检索结果-内蒙古大学图书馆

2011-2019年我国G9P型A组轮状病毒腹泻住院患儿流行病学和临床特征分析

疾病监测 2022年第6期37卷 760-763页

作者：魏宇航李静欣彭蕊王萌璇孙晓曼章青王宏范佳欣李丹地段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730000

目的了解我国G9P[8]型A组轮状病毒(Group A Rotavirus, RVA)腹泻住院患儿的流行病学和临床特征。方法收集2011年1月至2019年12月我国病毒性腹泻监测网络数据。监测网数据采用EpiData 3.0软件采集,采用Excel 2010软件数据整理,应用SPSS... 详细信息

目的了解我国G9P[8]型A组轮状病毒(Group A Rotavirus, RVA)腹泻住院患儿的流行病学和临床特征。方法收集2011年1月至2019年12月我国病毒性腹泻监测网络数据。监测网数据采用EpiData 3.0软件采集,采用Excel 2010软件数据整理,应用SPSS 26.0软件数据分析。结果 2011年1月至2019年12月采集到我国病毒性腹泻监测网络5岁以下急性胃肠炎住院患儿标本共计47 386份,其中G9P[8]型RVA阳性率为54.50%(8 149/14 952),G9P[8]型RVA在男性患儿中占比低于女性患儿。G9P[8]型RVA的流行季节为秋冬季。G9P[8]型RVA相对于非G9P[8]型RVA患儿在发热(59.79%,4 872/8 149)、呕吐(53.87%,4 390/8 149)、腹泻(92.93%,7 573/8 149)、肠道外症状的呼吸道症状(29.30%,2 388/8 149)、神经系统症状(2.07%,169/8 149)、mber>/8 149、神经系统症状(2.07%,169/8 149)、皮疹、肺炎、败血症(8.21%,669/8 149)等症状/体征多发且严重。结论 2011年1月至2019年12月我国G9P[8]型RVA逐渐成为我国的流行优势毒株,季节高峰为秋冬季,G9P[8]型RVA症状更重。本研究为RVA防控提供基础数据支持,为RVA疫苗候选毒株选择提供参考。

关键词：轮状病毒流行特征腹泻 G9P[8]型A组轮状病毒临床症状

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2018~2020年广西边境地区手足口病流行特征及病原学分析

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病毒学报 2022年第3期38卷 591-599页

作者：冀天娇居昱程文隽陈敏玫张勇肖金波张珂艺刘宏图许文波国家脊髓灰质炎实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206 广西重大传染病防控与生物安全应急响应重点实验室广西壮族自治区疾病预防控制中心南宁530028 国家病毒相关肿瘤室国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成... 详细信息

手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是一种由肠道病毒引起的儿童常见传染病,近年来在亚太地区尤其是东南亚地区发生了多起HFMD的大暴发,而我国广西壮族自治区与越南接壤,往来密切。为了解其边境地区HFMD的流行概况和病原学构成,比较该地区病原优势基因型与相邻地区的变异与进化关系。本研究选取与越南接壤的百色、崇左、防城港作为研究对象,收集其2018-2020年HFMD疫情资料进行流行病学分析,并随机采集这三个地市的375份手足口病患儿的临床标本进行荧光定量PCR鉴定,对阳性毒株进行VP1编码区基因扩增及测定,获得的序列与GenBank上下载的各基因型/亚型的代表序列构建系统发生树。结果显示2018-2020年,广西边境地区的报告发病数、重症数、重症比例(重症/发病)和重症率均呈下降趋势,5岁以下儿童为主要发病人群,除2020年以外,其发病流行曲线呈典型的双峰分布。病原谱分析显示,整体上以其他EV为优势循环血清型,且CVA6、CVA16、CVA10和EVA71为该地区的优势病原。同时,2018-2020年期间广西边境流行的EVA71、CVA16、CVA6和CVA10的优势基因亚型分别为C4a、B1b、D3a和C2,且与东南亚临近国家同基因型的流行株具有较近的亲缘关系,提示病毒共同循环进化。而边境地区环境复杂、人员往来密切,因此加强边境地区手足口病的监测及预警系统的建设是西南边境地区手足口病防控的关键。

关键词：手足口病边境地区流行特征病原学特点

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轮状病毒受体结合特征研究进展

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中华实验和临床病毒学杂志 2022年第6期36卷 748-752页

作者：王铭月孙晓曼李丹地中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 甘肃中医药大学公共卫生学院兰州730000

