检索结果-内蒙古大学图书馆

经济林研究 2015年第2期33卷 149-157页

作者：冉洪张莹胡陶冯云廉超郭起荣国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

经济树种通常基因组较大,测序的组装、注释等存在较大困难,有必要对这方面的研究进展及存在的问题进行分析比较,以提高经济林木全基因组的研究效率。对已经完成全基因组测序的28种经济树种的全基因组测序成果进行了概述,比较了所采用的... 详细信息

经济树种通常基因组较大,测序的组装、注释等存在较大困难,有必要对这方面的研究进展及存在的问题进行分析比较,以提高经济林木全基因组的研究效率。对已经完成全基因组测序的28种经济树种的全基因组测序成果进行了概述,比较了所采用的测序策略、技术与方法及所利用的测序材料,分析了各物种全基因组的大小、基因数量、基因密度、基因均长、平均内含子长度、GC含量等结构特点,汇集了各树种系统发育中的基因组复制等重要分子事件,探讨了其纤维素、木质素、糖与淀粉、油脂、抗性、生殖等重要生物经济性状的基因组学特征,展望了中国在基因组科学领域中的重要影响。

关键词：经济树种全基因组测序基因家族基因系统发育生物经济性状

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毛竹PheDof2转录因子克隆及表达分析

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核农学报 2021年第3期35卷 586-594页

作者：刘俊程占超郑慧芳蔡苗苗彭立鑫白羽聪宋华建高健国际竹藤中心/国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 河南中医药大学/中医药科学院河南郑州450046

Dof蛋白是单锌指结构蛋白家族之一,在植物生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。为了探索Dof转录因子在毛竹中的功能及表达特征,本研究以毛竹实生苗为材料,采取反转录PCR(RT-PCR)技术克隆得到PheDof2基因的cDNA序列,对其进行生物信息学... 详细信息

Dof蛋白是单锌指结构蛋白家族之一,在植物生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。为了探索Dof转录因子在毛竹中的功能及表达特征,本研究以毛竹实生苗为材料,采取反转录PCR(RT-PCR)技术克隆得到PheDof2基因的cDNA序列,对其进行生物信息学初步分析,并检测其在毛竹不同高度笋、花发育,及不同胁迫处理下的表达情况。序列分析结果表明,PheDof2开放阅读框(ORF)为1614 bp,编码527个氨基酸,分子量和等电点分别为53.20 kDa和5.37,具有典型的zf-dof结构域;生物信息学分析结果显示,PheDof2含有两个外显子,一个内含子,启动子序列中存在多个非生物胁迫和光响应元件。蛋白进化结果表明,PheDof2与二穗短柄草亲缘关系最近,相似性为79.05%。荧光定量PCR检测结果显示,PheDof2在毛竹叶片中表达量最高,其次是根,在茎中表达量最低,参与毛竹笋的快速生长及花的发育,说明该基因具有组织表达特异性。在干旱处理的根中,处理6 h时,PheDof2的表达水平出现峰值;在幼茎中,处理24 h时PheDof2的表达量降为最低值。在干旱和脱落酸(ABA)处理的叶片中,PheDof2均在处理6 h时降为最低值。结果表明,PheDof2参与干旱胁迫及ABA介导的信号转导途径。本研究结果为毛竹抗逆育种及PheDof2基因的功能研究提供了理论基础。

关键词：毛竹 PheDof2 基因克隆表达分析

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模型假设对基于模型的森林蓄积量估算的影响

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林业科学 2024年第9期60卷 111-123页

作者：齐元浩侯正阳刘太训徐晴北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室北京100083 国家林业和草原局黑龙江三江平原沼泽草甸生态系统定位观测研究站双鸭山518000 中交天津航道局有限公司天津300461 国际竹藤中心、国家林业和草原局/北京竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

【目的】1)评估模型的线性和非线性形式、模型残差假设对推断不确定性的效应;2)比较2种总体均值的方差估计方法(自助法和解析法);3)评估多种因素对推断不确定性的效应,构建基于遥感模型的统计推断经验法则用于指导实践。【方法】应用基... 详细信息

