检索结果-内蒙古大学图书馆

中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 913-922页

作者：黄健国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

肝细胞癌是原发性肝癌的主要类型,也是恶性程度最高的肿瘤之一.目前人们对肝癌的发病机制并不十分清楚.研究表明,由遗传学和表观遗传学改变引起的原癌基因的活化和抑癌基因的灭活而引起细胞恶性改变是肿瘤发生的核心生物学过程.过去人... 详细信息

肝细胞癌是原发性肝癌的主要类型,也是恶性程度最高的肿瘤之一.目前人们对肝癌的发病机制并不十分清楚.研究表明,由遗传学和表观遗传学改变引起的原癌基因的活化和抑癌基因的灭活而引起细胞恶性改变是肿瘤发生的核心生物学过程.过去人们普遍认为遗传学上的基因突变是肿瘤发病机制中的关键事件,尤其是抑癌基因的体细胞突变与肿瘤的发生有着密切的关系.但是,近年来随着对肿瘤认识的深入,人们发现DNA序列以外的调控机制(即表观遗传学)异常在肿瘤的发生、发展过程中也起到非常重要的作用.表观遗传学机制包括:DNA甲基化修饰,组蛋白修饰,非编码RNAs(包括microRNA),染色质重塑等.其中,DNA甲基化和microRNA与肝癌发生的关系是得到最为深入研究的表观遗传学机制.本文将结合本课题组的研究重点,综述DNA甲基化和microRNA在肝癌研究中的进展.

关键词：肿瘤肝癌表观遗传学 DNA甲基化 microRNA

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基因组分型技术的发展和应用

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 900-906页

作者：施锦绣王莹黄薇国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

伴随着人类基因组计划、人类单倍型图谱和人类拷贝数变异图谱的完成,基因分型技术获得了长足的发展,同时促进了对复杂性状疾病的研究.本文结合国家人类基因组南方研究中心的发展和研究项目,介绍了目前国际上广泛应用的几种基因分型技术... 详细信息

伴随着人类基因组计划、人类单倍型图谱和人类拷贝数变异图谱的完成,基因分型技术获得了长足的发展,同时促进了对复杂性状疾病的研究.本文结合国家人类基因组南方研究中心的发展和研究项目,介绍了目前国际上广泛应用的几种基因分型技术,及国内外复杂性状疾病遗传研究的突破和进展.

关键词：单核苷酸多态性拷贝数变异复杂性状疾病

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肝癌基因组学研究进展

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 907-912页

作者：韩泽广国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

在肝癌发生发展过程中,体细胞积累一些关键的遗传学变异.这些改变可以分为两类:第一类是与肝癌病因学密切相关的遗传学改变,包括乙型肝炎病毒(HBV)感染后的DNA插入整合,黄曲霉毒素B1暴露后引起的抑癌基因p53基因249位氨基酸突变等.第二... 详细信息

在肝癌发生发展过程中,体细胞积累一些关键的遗传学变异.这些改变可以分为两类:第一类是与肝癌病因学密切相关的遗传学改变,包括乙型肝炎病毒(HBV)感染后的DNA插入整合,黄曲霉毒素B1暴露后引起的抑癌基因p53基因249位氨基酸突变等.第二类遗传学改变属于继发性,如染色体的扩增与缺失,p53其他位点突变,Wnt/β-catenin信号途径因突变后活化等;携带这些遗传学变异的肿瘤细胞经进化选择后成为优势克隆.另外,肝癌易感基因鉴定是值得关注的重要方面.本文将就肝癌发生所涉及的基因组变异进行综述.

