检索结果-内蒙古大学图书馆

科教导刊（电子版） 2024年第1期 74-76页

作者：梁妃学冀旭颖南方医科大学生物医学工程学院数学物理系教研室广东广州 510515 南方医科大学基础医学院生理学教研室广东广州 510515

膜片钳电生理技术作为一种高级的实验技术,在医学研究生的培养中具有重要的作用,该技术的掌握不仅有利于开展高水平的科学研究,也使学生在学术和就业市场具有一定竞争优势.文章从研究生导师的角度出发,强调了膜片钳电生理技术在研究生... 详细信息

膜片钳电生理技术作为一种高级的实验技术,在医学研究生的培养中具有重要的作用,该技术的掌握不仅有利于开展高水平的科学研究,也使学生在学术和就业市场具有一定竞争优势.文章从研究生导师的角度出发,强调了膜片钳电生理技术在研究生培养中的重要性和实际应用前景,以及进一步改进和创新的必要性.探讨了传统膜片钳电生理技术教学存在的弊端,以及教学改革中采取的具体措施,包括实践操作和数据分析能力的培养等.文章为强化基础医学院研究生的科研能力提供实践经验,为推动教学改革和提高学生学习效果提供了有益的思考.

关键词：膜片钳电生理技术教学改革实验教学研究生科研能力

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大鼠小脑浦肯野神经元发育过程中Na_(v)亚基表达与电生理特性的发育成熟具有相关性

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南方医科大学学报 2023年第7期43卷 1102-1109页

作者：傅鸣宇纪晓宏钟磊吴琼李海福王宁黔南方医科大学基础医学院生理教研室广东广州510515 南方医科大学南方医院医疗质量管理科广东广州510515 解放军第74集团军医院疾控科广东广州510300 广东江门中医药职业学院基础医学院广东江门529000 南方医科大学生物医学工程学院数学物理系广东广州510515

目的通过免疫组化和电生理记录来探讨大鼠小脑浦肯野神经元发育过程中电压门控钠通道亚基的表达差异特性及其与电生理特性发育成熟的相关关系。方法将大鼠根据发育阶段分为4组:出生后5~7 d(婴幼儿组)、12~14 d(幼年组)、21~24 d(青少年... 详细信息

目的通过免疫组化和电生理记录来探讨大鼠小脑浦肯野神经元发育过程中电压门控钠通道亚基的表达差异特性及其与电生理特性发育成熟的相关关系。方法将大鼠根据发育阶段分为4组:出生后5~7 d(婴幼儿组)、12~14 d(幼年组)、21~24 d(青少年组)、42~60 d(成年组)。运用免疫组化染色方法检测Na_(v)1.1、1.2、1.3、1.6在浦肯野神经元发育过程中的表达变化,并分析不同年龄段的平均光密度值量化发育过程中各亚基的差异变化特性。同时,运用离体脑片全细胞膜片钳技术记录自发性电活动研究发育过程中浦肯野神经元电生理基本特性变化。结果Na_(v)各亚基在大鼠浦肯野神经元发育过程中表达差异明显。Na_(v)1.1亚基在整个发育阶段呈高表达,且随发育时间增加而增加(P<0.05)。Na_(v)1.2在整个发育阶段无表达(P>0.05)。Na_(v)1.3随发育表达量降低(P<0.05),青少年期后无表达。Na_(v)1.6婴幼年期无表达,随发育时间增加,表达量增多(P<0.05)。神经元发育早期主要表达Na_(v)1.1和Na_(v)1.3,而随发育增加,Na_(v)1.3消失,Na_(v)1.6增加。青少年期后主要表达Na_(v)1.1和Na_(v)1.6。Na_(v)蛋白总量随发育逐渐增加(P<0.05),青少年期后趋于成熟。浦肯野神经元自发放频率和兴奋性随发育逐渐增强,到青少年期达到成熟水平。Na_(v)亚基的发育表达变化与放电频率呈正相关(r=0.9942,P<0.05),与阈值变化呈负相关(r=-0.9891,P<0.05)。结论Na_(v)亚基在浦肯野神经元表达发育变化与神经元高频电生理特性的发育成熟具有相关性,提示Na_(v)亚基的表达成熟是电生理特性不断成熟的基础。

关键词：电压门控型钠通道浦肯野神经元发育免疫组化自发电活动相关性

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大数据时代生物信息学课程体系改革研究

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中国继续医学教育 2023年第7期15卷 6-9页

作者：兰雨佳肖云哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院生物信息学教研室黑龙江哈尔滨150081

