检索结果-内蒙古大学图书馆

基于原发癌灶T2WI的影像组学特征预测局部进展期直肠癌新辅助治疗疗效及多种分类器效能比较

磁共振成像 2023年第11期14卷 77-83页

作者：胡鸿博赵升姜昊姜慧杰蔺雪张莹哈尔滨医科大学附属第二医院放射科哈尔滨150086 哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学教研室哈尔滨150086

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机... 详细信息

目的3.0 T MRI影像数据具有评估局部进展期直肠癌(locally advanced rectal cancer,LARC)术前新辅助放化疗(neoadjuvant chemoradiotherapy,nCRT)疗效临床价值,但是构建模型多种机器学习间的比较并没有被探究过。我们将比较4种常用的机器学习方法在评估直肠癌新辅助治疗疗效临床价值的效能。材料与方法回顾性分析2021年9月至2023年1月于哈尔滨医科大学附属第二医院就诊经病理检查证实的LARC并行nCRT的病例共160例,按8∶2比例分为训练集及验证集。分别建立支持向量机(support vector machines,SVM)、朴素贝叶斯(naive Bayes,NB)、神经网络(neural network,NN)、卷积神经网络(convolutional neural networks,CNN)四种分类器模型,采用DeLong检验比较受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线的差异,对4种分类器诊断效能进行评估比较。结果2组患者年龄、性别差异无统计学意义(P>0.05)。通过最小绝对收缩和选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法得到9个与治疗效果分组相关的特征,9个特征在病理完全缓解(pathological complete response,pCR)/病理非完全缓解(non-pathological complete response,non-pCR)中有差异,但差异不具有统计学意义(P>0.05)。SVM模型在训练集的ROC曲线下面积为0.9150,评估nCRT效果最为显著。结论基于磁共振高分辨T2WI的纹理特征,通过SVM、NB、NN、CNN分类器模型可以对直肠癌nCRT疗效进行评估,其中SVM分类器模型诊断效能最佳。基于高分辨T2WI的影像组学可以评估LARC患者nCRT治疗效果。

关键词：直肠癌磁共振成像影像组学机器学习支持向量机

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喉癌颈淋巴结抗肿瘤免疫状态的研究

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中华耳鼻咽喉科杂志 2004年第4期39卷 223-226页

作者：张杰武徐晋赵雪松贾深汕哈尔滨医科大学附属肿瘤医院头颈外科 150040 哈尔滨医科大学基础医学院医学遗传学与细胞生物学教研室

目的　通过对肿瘤引流淋巴结中增生性滤泡反应和树突状细胞 (dendriticcell,DC)浸润密度进行定量分析 ,探讨其在喉癌患者抗肿瘤免疫反应中的作用。方法　重新制备 4 7例行选择性颈淋巴结清扫术的喉癌患者的 15 7枚颈淋巴结石蜡切片 ,用... 详细信息

目的　通过对肿瘤引流淋巴结中增生性滤泡反应和树突状细胞 (dendriticcell,DC)浸润密度进行定量分析 ,探讨其在喉癌患者抗肿瘤免疫反应中的作用。方法　重新制备 4 7例行选择性颈淋巴结清扫术的喉癌患者的 15 7枚颈淋巴结石蜡切片 ,用抗S 10 0、CD4 5RO和CD2 0单克隆抗体免疫组化抗生物素生物素过氧化物酶复合物 (avidin biotinperoxidase,ABC)法显示DC和增生性滤泡的分布并检测其密度。根据增生性滤泡反应的特点进行分型研究。结果　增生型滤泡反应的程度与类型和DC浸润密度有明显的相关性。术后生存 5年以上的患者淋巴结中滤泡计数和DC浸润密度明显多于生存期少于 5年者 (P <0 0 0 1)。无淋巴结转移组患者淋巴结中的滤泡计数和DC浸润密度较有转移组亦有明显增加 (P <0 0 0 1)。具有T细胞增生型滤泡反应的患者比T细胞非增生型患者有较高的 5年生存率 (P <0 0 1)和较低的淋巴结转移率 (P <0 0 5 )。结论　颈淋巴结中增生性滤泡反应和树突状细胞的浸润反映了机体免疫系统的抗肿瘤潜能。树突状细胞的浸润密度和增生性滤泡反应的程度及分型反映了该患者的抗肿瘤免疫状态 ,可以共同作为预后判定的重要指标。