轮状病毒(rotavirus,RV)是引起人类和动物急性胃肠炎的重要病原体。结构蛋白VP8*(viral protein 8*,VP8*)位于RV最外层的刺突状VP4的头部,VP8*在受体识别和结合中发挥重要作用。目前对RV受体结合特性的研究主要集中在A组轮状病毒(group ... 详细信息

轮状病毒(rotavirus,RV)是引起人类和动物急性胃肠炎的重要病原体。结构蛋白VP8*(viral protein 8*,VP8*)位于RV最外层的刺突状VP4的头部,VP8*在受体识别和结合中发挥重要作用。目前对RV受体结合特性的研究主要集中在A组轮状病毒(group A rotavirus,RVA)和C组轮状病毒(group C rotavirus,RVC)。本文对RV的蛋白结构、受体类型以及RVA和RVC受体结合特性及与受体相互作用的结构基础等研究进展进行综述。

关键词：轮状病毒 VP8*蛋白受体结合特征

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大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征

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中国疫苗和免疫 2023年第1期29卷 47-52页

作者：杨月朱琳杨芳韩一楠尹文娇曹经瑗毕胜利大连市疾病预防控制中心辽宁大连116021 庄河市疾病预防控制中心辽宁庄河116400 国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所北京102206

目的分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HA... 详细信息

目的分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus,HAV)流行株基因特征。方法采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型。结果从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15%-100%、98.13%-100%,属于ⅠA基因亚型。获得序列与中国内地序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42%-99.69%;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07%-100%。在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100%,1条序列与其存在2个氨基酸差异。结论大连市2020年HAV优势流行株为ⅠA基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源。HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施。

关键词：甲型肝炎甲型肝炎病毒基因型同源性

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血液中念珠菌重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白磁珠富集联合重组酶辅助聚合酶链式反应检测方法的建立

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中华流行病学杂志 2023年第5期44卷 823-827页

作者：张梦怡陈小萍孙秀丽马学军申辛欣郭彦言华北理工大学临床医学院唐山063210 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 唐山工人医院检验科唐山063000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206

目的建立重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白(M1蛋白)磁珠富集病原体结合重组酶辅助聚合酶链式反应(RAP)巢式核酸扩增技术检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的方法,以实现对白色念珠菌血症和热带念珠菌血症的早期诊断。方法针对白色念珠菌和... 详细信息

目的建立重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白(M1蛋白)磁珠富集病原体结合重组酶辅助聚合酶链式反应(RAP)巢式核酸扩增技术检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的方法,以实现对白色念珠菌血症和热带念珠菌血症的早期诊断。方法针对白色念珠菌和热带念珠菌的内转录间隔区的高度保守区域的设计引物探针,建立检测白色念珠菌和热带念珠菌的RAP检测方法;用梯度稀释的标准菌株核酸和临床常见的血流感染病原体核酸检验灵敏度、重复性、特异性;用模拟样本进行M1蛋白磁珠富集血浆白色念珠菌和热带念珠菌RAP和实时荧光PCR的检测,并对结果进行比较。结果建立的双重RAP方法灵敏度为2.4~2.8拷贝/反应,重复性好,特异性高;M1蛋白磁珠富集病原体结合双重RAP方法可在4 h内完成对血浆中白色念珠菌和热带念珠菌的检测,<10 CFU/ml的病原体富集后进行RAP检测样本数较PCR检测样本数多。结论本研究建立了检测血液中白色念珠菌和热带念珠菌的双重RAP方法,该检测方法具备准确、快速、减少污染物的优点,在念珠菌血症快速检测中具有较好的应用潜力。

关键词：白色念珠菌热带念珠菌重组人甘露聚糖结合凝集素蛋白磁珠念珠菌血症重组酶辅助聚合酶链式反应

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尼帕病毒N基因核酸检测方法对假病毒阳性标准品的制备及鉴定

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疾病监测 2022年第8期37卷 1011-1015页

作者：黄益曼宋敬东韩辉麻粉莲郑丽舒中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京100052 中国海关科学技术研究中心北京100026

目的针对致死率极高的尼帕病毒,制备安全、稳定的含有尼帕病毒N基因片段的重组假病毒颗粒阳性标准品。方法人工合成含有尼帕病毒N基因片段的核苷酸序列并导入CD513B慢病毒载体,与包装质粒同时转染HEK293T细胞,超速离心浓缩纯化,电镜... 详细信息

