检索结果-内蒙古大学图书馆

中国植保导刊 2021年第2期41卷 5-11页

作者：张琳婉谢佶芹张雪莲王磊岳碧松李静孟杨生物资源与生态环境教育部重点实验室/四川大学生命科学学院/濒危动物繁殖与保护遗传四川省重点实验室四川成都610064

为了鉴定草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)嗅觉受体相关基因,进一步挖掘其在进化与功能上的信息,基于已发表的草地贪夜蛾基因组数据,利用TBLASTN同源搜索的方法从基因组中鉴定得到63条嗅觉受体OR基因,对其进行GO及KEGG功能注释,再与8... 详细信息

为了鉴定草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)嗅觉受体相关基因,进一步挖掘其在进化与功能上的信息,基于已发表的草地贪夜蛾基因组数据,利用TBLASTN同源搜索的方法从基因组中鉴定得到63条嗅觉受体OR基因,对其进行GO及KEGG功能注释,再与8种鳞翅目昆虫的OR基因进行比较分析。结果表明,草地贪夜蛾与甜菜夜蛾(S. exigua)有16条OR在进化树上属同一分支。其中,6条(SfruOR-us2854、SfruOR-chr7.4、SfruOR-chr5.1、SfruORus9235、SfruOR-us6215、SfruOR-chr1.2)可能具有性别特异性;与家蚕性信息素受体BmorOR42属同一支的2条OR(SfruOR-chr5.2、SfruOR-chr17.5)可能具有性信息素识别功能。

关键词：草地贪夜蛾嗅觉受体进化分析

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麝香中脂溶性成分的提取与麝香质量鉴别

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四川动物 2006年第1期25卷 137-141页

作者：吴芬宏高媛岳碧松伍丕娥李静四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室珍稀濒危动物繁殖与保护遗传四川省重点实验室成都610064 四川省药品检验所

采用薄层层析和气相色谱技术,比较了超声、冷浸和热回流3种提取方法及乙醇、乙醚、正己烷3种溶剂对麝香提取液中脂溶性成分及麝香酮含量的影响。结果显示用不同提取方法和溶剂提取的麝香脂溶性成分经薄层层析后均呈现6或7个斑点。而经... 详细信息

采用薄层层析和气相色谱技术,比较了超声、冷浸和热回流3种提取方法及乙醇、乙醚、正己烷3种溶剂对麝香提取液中脂溶性成分及麝香酮含量的影响。结果显示用不同提取方法和溶剂提取的麝香脂溶性成分经薄层层析后均呈现6或7个斑点。而经气相色谱分析,其结果却有较大的差别,麝香乙醚提取液的色谱峰较乙醇和正己烷更丰富,超声提取的效果较冷浸和热回流好,色谱峰达到20个。麝香酮的定量分析显示冷浸法提取的麝香酮含量高于超声和热回流提取。通过薄层层析和气相色谱分析,对10个麝香样品的质量进行了鉴别。

关键词：麝香脂溶性成分提取质量鉴别

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幼年早期和成年大熊猫胰腺组织miRNA初步研究

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四川动物 2022年第2期41卷 121-131页

作者：杨苗孙洁沈富军凌珊珊吴虹林张亮侯蓉黄炎岳碧松张修月四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都610065 成都大熊猫繁育研究基地四川省濒危动物保护生物学重点实验室成都610081 中国大熊猫保护研究中心大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室四川都江堰623006

大熊猫Ailuropoda melanoleuca是独特的食肉目Carnivora动物,幼年早期以母乳为食,成年却严格以竹子为食。为探究microRNA(miRNA)对大熊猫幼年早期及成年营养利用及代谢的调控作用,对2只幼年早期和2只成年大熊猫的胰腺组织进行了small RN... 详细信息

大熊猫Ailuropoda melanoleuca是独特的食肉目Carnivora动物,幼年早期以母乳为食,成年却严格以竹子为食。为探究microRNA(miRNA)对大熊猫幼年早期及成年营养利用及代谢的调控作用,对2只幼年早期和2只成年大熊猫的胰腺组织进行了small RNA测序分析,鉴定了202个保守miRNA和8个新miRNA。保守miRNA差异表达分析中,在成年组中显著上调39个、显著下调38个。成年大熊猫胰腺组织中miR-27a、miR-370和miR-122的差异表达与脂质代谢有关;miR-1上调有利于其氨基酸代谢水平的提高;miR-363、miR-382、miR-494及miR-127下调促进了其能量代谢过程,这些均与mRNA分析结果一致。此外,鉴定出36个仅在幼年早期个体中表达的miRNA,其功能与蛋白质和脂质等大分子化合物的合成有关。这些结果表明,miRNA可能与大熊猫营养利用及代谢调控有关。