关键词：肝细胞癌染色体不稳定性基因突变癌基因抑癌基因

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基因组学在中国--从计划到实践的10年

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 879-881页

作者：陈竺赵国屏上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室国家人类基因组南方研究中心

在国家人类基因组南方研究中心成立10周年之际，我们集中发表一些与基因组研究相关的综述．抛砖引玉，为的是集思广益，探索基因组学今后在中国的发展方向和趋势．

关键词：基因组学中国人类基因组二倍体作物

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基因芯片与高通量DNA测序技术前景分析

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 891-899页

作者：滕晓坤肖华胜生物芯片上海国家工程研究中心上海201203 国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

基因芯片与第二代DNA测序是两种重要的高通量基因组学研究技术,对于揭示基因组的结构与功能已经并正在发挥重要的推动作用.基因芯片技术建立了10多年,技术日渐成熟,在功能基因组、系统生物学、药物基因组的研究中已经得到了广泛的应用.2... 详细信息

基因芯片与第二代DNA测序是两种重要的高通量基因组学研究技术,对于揭示基因组的结构与功能已经并正在发挥重要的推动作用.基因芯片技术建立了10多年,技术日渐成熟,在功能基因组、系统生物学、药物基因组的研究中已经得到了广泛的应用.2003年,454公司首先建立了高通量的第二代测序技术,其他公司相继推出了Solexa和Solid测序技术.虽然第二代测序技术建立的时间不长,但发展非常快,已经应用于基因组,包括测序和表观基因组学以及功能基因组学研究的许多方面.本文简要综述了基因芯片和第二代测序技术及其应用进展,并分析了这两种高通量基因组学技术的前景.

关键词：基因芯片第二代高通量测序技术基因组

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中国基因组生物信息学回顾与展望

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 882-890页

作者：顾坚磊周雁复旦大学生命科学学院上海200433 国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

基因组生物信息学是随着大规模基因组测序而兴起的一门交叉学科,其研究对象是基因组数据.因此,对基因组数据的各方面的深入了解,有助于把握基因组生物信息学的来龙去脉.本文从基因组数据展开,围绕着这些数据的收集、储存、分析和比较,... 详细信息

基因组生物信息学是随着大规模基因组测序而兴起的一门交叉学科,其研究对象是基因组数据.因此,对基因组数据的各方面的深入了解,有助于把握基因组生物信息学的来龙去脉.本文从基因组数据展开,围绕着这些数据的收集、储存、分析和比较,分别列举了相关的数据库、算法和软件包.今天,由新一代测序技术所带来的对数据处理、算法设计和功能信息挖掘等技术和研究方面的挑战,应该及时得到充分的重视.

关键词：基因组学生物信息学新一代测序技术

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HBx基因转染对Huh7细胞中基因转录的影响

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肿瘤 2008年第4期28卷 282-287页

作者：章莉郑大利黄健韩泽广华东理工大学生物工程学院生物化学系上海200237 上海市疾病与健康基因组学实验室-省部共建国家重点实验室培育基地国家人类基因组南方研究中心

目的:研究HBx基因对肝癌细胞Huh7中基因表达的影响,为探讨HBx在肝癌发生发展中的分子机制提供依据。方法:以pcDNA3.1b质粒为载体,将HBx转入Huh7细胞中,同时将pcDNA3.1b作空白对照。用Western印迹法证实基因转染成功。应用Affymetrix公... 详细信息

目的:研究HBx基因对肝癌细胞Huh7中基因表达的影响,为探讨HBx在肝癌发生发展中的分子机制提供依据。方法:以pcDNA3.1b质粒为载体,将HBx转入Huh7细胞中,同时将pcDNA3.1b作空白对照。用Western印迹法证实基因转染成功。应用Affymetrix公司的人类全基因组寡核苷酸基因芯片分析转染HBx基因前后,Huh7细胞的基因表达谱。随机选择转染前后有明显差异的6个基因(3个上调,3个下调),用荧光定量PCR技术进行验证。结果:从基因芯片结果分析中发现,与对照组相比,HBx转染后Huh7细胞中明显上调的基因有88个,下调的基因有111个,这些差异基因的功能涉及多个方面。结论:HBx基因对肝癌细胞的影响是双向的,既有转录激活的作用,同时又有转录抑制的功能。这些数据对于理解HBx基因在肝癌发生发展中的作用具有重要的参考意义。

关键词：癌肝细胞转录激活因子类寡核苷酸序列分析 HBx基因

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基因组学时代的免疫学研究

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中国科学（C辑） 2008年第10期38卷 923-929页

作者：李昊文王颖上海交通大学医学院、上海市免疫学研究所/医学科学研究院上海200025 国家人类基因组南方研究中心、上海市-科技部共建疾病与健康基因组学重点实验室上海201203

基因组学的研究成果为现代免疫学的发展提供了新的研究思路和策略.本文概述了基础免疫学、与疾病相关的免疫病理学及免疫疫苗的设计在高通量和大规模的基因组学研究策略支撑下获得的新进展,并探讨了其未来可能的发展方向.