关键词：喉癌颈淋巴结转移免疫学预后树突状细胞增生性滤泡反应

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曲古菌素A在胃腺癌细胞系SGC-7901中的作用

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中华胃肠外科杂志 2007年第4期10卷 376-379页

作者：李云龙邹小明郭宝良李晓林闫朝岐尤立光傅松滨哈尔滨医科大学附属第二医院普通外科 150086 哈尔滨医科大学附属第五医院普通外科哈尔滨医科大学附属第二医院基础医学院医学遗传学与生物学教研室 150086

目的研究曲古菌素A（TSA）在胃腺癌细胞系SGC-7901中的作用。方法四甲基偶氮唑蓝法测定TSA对SGC-7901的细胞毒性，荧光显微镜观察细胞核DNA的变化，流式细胞仪检测细胞周期和凋亡率，Western印迹检测组蛋白H3的乙酰化状态。结果SGC-790... 详细信息

目的研究曲古菌素A（TSA）在胃腺癌细胞系SGC-7901中的作用。方法四甲基偶氮唑蓝法测定TSA对SGC-7901的细胞毒性，荧光显微镜观察细胞核DNA的变化，流式细胞仪检测细胞周期和凋亡率，Western印迹检测组蛋白H3的乙酰化状态。结果SGC-7901细胞生长曲线表明，TSA浓度增高，细胞生长率下降。细胞凋亡率在75ng／mlTSA作用72h时与对照组比较，差异有统计学意义（P〈0．05）。凋亡细胞DNA变化主要表现为核染色质固缩及断裂，荧光染色增强。流式细胞仪分析出现明显的亚G1期峰，G1期细胞减少，细胞凋亡率达29．54％。TSA作用后，乙酰化的组蛋白如明显增多。结论TSA可以诱导SGC-7901细胞发生凋亡，组蛋白H3的乙酰化状态可能与细胞凋亡有关。

关键词：胃肿瘤曲古菌素A 细胞凋亡乙酰化组蛋白H3 细胞系SGC-7901

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转化生长因子β1对口腔鳞状细胞癌脑转移细胞系Tb细胞生长抑制作用的研究

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中华口腔医学杂志 2010年第7期45卷 421-425页

作者：刘成敏张成仁王秀梅徐旭光傅松滨哈尔滨医科大学附属第二医院口腔科 150086 哈尔滨医科大学基础医学院遗传学教研室黑龙江省生物医药工程重点实验室

目的探讨转化生长因子（transforming growth factor,TGF）β1对口腔鳞状细胞癌脑转移细胞系Tb细胞的生长抑制作用及可能的机制.方法采用细胞计数法检测TGF-β1对Tb细胞的生长抑制作用,流式细胞仪检测细胞周期的变化,微阵列分析法（su... 详细信息

目的探讨转化生长因子（transforming growth factor,TGF）β1对口腔鳞状细胞癌脑转移细胞系Tb细胞的生长抑制作用及可能的机制.方法采用细胞计数法检测TGF-β1对Tb细胞的生长抑制作用,流式细胞仪检测细胞周期的变化,微阵列分析法（superarray）筛查smad蛋白介导的TGF-B（TGF-β-Smads）信号通路中基因表达水平的变化,反转录聚合酶链反应（RT-PCR）验证差异表达基因.结果 TGF-β1对Tb细胞有明显的生长抑制作用（P〈0.05）.流式细胞仪检测显示,TGF-β1能够使Tb细胞周期阻滞于G1期（P〈0.05）.微阵列分析法筛查结果显示,TGF-β1作用后,活化素受体样激酶1（activin receptor-like kinase-1,ACVRL-1）、抗苗勒激素（anti-mullerian hirmine,AMH）、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子2B（cyclim-dependent kinase inhibitor-2B,CDKN-2B）、TGF-相互作用因子（indnced factor,TGIF）基因表达增加,而畸形肿瘤衍生生长因子1（teratocarcinomaderived growth factor-1,TDGF-1）基因表达降低.RT-PCR验证结果表明,ACVR-1（0.67±0.08）、CDKN-2B基因表达（2.16±0.95）与微阵列分析法结果一致,差异有统计学意义（P〈0.05）,AMH（0.38±0.07）、TDGF-1（0.44±0.06）及TGIF（0.52±0.10）基因表达水平无统计学意义（P〉0.05）.结论 TGF±β1对口腔鳞状细胞癌脑转移细胞系Tb细胞有明显的生长抑制作用,其机制可能与细胞周期调控及调节TGF-β1-Smads信号通路中ACVRL-1、CDKN-2B基因表达有关.