【目的】1)评估模型的线性和非线性形式、模型残差假设对推断不确定性的效应;2)比较2种总体均值的方差估计方法(自助法和解析法);3)评估多种因素对推断不确定性的效应,构建基于遥感模型的统计推断经验法则用于指导实践。【方法】应用基于模型的统计推断方法,以森林蓄积量估算为例,基于非洲稀树草原的薪材材积实测样地数据和Landsat 8遥感辅助数据,使用二阶抽样从总体中选择160块样地形成样本,在不同模型假设下进行总体参数推断,量化分析参数模型假设对估计量不确定性的效应,并辅以置信椭圆等诊断方法确保分析的有效性。【结果】1)不同模型假设下的总体均值估计值μ_(mb)为7.159~7.331 m^(3)·hm^(-2),解析方差估计值Var(μ_(mb))为0.147~0.221,抽样精度为93.59%~96.64%,总体均值的经验方差估计值Var(μ_(mb))为0.143~0.237。模型假设会影响模型参数估计,进而影响推断精度Var(μ_(mb))。自助法是检验总体参数解析估计量无偏性的有效方法。2)基于设计的统计推断方法得出的总体均值估计值μ_(db)为6.774 m^(3)·hm^(-2),其方差估计值Var(μ_(db))为0.965,抽样精度为85.50%。既定条件下,相比基于设计的统计推断,基于模型的统计推断能够有效将推断精度提升77.10%~84.77%,对抽样精度的提升为9.46%~13.03%。【结论】基于模型的统计推断在小样本推断中具有更高的推断精度和抽样精度,有助于实现高精度、低样本量、短周期的森林资源调查目标,但建模过程中的不确定性会影响推断精度,其中残差变异性对推断不确定性的影响最大。忽略方差异性和空间自相关效应在同方差假设下进行总体参数推断,会低估Var(μ_(mb)),在考虑方差异性的同时应进一步检验空间自相关性并使用相应的权函数和自相关函数模拟残差变异性。

关键词：森林资源遥感调查基于模型的统计推断回归模型方差估计

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16种玉兰亚属植物的AFLP分析

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东北林业大学学报 2013年第8期41卷 91-94页

作者：刘秀丽胡陶张启翔北京林业大学北京100083 国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室(国际竹藤中心)

对16种玉兰亚属植物进行了AFLP分析,共获得1 728个AFLP条带,其中具有多态性的条带为908条,多态率达52.5%。根据AFLP聚类结果对16种玉兰亚属植物的亲缘关系及新种的确定进行了探讨,研究结果支持将天目玉兰(***)和望春玉兰归为同一组;厚... 详细信息

对16种玉兰亚属植物进行了AFLP分析,共获得1 728个AFLP条带,其中具有多态性的条带为908条,多态率达52.5%。根据AFLP聚类结果对16种玉兰亚属植物的亲缘关系及新种的确定进行了探讨,研究结果支持将天目玉兰(***)和望春玉兰归为同一组;厚叶玉兰(***)和红花玉兰(***-sis)亲缘关系最近,结合形态学特征,推测厚叶玉兰可能是红花玉兰的多瓣化变种之一;倾向于将景宁玉兰(***-nostellata)单独作为种的分类处理,并将景宁玉兰、天目玉兰与望春玉兰同归为望春玉兰组;研究中,伏牛山玉兰(***)独特的聚类关系与已有的分类系统均不同,其确切的分类学地位还需更多的研究来验证;AFLP分子标记的研究结果还显示出以萼片状花被片、花被片颜色作为玉兰亚属分组依据存在欠缺和不足。

关键词：玉兰亚属亲缘关系 AFLP

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采用纸培法研究毛竹实生苗根系构型

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经济林研究 2013年第3期31卷 158-160,168页

作者：陈红冯云周建梅廉超郭起荣国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

为给毛竹的栽培管理提供依据,运用纸培法对毛竹根系构型进行了研究。结果表明:在纸培系统中,30 d内毛竹实生苗根长生长呈先快后慢趋势,三次曲线L=-7.116+11.271D+0.257 D2-0.013 D3为最佳拟合方程,相关系数达0.999;根长的生长速率曲线... 详细信息

为给毛竹的栽培管理提供依据,运用纸培法对毛竹根系构型进行了研究。结果表明:在纸培系统中,30 d内毛竹实生苗根长生长呈先快后慢趋势,三次曲线L=-7.116+11.271D+0.257 D2-0.013 D3为最佳拟合方程,相关系数达0.999;根长的生长速率曲线呈双峰形,最大值出现在第6天和第14天,分别为14.72、13.33 mm/d;根与茎叶存在交替生长现象;毛竹实生苗鲜质量根茎比为1.289,干质量根茎比为0.892;根系总表面积为7.598 8×10-4m2;整个纸培过程中毛竹苗仅有1条根系,基根未形成分枝。

