检索结果-内蒙古大学图书馆

生物工程学报 2025年第5期 2119-2131页

作者：陈楠刘秋颖任树成朱宝利王慕华律娜国家人类基因组北方研究中心/北京诺赛基因组研究中心有限公司中国科学院微生物研究所北京阅微基因技术股份有限公司山西省生物研究院有限公司

肠道微生物参与的色氨酸代谢能够产生多种吲哚衍生物促进人体健康。乳酸杆菌作为有益的肠道细菌,部分菌株已经被开发成为重要的益生菌,但大多数菌株的色氨酸代谢能力仍不明晰。本研究旨在利用基因组学方法,通过分析特定功能基因揭示乳... 详细信息

肠道微生物参与的色氨酸代谢能够产生多种吲哚衍生物促进人体健康。乳酸杆菌作为有益的肠道细菌,部分菌株已经被开发成为重要的益生菌,但大多数菌株的色氨酸代谢能力仍不明晰。本研究旨在利用基因组学方法,通过分析特定功能基因揭示乳酸杆菌色氨酸代谢潜在能力,使快速筛选具备生成特定色氨酸代谢产物能力的菌株成为可能。基于新构建的色氨酸代谢功能基因数据集,分析了从公共数据库下载的我国《可用于食品的菌种名单》中16种2 235株乳酸杆菌基因组序列,结果显示除广布乳杆菌属外,乳酸杆菌菌株具有丰富的色氨酸代谢基因,尤其是吲哚-3乳酸生成相关代谢酶基因,超过92%的菌株具有芳香族氨基酸氨基转移酶(aromatic amino acid aminotransferase,ArAT)、吲哚乳酸脱氢酶(indolelactate dehydrogenase,FLDH)和乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),拷贝数分别为1-11个、1-7个和1-11个,表现出了较高的吲哚-3-乳酸生成潜力。系统发育分析研究了吲哚-3-乳酸生成相关代谢酶ArAT、FLDH和LDH的相似性,结果显示ArAT、FLDH和LDH可以分别聚为3-4个簇,每簇的序列都来自不同菌种的菌株,表明乳酸杆菌的吲哚-3-乳酸生成潜力还受到基因型的影响。本研究通过新构建的色氨酸代谢基因数据集,分析了色氨酸代谢基因尤其是吲哚-3-乳酸代谢基因在乳酸杆菌菌株中的分布和基因的系统发育分析,深入解析了乳酸杆菌色氨酸代谢特征,为利用基因组学方法开发功能菌株提供了理论基础和筛选方法。

关键词：色氨酸代谢乳酸杆菌吲哚-3-乳酸基因组学特异性

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中医理论在拇外翻家系基因研究中的应用

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中医杂志 2016年第20期57卷 1741-1745页

作者：王朝鲁周玉娟温建民李秉珅孙卫东蒋科卫刘博杜楠梁朝中国中医科学院望京医院国家人类基因组北方研究中心北京诺赛基因组研究中心有限公司

目的对家族性拇外翻相关基因进行初步定位,为中医治疗拇外翻提供理论依据。方法通过流行病学调查,确定该病遗传因素群体的诊断指标,收集目前已知样本量最大的一个足拇趾外翻家系样本,对其进行全基因组扫描和连锁分析,并对这些区域包含... 详细信息

目的对家族性拇外翻相关基因进行初步定位,为中医治疗拇外翻提供理论依据。方法通过流行病学调查,确定该病遗传因素群体的诊断指标,收集目前已知样本量最大的一个足拇趾外翻家系样本,对其进行全基因组扫描和连锁分析,并对这些区域包含的基因的特点进行分析。结果找到6个相关的染色体区域,多是与骨骼和肌肉发育相关的基因,这些基因的表达会受到益肾填精、补钙壮骨中药复方的影响。结论本研究结果为进一步研究足拇趾外翻分子遗传机理提供最直观的依据,也为中医诊治拇外翻提供基因分子水平的佐证。

关键词：足拇趾外翻全基因组扫描连锁分析基因定位

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中药络石藤及其习用品的DNA条形码鉴定

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世界科学技术-中医药现代化 2016年第8期18卷 1413-1418页

作者：宫璐黄志海张靖白俊其苏贺张晓柠徐文广州中医药大学第二临床医学院广州510006 国家人类基因组北方研究中心/北京诺赛基因组研究中心有限公司/基因组学研究北京市重点实验室北京100176

目的:本研究应用ITS2序列鉴定区分络石藤及其习用品广东络石藤、地瓜藤、薜荔藤和扶芳藤。方法:提取以上5种中药基原植物基因组DNA,扩增不同样品的ITS2序列。采用隐马尔科夫模型HMMer进行序列注释,Clustal W法进行序列比对,K2P模型计算... 详细信息

目的:本研究应用ITS2序列鉴定区分络石藤及其习用品广东络石藤、地瓜藤、薜荔藤和扶芳藤。方法:提取以上5种中药基原植物基因组DNA,扩增不同样品的ITS2序列。采用隐马尔科夫模型HMMer进行序列注释,Clustal W法进行序列比对,K2P模型计算种内和种间遗传距离分析,邻接法和最大似然法构建进化树。结果:5个物种的ITS2序列长度各不相同,在220-243 bp之间。遗传距离分析显示,5个物种的最大种内遗传距离为0.038,最小种间遗传距离为0.113,最大种内遗传距离大于最小种间遗传距离。同时5个物种可以在进化树上区分开来。结论:ITS2序列可以用于中药络石藤及其习用品的分子鉴定,为准确区分该类药材提供新的技术手段。

