检索结果-内蒙古大学图书馆

病毒学报 2023年第2期39卷 384-392页

作者：王蕊王聪聪李晓亮宋洋刘莹李冀琛肖金波路环环刘志军孙强张勇潍坊医学院潍坊261053 国家脊髓灰质炎实验室国家卫生健康委员会生物安全重点实验室国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 山东第一医科大学济南250117

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果... 详细信息

柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)已成为近年来国内导致手足口病的主要病原体。本研究挑选16株中国流行的不同基因亚型的CVA6,通过在RD细胞上的细胞活性实验和观察致细胞病变效应来检测利巴韦林对不同CVA6毒株的抑制率。结果表明药物浓度在0.8mmol/L和0.4mmol/L作用下对部分CVA6有明显的抑制作用(P<0.0001),在0.8mmol/L药物浓度下根据抑制率的高低,将抑制率大于80%的CVA6株(5株,占31.25%)以及低于10%的CVA6株(5株,占31.25%)分别定义为对利巴韦林敏感组和耐药组。为了探究CVA6耐药性与病毒致病力之间的关系,在利巴韦林敏感组与利巴韦林耐药组分别随机挑选两株CVA6进行ICR乳鼠感染实验。通过观察乳鼠生存率、临床评分和体重变化,结果显示利巴韦林耐药组CVA6致病力均比利巴韦林敏感组弱,表明利巴韦林耐药与致病力之间存在一定联系。最后使用MEGA软件对利巴韦林敏感组和耐药组CVA6进行3D区氨基酸序列比对分析,发现两组CVA6在3D区75位、308位、342位、346位氨基酸完全不同,提示利巴韦林耐药与3D区的基因多态性存在一定联系。本研究提示对利巴韦林耐药的CVA6广泛存在,属于目前优势流行D3a基因亚型,不仅为手足口病患者个体化治疗提供了重要依据,而且对CVA6感染相关疾病的防控具有重要意义。

关键词：柯萨奇病毒A组6型利巴韦林差异位点分析耐药性

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Ⅲa基因缺失的人7型腺病毒载体系统的建立

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病毒学报 2024年第2期40卷 365-373页

作者：王洋王永进侯文哲郭小娟郑贵森邹小辉甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京100052

为了获得既能高效扩增外源基因,又不产生复制型子代病毒的腺病毒载体,我们构建了一个Ⅲa基因缺失的单周期腺病毒载体。本研究在前期已构建的E3区携带绿色荧光蛋白GFP的人7型腺病毒载体pK-Ad7E3GFP基础上进行。首先设计引物扩增包含氨苄... 详细信息

为了获得既能高效扩增外源基因,又不产生复制型子代病毒的腺病毒载体,我们构建了一个Ⅲa基因缺失的单周期腺病毒载体。本研究在前期已构建的E3区携带绿色荧光蛋白GFP的人7型腺病毒载体pK-Ad7E3GFP基础上进行。首先设计引物扩增包含氨苄青霉素抗性基因和质粒复制起点的AMP-ORI片段,利用限制性内切酶Asc I将pK-Ad7E3GFP切割为29.1kb与7.7kb的大小片段,其中,7.7kb小片段与AMP-ORI片段组装,获得第一个中间质粒pA-Ad7E3GAscI;经重叠延伸PCR、酶切、DNA组装等方法,将pA-Ad7E3GAscI上的Ⅲa基因进行删除,获得第二个中间质粒pA-AscDⅢa;经Pme I酶切的pA-AscDⅢa与上述29.1kb大片段经DNA组装后,得到重组腺病毒质粒pK-Ad7DⅢaE3GFP。同时,构建携带Ⅲa基因的真核表达载体pTPL-Ⅲa,转染293细胞,经G418筛选构建细胞系293-Ⅲa。结果发现,经Pme I线性化的pK-Ad7DⅢaE3GFP质粒转染293-Ⅲa细胞,7d后可见荧光聚集,且逐渐增大,表明重组腺病毒Ad7DⅢaE3GFP拯救成功;提取病毒基因组进行PCR鉴定,结果与预期相符;细胞培养上清经负染后,在电镜下可见腺病毒典型的正二十面体形态,培养细胞中也可见病毒呈晶格排列;以上结果均表明Ad7DⅢaE3GFP拯救成功。本研究成功建立了Ⅲa基因缺失的单周期人7型腺病毒载体系统,为该载体的研究与应用奠定基础。