生物信息学是一门涵盖人类基因组学、精准医疗、计算机科学、数学分析以及生物统计学等多个方面的新兴交叉学科。近年来随着"精准医疗"战略计划的开启,生物信息学作为生命科学领域研究手段,迎来了井喷式发展。生物信息学具有... 详细信息

生物信息学是一门涵盖人类基因组学、精准医疗、计算机科学、数学分析以及生物统计学等多个方面的新兴交叉学科。近年来随着"精准医疗"战略计划的开启,生物信息学作为生命科学领域研究手段,迎来了井喷式发展。生物信息学具有内容更新快、实践性强等特点,但我国的生物信息学尚处于起步阶段。这也意味着生物信息学专业现有的教学模式、教学内容和教学体系等已不能满足现在的科研和社会的需求,需要进行改革以跟上时代发展。结合现在生物信息学课程体系、科研创新与实践等方面存在的弊端和不足,以及生物信息学课程教学面临的困境,文章提出对该课程教学体系的建设、改革和创新进行探讨,为促进大数据时代生物信息学课程体系的高质量、持续性发展提供参考,以期培养更符合社会需求的生物信息学优质人才。

关键词：大数据时代生物信息学课程体系改革研究人才培养

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背景噪声对清醒小鼠初级听皮层神经元听觉响应特征的影响

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南方医科大学学报 2021年第11期41卷 1672-1679页

作者：宋长宝赵岩柏林南方医科大学生物医学工程学院数学物理系广东广州510515 南方医科大学基础医学院生理学教研室广东广州510515

目的探究不同强度持续噪声背景对清醒小鼠初级听皮层神经元听觉反应特征的影响。方法以清醒小鼠初级听皮层(A1)第4层神经元为研究对象,采用细胞外贴附式记录方式,研究清醒状态下A1神经元在不同强度背景噪声下对声刺激发生响应的声强调... 详细信息

目的探究不同强度持续噪声背景对清醒小鼠初级听皮层神经元听觉反应特征的影响。方法以清醒小鼠初级听皮层(A1)第4层神经元为研究对象,采用细胞外贴附式记录方式,研究清醒状态下A1神经元在不同强度背景噪声下对声刺激发生响应的声强调谐、频率调谐和时间调谐特征的变化。总计44例神经元均进行5种目标声刺激序列扫描,根据神经元的声强响应特征和目标声序列扫描完成情况,将神经元分为4组:单调性-声强组20例、非单调性-声强组6例,完成声强-噪声强度序列扫描;单调性-频率组25例,完成频率-噪声强度序列扫描;单调性-延时组15例完成延时-噪声强度序列扫描。结果给予持续宽带白噪声刺激,44例A1听神经元仅在给声后10~40 ms内出现瞬态的尖峰响应,不同强度的背景噪声对A1神经元的发放率无明显影响(P>0.05);单调性和非单调性-声强组,给予不同声强的目标声叠加持续背景噪声时,当背景噪声增强到一定程度,26例神经元对目标声刺激发生响应的声强阈值随背景噪声强度变化表现出线性增大(线性回归R2值均>0.90,P值均<0.05),各神经元的阈值变化斜率差异较大,但单调性和非单调性神经元群体之间的阈值变化趋势无明显差异(P>0.05);A1非单调性神经元的最佳声强也随背景噪声增强而增大,其变化斜率与该神经元声强阈值的变化趋势呈正相关(相关系数0.944,P<0.001);单调性-频率组,给予不同频率的目标声叠加持续背景噪声时,随背景噪声强度增大,神经元频率响应带宽减小(P<0.001),平均发放率减小(P<0.001),而最佳频率基本不变(P<0.001);单调性-延时组,噪声背景的增强使得神经元对同一声刺激的响应延时增大(P<0.05),但首个动作电位发放时间的精确性不发生改变(P>0.05)。结论在不断增强的噪声背景中,清醒小鼠A1神经元的声强响应阈值表现出线性升高,其变化斜率存在较大的个体差异,但与神经元的声强响应特征(单调或非单调)无关。增强的背景噪声压缩了A1神经元的频率响应范围,延长了神经元对目标声的响应时间,但神经元的频率选择性和对同一目标声发生反应的时间精确性不受噪声背景的干扰而保持稳定。