关键词：络石藤鉴定 ITS2 条形码

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聋病发生的分子机制与防控预警的系统研究

聋病发生的分子机制与防控预警的系统研究

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作者：韩东一管敏鑫王秋菊戴朴袁慧军杨伟炎沈岩赵辉杨仕明赵立东中国人民解放军总医院北京诺赛基因组研究中心有限公司(国家人类基因组北方研究中心)

这项科研成果的取得，是从临床上找问题，从基础研究上解决问题，是临床和基础研究不断良性互动的结果。在国际上首次提出和证明了一种新的耳聋遗传方式，即Y-连锁遗传的存在，丰富了遗传性耳聋的理论内容。研究还成功发现了一个X-连锁... 详细信息

标准号: 0900640211

这项科研成果的取得，是从临床上找问题，从基础研究上解决问题，是临床和基础研究不断良性互动的结果。在国际上首次提出和证明了一种新的耳聋遗传方式，即Y-连锁遗传的存在，丰富了遗传性耳聋的理论内容。研究还成功发现了一个X-连锁先天性聋哑家系致病基因POU3F4的新突变，破解了困扰该家族近百年的聋哑之谜；成功地对氨基糖苷类药物致聋的分子机理进行了系统研究，在国际上首次发现和阐明了线粒体12SrRNA C1494T的新突变，是家系成员接触氨基糖苷类药物超敏致聋的新分子机理；在国内率先开展了覆盖全国的聋病分子流行病学调查，成功完成了中国聋病易感基因热点突变图谱的绘制工作。

关键词：聋病发生分子机制遗传性耳聋氨基糖苷类药物聋病分子流行病学调查

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应用ITS2条形码鉴定岭南药材余甘子及其混淆中药品种

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世界科学技术-中医药现代化 2016年第8期18卷 1419-1423页

作者：黄辉庆黄志海黄娟张靖张晓柠丘小惠广州中医药大学第二临床医学院广州510006 国家人类基因组北方研究中心/北京诺赛基因组研究中心有限公司/基因组学研究北京市重点实验室北京100176

目的:本研究应用ITS2序列作为DNA条形码,建立余甘子及其混淆品分子鉴定方法。方法:收集8种共17份余甘子及其混淆品植物样本,提取基因组DNA,扩增ITS2基因并双向测序。所得序列采用Codon Code Aligner进行拼接,同时,从Gen Bank数据库中获... 详细信息

目的:本研究应用ITS2序列作为DNA条形码,建立余甘子及其混淆品分子鉴定方法。方法:收集8种共17份余甘子及其混淆品植物样本,提取基因组DNA,扩增ITS2基因并双向测序。所得序列采用Codon Code Aligner进行拼接,同时,从Gen Bank数据库中获3条相关ITS2序列用于比较分析。利用MEGA 6.06软件分析其种内及种间遗传距离,并构建系统进化树。结果:余甘子ITS2序列长度为208 bp,与其他各物种种间变异位点较多,遗传距离较大,为0.174-0.823。聚类树结果显示,余甘子基原植物独聚一支,与其他混淆品能够容易区分。结论:本研究采用ITS2序列能够有效鉴别余甘子及其混淆品基原植物,可为保证临床用药真实安全提供技术支撑。

关键词：余甘子 ITS2序列分子鉴定 DNA条形码

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儿茶酚胺-氧位-甲基转移酶及单胺氧化酶B基因多态性与帕金森病剂末现象及异动症的关联性研究

儿茶酚胺-氧位-甲基转移酶及单胺氧化酶B基因多态性与帕金森病剂...

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中华医学会第十六次全国神经病学学术会议

作者：郝宏莹邵明陈楚霜陈彪冯秀丽谢淑中国帕金森病研究协作组广州医科大学附属第一医院神经内科四川省八一康复中心(四川省康复医院) 首都医科大学宣武医院神经内科国家人类基因组北方研究中心(北京诺赛基因组研究中心有限公司)

目的:探究儿茶酚胺-氧位-甲基转移酶(COMT)及单胺氧化酶B(MAO-B)基因多态性与中国帕金森病患者剂末现象和异动症的关联性.方法:应用DNA自动测序仪采用sanger法检测了由中国帕金森病研究协作组收集的多中心1087例帕金森病人COMT和MAO-B...

目的:探究儿茶酚胺-氧位-甲基转移酶(COMT)及单胺氧化酶B(MAO-B)基因多态性与中国帕金森病患者剂末现象和异动症的关联性.方法:应用DNA自动测序仪采用sanger法检测了由中国帕金森病研究协作组收集的多中心1087例帕金森病人COMT和MAO-B基因型,用X2检验及Fisher精确概率法分析比较各基因型与帕金森病人剂末现象及异动症的关系,并利用二分类Logistic回归分析筛选帕金森病剂末现象及异动症的危险因素.

关键词：

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用于预测2型糖尿病易感性的试剂盒及引物

用于预测2型糖尿病易感性的试剂盒及引物

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