关键词：转化生长因子β1 癌鳞状细胞基因表达

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核酸检测技术进展及其在SARS-CoV-2核酸检测中的应用

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生物化学与生物物理进展 2021年第11期48卷 1290-1300页

作者：孟德豪张艳芬孙玉淼高旭马宁哈尔滨医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院检验科哈尔滨150000 黑龙江省基础医学研究所哈尔滨150086 哈尔滨医科大学北方转化医学研究合作中心哈尔滨150081 教育部中国遗传资源保护与疾病防控重点实验室哈尔滨150081 黑龙江省遗传改变模式动物重点实验室哈尔滨150081

2020年初至今,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情仍在全球多个国家流行,给全球公共卫生安全造成了严重威胁.中国在应对COVID-19的实践中,最先完成病毒核酸测序并共享序列信息,最早有效控制疫情蔓延、恢复生产,并在病毒作用人体机制研究、... 详细信息

2020年初至今,新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情仍在全球多个国家流行,给全球公共卫生安全造成了严重威胁.中国在应对COVID-19的实践中,最先完成病毒核酸测序并共享序列信息,最早有效控制疫情蔓延、恢复生产,并在病毒作用人体机制研究、疫苗研发、中和性抗体发现等环节均处于世界前沿.其中,针对病毒核酸的检测工作——试剂盒研发、检测配套设备研制、10合1混检策略及相关政策制订,有效提高了疫情防控效率、保障了百姓健康.本文就严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)核酸检测多种方法的原理、优劣势及其配套设备等进行综述.

关键词：新型冠状病毒核酸检测 CRISPR

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转化生长因子β1信号传导通路在口腔鳞癌中的功能意义

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中华肿瘤杂志 2009年第1期31卷 28-32页

作者：王秀梅刘成敏张成仁徐旭光傅松滨哈尔滨医科大学附属第二医院口腔科黑龙江哈尔滨150086 哈尔滨医科大学基础医学院遗传学教研室黑龙江省生物医药工程重点实验室黑龙江哈尔滨

目的探讨转化生氏网子β1（TGF-β1）及其信号通路分子在口腔鳞癌中的表达及与口腔鳞癌发生和转移的关系。方法采用免疫组织化学SP方法，检测TGF-β1及其受体I（TβRI）、Ⅱ（TβRⅡ）和该信号内下游关键分子Smad4在10例正常口腔组织和... 详细信息

目的探讨转化生氏网子β1（TGF-β1）及其信号通路分子在口腔鳞癌中的表达及与口腔鳞癌发生和转移的关系。方法采用免疫组织化学SP方法，检测TGF-β1及其受体I（TβRI）、Ⅱ（TβRⅡ）和该信号内下游关键分子Smad4在10例正常口腔组织和108例口腔鳞癌组织中的表达情况，分析其与口腔鳞癌发生和转移的关系。结果TβRⅡ和Smad4在口腔鳞癌组织中的阳性表达率分别为34.3％和38.9％，在正常口腔上皮组织中的阳性表达率分别为80.0％和100.0％，差异有统计学意义（P〈0.05）；而TGF-β1、TβR1的阳性表达在口腔鳞癌组织和正常口腔上皮组织间的差异无统计学意义（P〉0.05）。TGF-β1、Smad4、TβRI和TβRⅡ的阳性表达率均与临床分期呈负相关（P〈0.01），其中TGF-β1表达与临床分期、组织分化、肿瘤发生部位有关（P〈0.05）；Smad4表达与组织分化、淋巴结转移呈负相关（P〈0.05）；虽然TβRⅡ表达与淋巴结转移无关（P〉0.05），们淋巴结转移组的TβRⅡ表达明显低于无淋巴结转移组。结论Smad4介导的TGF-β1（TGF-β1／Smad4）信号通路异常与口腔鳞癌的发生和发展密切相关，TβRⅡ、Smad4低表达可促进口腔鳞癌的转移。

关键词：转化生长因子β1 口腔肿瘤鳞癌肿瘤转移

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序列和功能信息介导的蛋白质互作特征评价与数据库构建

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国际遗传学杂志 2014年第5期37卷 230-235页

