检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2019年第7期17卷 2279-2284页

作者：潘莉李勇杰马婷吴涛宁德鲁云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室昆明650201

油橄榄种间杂交可拓宽现有油橄榄种质资源的遗传基础,其杂种真实性鉴定可为种间杂交技术改良和种质利用提供技术条件。云南省林业科学院以佛奥(Olea europaea cv. Frantoio)作母本、尖叶木樨榄(***)作父本,成功杂交育得子代。本研究利... 详细信息

油橄榄种间杂交可拓宽现有油橄榄种质资源的遗传基础,其杂种真实性鉴定可为种间杂交技术改良和种质利用提供技术条件。云南省林业科学院以佛奥(Olea europaea cv. Frantoio)作母本、尖叶木樨榄(***)作父本,成功杂交育得子代。本研究利用14个在亲本间存在差异的油橄榄SSR标记,对3个种间杂交子代和1个疑似杂交种"欧莱雅"的杂种真实性进行了鉴定。结果表明,1个SSR标记(EMO90)仅在佛奥和杂交子代中有SSR-PCR扩增产物,而在尖叶木樨榄中无产物,表现为显性标记;其余13个SSR标记(Oli23,Oli26, GAPU01, GAPU59, GAPU71, DCA05, DCA07, DCA08, DCA15, DCA18, EMO2, EMO3, UDO09)为共显性标记,其中3个SSR标记(GAPU71, EMO2和EMO3)能够将子代杂合而亲本纯合的基因型直观进行呈现,明确证实了杂交种的真实性。本研究为今后油橄榄远缘杂交育种时杂种的早期鉴定提供了技术支持。

关键词：油橄榄尖叶木樨榄杂交种种间杂交 SSR

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蛹虫草聚酮合酶基因的多样性分析

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西部林业科学 2019年第2期48卷 97-103,113页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基... 详细信息

以蛹虫草的菌丝体为材料,利用基因组挖掘的方式从蛹虫草基因组中获得其聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因,对这些PKS基因进行生物信息学分析以推断它们的功能,并检测它们在不同培养基上的表达情况。结果表明:蛹虫草中含有13个PKS基因(CmPKS 1-13),包括2个非还原型聚酮合酶(Non-reducing PKS,NR-PKS),5个部分还原的聚酮合酶(Partial-reducing PKS,PR-PKS),6个高度还原型聚酮合酶(Highly reducing PKS,HR-PKS);聚类分析显示CmPKS 1、CmPKS 3可能参与链格孢吡喃酮(alternapyrone),CmPKS 4可能参与黄曲霉素,CmPKS 5可能参与美伐他汀,CmPKS 6可能参与分生孢子色素,CmPKS 8可能参与伊快霉素的生物合成,其余PKS与生物合成未知化合物的PKS聚为一支;半定量PCR显示CmPKS 7和CmPKS 9在4种培养基上均强烈表达;CmPKS 3、CmPKS 6在4种培养基上微弱表达;CmPKS 10、CmPKS 11和CmPKS 12只在GL培养基上强烈表达,在其余3种培养基上微弱表达;CmPKS 1和CmPKS 4只在GL培养上微弱表达,CmPKS 8仅在GS培养基上微弱表达;CmPKS 2、CmPKS 5和CmPKS 13在检测的培养基中都不表达。本研究为进一步异源表达蛹虫草中的PKS基因及其功能鉴定、具新颖结构聚酮化合物的发掘奠定基础。

关键词：蛹虫草基因组挖掘聚酮合酶基因表达聚酮类化合物

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皮革肾岛衣一个聚酮合酶基因的克隆与鉴定

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第1期48卷 82-87页

作者：原晓龙华梅陈剑张传光王毅云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达... 详细信息

通过对地衣型真菌皮革肾岛衣转录组数据的分析,挖掘出1条非还原型聚酮合酶基因,通过RT-PCR首次克隆得到该基因的cDNA全长(NpPKS2),并通过生物信息学手段分析其基因和蛋白氨基酸序列,采用荧光定量PCR技术分析该基因在不同培养基上的表达情况.结果显示:NpPKS2基因全长6 249 bp,编码2 082个氨基酸;生物信息学分析显示该基因编码1种非还原型聚酮合酶,结构域顺序为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,根据聚类分析和结构域分析,推断NpPKS2为苔色酸合成酶;荧光定量分析显示地衣型真菌皮革肾岛衣中的NpPKS2基因用BMG培养基培养时表达量最高.