关键词：毛竹纸培法实生苗根系构型

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叶黄素循环和D1蛋白周转在毛竹叶片光保护中的作用

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植物科学学报 2020年第1期38卷 134-142页

作者：娄永峰高志民江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室南昌330032 国际竹藤中心国家林业和草原局/北京竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

利用叶绿素荧光技术,对强光胁迫下以及叶黄素循环抑制剂-二硫苏糖醇(DTT)和D1蛋白合成抑制剂-硫酸链霉素(SM)处理后毛竹(Phyllostachys edulis(Carr.)Lehaie)的光抑制特征进行研究。结果显示:在夏季中午强光或人为强光胁迫下,毛竹叶片... 详细信息

利用叶绿素荧光技术,对强光胁迫下以及叶黄素循环抑制剂-二硫苏糖醇(DTT)和D1蛋白合成抑制剂-硫酸链霉素(SM)处理后毛竹(Phyllostachys edulis(Carr.)Lehaie)的光抑制特征进行研究。结果显示:在夏季中午强光或人为强光胁迫下,毛竹叶片最大光化学效率Fv/Fm均显著降低;在下午光强减弱或黑暗、弱光条件下,Fv/Fm可有效恢复。DTT和SM均可抑制毛竹叶片非光化学淬灭(NPQ),且DTT效果明显优于SM。另外,在强光下,DTT和SM处理均能使毛竹叶片Fv/Fm、实际光化学效率Y(Ⅱ)和光化学淬灭qP等荧光参数下降幅度增大。研究结果表明毛竹叶片具有完善的光破坏防御机制,NPQ与叶黄素循环和D1蛋白周转紧密关联,在叶片光保护机制中具有重要作用。

关键词：毛竹叶黄素循环 D1蛋白周转强光叶绿素荧光

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毛竹油菜素内酯受体激酶基因的分子特征及表达模式分析

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热带亚热带植物学报 2018年第3期26卷 215-223页

作者：王思宁孙化雨徐浩杨意宏赵韩生高志民国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所北京100102

为探究毛竹(Phyllostachys edulis)油菜素内酯(brassinolide,BL)受体激酶基因的分子特征和表达模式,采用生物信息学方法对毛竹中BL受体激酶基因进行了分析,并应用实时定量PCR技术对基因的表达模式进行了研究。结果表明,在毛竹基因组中... 详细信息

为探究毛竹(Phyllostachys edulis)油菜素内酯(brassinolide,BL)受体激酶基因的分子特征和表达模式,采用生物信息学方法对毛竹中BL受体激酶基因进行了分析,并应用实时定量PCR技术对基因的表达模式进行了研究。结果表明,在毛竹基因组中共获得8条BL受体激酶基因同源序列(PeBRLs),分别属于4个亚家族。8个PeBRLs编码858~1 224氨基酸,分子量为92~130 kDa。PeBRLs结构相对保守,激酶区均具有BL受体激酶特有的3个保守结构域;除PeBRL1-1具有2个跨膜结构域外,其余PeBRLs只有1个跨膜结构域。8个PeBRLs全部定位在细胞膜上,属于典型的膜嵌合蛋白。实时定量PCR结果显示,每个亚家族成员基因的组织特异性表达模式基本一致,但不同亚家族之间差异明显;在不同发育阶段的竹笋中,PeBRLs的表达呈现为4种变化趋势。因此,8个PeBRLs在毛竹不同组织和笋的不同发育阶段可能发挥着不同的作用。

关键词：毛竹油菜素内酯受体激酶基因生物信息学实时定量PCR 组织特异性表达

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毛竹(Phyllostachys edulis)光系统Ⅰ基因LhcaPe02全长的克隆与序列分析

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安徽农业大学学报 2008年第2期35卷 153-158页

作者：唐文莉彭镇华高健国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

根据大麦Lhca2基因序列的保守区设计PCR引物,采用RT-PCR技术与RACE技术,从毛竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因Lhca2全长。该基因序列从第74 bp开始到第862 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子,编码262个氨基酸。在5′端有73 bp的... 详细信息

根据大麦Lhca2基因序列的保守区设计PCR引物,采用RT-PCR技术与RACE技术,从毛竹中克隆到捕光叶绿素a/b结合蛋白基因Lhca2全长。该基因序列从第74 bp开始到第862 bp含有1个开放阅读框和一个中止密码子,编码262个氨基酸。在5′端有73 bp的非编码区,在3′端含有234 bp的非编码区和14 bp的Poly(A)。此基因定名为LhcaPe02(GenBank:EU121593)。此外,通过DNASTAR软件预测,该基因编码的蛋白质等电点和分子量分别为6.14和28 095.11 Da,其编码的氨基酸序列与光合作用密切相关的位点包括1个硫解酶活性部位(thiolases active site),2个4Fe-4S铁还原氧化蛋白的信号区(4Fe-4S ferredoxins,iron-sulfur binding region signature)等。通过Blast比较分析,LhcaPe02序列和编码的氨基酸序列分别与玉蜀黍、大麦和水稻的相似性较高。

