检索结果-内蒙古大学图书馆

浙江农林大学学报 2021年第1期38卷 93-102页

作者：娄永峰高志民江西省林业科学院江西省植物生物技术重点实验室江西南昌330032 国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所国家林业和草原局/北京市共建竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

【目的】探究早期光诱导蛋白(ELIP)基因在竹子光保护中的作用,为进一步阐述竹子光保护机制提供参考依据。【方法】以毛竹Phyllostachys edulis实生苗为材料,在前期研究的基础上克隆毛竹ELIP基因,利用qRT-PCR技术研究其在不同光照诱导下... 详细信息

【目的】探究早期光诱导蛋白(ELIP)基因在竹子光保护中的作用,为进一步阐述竹子光保护机制提供参考依据。【方法】以毛竹Phyllostachys edulis实生苗为材料,在前期研究的基础上克隆毛竹ELIP基因,利用qRT-PCR技术研究其在不同光照诱导下的表达谱,同时通过在拟南芥Arabidopsis thaliana中异位表达对1个基因的功能进行初步鉴定。【结果】克隆获得了3个毛竹ELIP基因(PeELIP1、PeELIP2和PeELIP3),分别编码165、179和182个氨基酸。蛋白结构分析表明:3个PeELIPs蛋白均具有典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能域,含3个α-螺旋跨膜结构,属于叶绿素a/b结合蛋白超家族。序列比对及进化分析表明:PeELIPs与水稻Oryza sativa、玉米Zea mays等单子叶植物的ELIPs相似性较高,同源性达72%以上,聚类在同一分支。qRT-PCR分析表明:3个PeELIPs基因在毛竹黄化苗中仅检测到微弱表达,光照处理使3个基因的表达量均显著上调;同时在正常毛竹实生苗叶片中,随着光照强度的增强和强光胁迫处理时间的延长,3个PeELIPs基因的表达量都显著上调。过表达PeELIP3可减缓转基因拟南芥在强光下Fv/Fm的下降幅度,但未影响转基因植株的非光化学猝灭系数。【结论】毛竹中至少存在3个PeELIPs,且其表达均受光照的诱导。过量表达PeELIP3能够减缓转基因拟南芥受光抑制的程度,具有一定的光保护作用。

关键词：毛竹早期光诱导蛋白基因表达分析光保护

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毛竹全长LTR逆转座子的鉴定和进化分析

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分子植物育种 2014年第6期12卷 1265-1274页

作者：胡陶马艳军李雪平刘秀丽高健国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 北京林业大学园林学院北京100083

转座子和逆转座子的大量插入,是高等植物基因组进化的重要动力。作为植物基因组研究热点的禾本科植物之一,毛竹基因组大小约为2 Gb,60%为重复序列,长末端重复序列型逆转座子（LTR逆转座子）则占全部重复序列的一半以上,然而目前对毛竹... 详细信息

转座子和逆转座子的大量插入,是高等植物基因组进化的重要动力。作为植物基因组研究热点的禾本科植物之一,毛竹基因组大小约为2 Gb,60%为重复序列,长末端重复序列型逆转座子（LTR逆转座子）则占全部重复序列的一半以上,然而目前对毛竹基因组中LTR逆转座子及进化情况知之甚少。本研究利用已发表的毛竹基因组序列,首次通过大数据筛查预测获得9 436个平均长度10.3 kb的全长LTR逆转座子。通过分析,我们估算出毛竹LTR逆转座子插入基因组的时间主要分布于200~500万年前,晚于毛竹基因组四倍化的时间。研究还发现了29个位于全长LTR逆转座子内部、有转录组序列支持的蛋白编码基因,这些毛竹基因均不符合所在基因组区段的毛竹-水稻基因共线性关系,且位于LTR逆转座子内部的基因与存在于染色体其他位置的同源基因在表达模式上有着较大差异。本研究首次尝试从LTR逆转座子的角度探索毛竹基因的进化历程,也为今后的植物基因组研究提供了重要的基础数据。

关键词：毛竹转座因子长末端重复序列型逆转座子进化基因组

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毛竹磷转运蛋白Ⅰ家族基因鉴定及表达模式

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浙江农林大学学报 2022年第3期39卷 486-494页

作者：王绍良张雯宇高志民周明兵杨克彬宋新章浙江农林大学省部共建亚热带森林培育国家重点实验室浙江杭州311300 国际竹藤中心竹藤资源基因科学与基因产业化研究所国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102

