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国际病毒学杂志 2024年第1期31卷 17-21页

作者：车如意周杰英范佳欣唐晓苹董梦洁熊光萍孙晓曼王宏章青庞立丽孔翔羽李丹地传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所、国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 郴州市第一人民医院 423000

目的研究一株G4P[6]基因型A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)CZ079的全基因组特征及进化规律.方法利用逆转录-聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)对CZ079的VP7、VP4、VP6、NSP1节段分别进行RT-PCR扩增,通过在线RVA自动分型工具对其分型,采用DNAstar5.1和Mega 11.0软件对各节段进行同源性及遗传进化分析.结果CZ079毒株基因型为G4-P[6]-I5-R ***6为I5型,NSP1为A8型.CZ079与LLR^(TM)、RotaTeq^(TM)和Rotarix^(TM)三种疫苗株在VP7的抗原表位中7-1b区域均存在氨基酸差异;VP4蛋白裂解后的VP8*抗原表位中8-1、8-2、8-3、8-4、5-1区域存在较大差异.结论2022年RVA毒株CZ079为罕见的G4P[6]-I5-A8型,推测该基因型RVA是由越南等东南亚地区传入中国,与中国RVA发生重配产生的新型重配毒株.

关键词： A组轮状病毒基因型重配株全基因组抗原表位

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引起2017年兰州市一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的CV-A2的基因特征分析

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病毒学报 2024年第3期40卷 574-579页

作者：陈建华于德山武海卓赵哲赵晓虹张勇张晓曙甘肃省疾病预防控制中心甘肃省传染病病原学重点实验室兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法... 详细信息

为了解引起2017年10月甘肃省兰州市一起疱疹性咽峡炎(Herpangina,HA)暴发疫情的致病病原体及其病原学特征,对采集的患儿的37份咽拭子样本开展病毒分离培养,然后对分离到的毒株采取一代测序获取VP1区全长核苷酸序列,根据分子定型的方法进行肠道病毒型别鉴定。根据VP1区核苷酸差异选择3个毒株进行二代测序,获取全基因组序列。使用MEGA软件(版本号11.0)进行病毒的核苷酸,氨基酸相似性分析,VP1区的氨基酸突变位点分析,并构建系统发育树,使用Simplot(版本号3.5.1)软件进行病毒重组分析。本次疫情中分离到的毒株鉴定为柯萨奇病毒A2型(Coxsackievirus A 2, CV-A2),分子分型显示属于D基因型,且VP1区第102位氨基酸发生了丙氨酸到甘氨酸(A102G)的突变,与省内2014-2015年分离到的两株CV-A2毒株在该位置的突变不同。重组分析发现,病毒在P2区和P3区发生了以CV-A4为主的重组事件。本次疫情的致病病原体CV-A2存在着VP1区氨基酸A102G的特征性变异及P2区和P3区的重组,需要加强对肠道病毒的变异和重组的监测和研究,以提升预警能力。

关键词：疱疹性咽峡炎柯萨奇病毒A2型基因组特征性突变重组变异分子流行病学

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青海省风疹病毒分离株基因特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第6期34卷 616-620页

作者：李崇亥汪春翔赵生仓王晓彤周青朱贞范丽霞青海省疾病预防控制中心西宁810007 化隆县疾病预防控制中心 810900 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

目的了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)基因型及基因特征。方法 2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本,经核酸检测和病毒分离后,扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列,即E1基因的739个核苷酸片段,然... 详细信息

目的了解青海省流行风疹病毒(Rubella virus,RV)基因型及基因特征。方法 2010年和2019年分别采集2个市州疑似风疹病例的咽拭子标本,经核酸检测和病毒分离后,扩增并测定阳性病毒分离株基因分型靶基因序列,即E1基因的739个核苷酸片段,然后与世界卫生组织(World Health Organization, WHO)推荐的13个基因型的32株参考株序列进行比对以确定基因型别,同时与我国其他省份流行RV株序列进行基因亲缘性关系分析。结果本研究分离获得4株RV病毒株,经基因亲缘性关系分析显示,这些病毒株分属于1E-Cluster A基因亚型和2B-Cluster C基因亚型,与我国同期其他省份RV流行趋势基本一致。青海省4株病毒株在氨基酸水平高度保守,但也存在地区特异性的突变位点。结论本研究为青海省风疹防控策略的制定提供了一定的实验室数据。