关键词：大熊猫胰腺组织 microRNA 消化代谢

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雉科鸟类微卫星位点的开发及应用

雉科鸟类微卫星位点的开发及应用

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：江雪周闯文秦超沈海波岳碧松张修月濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

雉科为鸡形目最大科,共38属159种,目前已有几个物种开展了微卫星的相关研究。本研究利用红腹锦鸡等8种雉科鸟类全基因组,利用软件Candi SSR筛选共有微卫星位点。按Candi SSR初始设置missing rate≤0.5的标准,除去单碱基微卫星位点,我们... 详细信息

雉科为鸡形目最大科,共38属159种,目前已有几个物种开展了微卫星的相关研究。本研究利用红腹锦鸡等8种雉科鸟类全基因组,利用软件Candi SSR筛选共有微卫星位点。按Candi SSR初始设置missing rate≤0.5的标准,除去单碱基微卫星位点,我们共找到2328个微卫星位点,按missing rate=0和重复次数二碱基≥7,三碱基≥5,四碱基≥4的标准筛选出二碱基微卫星位点共55个、三碱基微卫星位点共45个、四碱基微卫星位点共19个,总计119个。在这些位点的侧翼序列设计引物进行PCR条件优化,得到二碱基微卫星位点40个、三碱基微卫星位点30个、四碱基微卫星位点11个,总计81个。将优化后的81对引物在血雉等14种雉类基因组中扩增,筛选到在14个物种中都能扩增的微卫星位点共50个(其中二碱基22个,三碱基19个,四碱基9个)。利用筛选出的50个共有微卫星位点设计荧光引物,分别在四川山鹧鸪种群(21只),四川雉鹑种群(14只),血雉种群中进行扩增(19只),经过基因分型扫描等步骤,最终得到稳定扩增且有多态性的四川山鹧鸪微卫星遗传标记38对,四川雉鹑微卫星遗传标记25对,血雉微卫星遗传标记28对,其中在三种雉的种群中都具有多态性的微卫星遗传标记有13对。由于我们选取的14种雉科鸟类几乎均匀分布在雉科鸟类系统进化树中,因此50个微卫星位点有望成为雉科鸟类通用微卫星位点的潜在标记,对于雉科鸟类种群遗传学研究以及比较分析近缘种的遗传多样性、遗传结构以及野外种群数量调查等具有重要意义。

关键词：雉科鸟类基因组共有微卫星

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中国林蛙多组织转录组差异表达分析

中国林蛙多组织转录组差异表达分析

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：兰月唐瑞祥范振鑫岳碧松濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

中国林蛙(Rana chensinensis)是一种名贵的中药财,有研究证明"林蛙油"和林蛙皮具有多种营养和药用价值,同时其皮肤也是生产多种抗菌肽的良好资源。林蛙油为雌性林蛙膨大的输卵管,是传统滋补品,林蛙皮可直接入药。为了研究林... 详细信息

中国林蛙(Rana chensinensis)是一种名贵的中药财,有研究证明"林蛙油"和林蛙皮具有多种营养和药用价值,同时其皮肤也是生产多种抗菌肽的良好资源。林蛙油为雌性林蛙膨大的输卵管,是传统滋补品,林蛙皮可直接入药。为了研究林蛙不同组织的基因表达以及从基因层面探索林蛙各部位的药用价值,本研究分别对林蛙的输卵管、肠、胃等多个组织共45个样品使用RNA-seq进行了转录组测序,使用De Novo的方式完成了中国林蛙转录组的组装,产生了1,085,532条转录本序列,得到一个较为完整的中国林蛙转录组。功能注释在NR,Swiss-Prot,KEGG,COG和GO等5个公共数据库中分别注释到247,668(22.82%),194,620(17.93%),115,785(10.67%),113,311(10.44%)和12,320(17.49%)条转录本,综合多个数据库结果后共计注释了327,867(30.20%)条转录本。基于表达量比较分析鉴定出输卵管组织与其他组织间共计600多个差异表达基因,这些基因显著富集在了多个与免疫反应相关的GO条目。本研究的中国林蛙多组织基因表达数据为今后林蛙药用价值开发提供了基础数据。

关键词：中国林蛙林蛙油多组织转录组差异表达基因

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林麝嗅觉受体基因亚家族和特异性气味识别

林麝嗅觉受体基因亚家族和特异性气味识别

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：卜平简佐义岳碧松范振鑫濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

