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儿童轮状病毒胃肠炎免疫预防专家共识(2024年版)

中国疫苗和免疫 2024年第1期30卷 95-126页

作者：轮状病毒胃肠炎专家共识编写组段招军李金松张静邓莉赵鲁卿李丹地李静欣不详传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室、国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所中国疾病预防控制中心首都儿科研究所北京中医医院

轮状病毒胃肠炎(Rotavirus gastroenteritis,RVGE)是严重威胁5岁以下儿童健康的全球性公共卫生问题。中国RVGE相关疾病负担重,防控难度大。本共识在《儿童轮状病毒胃肠炎免疫预防专家共识(2020版)》和《世界卫生组织轮状病毒疫苗立场文... 详细信息

轮状病毒胃肠炎(Rotavirus gastroenteritis,RVGE)是严重威胁5岁以下儿童健康的全球性公共卫生问题。中国RVGE相关疾病负担重,防控难度大。本共识在《儿童轮状病毒胃肠炎免疫预防专家共识(2020版)》和《世界卫生组织轮状病毒疫苗立场文件—2021年7月》的基础上,系统综述了RVGE流行病学、已上市轮状病毒(Rotavirus,RV)疫苗的安全性、有效性和免疫保护持久性、RV疫苗免疫策略等国内外研究进展,增补了常见的RVGE诊疗方案。本共识旨在从预防为主和医防融合的角度出发,推动落实以疫苗接种为重点的RVGE综合性防控措施,降低儿童RVGE疾病负担,为从事疾病预防控制、疫苗接种、临床诊疗等多领域的工作人员提供参考。

关键词：轮状病毒胃肠炎轮状病毒疫苗免疫预防共识

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2017-2022年淄博市诺如病毒流行特征及病原学基因分析

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中国病原生物学杂志 2024年第5期19卷 562-565页

作者：张玲曹海霞郑加玉孙晓明陈梦迪傅忠燕靳淼山东省淄博市疾病预防控制中心山东淄博255026 山东省疾病预防控制中心中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室

目的分析2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行特征及优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法用描述性流行病学方法,对2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行病学资料和实验室检测资料进行统计分析。结果2017-2022年... 详细信息

目的分析2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行特征及优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法用描述性流行病学方法,对2017-2022年淄博市诺如病毒感染性疫情流行病学资料和实验室检测资料进行统计分析。结果2017-2022年淄博市共报告35起诺如病毒感染性疫情,其中托幼机构23起,中学7起,餐饮机构3起,小学和养老机构各1起,不同场所罹患率有统计学意义;报告发病917人,罹患率为8.30%,疫情总体呈上升趋势,年均增长率为10.76%;城市29起,农村6起,罹患率城市高于农村,差异有统计学意义;85.71%的诺如病毒感染性疫情与人传人传播有关,每年10月至次年3月是诺如病毒感染性疫情高峰期(68.57%,24/35);35起疫情中,以诺如病毒GⅡ组为主(阳性率80.00%,176/220),GI组检出率为13.641%(30/220),GⅨ组检出率低(6.36%,14/220);基因分型GⅡ.2[P16]占比最高(占35.71%,10/28),其次GⅡ.4[P16](占14.29%,4/28)、GⅡ.3[P12](占10.71%,3/28)和少数其他重组基因型。结论淄博市诺如病毒感染性疫情呈现上升趋势,托幼机构是发生诺如病毒感染性疫情的主要场所,诺如病毒感染性疫情主要为GⅡ组为主,GⅡ.2[P16]基因型为优势基因型,合并多种重组型的流行特征,加强诺如病毒分子流行病学监测,有利于掌握诺如病毒流行病学特征,为科学防控提供理论依据。

关键词：诺如病毒感染性疫情流行特征基因型

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两株西藏CV-B3的全基因组特征及溯源分析

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病毒学报 2018年第6期34卷 828-838页

作者：韩振志张勇红梅黄克强宋洋杨倩严冬梅祝双利许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所脊髓灰质炎室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室北京102206 西藏自治区疾病预防控制中心拉萨850000

肠道病毒是一种常见的引起婴幼儿急性传染病的病毒,它引起的疾病包括急性弛缓性麻痹、手足口病、无菌性脑膜炎和心肌炎等,甚至死亡。柯萨奇病毒B组3型(CV-B3)是引起急性心肌炎常见的病原体之一,并且也经常引起无菌性脑膜炎的暴发。本研... 详细信息

