检索结果-内蒙古大学图书馆

一种基于树的集成学习方法新思路在中老年人消化系统疾病相关因素研究中的应用

中国卫生统计 2023年第2期40卷 242-245页

作者：张蕊郭维恒王世伟冯彦成王添郭志旺王立芹河北医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室 050017 河北省环境与人群健康重点实验室西安医学院公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的本研究借鉴深度森林(deep forest)的思想,提出一种基于树的集成学习方法新思路,为以后相关的研究提供分析策略和思路。方法使用2015年中国健康与养老追踪调查数据库,筛选与消化系统疾病有关的变量,通过“人工地”建立多层随机森... 详细信息

目的本研究借鉴深度森林(deep forest)的思想,提出一种基于树的集成学习方法新思路,为以后相关的研究提供分析策略和思路。方法使用2015年中国健康与养老追踪调查数据库,筛选与消化系统疾病有关的变量,通过“人工地”建立多层随机森林模型,对人群进行分类,再分别建立模型筛选变量,通过计算评价指标评价模型效果,从而选择更优的模型解释与消化系统疾病相关的变量。结果本研究发现通过建立多层随机森林模型对人群分为两类后,再分别建立模型,各评价指标都有很大幅度提高。另外对两类人群分别构建随机森林模型后,根据变量重要性评分筛选出与消化系统疾病有关的重要变量,再建立logistic模型,结果显示,一类人群筛选出15个有统计学意义的变量,其中有13个危险因素,OR值由1.871至35.917,关联最强的是关节炎和风湿病,其次为肾脏疾病、过去一个月生过病、头痛或者颈部痛、胸背部或者腰臀部疼痛、心脏病等;2个保护因素为晚上的睡眠时间、血红蛋白值。另一类人群筛选出的相关变量与第一类人群大部分相同,但作用相反,OR值由0.067至0.771,并且对第一类人群危害最大的因素对第二类保护也最大。结论对于病因复杂的疾病,可通过对人群细分,再分别进行分析。本研究提出的基于树的集成学习新算法,通过叠加多层随机森林模型,可用于以上数据中进行人群分类,使模型更优。

关键词：消化系统疾病集成学习胃病相关因素随机森林

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基于倾向性评分匹配的慢性阻塞性肺疾病影响因素研究

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中华疾病控制杂志 2022年第7期26卷 857-861页

作者：任家辉乔宇超任浩全帝臣崔宇赵执扬仇丽霞山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室太原030001

目的经倾向性评分匹配(propensity score matching,PSM)均衡组间人口学特征后,研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)与生活行为习惯、个体疾病等因素的关系。方法使用2014-2015年山西省居民COPD监测数据,... 详细信息

目的经倾向性评分匹配(propensity score matching,PSM)均衡组间人口学特征后,研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)与生活行为习惯、个体疾病等因素的关系。方法使用2014-2015年山西省居民COPD监测数据,其中病例组277人,对照组1795人。采用PSM按1∶1选取在人口学特征上与病例相近的对照个体;采用条件Logistic回归分析模型分析COPD的影响因素。结果成功匹配275对,条件Logistic回归分析模型结果显示,知晓COPD者患病风险降低了92.8%;既往经常咳嗽、有呼吸道疾病史、接触有害气体、吸烟者患COPD的风险分别提高了1.489倍、1.371倍、1.013倍、0.834倍。结论加强COPD的健康教育、禁烟、不接触有害气体、及时治疗呼吸系统疾病是预防和减少COPD发生的重要措施。

关键词：倾向性评分匹配慢性阻塞性肺疾病影响因素

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MTB Hsp60重组蛋白对巨噬细胞趋化功能的影响

引用

中国病原生物学杂志 2024年第2期19卷 157-161,171页

作者：卫麟娜高雪涵董品志吴荧浓王海燕罗军敏覃明遵义医科大学基础医学院免疫学教研室贵州遵义563000 遵义医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室