关键词：青海省风疹病毒 1E基因型 2B基因型

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人诺如病毒感染引起的急性胃肠炎流行特征及其影响因素的研究进展

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病毒学报 2024年第1期40卷 140-150页

作者：谢迪何莲花刘晖李金松成都康华生物制品股份有限公司成都610100 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000

人诺如病毒(Human norovirus, HuNoV)属于杯状病毒科诺如病毒属,为无包膜单股正链RNA病毒,易发生重组,变异快,传染性强,致病剂量低;人群普遍易感,是全球急性胃肠炎(Acute gastroenteritis, AGE)的主要病因之一。HuNoV感染后,≤5岁儿童和... 详细信息

人诺如病毒(Human norovirus, HuNoV)属于杯状病毒科诺如病毒属,为无包膜单股正链RNA病毒,易发生重组,变异快,传染性强,致病剂量低;人群普遍易感,是全球急性胃肠炎(Acute gastroenteritis, AGE)的主要病因之一。HuNoV感染后,≤5岁儿童和>65岁老年人群中少数人会因大量失水导致电解质紊乱等重症,甚至死亡。HuNoV还易在封闭和/或半封闭人群拥挤的场所引起AGE暴发;新的变异株或/和型别出现,会导致暴发事件大幅升高,甚至出现大流行。因此,HuNoV导致了沉重的疾病负担,是全球性的公共卫生问题。本文综述了全球HuNoV AGE的流行病学研究进展,还从宿主、病毒和环境等多个方面综述了当前影响HuNoV AGE流行特征的主要影响因素,为HuNoV AGE的防控提供支撑。

关键词：人诺如病毒急性胃肠炎流行特征影响因素

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中国2015年麻疹风疹实验室网络运转与评价

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中国疫苗和免疫 2017年第2期23卷 157-161页

作者：王慧玲毛乃颖任丽高凌玉朱贞许松涛崔爱利张燕许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生和计划生育委员会医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区麻疹参比实验室北京102206

目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)2015年麻疹风疹实验室网络(Measles/rubella laboratory network,MRLN)的运转状况。方法采用描述流行病学方法分析2015年中国麻疹监测信息报告管理系统中的实验室数据和全国MRLN监... 详细信息

目的评价中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)2015年麻疹风疹实验室网络(Measles/rubella laboratory network,MRLN)的运转状况。方法采用描述流行病学方法分析2015年中国麻疹监测信息报告管理系统中的实验室数据和全国MRLN监测数据,评价中国MRLN运转的各项指标。结果 2015年全国共报告监测病例104 948例,其中麻疹病例42 382例,40 717例(96.07%)为实验室确诊病例;风疹病例8 143例,6 324例(77.66%)为实验室确诊病例。共报告暴发疫情400起,其中麻疹暴发329起,风疹暴发31起。共采集散发监测病例血标本90 305例,标本采集率97.47%;麻疹、风疹IgM检测阳性率分别为38.75%、6.30%。共采集散发监测病例病原学标本45 032例,标本采集率48.60%;麻疹、风疹病毒核酸检测阳性率分别为35.74%、5.43%。29个省级麻疹风疹室验室(Measles/rubella laboratory,MRL)共送检麻疹病毒3 967株,其中D_9基因亚型1株、A基因型(疫苗相关株)16株、中国本土流行的H_(1a)基因亚型3 950株。16个省级MRL共送检风疹病毒316株,其中1E基因型4株、2B基因型312株。国家MRL和32个省级MRL全部通过2015年世界卫生组织的职能考核。结论中国2015年MRLN运转良好,证实本土麻疹基因型H1仍在持续循环流行,为中国消除麻疹奠定了良好的实验室网络技术支撑。

关键词：麻疹风疹实验室网络血清学检测核酸检测病毒学监测质量控制

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中国2017-2019年<15岁儿童急性弛缓性麻痹病例监测

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中国疫苗和免疫 2021年第2期27卷 152-156,172页

作者：杨宏樊春祥祝双利王富珍李媛秋唐林温宁中国疾病预防控制中心免疫规划中心北京100050 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室/世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室北京102206

