

作者：赵辉曹峰林宁尚伟王乐天宿滨李霞哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨市150081 哈尔滨医科大学附属第一临床医学院卫生部细胞移植重点实验室黑龙江省血液肿瘤研究所血液肿瘤中心哈尔滨市150001

目的转录组测序技术为研究特定组织细胞生理状态和分子水平变化提供有力方法。为了建立分子水平变化和组织细胞生理功能之间的关系并排除随机因素的干扰，需要建立基于系列RNA-seq数据的表达模式分析方法。方法本文提出了一种整合的方法... 详细信息

目的转录组测序技术为研究特定组织细胞生理状态和分子水平变化提供有力方法。为了建立分子水平变化和组织细胞生理功能之间的关系并排除随机因素的干扰，需要建立基于系列RNA-seq数据的表达模式分析方法。方法本文提出了一种整合的方法（geneexpressionclustermethod，GECluster）用于对系列样本模式聚类。整合曲线拟合以及信息熵建立模型并提取特征属性，最后按照上面模型提供的特征属性对基因进行层次聚类分析。结果表达趋势一致的基因被很好地聚到一个类别中，功能富集分析发现这些基因具有很强的功能相关性，并与文献报道相吻合。结论GECluster可以更灵活客观对多样本系列RNA—seq数据挖掘共表达基因，为后期功能分析提供了更有效的研究方案。

关键词：转录组测序曲线拟合信息熵聚类分析

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改善高等数学教学效果的主要途径分析

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课程教育研究（新教师教学） 2015年第24期 13-13页

作者：尚德思韩君伟宿菲哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物信息教研室黑龙江哈尔滨 150086

随着社会和经济的快速发展，科学技术水平不断提升，高等数学在科学领域中的地位也越来越重要，高等数学的教学思想与方法，在学生的专业学习领域中发挥着基础性的作用，所以要注重高等数学的教学效果。本文主要分析了当前高等数学教学... 详细信息

随着社会和经济的快速发展，科学技术水平不断提升，高等数学在科学领域中的地位也越来越重要，高等数学的教学思想与方法，在学生的专业学习领域中发挥着基础性的作用，所以要注重高等数学的教学效果。本文主要分析了当前高等数学教学中存在的不足，并且从构建良好的师生关系、重视高等数学的应用价值、充分运用多媒体技术、构建科学的教学评价体系以及融入建模思想等几个方面，提出改善高等数学教学效果的建议。

关键词：高等数学教学效果建模思想

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计算机辅助药物设计教学实验课的探讨

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神州（中旬刊） 2016年第7期 63-63页

作者：解鸿波张德楠刘磊庞林陈秀杰哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能... 详细信息

计算机辅助药物设计(computer aided drug design)是以计算机化学为基础,通过预测药物与靶点之间的关系,从而设计新型药物.该课程是药学领域近年发展起来的新兴学科,是药学专业的必修课程.在教学中,除了基础理论知识,实验课程对学生能力的培养同样起到了至关重要的作用,本文探讨了计算机辅助药物设计实验课中的知识结构并在实践使教学效果得到提升.

关键词：计算机辅助药物设计实验课教学方法

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刍议化学信息软件在药物设计学教学中的应用

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知音励志 2016年第10期 132-132页

作者：解鸿波张德楠刘磊庞林陈秀杰哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院药物基因组学教研室

药物设计学是药学领域中的一门综合性学科,从药学的基本理论入手开发新型药物。药物化学结构的介绍是药物设计学课程中必不可少的内容,本文介绍了几种主要的化学信息软件,并探讨了这些软件在药物设计学教学中的实际应用。

关键词：化学信息学药物设计化学结构

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从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

从病毒细胞遗传进化的生物循环选育到新基因识别与验证

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2003年中国科协“生物信息学与进化计算”青年科学家论坛

作者：张德礼李衍达黄高升方福德季梁朱关福北京大学医学部公共卫生学院营养与食品卫生学系，北京大学人类疾病基因研究中心，北京，100083 清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清清华大学信息科学与技术国家实验室生物信息学研究部，清华大学生物信息学研究所生物信息学教育部重点实验室，清华大学信息科学技术学院自动化系智能技术与系统国家重点实验室，北京，100084 第四军医大学基础部病理学教研室，西京医院病理科，中国癌症研究基金会肿瘤研究所，西安，710032 中国医学科学院基础医学研究所，中国协和医科大学基础医学院医学分子生物学国家重点实验室，北京，710032

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物... 详细信息

初步建立了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环选育作用的理论与技术体系并得到实际应用。发现细小病毒超高增殖的交替选育规律又在不同实验体系基因与染色体水平分别得到验证，从而发现了病毒细胞遗传进化的优劣环境交替性生物循环的选育规律，提出了相关选育机制与方法，初步建立了这种选育作用的理论与技术体系并得到实际应用，它正是联系高效水貂细小病毒疫苗研制、痘苗病毒重组质粒转染技术创新、细胞系致癌毒理学安全性评价、异类肿瘤在体实验转化现象确立与横纹肌样瘤起源之谜初步揭示的纽带与桥梁，具有广泛的科学指导和实用意义。实际应用：(1)安全高效的水貂肠炎病毒细胞培养灭活疫苗的首次研制成功和长期广泛应用;(2)在对痘苗病毒重组质粒转染技术的探索性研究中首次简化了基因转染技术;(3)恶性横纹肌样瘤(MRT)在模型动物体内的首次发现和成功复制，为阐明其起源之谜提供了机会。从染色体遗传变异角度初步阐明了MRT的发生、发展规律，从比较医学角度揭示了MRT的组织细胞起源;(4)解了传代细胞(CCL)致癌毒理实验的难题，揭示了遗传变异率与致癌(瘤)的关系。在基因识别新方法与功能基因分离方面取得重要进展。建立了从计算机软件分析、人工干预分析及与实验生物学相结合角度来发现人类新基因的方法，并证明它是加速基因克隆和鉴定的一条有效途径。电子克隆百余人类新基因(还用合作开发的软件计算机识别800个人类新基因候选对象)，部分基因编码序列已被实验证实和引用，其中几个新克隆基因已在动物实验中显示出明显的生物学功能活性。发现了美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释项目公布的人类基因模式参考序列(REFSEQ)存在各种类型的多种/处错误，这一结果提示应慎重使用NCBI的REFSEQ数据库。

关键词：病毒细胞生物循环基因识别遗传进化

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