关键词： Ⅲa基因人7型腺病毒载体单周期载体 DNA组装病毒拯救

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纤维顶球改造增强了人5型腺病毒载体对造血细胞的感染

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病毒学报 2021年第5期37卷 1079-1088页

作者：郭小娟梅玲玲付鸿臣邹小辉鲁茁壮洪涛中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京100052 潍坊医学院公共卫生与管理学院潍坊261053

基于人5型腺病毒(Human adenovirus type 5,HAdV⁃5)的腺病毒载体对造血细胞的基因转导效率低,将病毒fiber基因替换为HAdV⁃11p的同源基因F11p后,载体对造血细胞的感染效率增强。本研究拟在F11p纤维顶球(knob)结构域添加RGD4C多肽或HIV包... 详细信息

基于人5型腺病毒(Human adenovirus type 5,HAdV⁃5)的腺病毒载体对造血细胞的基因转导效率低,将病毒fiber基因替换为HAdV⁃11p的同源基因F11p后,载体对造血细胞的感染效率增强。本研究拟在F11p纤维顶球(knob)结构域添加RGD4C多肽或HIV包膜糖蛋白(gp120)的V3结构域,观察重组HAdV⁃5对造血细胞感染效率的变化。在前期构建的pKAd5f11p153R⁃EPG腺病毒质粒基础上,结合限制性酶切和DNA组装技术,在F11p 153 aa后(knob AB loop,153位)、228位(FG loop)以及300位(IJ loop)插入RGD4C肽或者gp120的V3肽,构建了共6种重组腺病毒载体(F153RGD⁃EG、F228RGD⁃EG、F300RGD⁃EG、F153CV⁃EG、F228CV⁃EG和F300CV⁃EG),以fiber未改造的HAdV5⁃EG和改造为F11p的F11p⁃EG病毒作对照,观察了其对4种造血细胞系U937、K562、Jurkat和HL60以及人原代T细胞的感染效率。结果显示,对于U937细胞,当感染复数(MOI,vp/cell)为100时,HAdV5⁃EG感染效率最低,为2%;其次为F228CV⁃EG,感染率为45%;F300RGD⁃EG、F153CV⁃EG和F300CV⁃EG感染率为85%~90%;F153RGD⁃EG、F228RGD⁃EG高于阳性对照病毒F11p⁃EG,三者分别为99%、99%、95%。各病毒对于Jurkat细胞的感染率均较高,但HAdV5⁃EG明显低于F11p⁃EG、F153RGD⁃EG和F228RGD⁃EG,当MOI为100时分别为75%、93%、93%和96%。感染K562细胞的情况与U937细胞类似。各病毒对于HL60细胞感染效率最低,MOI为500时,F300RGD⁃EG和F300CV⁃EG的转导效率为28%和33%,是F11p⁃EG的10倍。对于人原代T细胞,F153RGD⁃EG和F228RGD⁃EG优于F11p⁃EG,当MOI为1000时,感染率分别为87%、90%和84%。研究结果表明,F11p knob插入RGD4C比单独F11p替换的HAdV⁃5对造血细胞的感染效率高,同时,本研究还发现HAdV⁃11p fiber knob的AB、FG或IJ loop可插入外源多肽,为腺病毒嗜向性改造增加了新靶点。

关键词：人5型腺病毒(HAdV⁃5) 纤维顶球造血细胞

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口服轮状病毒疫苗Rotarix保护效果的Meta分析

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疾病监测 2021年第8期36卷 797-805页

作者：魏宇航李金松孙晓曼庞立丽王宏章青王萌璇毛彤瑶王明雯范佳欣李丹地吴建军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000

目的评价口服轮状病毒疫苗Rotarix在全球范围内使用后对轮状病毒胃肠炎(RVGE)的保护效果,为Rotarix疫苗在全球轮状病毒高低死亡率地区的使用提供更好的科学依据。方法检索2001—2021年公开发表的符合入选标准的有关Rotarix疫苗的文献,... 详细信息