目的针对致死率极高的尼帕病毒,制备安全、稳定的含有尼帕病毒N基因片段的重组假病毒颗粒阳性标准品。方法人工合成含有尼帕病毒N基因片段的核苷酸序列并导入CD513B慢病毒载体,与包装质粒同时转染HEK293T细胞,超速离心浓缩纯化,电镜观察假病毒颗粒形态,感染实验验证假病毒功能,并进行线性、稳定性和均一性检测。结果包装并纯化后的假病毒颗粒浓度较高,直径在100~200 nm,可见明显的G蛋白刺突,感染实验绿色荧光蛋白信号强且不同温度下储存稳定性良好,均一性检测变异系数小于1%。结论成功构建含有尼帕病毒N基因片段的假病毒颗粒,可作为阳性对照品在尼帕病毒核酸提取和检测过程中实现全程质量控制。

关键词：尼帕病毒N基因假病毒阳性标准品

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2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

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疾病监测 2021年第8期36卷 774-779页

作者：朱曦孔翔羽章青李静欣李慧莹靳淼段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206

目的了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016—2019年中国诺如病毒分子流行特征。方法收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如... 详细信息

目的了解中国诺如病毒监测网络(CaliciNet China)的发展及2016—2019年中国诺如病毒分子流行特征。方法收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应(real-time,RT-PCR)进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,将数据录入CaliciNet China数据库并进行基因分型。结果2016年10月至2019年9月,共报告诺如病毒疫情1153起,对其中776起疫情(67.3%)的阳性样本进行了基因分型。94.9%的暴发疫情与人–人传播有关,发生在托幼机构或学校(94.4%),每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰(65.0%)。57.6%的诺如病毒暴发由GⅡ.2[P16]引起。结论GⅡ.2[P16]是2016年10月至2019年9月引起我国诺如病毒暴发的主要基因型,主要发生在托幼机构或或学校,CaliciNet China正在进行的监测提供了有关毒株基因分型和暴发特征的信息。

关键词：诺如病毒胃肠炎暴发监测网络基因型

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2022年深圳市5株肠道腺病毒41型(HAdV-41)的分子特征分析

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病毒学报 2023年第6期39卷 1578-1585页

作者：周莎张海龙陈龙屈雅丽黄小丽刘婉秋孟君杨洪朱贞何雅青南华大学公共卫生学院衡阳421001 深圳市疾病预防控制中心病原微生物检测所深圳518055 南方医科大学公共卫生学院流行病学系广州510515 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒学和病毒病重点实验室北京102206

人腺病毒41型(Human adenovirus,HAdV-F41)是儿童胃肠炎的常见病因,但目前HAdV-F41的分子特征尚未得到详细研究。本研究选取2022年2-5月的5个儿童急性腹泻患者的粪便样本,进行高通量测序得到全基因组序列。5个深圳株与参考株Tak(DQ3153... 详细信息

人腺病毒41型(Human adenovirus,HAdV-F41)是儿童胃肠炎的常见病因,但目前HAdV-F41的分子特征尚未得到详细研究。本研究选取2022年2-5月的5个儿童急性腹泻患者的粪便样本,进行高通量测序得到全基因组序列。5个深圳株与参考株Tak(DQ315364)的核苷酸序列同一性为97.5%~98.6%,在四个重要结构基因中无核苷酸的插入和缺失,有2株在Hexon基因可见ε抗原表位发生突变,可能使毒株出现免疫逃逸,出现显著突变的基因区域还有E2A、L4、L5和E4。从NCBI上下载37个完整的HAdV-41全基因组序列建立系统发育树。系统发育树主要分为四个进化分支,其中分支1和分支2是主要的流行分支,5株深圳株处于这两个分支上。在5株深圳株中未发现有明显重组现象。

关键词： HAdV-41 深圳全基因组序列分子特征

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通用引物高通量测序扩增GⅡ.4 Sydney[P31]型诺如病毒基因组及进化分析

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中华实验和临床病毒学杂志 2022年第1期36卷 15-20页

作者：朱曦王鹏飞闫玉晓章青李慧莹靳淼段招军中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 上海吉玛制药技术有限公司上海201203 兰州大学第一临床医学院上海730000

目的分析2017至2020年我国诺如病毒流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因型的基因组以及变异情况。方法利用通用引物初步建立GⅡ组诺如病毒基因组扩增方法,扩增GⅡ.4 Sydney[P31]株基因组,并应用高通量测序技术对其基因组测序,对GⅡ.4 Sydney[P... 详细信息

