华南虎(Panthera tigris amoyensis)是唯一仅分布于我国的虎亚种。据历史记载,华南虎的足迹遍布东至东经119°-120°(浙闽边境),西至东经100°左右(青川边境),南至北纬21°-22°(粤桂南端),北至北纬34°-35°(秦岭至黄河一线)之间。然而由于人类活动和五六十年代的"除四害"运动,野生华南虎被大量捕杀,目前野外可能已经灭绝。华南虎与其他虎亚种的生态位重叠较少,携带有虎系统发生树上位于基部的线粒体单倍型,因此华南虎在虎的演化历史中意义重大。由于华南虎野外种群可能已经灭绝,续存希望仅存于圈养群体。华南虎圈养群体均源自6只奠基者,目前共约200只,分散在全国15家动物园和南非1家野化基地。我们于2005年-2009年期间收集了87只华南虎血液样品,这些个体源自所有的华南虎饲养机构,包括所有的华南虎家系,占到了采样期间全部存活个体数量的75%以上。基于与世界虎亚种基准(voucher)样本的比较,我们沿用相同的分子遗传标记系统(VSA,Luo et al.2008:2010a;2010b)分析了华南虎圈养群体的遗传起源与结构。结果显示,目前的华南虎圈养种群存在3种线粒体单倍型:AMO1、COR1和ALT,其中AMO1是华南虎特有的(占比47.54%),COR1也存在于印支虎中(26.30%),ALT是东北虎的线粒体单倍型(14.16%)。根据谱系追踪,AMO1的华南虎线粒体单倍型源自奠基者#7;COR1的华南虎线粒体单倍型源自奠基者#26;而ALT单倍型个体不能追踪到任何奠基者,属于在华南虎饲养过程中由于管理失误导致错配引入的。进一步的微卫星基因型分析显示,华南虎圈养群体主要可以分为2组:第一组其线粒体单倍型以AMO1为主(称为重庆系),第二组其线粒体单倍型以COR1为主(称为苏州系),以及这两组间的混合个体。除此以外,还有18只虎呈现出较高程度的源自其他虎亚种(如孟加拉虎、东北虎和印支虎)的基因渗透,进一步证明了其可能来源于谱系繁育管理的失误,因此我们建议将其排除在华南虎的繁殖和管理以外。遗传特征符合重庆系和苏州系的华南虎均将继续纳入圈养华南虎繁育谱系。在排除了由于繁育管理失误造成其他亚种基因渗入的虎个体之后,基于个体的微卫星进化树和贝叶斯种群遗传结构分析均发现,在所有的虎亚种中,印支虎具有较高的遗传多样性,可以分为多个亚群,华南虎与其中的一个亚群聚在一起,这显示华南虎圈养种群与印支虎具有较近的遗传关系。由于历史上华南虎分布范围非常宽广,覆盖多个生境,最终理清华南虎与印支虎的进化关系,解析华南虎的遗传起源,将依赖于对野生来源的不同分布区的华南虎历史标本的基因组层面的分析。通过将纯种华南虎圈养种群数据与纳入欧洲和北美的东北虎繁育保护计划的圈养东北虎数据(Luo et al.2008)进行比较,我们发现华南虎圈养群体的近交水平显著高于圈养东北虎,但是在平均等位基因数量、期望和观察杂合度等方面二者较为接近。同时,华南虎圈养种群还具有中等水平杂合度(HO=0.441、HE=0.471)。目前该种群幼崽存活率逐年增加,年龄结构呈现金字塔形状,性别比例均衡,仍然具有一定的复壮潜力。建议在现有圈养种群基础上,关注个体的健康状况,从繁殖策略上最大可能地避免近交衰退,提升遗传多样性,以维系华南虎种群续存的最后希望。
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