目的研究结核分枝杆菌H37Rv重组热休克蛋白60(Heat shock protein 60 of Mycobacterium tuberculosis,MTB Hsp60)对巨噬细胞(RAW264.7)趋化功能的影响。方法MTB Hsp60重组蛋白(100 ng/mL)刺激巨噬细胞24 h后,采用实时荧光定量PCR检测下列趋化因子如单核细胞趋化蛋白1(Monocyte chemotactic protein-1,MCP-1,CCL2)、巨噬细胞炎症蛋白1α(Macrophage inflammatory protein-1α,MIP-1α,CCL3)、巨噬细胞炎症蛋白1β(Macrophage inflammatory protein-1β,MIP-1β,CCL4)、调节活化正常T细胞表达与分泌的趋化因子(Regulation of Activation,Expression and Secretion by Normal T Cells,RANTES,CCL5)和单核细胞趋化蛋白5(Monocyte chemotactic protein-5,MCP-5,CCL12)的mRNA表达;ELISA法检测细胞培养上清液中趋化因子CCL2、CCL3、CCL4、CCL5和CCL12的分泌水平;Western bolt检测巨噬细胞表面趋化因子受体CC基序趋化因子受体1(C-C motif chemokine receptor 1,CCR1)、CCR2和CCR5的蛋白表达;流式细胞术检测表达趋化因子受体CCR1、CCR2、CCR5的巨噬细胞;Transwell实验检测巨噬细胞的趋化功能。结果100 ng/mL MTB Hsp60重组蛋白刺激巨噬细胞24 h后,其趋化因子CCL2、CCL3、CCL4及CCL12的mRNA表达水平无明显差异,但CCL5的mRNA水平显著上调(P<0.05);巨噬细胞表面主要的趋化因子受体CCR1、CCR2蛋白表达水平显著增高(P<0.05),而其表面CCR5蛋白的变化不明显;流式细胞术检测结果显示,与未处理组相比,处理组中CCR1^(+)、CCR2^(+)巨噬细胞数量明显增加(P<0.05),而CCR5^(+)巨噬细胞数量无明显差异;Transwell实验表明,经过MTB Hsp60重组蛋白处理后的巨噬细胞有更明显的被募集的趋势(P<0.05);而上清液中趋化因子CCL2、CCL3、CCL4、CCL5及CCL12的释放水平无明显变化。结论MTB Hsp60重组蛋白能上调巨噬细胞中趋化因子CCL5的mRNA表达水平,能增加巨噬细胞表面趋化因子受体CCR1和CCR2的表达,并且能增强巨噬细胞的趋化功能。

关键词： MTB Hsp60重组蛋白巨噬细胞趋化因子趋化因子受体

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基于心脑血管疾病发病风险预测的CatBoost算法和贝叶斯网络模型分析

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吉林大学学报（医学版） 2024年第4期50卷 1044-1054页

作者：王爱民王凤琳黄一铭徐雅琪张文婧丛显铸苏维强王素珍高梦瑶李爽孔雨佳石福艳陶恩学山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 山东第二医科大学基础医学院山东潍坊261053