关键词：皮革肾岛衣非还原型聚酮合酶生物信息学基因表达

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文山兜兰种子非共生萌发方法的研究

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西部林业科学 2019年第2期48卷 109-113页

作者：华梅向振勇孔继君赵黎明蒋宏云南省林业科学院云南昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201

以文山兜兰成熟但未开裂的果荚为研究材料,以种子萌发时间及萌发率作为考察指标,探究固体培养和液体悬浮培养2种方法对文山兜兰种子萌发的影响,同时采用单因素法探究直接播种与低温处理播种对文山兜兰种子萌发的影响。结果表明,与固体... 详细信息

以文山兜兰成熟但未开裂的果荚为研究材料,以种子萌发时间及萌发率作为考察指标,探究固体培养和液体悬浮培养2种方法对文山兜兰种子萌发的影响,同时采用单因素法探究直接播种与低温处理播种对文山兜兰种子萌发的影响。结果表明,与固体培养方法相比,文山兜兰种子在液体悬浮培养的条件下平均萌发时间提前且萌发率更高,液体悬浮培养更适合文山兜兰种子初期的萌发培养。文山兜兰种子直接播种,其萌发时间较长,且萌发率较低。在经过低温处理73d以后再进行播种,文山兜兰种子萌发时间可提前13d,萌发率达到59.33%。不同的培养基种类能显著地影响文山兜兰种子萌发的时间及萌发率,1g/L的花宝1号(含椰子粉)培养基能显著缩短萌发的时间,并且具有较高的萌发率。综合分析,文山兜兰种子最佳的萌发方法为低温处理种子,采用花宝1号(含椰子粉)作为培养基进行液体悬浮培养。

关键词：文山兜兰非共生萌发液体悬浮培养低温处理

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球孢白僵菌发酵液抗人体致病细菌活性研究

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西部林业科学 2019年第1期48卷 18-22,28页

作者：李娟虞泓王毅云南大学云南昆明650091 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了探究球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液的抗菌活性以及不同培养基对其抗菌效果的影响,用乙酸乙酯萃取球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液,旋干后得到提取物,采用抑菌圈法测定其对6种耐药性人体致病细菌以及8种普通人体致病细菌的抗菌活性,并通过单... 详细信息

为了探究球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液的抗菌活性以及不同培养基对其抗菌效果的影响,用乙酸乙酯萃取球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液,旋干后得到提取物,采用抑菌圈法测定其对6种耐药性人体致病细菌以及8种普通人体致病细菌的抗菌活性,并通过单菌多产物策略,改变培养基碳氮源,检测抗菌效果的变化。结果表明:球孢白僵菌YFCCFQ001提取物对4种耐药性致病细菌(溶血性葡萄球菌、大肠埃希菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌)和8种普通致病细菌均有抗菌活性(其中关于球孢白僵菌对副溶血性弧菌、短小芽孢杆菌、无乳链球菌、福氏志贺氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌的抗菌活性未见文献报道)。不同氮源对其抗菌活性影响显著,其中胰蛋白胨抗菌效果最好,对3种耐药性致病细菌和6种普通致病细菌均有活性。研究发现了球孢白僵菌对耐药性致病细菌的抗菌活性,以及不同培养基对球孢白僵菌发酵液抗菌活性的影响,为真菌中新型抗菌天然产物的寻找和利用提供新的思路。

关键词：球孢白僵菌 OSMAC策略抗菌活性耐药性致病细菌人体致病细菌

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三江并流区金沙江流域云南核桃种质资源遗传多样性及分布特征

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南方农业学报 2019年第12期50卷 2656-2664页

作者：陈少瑜吴涛肖良俊云南省林业和草原科学院昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南省林业和草原科学院经济林研究所昆明650201

【目的】揭示三江并流区金沙江流域云南核桃种质资源的遗传多样性及分布特征,为该区域核桃资源的合理开发利用及科学保护提供参考依据。【方法】沿金沙江流域采集153份云南核桃资源,根据乡(镇)行政区划及资源分布情况将其划分成5个群体... 详细信息