嗅觉是哺乳动物的重要感觉器官,动物依赖其寻找食物、避开天敌、寻找配偶以及群体交流等。嗅觉由属于G-蛋白偶联受体超家族的嗅觉受体蛋白(OR)介导,编码嗅觉受体蛋白的基因家族是哺乳动物中最大的多基因家族。林麝(Moschus berezovskii... 详细信息

嗅觉是哺乳动物的重要感觉器官,动物依赖其寻找食物、避开天敌、寻找配偶以及群体交流等。嗅觉由属于G-蛋白偶联受体超家族的嗅觉受体蛋白(OR)介导,编码嗅觉受体蛋白的基因家族是哺乳动物中最大的多基因家族。林麝(Moschus berezovskii)作为典型的晨昏活动型动物,敏锐的嗅觉有利于其捕食和规避风险。为了研究林麝嗅觉受体的基因信息,我们利用本实验室已组装完成的林麝基因组序列,对林麝嗅觉受体进行了详细的生物信息学分析。使用本实验室开发的orfam程序,鉴定出林麝有1378个OR基因,其中完整基因、假基因和片段基因分别为864个、366个、148个,假基因比例约26%;通过聚类分析得出,林麝OR基因可分为Class I和Class II两个类别,进一步通过序列一致性又可分为18个家族和244个亚家族,林麝OR基因家族分化大。对小鼠、人类、犬和林麝的OR蛋白序列进行相似性聚类分析,共聚成551个基因簇,4个物种共享185个基因簇,而林麝特有12个基因簇;但对林麝、牛、牦牛和猪的OR蛋白序列进行相似性聚类分析时,林麝仅有2个特有基因簇。林麝OR基因的潜在识别气味分析得出,林麝偏向于识别花香、木香、青草香和脂类等气味,而特有基因则集中在对薄荷和香菜的识别。本研究首次对林麝嗅觉受体基因家族进行描述,了解林麝嗅觉受体基因家族的分化情况,对理解林麝行为与嗅觉之间的关系提供了数据支持,更有利于林麝保护。

关键词：林麝嗅觉受体特异性气味识别

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中华大蟾蜍多组织差异转录组分析

中华大蟾蜍多组织差异转录组分析

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：唐瑞祥兰月王磊范振鑫岳碧松濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)的皮肤产物蟾酥以及其褪皮而得的蟾衣具有极高的药用价值,现代医学的研究证明了蟾酥和蟾衣内含有多种有效的生物活性成分。蟾酥主要由蟾蜍耳后腺组织分泌,耳后腺作为皮肤组织的主要分泌部位。为了研究蟾蜍... 详细信息

中华大蟾蜍(Bufo gargarizans)的皮肤产物蟾酥以及其褪皮而得的蟾衣具有极高的药用价值,现代医学的研究证明了蟾酥和蟾衣内含有多种有效的生物活性成分。蟾酥主要由蟾蜍耳后腺组织分泌,耳后腺作为皮肤组织的主要分泌部位。为了研究蟾蜍不同组织的基因表达以及探索调控蟾酥分泌的基因表达网络,本研究对一只蟾蜍的肝脏、脾脏、心脏、卵泡、肌肉、腹部皮肤、右耳后腺共7个组织使用RNA-seq进行了转录组测序,使用De Novo的方式完成了中华大蟾蜍转录组的组装,产生了270,017条转录本序列,得到一个较为完整的中华大蟾蜍转录组。功能注释在NR,Swiss-Prot,KEGG,COG和GO这5个公共数据库中共注释到44,976(34.04%),34,984(26.47%),11,896(9.00%),11,292(8.54%)和12,320(9.32%)条转录本,整理后共计注释到47,156 (35.69%)条转录本。基于表达量比较分析,鉴定出在耳后腺组织与其他组织间共计4,092个显著上调基因和246个显著下调基因,这些差异表达基因显著富集在了蛋白质合成、酶的调节、前体物质的代谢合成等通路上,比如鞘糖脂的生物合成通路、核糖体相关通路。其中甾类激素生物合成通路中的HSD11B2、cytochrome P450家族等基因,可能对蟾蜍甾族化合物的合成起到关键作用。

关键词：中华大蟾蜍转录组差异表达基因蟾酥合成调控

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在熊猫血液中与年龄相关的microRNA的差异性表达

在熊猫血液中与年龄相关的microRNA的差异性表达

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第十届全国野生动物生态与资源保护学术研讨会

作者：杨茗羽杜联明范振鑫张修月岳碧松四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室成都 610064 四川大学生命科学学院四川省濒危动物繁殖与保护遗传重点实验室成都 610064

大熊猫基因组早已组装完成,但是还没有关于其microRNA的研究报道.最近有研究表明,microRNA 表达量的改变与年龄及相关疾病有关,比如人类癌症和心血管疾病.本研究通过Solexa深度测序技术测序了四只不同年龄不同性别的大熊猫血液microRNA.