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过... 详细信息

目的:筛选影响心脑血管疾病发病的主要特征变量,基于排序前10位的特征变量构建心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型,为心脑血管疾病发病风险预测提供参考。方法:从英国生物样本(UK Biobank)数据库中纳入315896例参与者和相关变量,通过类别型特征提升(CatBoost)算法进行特征选择,将所有参与者按7∶3比例随机分为训练集和测试集,并基于最大最小爬山(MMHC)算法构建贝叶斯网络模型。结果:本研究中人群心脑血管疾病患病率为28.8%。CatBoost算法筛选的排名前10位变量分别为年龄、体质量指数(BMI)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、总胆固醇(TC)、甘油三酯-葡萄糖(TyG)指数、家族史、载脂蛋白A/B比值、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、吸烟状态和性别。CatBoost训练集模型受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)为0.770,模型准确性为0.764;验证集模型AUC为0.759,模型准确性为0.763。临床效能分析,训练集阈值范围为0.06~0.85,验证集阈值范围为0.09~0.81。心脑血管疾病发病风险贝叶斯网络模型分析,年龄、性别、吸烟状态、家族史、BMI和载脂蛋白A/B比值与心脑血管疾病直接相关,是心脑血管疾病发生的重要风险因素,TyG指数、HDL-C、LDL-C和TC通过影响BMI和载脂蛋白A/B比值间接影响心脑血管疾病的发生风险。结论:控制BMI、载脂蛋白A/B比值和吸烟行为,可以降低心脑血管疾病的发病风险。贝叶斯网络模型可用于预测心脑血管疾病发病风险。

关键词：心脑血管疾病 CatBoost算法贝叶斯网络风险推理

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胰岛素样生长因子1与结直肠癌因果关系的两样本孟德尔随机化研究

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吉林大学学报(医学版) 2025年第2期51卷 479-485页

作者：穆华夏卜伟晓丁淑婷高梦瑶苏维强张震薄其付刘峰石福艳王清华孔雨佳王素珍山东第二医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室山东潍坊261053 山东第二医科大学附属医院肿瘤科山东潍坊261041

目的:基于双向两样本孟德尔随机化(MR)分析,探索胰岛素样生长因子1(IGF-1)与结直肠癌(CRC)之间的因果关联。方法:基于已公开的全基因组关联研究(IEU OpenGWAS)项目的公开汇总数据进行双向两样本MR分析,采用逆方差加权法(IVW)作为主要分... 详细信息

目的:基于双向两样本孟德尔随机化(MR)分析,探索胰岛素样生长因子1(IGF-1)与结直肠癌(CRC)之间的因果关联。方法:基于已公开的全基因组关联研究(IEU OpenGWAS)项目的公开汇总数据进行双向两样本MR分析,采用逆方差加权法(IVW)作为主要分析方法,采用加权中位数法(WM)、MR-Egger回归法、加权众数法(WME)和简单众数法(SM)进行辅助分析,以评估IGF-1对CRC的因果影响;通过敏感性分析检查结果的稳健性。结果:以IGF-1作为暴露因素共筛选到386个单核苷酸多态性(SNPs)作为工具变量(IVs)。MR分析,IGF-1与CRC之间存在正向因果关联,比值比(OR)为1.178,95%置信区间(CI)为1.092~1.272,P<0.001;且该因果关联在校正了身高后仍然存在[OR(95%CI)=1.214(1.111,1.327),P<0.001]。Cochran's Q检验显示IV之间存在异质性(P<0.05),MR-Egger回归法未发现IV的水平多效性(P>0.05)。留一法逐个剔除SNPs后,结果显示该因果关联稳健。反向MR分析显示IGF-1与CRC之间不存在反向因果关系[OR(95%CI)=1.017(0.997,1.037),P=0.103]。结论:IGF-1水平与CRC之间存在因果关联,高IGF-1水平是CRC的潜在风险因素。

关键词：胰岛素样生长因子1 结直肠癌孟德尔随机化身高单核苷酸多态性

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基于分组的轨迹模型及其SAS实现

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中国卫生统计 2024年第3期41卷 462-467页

作者：宋福曼王思婷乔亲群刘媛媛陈佳庚马骏天津医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室、天津市环境营养与人群健康重点实验室 300070

目的对基于分组的轨迹模型(group-based trajectory modeling,GBTM)的基本原理、适用性及SAS软件程序进行介绍。方法使用SAS软件中的PROC TRAJ过程步,构建不同数据类型的GBTM模型。结果选取多项前瞻性数据,根据数据类型构建了CNORM、ZI... 详细信息