作者：李晋陈曦林效宗杨欢张瑞杰王丽美哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院统计遗传学教研室哈尔滨医科大学附属第二医院急诊创伤外科哈尔滨医科大学基础医学院计算机教研室

目的蛋白质相互作用研究对于理解DNA功能、基因组元件作用机制有重要意义。已有大量工作在从蛋白质-蛋白质互作的计算预测方向展开,其中蛋白质-蛋白质互作的特征起着很重要的作用。互作特征的评价及相关数据库构建仍是蛋白质互作预测的... 详细信息

目的蛋白质相互作用研究对于理解DNA功能、基因组元件作用机制有重要意义。已有大量工作在从蛋白质-蛋白质互作的计算预测方向展开,其中蛋白质-蛋白质互作的特征起着很重要的作用。互作特征的评价及相关数据库构建仍是蛋白质互作预测的一项重要工作。方法该文从基因、蛋白质序列、功能信息层面提取出人类蛋白质-蛋白质对的27个特征,并应用于多种分类器,利用ROC曲线对特征的性能给出了科学的评价。结果通过研究发现逻辑回归和贝叶斯网络分类效果最好,生物过程、细胞组分、分子功能、基因表达值、组织、域间互作的可用性明显高于其他特征,同时构建了人类蛋白质互作特征数据库,供广大科研工作者使用。结论从多角度评价了特征可用性,得到了表现较优的特征,但是对于其中一些特征,还需要进一步提高覆盖率,从而达到更好的效果。

关键词：蛋白质-蛋白质互作机器学习特征评价数据库

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基于CRISPR/Cas9技术的哺乳动物细胞基因敲入的策略优化与效率提升

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生命的化学 2024年第8期44卷 1433-1441页

作者：邹爽孟德豪李贺年张艳芬马宁哈尔滨医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室哈尔滨150081 哈尔滨医科大学附属第二医院检验科哈尔滨150000 黑龙江省遗传改变模式动物重点实验室哈尔滨150081

CRISPR基因编辑系统自问世以来,极大推动了疾病治疗、药物研发、疾病模型构建等领域的研究进展。基于该系统的基因敲入(knock-in,KI)策略已成为基因工程生物制备与基因治疗等应用的常用策略。但外源DNA的敲入,尤其是较大DNA片段的敲入... 详细信息

CRISPR基因编辑系统自问世以来,极大推动了疾病治疗、药物研发、疾病模型构建等领域的研究进展。基于该系统的基因敲入(knock-in,KI)策略已成为基因工程生物制备与基因治疗等应用的常用策略。但外源DNA的敲入,尤其是较大DNA片段的敲入效率一直是该策略有待优化的问题。研究者已从基因(组)编辑系统、DNA损伤修复、细胞周期调节等方面进行了提升KI效率的探索。本文主要针对以上方面进行综述,阐述影响KI效率的关键因素与提升KI效率的优化策略。