【目的】揭示三江并流区金沙江流域云南核桃种质资源的遗传多样性及分布特征,为该区域核桃资源的合理开发利用及科学保护提供参考依据。【方法】沿金沙江流域采集153份云南核桃资源,根据乡(镇)行政区划及资源分布情况将其划分成5个群体(YL、DQ、QZ、PTG和YC),采用微卫星(SSR)分子标记进行等位片段检测;运用GenAIEx6.5计算等位片段数,并以POPGENE version 1.32分析群体的遗传多样性。【结果】19对SSR引物共检测到130个等位片段,各片段在153份样本中的出现频率各不相同,其中片段A122出现的频率最高,达0.8301;有14个片段频率最低(稀有等位片段),仅0.0033。5个群体等位片段数量占总数的比例在70.70%~85.38%,Nei’基因多样性指数(H)平均为0.6046,Shannon’s信息指数(I)平均为1.1709,期望杂合度(He)平均为0.6165。5个群体遗传多样性的分布排序依次为QZ>YL>PTG>YC>TD。其中,TD群体高频率等位片段频率达0.9062,稀有等位片段占总稀有等位片段的比例为21.43%;PTG群体稀有等位片段占总稀有等位片段的比例达42.86%。【结论】三江并流区金沙江流域云南核桃种质资源的遗传多样性属于中等水平,应采取积极措施进行保护和利用,尤其应加强对野生核桃资源的保护和利用。开展品种选育及种质资源保护工作时,在选择遗传多样性高的群体基础上,应结合表型性状及稀有等位片段频率的分布特征,侧重于群体内单株的选择。

关键词：云南核桃种质资源 SSR标记遗传多样性分布特征三江并流区金沙江流域

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1个含有SDR结构域PKS/NRPS基因的克隆

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浙江农林大学学报 2019年第6期36卷 1247-1253页

作者：原晓龙李娟李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091

聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中... 详细信息

聚酮和非核糖体多肽的复合化合物具有独特的生理活性,它们由聚酮合酶/非核糖体肽合成酶(PKS/NRPS)催化合成。目前球孢白僵菌Beauveria bassiana中含SDR结构域的PKS/NRPS酶的生物合成机制尚不清楚,采用基因挖掘技术从球孢白僵菌基因组中分离得到1个PKS/NRPS基因(命名Bbpks2),利用生物信息学分析对其功能进行预测并检测该基因在以6.0 g·L^-1麦芽提取物和3.0 g·L^-1酵母提取物为基本氮源培养基,7种碳源添加物和以1.8 g·L^-1麦芽糖和6.0 g·L^-1葡萄糖为基本碳源培养基,4种氮源添加物培养基上的具体表达情况,其中每种添加物含量为4.0 g·L^-1。结果显示:Bbpks2基因长度为12 051 bp,编码4 016个氨基酸;其结构域组织顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR,是一种含有SDR结构域的PKS/NRPS;系统进化分析发现,BbPKS2与球孢白僵菌JEF007菌株(PMB64475.1)、头状虫草Tolypocladium capitatum(PNY25600.1)等的PKS/NRPS蛋白聚在同个分支中,可能参与一种聚酮/非核糖体多肽类化合物的生物合成;比较不同氮源、碳源添加物对Bbpks2基因表达的影响,发现该基因在添加了乳糖的培养基上的表达量是其他碳源添加物的3.4倍以上,添加了牛肉浸粉的培养基上表达量是其他氮源添加物的1.3倍以上。该研究为下一步通过异源表达鉴定Bbpks2基因的具体功能,及其调控机理研究和基因资源利用奠定基础。

关键词：森林保护学球孢白僵菌杂合PKS/NRPS 生物信息学分析

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长蕊木兰叶片挥发油的化学成分及其分类学意义

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西部林业科学 2019年第1期48卷 29-35页

作者：华梅司马永康马惠芬张达杨冀寅徐涛云南省林业科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南大学生命科学学院云南昆明650091

采用同时蒸馏萃取法(SDE)对长蕊木兰叶片中挥发油进行提取,同时采用气相色谱/质谱(GC/MS)联用技术对挥发油中化学成分进行分析,并利用峰面积归一化法得出各化学成分在挥发油中的相对百分含量。采用文献比对分析法,将长蕊木兰叶片挥发油... 详细信息