目的对基于分组的轨迹模型(group-based trajectory modeling,GBTM)的基本原理、适用性及SAS软件程序进行介绍。方法使用SAS软件中的PROC TRAJ过程步,构建不同数据类型的GBTM模型。结果选取多项前瞻性数据,根据数据类型构建了CNORM、ZIP等单轨迹及双轨迹模型,在此基础上将协变量纳入模型,观察影响发展轨迹的因素。结论GBTM为解决纵向数据复杂性和结果可解释性之间的平衡问题提供了有价值的工具,同时SAS软件可以很好地实现轨迹模型的构建,并为模型的不断拓展提供了较为方便的实现形式。

关键词：基于分组的轨迹模型轨迹分析纵向数据

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多元纵向测量的潜在过程模型在轻度认知障碍逆转研究中的应用

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中国卫生统计 2024年第1期41卷 64-67,71页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣马艺菲崔靖白文琳张荣余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时... 详细信息

目的将多元纵向测量的潜在过程模型应用于轻度认知障碍向认知正常逆转的研究,为慢性病纵向研究提供方法学借鉴。方法基于多个纵向认知标记物共同代表同一个潜在认知过程的假设,构建多元纵向测量的潜在过程模型,捕捉潜在认知过程随时间的变化轨迹,量化不同纵向认知标记物解释潜在认知过程的贡献,讨论不同认知标记物用以衡量认知功能的敏感性,及其协变量效应。参数估计采用极大似然法,采用残差分析和不同纵向认知标记物解释潜在认知过程所占百分比进行拟合优度评价。结果性别(P=0.004),受教育年限(P=0.002),随访时间(P<0.001)和随访时间的二次方(P<0.001)与潜在认知过程显著相关。性别(P=0.048)与受教育年限(P=0.013)的不同纵向认知标记物之间有统计学差异。残差分析和潜在过程解释纵向测量变异的比例说明模型拟合良好。结论多元纵向数据潜在过程模型在痴呆等慢性病研究中具有很好的应用价值。

关键词：潜在过程纵向数据轻度认知障碍逆转

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多状态Markov模型在阿尔茨海默病自然史中的应用

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中国卫生统计 2024年第2期41卷 227-230,234页

作者：秦瑶韩红娟刘龙陈杜荣王浩基崔靖白文琳余红梅山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室 030001 山西医科大学基础医学院数学教研室山西医科大学公共卫生学院儿少卫生学教研室重大疾病风险评估山西省重点实验室

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)... 详细信息

目的将多状态Markov模型应用于阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)自然史研究,为慢性病自然史研究提供方法学借鉴。方法基于美国公共数据库ADNI,构建正常认知(normal cognition,NC)-轻度认知障碍(mild cognitive impairment,MCI)-AD多状态Markov模型,估计不同状态间的转移强度、转移概率、影响因素和各状态的逗留时间,绘制生存曲线,并进行模型拟合优度评价。结果性别、年龄、FAQ、MMSE、CDRSB、ADAS13、TMT-B-Time是AD自然史中重要的影响因素;NC与MCI状态的平均逗留时间分别为7.502年,11.621年。多状态Markov模型拟合结果较好。结论多状态Markov模型在AD等多状态慢性病转归研究中具有很好的应用价值。

关键词：多状态Markov模型阿尔茨海默病慢性病自然史

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广西壮族人群体脂率与常规肥胖指标的关系及其切点值研究

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中华疾病控制杂志 2024年第8期28卷 937-943,975页

作者：吕芳芳莫彩梅雷立地李金秀韦港杰陆佩妮许雪梅黄泫茜曾小云仇小强刘顺广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室南宁530021 广西南宁市第五人民医院儿童青少年心理科南宁530001 广西医科大学公共卫生学院儿少卫生与妇幼保健教研室南宁530021

目的探讨广西壮族自治区35~<75岁壮族人群体脂率(body fat percentage, BFP)与BMI和腰围(waist circumference, WC)的关系及其肥胖切点值。方法基于2018―2019年广西壮族自治区少数民族自然人群慢性病前瞻性队列的基线调查资料,选... 详细信息