关键词：背景噪声初级听皮层清醒小鼠

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基于代谢网络识别共病性疾病对的潜在药靶

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哈尔滨医科大学学报 2020年第1期54卷 31-33,38页

作者：宋朝娜王亚辉许满意张悦葛銮凤王平何月涵李琬陈丽娜哈尔滨医科大学生物物理学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的基于代谢网和药物靶点来分析心脑血管疾病间的相似性,识别显著相似疾病对的潜在药物靶点和治疗药物。方法利用常用代谢数据库中存储的数据,构建多个经典的代谢网络;开发了新的疾病相似性算法,基于心脑血管疾病的药靶和疾病基因在生... 详细信息

目的基于代谢网和药物靶点来分析心脑血管疾病间的相似性,识别显著相似疾病对的潜在药物靶点和治疗药物。方法利用常用代谢数据库中存储的数据,构建多个经典的代谢网络;开发了新的疾病相似性算法,基于心脑血管疾病的药靶和疾病基因在生物代谢网络中的重叠度与距离特性,来衡量疾病间的相似性。进一步通过功能富集挖掘显著相似疾病对潜在的药靶和治疗药物。结果获得多组心脑血管疾病对的相似性得分,并成功地识别出慢阻肺-冠心病和糖尿病-肥胖症这两组疾病的潜在的药靶及相应治疗药物。结论基于生物代谢网络和药物靶点的新算法,识别出了多组显著相似的疾病对,并证实了其有效性,对疾病对的共药性研究以及心脑血管疾病的治疗药靶的筛选具有重要的指导作用。

关键词：药靶代谢网心脑血管疾病功能富集

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表观调控rDNA转录的研究进展

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生物化学与生物物理进展 2018年第5期45卷 485-493页

作者：程香荣魏艳军黄星卫王楠姜琦刘惠雷蕾哈尔滨医科大学组织学与胚胎学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院哈尔滨150081

rDNA是控制细胞核糖体生物合成的串联重复基因,影响着整体蛋白质的翻译水平,与细胞生长代谢息息相关.由于rDNA序列具有多拷贝的重复特征,其转录除了受一般转录机制的调节外,还受多重表观调控机制的调节,精细调控着rDNA的转录状态.一般认... 详细信息

rDNA是控制细胞核糖体生物合成的串联重复基因,影响着整体蛋白质的翻译水平,与细胞生长代谢息息相关.由于rDNA序列具有多拷贝的重复特征,其转录除了受一般转录机制的调节外,还受多重表观调控机制的调节,精细调控着rDNA的转录状态.一般认为rDNA分为活跃和沉默两种状态,分别与活跃染色质标记和异染色质标记相关.近些年来,发现一种平衡态rDNA的存在,更加丰富了rDNA表观机制的研究.H3.3是一种H3组蛋白变体,是近些年来的研究热点,已有报道H3.3可能在分子伴侣HIRA的介导下整合进入活跃rDNA,然而沉默rDNA的维持是否也与H3.3的作用相关需要更多的探索.CTCF是rDNA重复单元间的绝缘子成分,与H3.3相关但并不清楚是否也调控着rDNA的转录.该综述讨论了几种调控rDNA表观状态的机制,并对可能参与该过程的新机制提出了设想.

关键词： rDNA 表观遗传调控 H3.3 分子伴侣 CTCF

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基于罗杰斯特回归分类模型预测药物副作用

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哈尔滨医科大学学报 2019年第2期53卷 145-149页

作者：陈晓文陈曦李函章王世缘王吉喆向睿智哈尔滨医科大学生物信息与技术学院生物数学教研室黑龙江哈尔滨150081 东北林业大学理学院基础数学教研室黑龙江哈尔滨150040 黑龙江大学计算机学院黑龙江哈尔滨150080

目的探讨药物副作用发生相关的药物-靶蛋白子结构对。方法从DrugBank,Kinase Knowledgebase,PDSP Ki,Matador 4个药物信息数据库中获得药物-靶点互作关系对做作为参考集,利用朴素贝叶斯算法预测副作用相关的药物靶点。在Pubchem和Pfam... 详细信息