肠道病毒是一种常见的引起婴幼儿急性传染病的病毒,它引起的疾病包括急性弛缓性麻痹、手足口病、无菌性脑膜炎和心肌炎等,甚至死亡。柯萨奇病毒B组3型(CV-B3)是引起急性心肌炎常见的病原体之一,并且也经常引起无菌性脑膜炎的暴发。本研究对在西藏自治区分离的两株CV-B3进行全基因组序列测定和分析,结果表明与原型株相比,核苷酸相似性仅为80.6%。通过系统进化分析,中国大陆流行的CV-B3可以分为三个传播链(lineage1～3),从20世纪lineage1便开始在中国传播,现在倾向于消失,目前lineage2和lineage3替代lineage1成为主要的传播链,现在在中国大陆地区传播。本研究的两株CV-B3也被发现可能与江苏省的一株CV-B5(2009-148-4株)在P3编码区发生了重组,且最大似然进化树的拓扑结构的改变也印证这一重组事件的可能性。频繁的重组活动为肠道病毒的进化提供了原始的基因材料,这也成为肠道病毒频繁暴发的原因之一。本研究分析了西藏两株CV-B3的全基因组序列特征,阐明了CV-B3在中国大陆的传播模式,为CV-B3的防控工作提供了基础资料。

关键词：柯萨奇病毒B组3型(CV-B3) 系统进化分析重组溯源分析

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大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征

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中国疫苗和免疫 2023年第1期29卷 47-52页

作者：杨月朱琳杨芳韩一楠尹文娇曹经瑗毕胜利大连市疾病预防控制中心辽宁大连116021 庄河市疾病预防控制中心辽宁庄河116400 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HA... 详细信息

目的分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型。结果从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15%-100%、98.13%-100%,属于ⅠA基因亚型。获得序列与中国内地序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42%-99.69%;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07%-100%。在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100%,1条序列与其存在2个氨基酸差异。结论大连市2020年HAV优势流行株为ⅠA基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源。HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施。

关键词：甲型肝炎甲型肝炎病毒基因型同源性

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2016—2017年宁夏手足口病的病原构成及流行的EV-A71和CV-A16基因特征分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2019年第1期33卷 10-15页

作者：李婕马江涛刘俐张勇冀天娇许文波严冬梅武桂珍国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所中国疾病预防控制中心北京102206 宁夏疾病预防控制中心病毒科银川750004 北京市海淀区疾病预防控制中心 100089

目的了解引起2016—2017年宁夏自治区(宁夏)手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成,分析主要病原体肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的基因特征。方法分析2016—2017年宁夏HFMD的核酸检测结果,确定HFMD的病原构成;对2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的肠道病毒毒株利用RT-PCR方法扩增VP1编码区并进行基因序列测定,BLAST分析确定毒株的血清型别,同时选取EV-A71和CV-A16分离株分别构建系统进化树。结果核酸检测结果显示,2016和2017年宁夏HFMD中阳性检出率最高的病原体分别为其他肠道病毒(enterovirus,EV)(397,43.72%)和EV-A71(918,56.18%),且不同月份检测出的优势病原体有差异。2017和2016年相比HFMD的病原构成由其他EV和CV-A16为主转变成EV-A71和其他EV为主。2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的EV-A71均属于C4基因亚型的C4a进化分支,CV-A16均属于B1基因亚型的B1b进化分支。结论宁夏HFMD的病原构成中,2017年EV-A71、CV-A16和其他EV的构成与2016年相比发生了动态变化,持续开展宁夏HFMD的病原构成中EV-A71的动态变化,对指导EV-A71疫苗的使用策略、集中优势医疗资源加强救治重症病例,降低重症HFMD的病死率具有重要意义。

关键词：手足口病病原构成公共卫生分子流行病学

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新冠病毒感染后机体病毒载量变化及相关影响研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2024年第1期38卷 99-104页

作者：包恬淼冯晔囡范华陈操山东第一医科大学公共卫生与健康管理学院济南250117 传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430071

新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)是由新型冠状病毒(新冠病毒, 2019-nCoV)感染引起的传染性疾病。截至2023年9月24日, COVID-19疫情已波及220多个国家和地区, 累计确诊和死亡病例分别超过7.7亿例和660万例, 对全球... 详细信息