关键词： CRISPR/Cas9 基因敲入同源重组修复非同源末端连接

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遗传性耳聋基因治疗临床指南

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实用医院临床杂志 2024年第2期21卷 39-44页

作者：齐洁玉谈方志张李燕陆玲王洪阳李文妍刘闻闻付小龙贺祖宏丁小琼孙珊方巧军董耀东朱学伟童步升曹现宝郭敏范欣淼汪芹马璐张天虹于亚峰李永新樊建刚崔勇吴佩娜张宏征唐杰郭维维查定军叶放蕾何双八曹卫杨见明钱晓云赵宇孙敬武陈晓巍孙宇夏明王秋菊袁慧军冯永孔维佳杨仕明王海波高下李华伟徐磊柴人杰东南大学数字医学工程全国重点实验室附属中大医院耳鼻咽喉头颈外科生命科学与技术学院生命与健康高等研究院江苏省生物医学高新技术研究重点实验室江苏南京210096 南通大学神经再生联合创新中心江苏南通226001 北京理工大学航天中心医院神经内科生命学院北京10081 南京大学医学院附属鼓楼医院耳鼻喉头颈外科江苏省医学重点学科(实验室)江苏南京210008 中国人民解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科医学部北京100853 听觉与平衡觉全国重点实验室北京100853 国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心北京100853 聋病教育部重点实验室北京100853 聋病防治北京市重点实验室北京100853 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院医学神经生物学国家重点实验室教育部脑科学前沿研究中心上海200031 复旦大学生物医学研究所上海200032 国家卫健委听觉医学重点实验室上海200031 复旦大学脑科学研究院和脑科学协同创新中心上海200032 山东大学山东省耳鼻喉医院耳鼻咽喉头颈外科山东济南250022 山东省耳鼻喉研究所山东济南250022 山东第一医科大学/山东省医学科学院医学科技创新中心山东济南250000 武汉大学中南医院耳鼻咽喉头颈外科湖北武汉430071 东南大学附属中大医院耳鼻咽喉头颈外科江苏南京210009 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院耳鼻喉科上海200032 安徽医科大学第二附属医院耳鼻咽喉头颈外科安徽合肥230601 中国医科大学附属盛京医院耳鼻咽喉头颈外科辽宁沈阳110004 吉林大学中日联谊医院耳鼻咽喉头颈外科吉林长春130033 安徽医科大学第一附属医院耳鼻咽喉头颈外科安徽合肥230022 云南省第一人民医院耳鼻喉科云南昆明650032 昆明医科大学第一附属医院耳鼻喉科云南昆明650032 中国医学科学院北京协和医学院北京协和医院耳鼻咽喉科北京100730 中南大学湘雅二医院耳鼻咽喉头颈外科湖南长沙410008 南华大学衡阳医学院基础医学院细胞生物学与遗传学教研室细胞应激生物学衡阳市重点实验室湖南衡阳421001 哈尔滨医科大学附属第一医院黑龙江哈尔滨150001 苏州大学附属第一医院耳鼻咽喉科江苏苏州215006 首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科北京100730 四川省医学科学院·四川省人民医院/电子科技大学附属医院耳鼻咽喉头颈外科四川成都610072 广东省人民医院耳鼻咽喉头颈外科/广东省医学科学院/南方医科大学广东广州510080 南方医科大学珠江医院耳鼻咽喉头颈外科广东广州510282 空军军医大学西京医院耳鼻咽喉-头颈外科陕西西安710032 郑州大学第一附属医院耳科河南郑州450000 东南大学医学院附属南京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科江苏南京211102 四川大学华西医院耳鼻咽喉头颈外科四川成都610041 中国科学技术大学附属第一医院耳鼻咽喉头颈外科安徽合肥230001 华中科技大学同济医学院附属协和医院耳鼻咽喉头颈外科湖北武汉430022 山东第一医科大学附属山东省立医院耳鼻咽喉科山东济南250021 山东省医学科学院医学科技创新中心山东济南250021 山东大学附属山东省立医院耳鼻咽喉科山东济南250021 国家卫生健康委耳鼻咽喉重点实验室山东济南250021 四川大学华西医院罕见病研究院四川成都6010041 南华大学衡阳医学院南华大学附属妇幼保健院湖南长沙410008 中南大学湘雅医院耳鼻咽喉头颈外科湖南长沙410008 上海人工耳蜗工程技术研究中心上海200031 东南大学深圳研究院广东深圳518063

遗传性耳聋是一种常见的遗传性疾病,新生儿的发病率为1‰~3‰。患者终身携带致病突变,导致不可逆性耳聋,至今尚无临床可用的治疗药物。在部分遗传性耳聋动物模型中,基因治疗已被证实为潜在有效的治疗方法。国内外已开展了多项遗传性耳... 详细信息

遗传性耳聋是一种常见的遗传性疾病,新生儿的发病率为1‰~3‰。患者终身携带致病突变,导致不可逆性耳聋,至今尚无临床可用的治疗药物。在部分遗传性耳聋动物模型中,基因治疗已被证实为潜在有效的治疗方法。国内外已开展了多项遗传性耳聋基因治疗的临床试验。其中,由东南大学附属中大医院牵头,联合国内多家医院成功开展的遗传性耳聋基因治疗临床试验,取得了显著的疗效,并积累了丰富的经验。为规范遗传性耳聋基因治疗并提供临床研究指导,全国多家医院的耳科专家讨论制定了遗传性耳聋基因治疗临床指南,内容涵盖了伦理审查、遗传性耳聋的诊断和入组标准、临床前准备、药物、疗效与安全性评估标准、术后言语康复等。本指南将为耳聋基因治疗的临床诊疗提供规范的理论和技术指导。

关键词：遗传性耳聋基因治疗临床指南

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