目的:研究头颈部鳞癌(HNSC)肿瘤微环境中免疫及基质浸润状态的预测因子,发现HNSC中潜在的预后相关基因。材料与方法:提取TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中HNSC患者的基因表达数据及临床数据,利用ESTIMATE算法进行肿瘤样本的免疫/...
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目的:研究头颈部鳞癌(HNSC)肿瘤微环境中免疫及基质浸润状态的预测因子,发现HNSC中潜在的预后相关基因。材料与方法:提取TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中HNSC患者的基因表达数据及临床数据,利用ESTIMATE算法进行肿瘤样本的免疫/基质评分。对差异基因进行功能富集分析,蛋白互作网络(PPI)分析和整体生存率分析,以明确与肿瘤微环境中免疫及基质浸润状态关联的关键基因。而后进行单基因的肿瘤及正常组织表达差异分析、生存分析、临床特征相关性分析,以及该基因高、低表达组的免疫细胞差异分析和相关性分析。结果:HNSC肿瘤样本的免疫评分与患者整体生存率、临床分期及T分期之间存在相关性。根据免疫/基质评分,共提取出297个交叉基因,将其中前30位基因与COX回归模型获得的30个低风险基因取交集,得到3个核心基因。经过单基因差异分析后,发现P2RY14可做为预测因子。进一步分析表明,肿瘤组织的P2RY14表达水平低于正常组织,高表达P2RY14的患者预后较好。P2RY14的表达水平与患者临床分期及T分期之间存在相关性。高表达P2RY14组基因主要富集于免疫相关通路;低表达P2RY14组基因主要富集于代谢相关通路。高表达P2RY14的肿瘤样本中CD8+T细胞和激活的CD4+记忆型T细胞增多;M0型巨噬细胞减少,M1型巨噬细胞增多;激活的肥大细胞减少,静息的肥大细胞增多。结论:HNSC的肿瘤微环境与患者预后显著相关,高表达P2RY14的肿瘤样本处于抗肿瘤免疫优势状态,且患者预后较好。
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