采用同时蒸馏萃取法(SDE)对长蕊木兰叶片中挥发油进行提取,同时采用气相色谱/质谱(GC/MS)联用技术对挥发油中化学成分进行分析,并利用峰面积归一化法得出各化学成分在挥发油中的相对百分含量。采用文献比对分析法,将长蕊木兰叶片挥发油中分析得到的主要化学成分与已报到的木兰科其他属种挥发油的化学主成分进行比对分析,以探讨长蕊木兰叶片挥发油的主成分作为其化学分类指标的可能性。结果表明:从长蕊木兰叶片的挥发油中共分离出29个色谱峰,鉴定其中的26个化合物,占挥发物组成的92.92%。长蕊木兰叶片的挥发油化学成分主要由醇和烯类化合物组成,3-蒈烯相对百分含量占52.11%,为长蕊木兰叶片挥发油中相对百分含量最高的成分。其余成分还包括右旋柠檬烯(2.59%)、Tricyclo[2,2,1,0(2,6)]heptane,1,3,3-trimethyl(2.36%)、3-Thujene(9.67%)、罗勒烯(3.77%)、4-蒈烯(2.2%)、黃樟素(2.81%)、马兜铃烯(2.94%)、4-杜松二烯(4.42%)、反式-橙花叔醇(2.64%)、α-毕橙茄醇(2.14%)。长蕊木兰挥发油化学成分中3-蒈烯的相对百分含量较高,并且与木兰科其他属种挥发油的主成分不同,因此相对百分含量较高的3-蒈烯有望作为长蕊木兰中区别于木兰科其他属种的一个重要化学指标。

关键词：长蕊木兰化学分类学 GC/MS 同时蒸馏萃取法挥发油

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球孢白僵菌中与致病相关的NRPS基因的克隆与表达

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西部林业科学 2019年第6期48卷 135-139页

作者：原晓龙李桂凤李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护与繁育重点实验室云南昆明650201 沾益海峰省级自然保护区管护局云南曲靖655331

以真菌球孢白僵菌为研究对象,以基因序列相似性为基础从球孢白僵菌基因组中挖掘获得Bbnrps1基因,再通过序列相似性和聚类分析等生物信息学方法推断该基因功能,并比较相同环境下不同的培养基配方对该基因表达水平差异等手段以寻找能够诱... 详细信息

以真菌球孢白僵菌为研究对象,以基因序列相似性为基础从球孢白僵菌基因组中挖掘获得Bbnrps1基因,再通过序列相似性和聚类分析等生物信息学方法推断该基因功能,并比较相同环境下不同的培养基配方对该基因表达水平差异等手段以寻找能够诱导该基因表达的最佳条件。结果表明,Bbnrps1基因的cDNA全长4032bp,编码1343个氨基酸;BbNRPS1是一种定位于细胞质基质,无信号肽具7个跨膜结构域的蛋白;BbNRPS1与羊毛状小孢子菌(Microsporum canis,XP_002842845)、Nannizzia gypsea(XP_003169294)、Xylona heveae(XP_018190776)聚为一支,可能负责参与ETP类毒素的生物合成。在以乳糖、葡萄糖、山梨醇和肌醇为碳源添加物的培养基上,Bbnrps1基因表达量较高,在以甘露糖和果糖为碳源添加物的培养基上表达量较低,在麦芽糖上不表达;在以牛肉浸粉(SGB)、胰蛋白胨(SGT)和马铃薯浸粉(SGP)为氮源添加物的培养基上表达量较高,在酪蛋白胨(SGC)上不表达。本研究有助于预测nrps基因功能,为异源表达球孢白僵菌中nrps基因奠定基础。

关键词：球孢白僵菌非核糖体多肽合成酶聚类分析基因克隆基因表达

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球孢白僵菌Bbpks1基因的序列分析及其最佳表达培养基的筛选

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福建农林大学学报（自然科学版） 2019年第4期48卷 423-428页

作者：原晓龙李娟李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204 云南大学中草药生物资源研究所云百草实验室云南昆明650091

采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,... 详细信息

采用基因组挖掘的方法从球孢白僵菌基因组中获得了一条杂合PKS/NRPS基因(命名为Bbpks1),通过生物信息学分析预测了该基因的功能,检测了该基因在不同碳源、氮源培养基上的表达情况.结果显示:Bbpks1基因长度为11838bp,编码3945个氨基酸,其结构域顺序为KS-AT-DH-MT-KR-ACP-C-A-PP-SDR;BbPKS1蛋白与布氏虫草、半翅轮枝菌、塔宾曲霉等真菌中的杂合PKS/NRPS蛋白序列(GenBank登录号分别为OAA40809.1、CEJ94083.1、OJI88893.1)聚为一个分支,且与参与细胞松弛素和伊快霉素合成的蛋白的亲缘关系较近,可推测该基因在球孢白僵菌中参与2,4-吡咯酮型化合物的合成;Bbpks1基因在含有乳糖、肌醇碳源的培养基上表达量较高,在以麦芽糖作为碳源的培养基上不表达,在含不同氮源的培养基上均大量表达.

关键词：球孢白僵菌杂合PKS/NRPS 聚类分析基因表达

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