关键词：毛竹 LhcaPe02 序列特性

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毛竹KNOX基因家族全基因组鉴定和组织表达特异性分析

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分子植物育种 2018年第19期16卷 6261-6268页

作者：徐秀荣王思宁刘青赵韩生高志民国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

为了探究KNOX基因在竹子快速生长中的作用,本研究以毛竹(Phyllostachys edulis)为对象,通过同源比对从毛竹基因组中获得12条KNOX同源基因序列。序列分析表明,PeKNOXs的基因结构差异较大,内含子数目1～6个不等,且长度差异较大(30～3 801 ... 详细信息

为了探究KNOX基因在竹子快速生长中的作用,本研究以毛竹(Phyllostachys edulis)为对象,通过同源比对从毛竹基因组中获得12条KNOX同源基因序列。序列分析表明,PeKNOXs的基因结构差异较大,内含子数目1～6个不等,且长度差异较大(30～3 801 bp),但都符合GT-AG剪切原则。PeKNOXs编码蛋白的长度为145～355 aa,分子量为92～130 k D。系统进化分析表明,毛竹PeKNOXs被聚类到2个较大的分支,分别属于Ⅰ、Ⅱ类KNOX亚家族,Ⅰ类中包含PeKNOX1-1～PeKNOX1-5,其中PeKNOX1-1与OSH71、PeKNOX1-2与OSH10、PeKNOX1-3与OSH15均聚类到一起,而PeKNOX1-4和PeKNOX1-5与OSH43聚类到较近的分支;Ⅱ类中包含PeKNOX2-1～PeKNOX2-7,其中PeKNOX2-1和PeKNOX2-2聚类到一个分支,与其它PeKNOXs距离较远,而且PeKNOXs与已知拟南芥的KNATs距离均较远。利用毛竹转录组数据构建热图进行分析,表明除了PeKNOX2-1外,其余PeKNOXs均检测到表达,但2个亚家族不同成员的表达均存在着一定的差异,如PeKNOX1-3的相对表达量最高,PeKNOX1-5的最低。实时定量PCR验证表明,PeKNOX1-3和PeKNOX1-5在不同组织中均有表达,其中在节中表达量最高,其次是茎,而在叶片和叶鞘中的表达量均较低,这与转录组数据相类似。由此表明,PeKNOXs可能在竹子生长发育中起重要调控作用,为进一步利用PeKNOXs开展竹子基因工程研究提供了参考。

关键词：毛竹 KNOX基因分子特征表达模式分析

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不同竹种竹叶提取物制备及其抗氧化活性比较研究

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安徽农业大学学报 2012年第4期39卷 540-544页

作者：王慧岳永德郭雪峰汤锋王进姚曦孙嘏国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

以毛竹、苦竹、香竹、箬竹、粉单竹、青杆竹和青皮竹7个竹种竹叶为材料,采用热回流法提取,大孔树脂法分离纯化,对得到竹叶提取物测定其得率和主要黄酮成分的含量,进而探讨竹叶提取物的抗氧化活性,为竹叶提取物在食品和化妆品领域的应用... 详细信息

以毛竹、苦竹、香竹、箬竹、粉单竹、青杆竹和青皮竹7个竹种竹叶为材料,采用热回流法提取,大孔树脂法分离纯化,对得到竹叶提取物测定其得率和主要黄酮成分的含量,进而探讨竹叶提取物的抗氧化活性,为竹叶提取物在食品和化妆品领域的应用提供科学依据。结果表明,苦竹叶提取物得率最高,为3.60%～3.70%;香竹叶提取物中所含的荭草苷和异荭草苷量最高,为2.523 0%～2.532 6%,苦竹叶提取物中所含的牡荆苷量最高,为0.887 0%～0.889 6%,青杆竹叶提取物中所含的异牡荆苷量最高,为2.223 1%～2.226 1%;竹叶提取物具有较强的自由基清除作用;香竹表现的DPPH自由基清除能力最强,IC50值为30.50 mg·L-1;箬竹的超氧阴离子和羟自由基清除效果最强,IC50值分别为339.32 mg·L-1和324.87 mg·L-1。

关键词：竹叶提取物抗氧化活性 IC50值

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