目的评价中国2017-2019年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测质量和维持无脊髓灰质炎(脊灰)状态。方法通过中国AFP病例监测信息管理系统收集2017-2019年AFP病例信息,进行描述性流行病学分析。结果中国2017年、2018年... 详细信息

目的评价中国2017-2019年急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例监测质量和维持无脊髓灰质炎(脊灰)状态。方法通过中国AFP病例监测信息管理系统收集2017-2019年AFP病例信息,进行描述性流行病学分析。结果中国2017年、2018年和2019年<15岁儿童非脊灰AFP病例报告发生率分别为2.33/10万(5278例)、2.31/10万(5292例)和2.23/10万(5183例),合格粪便标本采集率分别为92.71%、92.10%和92.34%。各年AFP病例中脊灰疫苗全程免疫分别占93.99%、95.63%和95.76%。2017-2019年未检出脊灰野病毒。2017年河南省和山东省、2018年江苏省、2019年四川省和吉林省检出疫苗衍生脊灰病毒。结论中国2017-2019年AFP病例监测系统保持高质量运转,继续维持无脊灰状态。

关键词：脊髓灰质炎急性弛缓性麻痹监测

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中国2016年麻疹风疹实验室网络运转分析

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中国疫苗和免疫 2017年第3期23卷 241-245页

作者：王慧玲毛乃颖高凌玉朱贞许松涛崔爱利张燕许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生和计划生育委员会医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区麻疹参比实验室北京102206

目的通过对中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)2016年麻疹风疹实验室网络(Measles/rubella laboratory network,MRLN)运转状况的分析和评估,为中国消除麻疹和控制风疹提供实验室依据。方法采用描述流行病学方法分析2016年中国... 详细信息

目的通过对中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区)2016年麻疹风疹实验室网络(Measles/rubella laboratory network,MRLN)运转状况的分析和评估,为中国消除麻疹和控制风疹提供实验室依据。方法采用描述流行病学方法分析2016年中国麻疹监测信息报告管理系统中的实验室数据和全国MRLN监测数据,评价中国MRLN运转的各项指标。结果 2016年全国报告监测病例69 288例,其中散发病例63 211例,散发病例的血清和病原学标本采集率分别为96.25%、48.27%。麻疹、风疹Ig M检测阳性率分别为34.46%(22 276/64 637)、5.71%(3 646/63 828)。麻疹、风疹病毒核酸检测阳性率分别为32.54%(8 580/26 368)、4.16%(1 081/26 005)。29个省级麻疹风疹实验室(Measles/rubella laboratory,MRL)共送检麻疹病毒2 461株,其中D8基因型3株、A基因型(疫苗相关株)10株、H_(1a)基因亚型(中国本土流行优势株)2 448株;17个省级MRL共送检风疹病毒126株,其中1E基因型6株、2B基因型120株。国家麻疹风疹实验室(National measles/rubella laboratory,NMRL)作为世界卫生组织(WHO)西太平洋区麻疹风疹参比实验室通过了2016年WHO的血清和分子职能考核;6个省级MRL通过了WHO专家组的现场认证;所有省级MRL通过了WHO和NMRL组织的血清职能考核。结论 2016年中国MRLN运转良好,为麻疹消除和风疹控制提供了强有力的实验室科技支撑。

关键词：麻疹风疹实验室网络血清学检测核酸检测病毒学监测质量控制

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人肠道类器官培养在诺如病毒和轮状病毒感染研究中的应用

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国际病毒学杂志 2024年第5期31卷 437-440页

作者：王怡鹏庞立丽段招军甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730000 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

人诺如病毒(human norovirus,HuNoV)和轮状病毒(human rotavirus,HRV)感染是引起人类急性胃肠炎的主要病因,为全球造成巨大的疾病负担.病毒的分离培养对研究病毒感染特性、与宿主免疫反应相互作用机制和制定防治策略至关重要.人肠道类器... 详细信息

人诺如病毒(human norovirus,HuNoV)和轮状病毒(human rotavirus,HRV)感染是引起人类急性胃肠炎的主要病因,为全球造成巨大的疾病负担.病毒的分离培养对研究病毒感染特性、与宿主免疫反应相互作用机制和制定防治策略至关重要.人肠道类器官(human intestinal enteroids,HIEs/human intesinal organoids,HIOs)体外三维培养体系的建立与发展为HuNoV和HRV的分子生物学机制研究提供了重要的平台.本文综述了HIEs/HIOs培养在HuNoV和HRV感染研究中的应用,为利用肠道类器官对胃肠炎病毒的深入研究提供参考.