新型冠状病毒病(coronavirus disease 2019, COVID-19)是由新型冠状病毒(新冠病毒, 2019-nCoV)感染引起的传染性疾病。截至2023年9月24日, COVID-19疫情已波及220多个国家和地区, 累计确诊和死亡病例分别超过7.7亿例和660万例, 对全球经济政治生活造成严重冲击和影响。目前, 2019-nCoV仍在不断变异, 具有传播优势的变异株已导致全球出现多次流行高峰。2019-nCoV感染人体后在体内复制, 病毒载量不断变化。通过了解排毒规律, 可辅助疫情防控和疾病诊治。本文从病毒复制和机体免疫清除的角度对感染后2019-nCoV核酸载量变化和相关影响因素的研究进展进行综述。

关键词：新型冠状病毒病新型冠状病毒病毒载量病毒复制免疫清除

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血液中念珠菌重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白磁珠富集联合重组酶辅助聚合酶链式反应检测方法的建立

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中华流行病学杂志 2023年第5期44卷 823-827页

作者：张梦怡陈小萍孙秀丽马学军申辛欣郭彦言华北理工大学临床医学院唐山063210 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 唐山工人医院检验科唐山063000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的建立重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白(M1蛋白)磁珠富集病原体结合重组酶辅助聚合酶链式反应(RAP)巢式核酸扩增技术检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的方法,以实现对白色念珠菌血症和热带念珠菌血症的早期诊断。方法针对白色念珠菌和... 详细信息

目的建立重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白(M1蛋白)磁珠富集病原体结合重组酶辅助聚合酶链式反应(RAP)巢式核酸扩增技术检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的方法,以实现对白色念珠菌血症和热带念珠菌血症的早期诊断。方法针对白色念珠菌和热带念珠菌的内转录间隔区的高度保守区域的设计引物探针,建立检测白色念珠菌和热带念珠菌的RAP检测方法;用梯度稀释的标准菌株核酸和临床常见的血流感染病原体核酸检验灵敏度、重复性、特异性;用模拟样本进行M1蛋白磁珠富集血浆白色念珠菌和热带念珠菌RAP和实时荧光PCR的检测,并对结果进行比较。结果建立的双重RAP方法灵敏度为2.4~2.8拷贝/反应,重复性好,特异性高;M1蛋白磁珠富集病原体结合双重RAP方法可在4 h内完成对血浆中白色念珠菌和热带念珠菌的检测,<10 CFU/ml的病原体富集后进行RAP检测样本数较PCR检测样本数多。结论本研究建立了检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的双重RAP方法,该检测方法具备准确、快速、减少污染物的优点,在念珠菌血症快速检测中具有较好的应用潜力。

关键词：白色念珠菌热带念珠菌重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白磁珠念珠菌血症重组酶辅助聚合酶链式反应

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2013-2019年全国手足口病ECHO-9的分子流行病学研究

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病毒学报 2021年第1期37卷 115-122页

作者：司芬芬卫海燕关路媛冀天娇王东艳张勇祝双利宋洋韩振志李俊含许文波严冬梅国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 河南省疾病预防控制中心郑州450016 陕西省疾病预防控制中心西安710054 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000

埃可病毒9型(Echovirus 9,ECHO-9)是引起无菌性脑膜炎(Aseptic meningitis,AM)和手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)暴发流行的重要病原体,但目前全球关于ECHO-9分子流行病学研究仍比较匮乏,ECHO-9基于VP1全长的基因分型结果尚未明确。本研究依托国家HFMD监测网络,2013-2019年在中国大陆共分离到15株ECHO-9毒株,对其进行VP1区全长序列测定和分析,并与GenBank中下载的全部112条ECHO-9VP1区全长序列共同构建系统发育进化树。结果显示,全球ECHO-9分为A-G七个基因型,其中C、D和F基因型可被进一步划分为C1-C2,D1-D4和F1-F2基因亚型。各洲之间优势基因型别有显著差异,亚洲和欧洲分别以D和C基因型为绝对优势基因型。中国大陆ECHO-9优势基因型别为D基因型,但其优势基因亚型随时间推移有明显转变。2000-2005年,中国大陆ECHO-9全部为D1基因亚型,2006年开始出现D1、D2和D3基因亚型的共同流行,2010年后D1和D2基因亚型消失,D3成为中国大陆绝对优势基因型别。本研究测定的15株ECHO-9分离自2013-2019年,其中14株属于D3基因亚型,1株江西ECHO-9为C2基因亚型,推测其可能来源于境外。本研究建立了全球ECHO-9基于VP1全长的基因分型方法,揭示了ECHO-9在全国及全球范围的分子流行特征。