目的分析2017至2020年我国诺如病毒流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因型的基因组以及变异情况。方法利用通用引物初步建立GⅡ组诺如病毒基因组扩增方法,扩增GⅡ.4 Sydney[P31]株基因组,并应用高通量测序技术对其基因组测序,对GⅡ.4 Sydney[P31]株进行系统进化分析和关键位点分析。结果利用初步建立的GⅡ组基因组扩增方法,8株GⅡ.4 Sydney[P31]株中,6株扩增成功并获得基因组序列。通过系统进化分析表明,本研究获得的自2017—2020年6株毒株和2015—2019年的GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇,2013年我国毒株GZ20133135株与2012—2014年GⅡ.4 Sydney[P31]参考株划为一簇。血型抗原受体结合位点(HBGAs)分析表明2014年以后的毒株在SiteⅡ发生了氨基酸突变Asp372Asn。通过抗原表位分析,2017年以后的毒株,在A表位(297、372和373)、B表位(333)、E表位(414)和H表位(309、310)都发生了变化;2020年的毒株20HN261和20HN253株在A表位(368)和G表位(355)较之前的毒株出现了新变化。结论本研究确定了我国流行株GⅡ.4 Sydney[P31]基因组关键位点变异情况,跟踪新毒株的出现提供了科学依据,为针对我国流行株疫苗研发设计提供了基础数据。

关键词：诺如病毒基因组系统进化分析

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基于CRISPR/Cas9系统Ⅰ型干扰素受体亚单位1基因敲除的Caco-2细胞系的构建

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中国生物制品学杂志 2023年第2期36卷 145-150,157页

作者：刘欣奕安妮章青王宏孔翔羽王铭月庞立丽段招军甘肃中医药大学公共卫生学院甘肃兰州730000 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室北京102206 中国医学科学院医药生物技术研究所北京100050

目的利用成簇规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palinmic repeats,CRISPR)/CRISPR相关蛋白9(CRISPR-associated protein 9,Cas9)系统在人结肠腺癌细胞Caco-2中敲除Ⅰ型干扰素受体亚单位1(interferon alpha/beta receptor subunit 1,IFNAR1)基因,构建IFNAR1基因敲除Caco-2细胞系。方法利用CRISPR/Cas9技术设计特异性识别IFNAR1基因外显子区的sgRNA(single guide RNA)序列,构建LentiCRISPRv2-IFNAR1-sgRNA重组质粒,慢病毒包装后感染Caco-2细胞,嘌呤霉素抗性筛选,有限稀释法培养单克隆细胞系。通过靶基因测序和Western blot法验证IFNAR1基因敲除情况;通过加入外源性IFNβ检测IFNAR1基因敲除细胞CXC趋化因子配体10(CXC chemokine ligand 10,CXCL10)和干扰素刺激基因20(interferon-stimulatd gene 20,ISG20)mRNA水平。结果质粒LentiCRISPRv2-IFNAR1-sgRNA测序结果显示插入位置均位于BsmBⅠ酶切黏性末端。共获得2株IFNAR1基因敲除单克隆细胞株,测序结果显示Caco-2-IFNAR1-KO1的IFNAR1第6个外显子发生5 bp缺失,Caco-2-IFNAR1-KO2的第7个外显子发生18 bp缺失,同时有1 bp增加。与野生型Caco-2细胞相比,Caco-2-IFNAR1-KO1和Caco-2-IFNAR1-KO2细胞IFNAR1蛋白未见表达。相比于0 ng/mL IFNβ,在50 ng/mL外源IFNβ刺激下,Caco-2-IFNAR1-KO1和Caco-2-IFNAR1-KO2细胞CXCL10基因mRNA水平(t分别为0.566和1.268,P>0.05)和ISG20基因mRNA水平(t分别为1.522和1.733,P>0.05)均无明显升高;与野生型Caco-2细胞相比,在50 ng/mL外源IFNβ刺激下,Caco-2-IFNAR1-KO1和Caco-2-IFNAR1-KO2细胞CXCL10基因mRNA水平(t分别为6.763和6.777,P<0.05)和ISG20基因mRNA水平(t分别为5.664和5.653,P<0.05)均显著降低。结论利用CRISPR/Cas9技术成功获得了IFNAR1基因敲除的Caco-2细胞株,该细胞系依赖Ⅰ型IFN受体(interferon alpha/beta receptor,IFNAR)激活的下游分子被明显抑制,为进一步探讨病毒感染Caco-2细胞后的天然免疫反应及复制包装机制提供了有力的工具。

关键词：人结肠腺癌细胞 CRISPR/Cas9系统 Ⅰ型干扰素受体亚单位1基因基因编辑干扰素β CXC趋化因子配体10 干扰素刺激基因20

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