目的探讨药物副作用发生相关的药物-靶蛋白子结构对。方法从DrugBank,Kinase Knowledgebase,PDSP Ki,Matador 4个药物信息数据库中获得药物-靶点互作关系对做作为参考集,利用朴素贝叶斯算法预测副作用相关的药物靶点。在Pubchem和Pfam数据库中分别获得药物的子结构fingerprint和蛋白质靶点的子结构结构域并将其两两配对,组成药物-蛋白质子结构对,将其作为特征构建二元罗杰斯特回归模型预测药物的副作用。最后,对模型进行了特征选择优化和多倍交叉验证,应用ROC曲线下面积(AUC)进行效能评价。结果罗杰斯特回归方法成功地应用于肾衰竭,其AUC值为0.80。与支持向量的方法比较,本方法获得了更高的准确率。结论基于药物和靶点的子结构可以有效地预测药物副作用,为副作用的早期预测提供了重要的参考。

关键词：副作用朴素贝叶斯分类模型逻辑回归模型子结构支持向量机

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基于显著表达差异三元组识别缺血性心肌病易感基因

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哈尔滨医科大学学报 2018年第6期52卷 530-533页

作者：邹宇情宋朝娜王亚辉冯玉炎胡二强陈丽娜李琬哈尔滨医科大学生物物理学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的基于系统生物学理论和生物信息学方法,识别缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)易感基因。方法从包含缺血性心肌病和正常样本的测序数据获得各样本的mRNA、miRNA和lncRNA的表达数据,在疾病组和对照组中分别构建显著表达差异... 详细信息

目的基于系统生物学理论和生物信息学方法,识别缺血性心肌病(ischemic cardiomyopathy,ICM)易感基因。方法从包含缺血性心肌病和正常样本的测序数据获得各样本的mRNA、miRNA和lncRNA的表达数据,在疾病组和对照组中分别构建显著表达差异三元组,将其中富集到疾病相关功能类中的差异基因作为疾病候选易感基因。进一步将在疾病相关功能类中且单一和组合均能较好区分疾病和正常样本的候选易感基因作为缺血性心肌病易感基因。结果结合高通量基因组信息和功能性分析,识别出了8个缺血性心肌病易感基因,其所在显著表达差异三元组也能够有效地分类样本。结论识别出的缺血性心肌病易感基因有助于缺血性心肌病的诊断、治疗以及疾病机制的研究。

关键词：缺血性心肌病易感基因三元组分类效能

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基于miRNA-TF调控网络识别乳腺癌亚型关键调控子

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哈尔滨医科大学学报 2017年第1期51卷 21-24页

作者：韩晓乐赵宁刘永晶严自创张强周元帅张瑞许艳哈尔滨医科大学生物物理学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网... 详细信息

目的挖掘乳腺癌各亚型关键调控子并评估其预后能力。方法整合TCGA数据库中乳腺癌样本基因表达、拷贝数变异和DNA甲基化数据,分亚型筛选癌症相关基因。以此为基础,挖掘各亚型的四类motif,将同亚型四类motif合并构建各亚型miRNA-TF调控网络。随后,挖掘每个网络hub节点,并对其预后能力进行评估。结果各调控网络中的10个hub miRNA分别为乳腺癌亚型关键调控子。结论基于miRNA-TF调控网络能有效识别出乳腺癌亚型预后相关生物标志物。

关键词：乳腺癌亚型 miRNA—TF调控网络 miRNA

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基于共病性原则筛选PCOS潜在治疗药靶

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哈尔滨医科大学学报 2016年第3期50卷 189-191页

作者：何月涵韦文青谢瑞强黄昊吕俊杰李琬陈丽娜哈尔滨医科大学生物物理学教研室黑龙江哈尔滨150081

目的寻找多囊卵巢综合征的潜在治疗药靶。方法采用Grapweb软件中的MCL clustering算法,在蛋白质互作网络中,分别以2型糖尿病和多囊卵巢综合征的已知致病基因为种子,挖掘两种疾病共病性模块;以DAVID功能富集分析软件进行模块中基因的GO... 详细信息

目的寻找多囊卵巢综合征的潜在治疗药靶。方法采用Grapweb软件中的MCL clustering算法,在蛋白质互作网络中,分别以2型糖尿病和多囊卵巢综合征的已知致病基因为种子,挖掘两种疾病共病性模块;以DAVID功能富集分析软件进行模块中基因的GO功能注释和通路富集显著性分析(FDR<0.05)。结果获得了68个共病性模块,其中2个为多囊卵巢综合征的潜在药靶模块。结论得到PPARG、ESR1与ESR2等潜在治疗药物靶点。

关键词：多囊卵巢综合征 2型糖尿病共病性模块

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