目的评价口服轮状病毒疫苗Rotarix在全球范围内使用后对轮状病毒胃肠炎(RVGE)的保护效果,为Rotarix疫苗在全球轮状病毒高低死亡率地区的使用提供更好的科学依据。方法检索2001—2021年公开发表的符合入选标准的有关Rotarix疫苗的文献,共纳入了63990人研究对象,其中低死亡率地区纳入研究对象27725人,高死亡率地区纳入研究对象36265人,使用RevMan 5.3软件进行统计分析。结果在低死亡率地区,Rotarix对RVGE、SRVGE的保护率为VE_(RVGE)=73%(95%CI:58%~82%)、VE_(SRVGE)=89%(95%CI:80%~94%),其中对黄色人种RVGE、SRVGE保护效果为VE_(RVGE)=69%(95%CI:39%~84%)、VE_(SRVGE)=91%(95%CI:74%~97%),对白色人种RVGE、SRVGE保护效果为VE_(RVGE)=78%(95%CI:73%~83%)、VE_(SRVGE)=90%(95%CI:85%~93%);在高死亡率地区,Rotarix对RVGE、SRVGE的保护率为VE_(RVGE)=53%(95%CI:27%~70%)、VE_(SRVGE)=70%(95%CI:42%~85%),其中对黄色人种RVGE、SRVGE保护效果为VE_(RVGE)=61%(95%CI:45%~73%)、VE_(SRVGE)=80%(95%CI:68%~87%),对黑色人种RVGE、SRVGE保护效果为VE_(RVGE)=43%(95%CI:-98%~68%)、VE_(SRVGE)=42%(95%CI:25%~56%)。结论在任何地区口服Rotarix对预防任意严重程度轮状病毒胃肠炎都有一定的保护效果,对重症轮状病毒胃肠炎保护效果更好。在低死亡率地区,Rotarix对白色人种的任何严重程度轮状病毒胃肠炎的保护效果优于黄色人种;在高死亡率地区,Rotarix对黄色人种的任何严重程度轮状病毒胃肠炎的保护效果优于黑色人种。

关键词：口服轮状病毒减毒活疫苗 Rotarix 保护效果 Meta分析亚组分析

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2011-2019年我国腹泻住院患儿中G1P型A组轮状病毒的流行病学和临床特征分析

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病毒学报 2023年第3期39卷 729-734页

作者：魏宇航孙晓曼彭蕊王萌璇李静欣庞立丽范佳欣李丹地段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000

了解2011-2019年G1P[8]型A组轮状病毒(Group A rotavirus,RVA)在我国腹泻住院患儿中的流行病学和临床特征。收集2011年1月-2019年12月我国病毒性腹泻监测网络数据。监测网数据的采集和整理采用EpiData 3.0软件和Excel 2010,应用SPSS 26.... 详细信息

了解2011-2019年G1P[8]型A组轮状病毒(Group A rotavirus,RVA)在我国腹泻住院患儿中的流行病学和临床特征。收集2011年1月-2019年12月我国病毒性腹泻监测网络数据。监测网数据的采集和整理采用EpiData 3.0软件和Excel 2010,应用SPSS 26.0软件进行数据分析。2011-2019年共采集到我国5岁以下急性胃肠炎住院患儿标本共计47 386份,结果显示G1P[8]型RVA阳性率为1.98%(938/47 386),G1P[8]型RVA感染不具有明显的性别分布特征。G1P[8]型RVA的流行季节为秋冬季,夏季该基因型有小暴发的情况发生。G1P[8]型RVA住院患儿在腹泻严重程度(χ^(2)=0.177,P=0.915,P>0.05)与非G1P[8]型RVA住院患儿无明显差异,G1P[8]型RVA相对于非G1P[8]型RVA患儿在发热(χ^(2)=22.572,P=0,P<0.05)、皮疹、肺炎、败血症等并发症(χ^(2)=12.921,P=0,P<0.05)少且轻。2011-2019年我国G1P[8]型RVA流行趋势逐渐下降,季节高峰为秋冬季,夏季偶有暴发,G1P[8]型RVA发热等并发症较非G1P[8]型RVA轻。本研究为RVA疫苗候选毒株选择提供数据参考,为G1P[8]型RVA防控和治疗提供基础数据支持。

关键词： A组轮状病毒流行病学腹泻 G1P

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新型冠状病毒基因组序列的网络平台与基因分型

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病毒学报 2021年第1期37卷 181-190页

作者：宋洋许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒与病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是引起2019新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体,目前COVID-19仍在世界范围内大规模流行。随着学者对SARS-CoV-2研究的不断深入,以及各大数据库的序列资源共享,一些学者开发了SARS-CoV-2相关序列分析网络在线平... 详细信息