【目的】鉴定毛竹Phyllostachys edulis磷转运蛋白Ⅰ(phosphate transporter 1,PHTⅠ)家族基因,分析其表达模式。【方法】利用生物信息学方法,鉴定毛竹PHTⅠ家族成员,分析基因启动子调控元件、编码蛋白的理化性质、基因结构、氨基酸保... 详细信息

【目的】鉴定毛竹Phyllostachys edulis磷转运蛋白Ⅰ(phosphate transporter 1,PHTⅠ)家族基因,分析其表达模式。【方法】利用生物信息学方法,鉴定毛竹PHTⅠ家族成员,分析基因启动子调控元件、编码蛋白的理化性质、基因结构、氨基酸保守基序、基因在染色体的位置、组织表达特异性、基因适应性进化及系统进化等。【结果】毛竹中共鉴定出20个PHTⅠ家族基因(PePHTs),分布在10条染色体上,均定位于细胞膜。每个基因都含有1~2个内含子,PePHTs启动子序列中包含干旱、低温等非生物胁迫以及赤霉素等激素类响应元件。毛竹PHTⅠ大部分为碱性蛋白质,分子量为48.61~76.37 kDa,理论等电点为6.84~9.30,疏水性值均大于0,都属于疏水蛋白。基因适应性进化分析显示:大多数PePHTs的选择压力值小于0,说明多数基因受到负选择压力。转录组表达图谱表明:PePHTs在不同组织中的表达存在差异性,说明该基因家族在毛竹生长发育过程中发挥着不同的作用。系统进化树表明:PePHTs都聚类在第Ⅰ亚家族,并且优先和水稻Oryza sativa聚类在同一支上。【结论】PHTⅠ家族在植物吸收和转运磷的过程中扮演了重要作用。本研究结果为深入研究毛竹PHTⅠ家族基因的功能奠定了理论基础。

关键词：毛竹磷转运蛋白磷吸收分子特征表达分析

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毛竹miR164b前体的克隆及其在叶形态建成中的功能分析

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植物科学学报 2017年第4期35卷 551-557页

作者：王丽丽李利超孙化雨赵韩生高志民国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 连云港市农业科学院江苏连云港222006

microRNA(miRNA)参与植物多种生理代谢过程,在调控植物形态建成中发挥着重要作用。miR164作为植物特有的miRNA,其主要的靶基因是NAC转录因子,参与调控植物茎、叶顶端分生组织的建立、器官的分化和植株衰老等过程。本研究以毛竹(Phyllost... 详细信息

microRNA(miRNA)参与植物多种生理代谢过程,在调控植物形态建成中发挥着重要作用。miR164作为植物特有的miRNA,其主要的靶基因是NAC转录因子,参与调控植物茎、叶顶端分生组织的建立、器官的分化和植株衰老等过程。本研究以毛竹(Phyllostachys edulis(Carr.)Lehaie)为材料,从中分离出miR164b的前体序列(82 bp),二级结构分析结果发现该前体序列能够形成稳定的茎环结构,其成熟序列(21 bp)产生于茎环结构5'端的臂上,且碱基具有较高的保守性。本研究还构建了由Ca MV 35S启动,包含毛竹miR164b前体序列的植物表达载体,并转化野生型拟南芥(Arabidopsis thaliana(L.)Heynh),获得了转基因植株。结果表明,转基因植株生长瘦弱,莲座叶数量明显减少,叶片变小且叶片边缘锯齿减少,更加光滑。实时定量PCR分析结果显示,转基因拟南芥中毛竹miR164b的表达量极显著上升,而拟南芥内源靶基因CUC1与CUC2的表达量极显著下降。表明毛竹miR164b通过调节CUC1和CUC2的表达来参与植物叶形态建成过程。研究结果可为利用miRNA开展竹子分子育种提供参考。

关键词：毛竹 miR164b 前体叶形态建成

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毛竹CCR基因家族成员生物信息学和表达模式分析

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基因组学与应用生物学 2019年第3期38卷 1168-1177页

作者：徐浩孙化雨王思宁杨意宏赵韩生高志民国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室国际竹藤中心竹藤资源基因科学研究所北京100102 河北农业大学保定071001

肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素生物合成的关键酶之一,对木质素生物合成途径的碳流具有重要的调控作用。研究毛竹(Phyllostachys edulis) CCR基因的分子特征和表达模式对于揭示影响竹子材性的木质素调控机制具有重要意义。采用同源序... 详细信息

肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)是木质素生物合成的关键酶之一,对木质素生物合成途径的碳流具有重要的调控作用。研究毛竹(Phyllostachys edulis) CCR基因的分子特征和表达模式对于揭示影响竹子材性的木质素调控机制具有重要意义。采用同源序列比对的方法在毛竹基因组中获取13个CCR基因同源序列,其中9个具有完整的保守结构域,依次命名为PeCCR1～PeCCR9。PeCCRs基因的内含子数量、长度和位置均存在较大差异,如PeCCR2有5个内含子,而PeCCR5没有内含子;内含子最长的为4 090 bp,最短的仅为89 bp。PeCCRs编码的氨基酸序列长度范围为136～391 aa,推测分子量在14.97～43.05 kD之间,理论等电点介于5.60～8.31之间。PeCCRs的氨基酸序列在N-端和C-端均存在明显的差异,二级、三级结构进一步显示了其差异,但中部序列具有很高的一致性,都含有肉桂酰辅酶A还原酶家族蛋白特有的保守结构域和催化位点,表明其进化上是比较保守的。基于转录组数据的基因组织表达特异性分析表明,PeCCRs在各组织中的表达量差异明显,如PeCCR6在盛花期花序、鞭和笋中均未检测到基因表达,PeCCR9在盛花期花序中的表达是所有PeCCRs最高的,而PeCCR5在50 cm笋中则是所有检测到PeCCRs中最低的。本研究为进一步研究毛竹CCR基因家族成员的功能提供了参考,为利用基因工程调控竹子木质素提供了依据。

关键词：毛竹肉桂酰辅酶A还原酶生物信息学表达模式

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毛竹miR398和miR408的克隆及其表达分析

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热带亚热带植物学报 2017年第3期25卷 241-249页

作者：李利超孙化雨杨意宏赵韩生王思宁高志民国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 河北农业大学园艺学院河北保定071001

为了解毛竹(Phyllostachys edulis)中miR398和miR408的表达情况,从毛竹叶片中分离了二者的前体序列,并用实时定量PCR技术对其表达模式进行了研究。结果表明,毛竹中miR398和miR408前体序列ped-MIR398和ped-MIR408长度分别为83 bp和92 bp... 详细信息

为了解毛竹(Phyllostachys edulis)中miR398和miR408的表达情况,从毛竹叶片中分离了二者的前体序列,并用实时定量PCR技术对其表达模式进行了研究。结果表明,毛竹中miR398和miR408前体序列ped-MIR398和ped-MIR408长度分别为83 bp和92 bp,二者均能形成稳定的茎环结构,其中成熟miRNA序列(ped-miR398和ped-miR408)均位于5′端臂上。ped-miR398和ped-miR408均为组成型表达,在毛竹叶中表达量最高。强光、蔗糖和GA3处理后,叶片中ped-miR398与pedmiR408的表达量均上调;CuSO_4和ABA处理后,叶片中二者的表达量均下调;黑暗、NaCl和4℃处理后,前者表达量上调,后者表达量下调。因此,ped-miR398与ped-miR408在毛竹适应逆境胁迫过程中可能发挥着不同的调控作用。

关键词：毛竹 miRNA 非生物胁迫基因表达

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绿竹BoSUT2基因的分子特征与亚细胞定位

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林业科学 2010年第2期46卷 45-50页

作者：高志民杨学文彭镇华李雪平牟少华马艳军国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 中国林业科学研究院林业研究所北京100091

植物蔗糖转运蛋白(sucrose transporter,SUT)作为一种功能性蛋白,在蔗糖运输以及蔗糖特异信号感应过程中发挥着重要的生理功能。采用RT-PCR方法从绿竹中分离1个新的编码蔗糖转运蛋白基因,cDNA长1668bp,编码555个氨基酸,命名为BoSUT2(注... 详细信息