关键词：埃可病毒9型(ECHO-9) 无菌性脑膜炎(AM) 手足口病(HFMD) 基因分型分子流行病学

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两组中断时间序列设计及其分析方法

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中华流行病学杂志 2019年第9期40卷 1159-1163页

作者：李洋于石成金承刚杨梦婕马学军王琦琦中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心流行病学办公室北京102206 北京师范大学社会发展与公共政策学院 100875

中断时间序列(ITS)是对具有时间序列特点的结果变量进行分析,评价干预措施是否有效的类实验设计方法。相对于单组ITS,两组ITS可以更好地控制干预前混杂因素的影响,评价干预措施的效果。本文阐述两组ITS的设计原理和统计方法,以两市疾病... 详细信息

中断时间序列(ITS)是对具有时间序列特点的结果变量进行分析,评价干预措施是否有效的类实验设计方法。相对于单组ITS,两组ITS可以更好地控制干预前混杂因素的影响,评价干预措施的效果。本文阐述两组ITS的设计原理和统计方法,以两市疾病发病率为例,采用Prais-Winsten法和Newey-West法拟合线性回归模型,并对结果进行了详细的解释和比较。在干预实施的时间窗口中存在多个政策转变时,两组ITS可以更好地平衡序列干预前已存在的趋势,科学地估计干预措施有效性具有重要的现实意义,为项目效果评价提供一个新的思路。

关键词：中断时间序列设计类实验设计干预项目评价

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2017-2020年河南省漯河市呼吸道合胞病毒流行特征研究

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病毒学报 2021年第3期37卷 554-560页

作者：谢智博段晓健郭晋源徐瑾宋金华宋晶晶夏百成王慧玲崔爱利朱贞毛乃颖许文波张燕国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 河南省疾病预防控制中心郑州450016 中国科学院生物安全大科学研究中心武汉430000

呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是引起严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)的一个重要病原,尤其以5岁以下儿童为主。为了解河南省漯河市SARI住院患者中RSV感染的流行病学和临床特征,为RSV... 详细信息

呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus,RSV)是引起严重急性呼吸道感染(Severe acute respiratory infection,SARI)的一个重要病原,尤其以5岁以下儿童为主。为了解河南省漯河市SARI住院患者中RSV感染的流行病学和临床特征,为RSV预防控制及临床诊疗提供科学数据,本研究采集2017年10月至2020年8月河南省漯河市SARI住院病例的咽拭子,并收集流行病学和临床信息。采用荧光定量PCR方法鉴定RSV A/B阳性病例,分析其流行病学和临床特征。结果显示,本研究共入组1335例SARI病例,其中220例(16.48%)为RSV阳性,A和B亚型分别占64.55%和30.45%。RSV感染以5岁以下儿童为主(占91.36%),2岁以下婴幼儿占RSV感染病例的一半以上(占55.37%)。RSV流行高峰出现在11月-次年1月,不同年份流行季可前后相差一个月。A、B亚型在不同月份可单独流行也可共流行。受新型冠状病毒肺炎疫情影响,2020年2-8月SARI病例数较往年同期减少60%以上,RSV阳性率在2020年2-8月降低为0。与非RSV感染组相比,RSV更易感染2岁以下儿童,下呼吸道感染占比更高(以支气管肺炎为主)。本研究通过近3年SARI病例监测,揭示河南省漯河市RSV感染以冬春季常见,以下呼吸道感染为主,主要感染5岁以下儿童,其中2岁以下婴幼儿是防控重点人群。新型冠状病毒肺炎流行期间,由于限制性防控措施的干预,RSV感染大大降低。本研究将为RSV疫苗和单克隆抗体等预防性干预手段的使用策略提供基础数据。

关键词：呼吸道合胞病毒(RSV) 新型冠状病毒肺炎严重急性呼吸道感染(SARI) 流行病学特征临床特征

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