目的采用成簇的规律性间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)系统构建基因敲除细胞文库,以人结肠腺癌细胞Caco-2为研究对象构建稳定...
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目的采用成簇的规律性间隔短回文重复序列及其相关蛋白9(clustered regulatory interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9,CRISPR/Cas9)系统构建基因敲除细胞文库,以人结肠腺癌细胞Caco-2为研究对象构建稳定表达Cas9蛋白的细胞系。方法包装重组Cas9慢病毒并感染Caco-2细胞,经杀稻瘟菌素及2次有限稀释法筛选Caco-2/Cas9单克隆细胞,并进行PCR和Western blot鉴定。用同时表达GFP和带有GFP向导RNA(single guide RNA,sgRNA)的慢病毒感染Caco-2/Cas9单克隆细胞,经嘌呤霉素筛选后,采用流式细胞术检测结果计算Caco-2细胞株的敲除效率,CCK-8法检测其细胞增殖活性。结果共获得5株Caco-2/Cas9单克隆细胞系,分别命名为Caco-2/Cas9-2、Caco-2/Cas9-3、Caco-2/Cas9-4、Caco-2/Cas9-5和Caco-2/Cas9-6,均可扩增出392 bp的Cas9基因条带,Cas9蛋白在细胞中稳定表达,敲除效率分别为91.27%、20.30%、24.13%、11.33%、12.27%、8.89%;Caco-2/Cas9-4、Caco-2/Cas9-5、Caco-2/Cas9-63株单克隆细胞及未感染Caco-2细胞的增殖活性分别为2.07、1.75、1.46和1.40。Caco-2/Cas9-5、Caco-2/Cas9-6单克隆细胞与未感染Caco-2细胞比较,差异均无统计学意义(t分别为1.92和0.37,P均>0.05)。结论筛选出1株具有Cas9高酶切活性且细胞增殖活性较未感染Caco-2细胞无显著变化的Caco-2/Cas9单克隆细胞系,即Caco-2/Cas9-6单克隆细胞,为进一步构建高覆盖率敲除细胞文库奠定了基础,也为筛选病毒感染有关基因和其他特定功能基因提供了平台。
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