植物蔗糖转运蛋白(sucrose transporter,SUT)作为一种功能性蛋白,在蔗糖运输以及蔗糖特异信号感应过程中发挥着重要的生理功能。采用RT-PCR方法从绿竹中分离1个新的编码蔗糖转运蛋白基因,cDNA长1668bp,编码555个氨基酸,命名为BoSUT2(注册号:EU247931)。序列分析表明,BoSUT2与其他单子叶植物的蔗糖转运蛋白有着较高的一致性,其中与绿竹BoSUT1一致性最高,达92.3%。编码蛋白二级结构预测分析显示,BoSUT2具有糖运转子保守域和跨膜结构域,属于膜蛋白。组织特异性表达检测表明,BoSUT2在叶片和叶鞘中的表达丰度较高且比较接近,在根中有微弱表达。将BoSUT2置于35S启动子之下,构建了含GFP的融合表达载体,并转化烟草悬浮细胞,观察结果表明,BoSUT2主要定位到细胞质膜上。

关键词：绿竹蔗糖转运蛋白基因组织特异性表达亚细胞定位

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毛竹PSⅡ大量捕光天线蛋白基因克隆及其表达分析

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植物科学学报 2012年第1期30卷 64-71页

作者：高志民刘颖丽彭镇华国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 中国林业科学研究院林业研究所北京100091

采用RT-PCR和RACE技术,从一年生毛竹(Phyllostachys edulis)新鲜叶片中分离到3个捕光色素结合蛋白基因cab-PhE2、cab-PhE3和cab-PhE6,GenBank登记号分别为EF207230、EF405877和EF628209。序列分析表明,3个基因分别与其它植物如水稻、玉米、大麦等PSⅡ的lhcb2、lhcb1、lhcb3基因有着较高的一致性,其编码的蛋白属于大量捕光天线。蛋白结构预测表明,3个基因编码的蛋白均由导肽和成熟蛋白组成,其中成熟蛋白的二级结构均包含4个α螺旋结构、3个类胡萝卜素结合位点,以及相应的叶绿素a、b结合位点。组织特异性表达检测表明,3个基因在叶片、叶鞘和幼茎中均有表达,且在叶片中最高,而在根中未检测到表达。在强光照射(1500μmo.l m-2.s-1)条件下,3个基因的表达量均呈下调趋势,不同基因间存在着一定的差异,其中cab-PhE3和cab-PhE2的表达丰度在光照4 h内下降较快,至6 h cab-PhE2接近于零,而cab-PhE6经光照4 h表达丰度仍为对照的70%以上,但之后2 h后很快降至对照的5%以下。

关键词：毛竹光系统Ⅱ 捕光蛋白基因二级结构预测

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中国竹类研究成果分析

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江西农业大学学报 2013年第3期35卷 468-472页

作者：陈红冯云马学忠周建梅廉超郭起荣国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京朝阳100102 上犹县林业局江西上犹341200

系统搜集、整理了我国1949—2010年间鉴定的竹类研究成果1 000项。分析发现,竹类研究成果数量随年代稳步增长,20世纪80年代开始迅速增长;毛竹的成果数量最多,占总量33.8%;县市级科研单位、院校和省级以上科研院所系统成果数量分别占总量... 详细信息

系统搜集、整理了我国1949—2010年间鉴定的竹类研究成果1 000项。分析发现,竹类研究成果数量随年代稳步增长,20世纪80年代开始迅速增长;毛竹的成果数量最多,占总量33.8%;县市级科研单位、院校和省级以上科研院所系统成果数量分别占总量的30.8%、23.1%和21.1%,为产出竹类研究成果的中坚;福建、江西、浙江、湖南、四川、广东、安徽、广西等8省成果数量最多,占总量的71.6%;研究成果中,林业工程、森林培育学、经济林学和森林保护学4个二级学科占据总量的78%。

关键词：竹类研究成果中国数量特征

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一个中国水仙MADS-box基因的克隆与分析

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园艺学报 2008年第2期35卷 295-300页

作者：高志民陈段芬李雪平蔡春菊彭镇华国际竹藤网络中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室北京100102 中国林业科学研究院林业研究所北京100091

采用RT-PCR技术从中国水仙(Narcissus tazetta *** Roem.)幼嫩花蕾中分离到一个新的水仙花发育相关MADS-box基因,命名为NTMADS1(GenBank登录号:EF421828)。该基因长879bp,编码区共编码230个氨基酸,具有典型的植物MADS-box基因结构,由MADS区、I区、K区和C末端组成。序列分析结果表明,NTMADS1编码的蛋白与其它植物的MADS-box蛋白有着较高的一致性,其中与扫状天门冬(Asparagus virgatus Baker)的AVAG1的一致性高达89%。系统进化树分析表明NTMADS1属于AG亚族。

关键词：中国水仙 MADS—box基因克隆系统进化树分析

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