新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是引起2019新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的病原体,目前COVID-19仍在世界范围内大规模流行。随着学者对SARS-CoV-2研究的不断深入,以及各大数据库的序列资源共享,一些学者开发了SARS-CoV-2相关序列分析网络在线平台,并发表了对SARS-CoV-2基因分型、命名的规则。"GISAID"是目前SARS-CoV-2基因组序列共享和储存最大的数据库,"Nextstrain"和"CoV-GLUE"是国际最常用的SARS-CoV-2序列分析平台。目前有四种比较通用的SARS-CoV-2的基因分型方法,在本文中分别简称为:"中国分型法"、"Pangolin分型法"、"GISAID分型法"和"Nextstrain分型法"。这四种分型方法的定义不尽相同,但又有相似之处。本综述对目前SARS-CoV-2在线分析网络平台和不同的基因分型方法进行了较为系统的介绍、对比和总结。

关键词：新型冠状病毒(SARS-CoV-2) 分子流行病学基因分型网络分析平台

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中国风疹控制和消除进展

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中华医学杂志 2021年第48期101卷 3981-3986页

作者：刘莹许文波朱贞中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区麻疹和风疹参比实验室北京102206

随着2008年我国正式将风疹疫苗纳入扩大免疫规划,婴幼儿免疫覆盖率自2012年持续维持在95%以上,因此在人群中建立了一定的免疫屏障,使得我国风疹发病率逐年下降,并逐步阻断了本土流行风疹病毒的传播,显示我国正在向风疹消除目标迈进。然... 详细信息

随着2008年我国正式将风疹疫苗纳入扩大免疫规划,婴幼儿免疫覆盖率自2012年持续维持在95%以上,因此在人群中建立了一定的免疫屏障,使得我国风疹发病率逐年下降,并逐步阻断了本土流行风疹病毒的传播,显示我国正在向风疹消除目标迈进。然而,为了加速我国风疹消除进程,应根据监测实情科学制定重点人群的补充免疫策略,提升应对暴发疫情的处置能力,同时有必要通过构建医防融合机制并推进先天性风疹综合征监测,从而为风疹消除提供证据支持。

关键词：风疹消除疫苗监测

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口服轮状病毒疫苗RotaTeq对不同人种轮状病毒胃肠炎免疫原性的meta分析

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病毒学报 2023年第2期39卷 410-418页

作者：魏宇航彭蕊王萌璇范佳欣吴铮毛彤瑶王明雯孙晓曼李丹地甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对全球儿童轮状病毒胃肠炎免疫原性,为疫苗的使用提供循证参考。检索2006-2021年公开发表的有关口服轮状病毒减毒活疫苗(Oral Live Attenuated Rotavirus Vaccine,ORV)RotaTeq(RV5)的文献,根据纳入排... 详细信息

评价口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq对全球儿童轮状病毒胃肠炎免疫原性,为疫苗的使用提供循证参考。检索2006-2021年公开发表的有关口服轮状病毒减毒活疫苗(Oral Live Attenuated Rotavirus Vaccine,ORV)RotaTeq(RV5)的文献,根据纳入排除标准筛选,共纳入了8 015名研究对象,其中疫苗组纳入研究对象4 062名,对照组纳入研究对象3 953名,使用RevMan5.3软件进行数据分析。共纳入6篇文献,对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了73%(95%CI:65%~81%)、35%(95%CI:19%~50%)、11%(95%CI:6%~16%)、12%(95%CI:5%~19%)、30%(95%CI:21%~38%)、23%(95%CI:8%~38%);与对照组相比,黄色人种疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了75%(95%CI:66%~85%)、41%(95%CI:19%~62%)、14%(95%CI:4%~24%)、19%(95%CI:7%~31%)、28%(95%CI:9%~47%)、34%(95%CI:11%~58%);白色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了82%(95%CI:77%~87%)、54%(95%CI:42%~66%)、15%(95%CI:5%~24%)、9%(95%CI:2%~16%)、38%(95%CI:26%~51%)、22%(95%CI:10%~33%);黑色人种中与对照组相比疫苗组血清IgA抗体、SNA-G1抗体、SNA-G2抗体、SNA-G3抗体、SNA-G4抗体、SNA-P1A[8]抗体的抗体阳转率分别升高了59%(95%CI:52%~67%)、19%(95%CI:14%~24%)、6%(95%CI:2%~10%)、5%(95%CI:1%~9%)、27%(95%CI:19%~36%)、10%(95%CI:5%~16%)。口服轮状病毒减毒活疫苗RotaTeq在不同的人种中免疫原性有一定的差异,且在黄色人种和白色人种中的免疫原性要比黑色人种的免疫原性更好。