关键词：基因组学免疫学免疫病理学疫苗设计

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肝癌相关基因DLK1转基因小鼠的构建与鉴定

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中华消化杂志 2008年第5期28卷 310-313页

作者：黄丽钰王克生韩泽广张新上海交通大学医学院附属瑞金医院血液病研究所 200025 上海市疾病与健康基因组学实验室-省部共建国家重点实验室培育基地国家人类基因组南方研究中心

目的构建并鉴定肝脏特异性表达的DLKl转基因小鼠.方法通过基因重组方法,将小鼠DLK1 cDNA片段置于小鼠白蛋白基因增强子和启动子序列下游,构建肝脏特异性表达的DLKl重组质粒,酶切重组质粒得到转基因片段,转基因在体外进行表达鉴定后,... 详细信息

目的构建并鉴定肝脏特异性表达的DLKl转基因小鼠.方法通过基因重组方法,将小鼠DLK1 cDNA片段置于小鼠白蛋白基因增强子和启动子序列下游,构建肝脏特异性表达的DLKl重组质粒,酶切重组质粒得到转基因片段,转基因在体外进行表达鉴定后,显微注射获得DLK1转基因首建小鼠,对首建小鼠进行传代,利用F1代小鼠进行DLK1转基因表达的鉴定.结果逆转录(RT)-PCR和细胞免疫荧光显示,转基因DLK1片段可在小鼠肝癌细胞系Hep1-6中表达.RT-PCR和免疫组化结果显示,DLK1在F1代成年转基因小鼠肝脏中特异性表达.结论成功构建了肝脏特异性表达的DLK1转基因小鼠.

关键词：肝肿瘤基因表达鼠,转基因

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肝细胞癌中转录因子E2F7对Wnt/β-catenin信号通路活性的影响

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中国生物化学与分子生物学报 2014年第6期30卷 565-570页

作者：翟杨杨卢大儒韩泽广邓庆复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室现代人类学教育部重点实验室上海200433 上海市疾病与健康基因组学实验室-省部共建国家重点实验室培育基地国家人类基因组南方研究中心上海201203

探讨肝细胞癌(HCC)中非典型性E2F家族成员E2F7在肝癌细胞生长、分化中的作用及可能涉及的分子机制.本研究运用实时荧光定量PCR检测38例原发性肝细胞癌及对应的癌旁组织中E2F7基因mRNA的表达情况;分别通过基因过表达和RNA干扰技术上调或... 详细信息

探讨肝细胞癌(HCC)中非典型性E2F家族成员E2F7在肝癌细胞生长、分化中的作用及可能涉及的分子机制.本研究运用实时荧光定量PCR检测38例原发性肝细胞癌及对应的癌旁组织中E2F7基因mRNA的表达情况;分别通过基因过表达和RNA干扰技术上调或下调E2F7基因表达,并运用实时荧光定量PCR和Western印迹检测肝癌细胞株MHCC-H中β-catenin及其靶基因cmyc的表达情况;双荧光素酶报告基因系统检测E2F7对Wnt/β-catenin信号通路活性的影响;核浆分离实验检测过表达E2F7基因对β-catenin入核的影响;免疫共沉淀实验检测异位表达E2F7与内源β-catenin的相互作用.结果显示,肝细胞癌组织中E2F7基因的表达量显著高于相应的癌旁组织(P<0.001);转录因子E2F7可与β-catenin相互作用并促进β-catenin进入细胞核.转录因子E2F7可以促进Wnt/β-catenin信号通路的活性.

关键词：转录因子E2F7 肝细胞癌 Wnt β-catenin信号通路

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