关键词：大熊猫基年龄血液microRNA 新microRNA

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斑秃雄性大熊猫血液转录组分析

斑秃雄性大熊猫血液转录组分析

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：沈海波李才武何鸣吴虹林黄炎范振鑫岳碧松张修月濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院中国大熊猫保护中心生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于食肉目、大熊猫科,是保护生物中的旗舰物种,中国的"国宝"。斑秃是哺乳动物中一种常见的多基因参与的复杂性疾病,在小鼠、恒河猴、北极熊中有均有报道,表现为身体部分区域的毛发稀少和脱毛... 详细信息

大熊猫(Ailuropoda melanoleuca)属于食肉目、大熊猫科,是保护生物中的旗舰物种,中国的"国宝"。斑秃是哺乳动物中一种常见的多基因参与的复杂性疾病,在小鼠、恒河猴、北极熊中有均有报道,表现为身体部分区域的毛发稀少和脱毛、断毛现象。圈养大熊猫中雄性斑秃较常见,通常发生在春夏季繁殖季节。为探究斑秃大熊猫斑秃发生的原因,本研究收集了5只正常大熊猫和5只斑秃大熊猫外周血液,提取总RNA,采用Illumina HiSeq 2000测序,分析差异表达基因,对差异表达基因进行GO功能注释、KEGG通路富集、PPI蛋白互作等生物信息学分析。我们共鉴定了1154个差异表达基因,其中表达上调的803个,表达下调的351个。Wnt10b作为一种毛发生长促进因子,在斑秃大熊猫中显著下调,热休克蛋白HSP90AA1与一些炎症相关基因显著上调。差异基因GO分析显著富集在一些代谢过程条目,KEGG分析显示上调基因显著富集在剪接体通路,下调基因显著富集在人类免疫疾病通路,PPI分析表明差异基因参与一些产热通路。初步结果推测大熊猫斑秃可能与炎症相关的免疫异常有关。

关键词：大熊猫斑秃血液转录组差异表达基因功能富集

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血液转录组揭示大熊猫繁殖周期免疫变化

血液转录组揭示大熊猫繁殖周期免疫变化

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第八届中国西部动物学学术研讨会

作者：吴威吴虹林何鸣耿炀张茜黄炎岳碧松张修月濒危动物繁殖与保护四川省重点实验室四川大学生命科学学院中国大熊猫保护中心生物资源与生态环境教育部重点实验室四川大学生命科学学院

在繁殖周期中,哺乳动物免疫会经历大的改变。本研究基于血液转录组探究大熊猫母兽发情期、妊娠早期、妊娠晚期和哺乳期等4个繁殖时期的免疫变化,并通过构建共表达网络,筛选与状态特有生理相关的潜在分子标记。差异表达分析和蛋白质互作... 详细信息

在繁殖周期中,哺乳动物免疫会经历大的改变。本研究基于血液转录组探究大熊猫母兽发情期、妊娠早期、妊娠晚期和哺乳期等4个繁殖时期的免疫变化,并通过构建共表达网络,筛选与状态特有生理相关的潜在分子标记。差异表达分析和蛋白质互作网络表明,发情期大熊猫先天性免疫及炎症反应增强,IL1B可能在发情期的先天免疫及炎症反应的变化中扮演重要角色,在适应性免疫方面,与T细胞介导的细胞免疫降低,与B细胞介导的体液免疫增强。与人类妊娠期不同,大熊猫在妊娠早期,先天性免疫受到抑制,直到妊娠晚期,与抗病毒、病菌等先天免疫相关基因才显著上调。适应性免疫方面,细胞免疫在妊娠早期可能受到抑制,在妊娠晚期有一定恢复。与对照组相比,我们并未在哺乳期发现免疫相关基因有显著变化,这可能与我们收集样本的时间有关。我们的样本都在哺乳2个月后收集,在免疫方面可能与对照组相差不大。结合WGCNA和差异表达分析,我们共筛选出6个与生理状况显著相关的核心基因。其中,ARG2在大熊猫发情期上调;NOTCH1参与卵泡成熟和胚胎发育,并在整个发情、妊娠期中上调;THAP11和DEAF1已被证明与早期胚胎发育相关,但仅在大熊猫妊娠后期显著上调;SREBP-1c和ZBTB7B在大熊猫妊娠期间可能参与脂质合成和胰岛素抵抗,在妊娠期显著上调,这些基因可以作为妊娠诊断的候选基因。

关键词：大熊猫繁殖周期转录组免疫改变妊娠诊断

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