关键词：口服轮状病毒活疫苗免疫原性 meta分析亚组分析

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2018-2019年泉州人呼吸道合胞病毒基因型及基因特征分析

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中华医学杂志 2021年第22期101卷 1695-1699页

作者：宋金华陈志旭郭晋源谢智博杜佳王慧玲崔爱利朱贞毛乃颖许文波张燕国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所世界卫生组织西太平洋地区麻疹/风疹参比实验室北京102206 泉州市儿童医院重症医学科泉州362000

目的分析泉州2018-2019年人呼吸道合胞病毒(HRSV)流行情况和基因特征。方法样本来自2018年11月至2019年5月福建省泉州市儿童医院送检的下呼吸道感染患儿咽拭子样本,共141份。采用RT-PCR法进行HRSVG基因3′末端靶基因扩增,使用sequencher... 详细信息

目的分析泉州2018-2019年人呼吸道合胞病毒(HRSV)流行情况和基因特征。方法样本来自2018年11月至2019年5月福建省泉州市儿童医院送检的下呼吸道感染患儿咽拭子样本,共141份。采用RT-PCR法进行HRSVG基因3′末端靶基因扩增,使用sequencher 5.0以及MEGA5.05软件进行序列编辑、进化树构建和基因特征分析。结果HRSV阳性样本25份,17份样本成功获得靶基因序列,其中HRSVA 13份,HRSVB 4份;共鉴定出两个基因型:ON1基因型(13份,HRSVA)和BA9基因型(4份,HRSVB)。5条ON1基因型靶基因序列与2012-2015年北京、长春和浙江流行的ON1基因型序列汇聚为一簇(Cluster1);1条(FJ19-02)与2012-2015年我国多个地区流行的ON1基因型序列汇聚为一簇(Cluster2);其余7条为独立的一簇(Cluster-FJ)。HRSVB亚型中FJ18-02、FJ19-14、FJ19-15与2015年在吉林长春流行的BA9基因型序列汇聚在一起;FJ19-13则与2013年在广州和浙江两地流行的BA9基因型序列具有较近的亲缘性。ON1基因型和BA9基因型均在重复插入的72和60个碱基片段区出现了核苷酸和氨基酸变异。Cluster-FJ分支靶基因序列出现了特征性氨基酸突变(H266L);FJ19-13出现了H261Q和Q265L的独立突变。结论2018-2019年福建泉州流行的HRSV基因型为BA9和ON1,Cluster-FJ为新发现的独立传播链,有可能在泉州建立了本土循环流行。

关键词：呼吸道合胞病毒,人基因型基因特征

来源：评论

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呼吸道病原体多重核酸扩增在老年患者呼吸系统感染检测中的应用

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中华实验和临床病毒学杂志 2020年第3期34卷 299-303页

作者：宋国威潘婧梁芸马学军万玲玲李玉雪李立新石家庄市第一医院检验科 050000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提... 详细信息

目的了解多重RT-PCR方法检测13种常见呼吸道感染病原体,在老年患者呼吸系统感染病原体检测中的应用价值。方法317例2016年6月至2017年5月在石家庄市第一医院老年科就诊的具有呼吸系统感染症状的老年患者,年龄60~98岁,采集其抽吸痰液,提取病毒DNA/RNA,利用多重RT-PCR技术扩增,通过毛细管电泳,同时检测13种呼吸道病原体;并以直接测序方法和荧光实时PCR法为标准,评价该试剂的临床性能。结果使用直接测序和荧光实时PCR结果为参照,多重RT-PCR技术的准确性为99.93%(95%CI:99.79%~99.98%),阳性预测值为99.24%(95%CI:97.78%~99.74%),阴性预测值为100%(95%CI:99.9%~100%),Cohen’skappa值为0.9958(95%CI:0.9652~1.026)。在317例老年患者中,呼吸道病原阳性检出率为75.7%(240/317),其中甲型流感病毒最高,为20.2%(64/317),主要为H3亚型(70.3%(45/64);其次为鼻病毒、腺病毒、肺炎支原体和乙型流感病毒,检出率分别为15.5%(49/317)、13.6%(43/317)、11.0%(35/317)和10.1%(32/317)。此外,同时检出2种以及2种以上病原体的老年患者为81例,检出率为25.6%(81/317)。结论多重RT-PCR方法能满足临床对呼吸道病原体检测的需求,并为老年患者呼吸系统感染的防治提供有效的临床资料。

关键词：呼吸道感染毛细管电泳老年患者逆转录聚合酶链反应

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