目的探讨广西壮族自治区35~<75岁壮族人群体脂率(body fat percentage, BFP)与BMI和腰围(waist circumference, WC)的关系及其肥胖切点值。方法基于2018―2019年广西壮族自治区少数民族自然人群慢性病前瞻性队列的基线调查资料,选取12 311名壮族人群作为研究对象。通过曲线拟合确定BFP与BMI、WC的曲线关系,利用多元线性回归模型分析BFP的主要影响因素,分别构建BMI、WC预测BPF回归方程以计算BPF的超重和肥胖切点值,以BMI、WC判定标准为金标准计算BFP相应切点值的灵敏度、特异度和受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线下面积(area under curve, AUC)评估其诊断价值。结果 BMI对BFP的预测价值优于WC;基于我国肥胖标准BMI为28 kg/m^(2)计算的BFP肥胖切点值在男性和女性中分别为23.4%和35.6%,AUC分别为0.732和0.847;对应的灵敏度和特异度,男性为0.581和0.882,女性为0.818和0.876。结论在广西壮族自治区人群中,基于我国肥胖标准计算BFP切点值应以BMI为参考,计算出来的切点值在男性中低于国际标准,而以BMI≥30 kg/m^(2)时计算所得切点值均高于国际标准,其合理性还需综合考虑阳性预测值和未来肥胖相关疾病风险的研究进一步予以验证。

关键词：体脂率肥胖壮族人群切点值

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构建与细胞焦亡和坏死性凋亡相关预后模型预测肝癌预后

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现代预防医学 2022年第19期49卷 3621-3626页

作者：赵晓田郝岩陈淑婷成颖沈永梅仇玉兰山西医科大学公共卫生学院卫生毒理学教研室山西医科大学公共卫生学院卫生统计学教研室

目的构建与焦亡和坏死性凋亡相关用于预测肝癌预后的模型。方法通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)获得的肝癌和非肝癌样本RNA测序数据以及相应的临床信息。通过GeneCards数据库检索得到关于焦亡和坏死性凋亡相关基因... 详细信息

目的构建与焦亡和坏死性凋亡相关用于预测肝癌预后的模型。方法通过癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)获得的肝癌和非肝癌样本RNA测序数据以及相应的临床信息。通过GeneCards数据库检索得到关于焦亡和坏死性凋亡相关基因，R包“limma”筛选差异基因，R包“ConsensusClusterPlus”对肝癌进行聚类分型。之后再筛选不同肝癌分型之间的差异基因。基于差异基因，利用LASSO Cox回归筛选基因来构建预后模型。根据中位风险评分将肝癌患者分成高低风险组，两组间进行主成分(Principal Component Analysis, PCA),t分布随机邻域嵌入(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding,t-SNE),总生存时间(Overall Survival, OS)和受试者工作特征曲线(Receiver Operating Characteristic, ROC)分析。结果通过一致性聚类分析将肝癌患者分为C1,C2两种分型，分型的OS高于C2分型的OS且有统计学差异(P<0.001)。筛选两分型间有关焦亡和坏死性凋亡相关差异基因，构建预后模型将肝癌患者分为低、高风险组，两组间OS有显著差异(P<0.001)。对风险评分进行独立预后分析，结果表明风险评分可作为独立因素预测肝癌预后，风险评分越高，肝癌患者预后越差(单因素HR=4.846,95%CI:2.950～7.971;多因素HR=4.227,95%CI:2.499～7.149。结论本研究确定了与焦亡和坏死性凋亡相关的，可以独立预测肝癌患者的预后模型，包含九个基因(CASP8、TREM2、SQSTM1、ADORA1、ADORA2B、PARP1、MKI67、GLMN和POP1)。

关键词：肝癌细胞焦亡坏死性凋亡预后

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