关键词：肠道类器官诺如病毒轮状病毒

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2015~2018年柯萨奇病毒A组6型在黑龙江省的持续流行

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病毒学报 2020年第2期36卷 201-206页

作者：张曼陈淑红张勇宋洋许军孙巍杨明韩振志肖金波路环环许文波刘志军杨倩潍坊医学院潍坊261053 黑龙江省疾病预防控制中心哈尔滨150001 国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心北京102206

手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)是一类常见的儿童传染病,自2009年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)已经成为引起HFMD流行持续循环的重要病原之一,是其他肠道病毒(Enterovirus,EV)中的优势病原,而黑龙江省CV-A6相关研究报道尚欠缺。本研究为了解2015~2018年黑龙江省HFMD流行概况和病原学组成,并分析该地区CV-A6的基因特征,收集2015~2018年黑龙江省HFMD疫情资料进行流行病学分析,并采集HFMD病例临床标本进行EV核酸检测。对分离出的EV毒株进行CV-A6的特异性荧光定量PCR法检测,对所有CV-A6阳性毒株进行全长VP1区扩增和核苷酸序列测定,并与GenBank上下载的CV-A6分型代表株构建系统进化树,以了解CV-A6的基因特征。流行病学结果显示,2015~2018年黑龙江省HFMD疫情平稳且2017年有所下降,无死亡病例。黑龙江省每年7月~8月为HFMD流行高峰,患病人群平均年龄为(4.39±3.74)岁,男女患病比例为1.44∶1。全省13个地市均收集到标本,哈尔滨市标本数最多,占36.77%。2015~2018年在黑龙江省共分离到69株CV-A6,与CV-A6原型株的核苷酸相似性为81.8%~83.9%,氨基酸相似性为94.0%~96.3%,均属D3基因亚型的D3a进化分支。尽管肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和CV-A16为主要病原,但D3基因亚型的CV-A6也已成为引起黑龙江省HFMD流行的稳定型别之一,且有加强的趋势,因此应加强CV-A6疫情的监控和分析,为该地区HFMD防控及疫苗研制提供基础数据。

关键词：柯萨奇病毒A组6型(CV-A6) D3基因亚型手足口病(HFMD)

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2019年中国麻疹风疹实验室网络运转状况

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中国疫苗和免疫 2021年第3期27卷 246-249页

作者：宋金华郭晋源王慧玲朱贞毛乃颖崔爱利曹蕾许文波张燕国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室/中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所/世界卫生组织西太平洋地区麻疹风疹参比实验室北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心湖北武汉430000

目的评价2019年中国麻疹风疹实验室网络(China Measles and Rubella Laboratory Network,CMRLN)运转状况。方法利用中国麻疹监测信息报告管理系统(Measles Surveillance System,MSS)和CMRLN实验室监测数据库,分析CMRLN运转指标和麻疹风疹病例实验室监测结果。结果2019年全国报告监测病例78787例,其中散发病例65507例,散发病例的血标本、病原学标本采集率分别为95.86%、50.16%,3d内送达网络实验室的比例分别为97.89%、84.13%。监测病例的麻疹、风疹病毒IgM检测阳性率分别为4.65%(3226/69436)、31.14%(21784/69963)。散发监测病例麻疹、风疹病毒核酸检测阳性率分别为3.28%(1090/33254)、31.31%(10367/33112)。全国报告麻疹、风疹暴发疫情分别为24起、177起,实验室确诊率分别为100%、99.44%。共分离到265株麻疹病毒,其中D8、A(疫苗相似株)、B3和H1基因型分别为176株、18株、51株和30株;分离到风疹病毒2822株,其中1E和2B基因型分别为1608株和1214株。国家、32个省级、27个地市级网络实验室均通过了麻疹和风疹血清盲样、核酸盲样和/或基因定型考核。结论2019年中国麻疹风疹实验室网络运转良好,为中国麻疹和风疹的消除提供了技术支撑。

关键词：麻疹风疹实验室网络病毒学监测质量控制

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