检索结果-内蒙古大学图书馆

湖南林业科技 2022年第3期49卷 24-29页

作者：张永坤张珊珊勐海县林业和草原局技术推广服务中心云南勐海666200 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

通过采用不同浓度水杨酸溶液(简称SA,浓度0、0.50、0.75 g·L^(-1))进行浸种处理及不同浓度聚乙二醇6000溶液(简称PEG 6000,浓度5%、15%和20%)模拟不同强度的干旱胁迫,研究干旱胁迫条件下SA溶液浸种对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼... 详细信息

通过采用不同浓度水杨酸溶液(简称SA,浓度0、0.50、0.75 g·L^(-1))进行浸种处理及不同浓度聚乙二醇6000溶液(简称PEG 6000,浓度5%、15%和20%)模拟不同强度的干旱胁迫,研究干旱胁迫条件下SA溶液浸种对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼苗生长指标的影响。结果表明:当SA溶液浓度分别为0、0.50和0.75 g·L^(-1)时,随着PEG 6000溶液浓度的增加,八蕊单室茱萸种子的萌发率、发芽势、发芽指数、地上部分干重和地下部分干重都显著下降。但是,当SA溶液浓度分别为0.50和0.75 g·L^(-1)时,种子萌发和早期幼苗生长指标的值显著高于同等PEG 6000浓度条件下SA溶液浓度为0 g·L^(-1)时的数值;而且,随着SA溶液浓度的增加,各项指标的值先升后降,在浓度为0.50 g·L^(-1)时达到最高值,显著高于浓度为0和0.75 g·L^(-1)两种处理条件下的值。综上所述,SA溶液的浸种处理可一定程度上缓解干旱胁迫对八蕊单室茱萸种子萌发和早期幼苗生长的影响。本研究可为八蕊单室茱萸的育苗提供一定的科学依据。

关键词：八蕊单室茱萸种子萌发幼苗生长水杨酸干旱胁迫

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竹叶花椒MYB基因家族的鉴定及其表达特性的分析

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经济林研究 2021年第4期39卷 148-157页

作者：冯发玉王毅王丽娟罗玛妮娅徐令文杨彦萍陆斌西南林业大学林学院云南昆明650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 云南省林业和草原科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据... 详细信息

【目的】利用测序获得的竹叶花椒Zanthoxylum armatum转录组数据,研究竹叶花椒中MYB转录因子家族的序列信息、进化模式、表达模式,探寻此家族中参与竹叶花椒皮刺生长发育的相关基因,为进一步揭示MYB转录因子家族生物学功能提供理论依据,为后续的无刺竹叶花椒品种的基因工程培育奠定理论基础。【方法】利用生物信息学方法,从测序获得的竹叶花椒转录组数据库中筛选MYB转录因子,对其蛋白基序、理化性质、系统进化关系、基因表达特性等进行分析,并利用qRT-PCR技术和基因克隆,对所选基因进行验证。【结果】从竹叶花椒中共鉴定出39条MYB转录因子序列,其中包括9个R1-MYB型基因、28个R2R3-MYB型基因、1个R3型基因和1个R4型基因。对其蛋白理化性质的分析结果表明:39个MYB转录因子所含氨基酸数量为101~621个,其均为可溶性蛋白,而其二级结构以无规则卷曲为主。亚细胞定位预测结果显示:39个MYB转录因子定位于细胞核的可能性最大,这符合转录因子调控下游基因的表达特性。基因表达情况的分析结果显示:部分MYB转录因子在竹叶花椒同一组织的不同发育时期的表达差异显著,其中ZaMYB10、ZaMYB23和ZaMYB25这3个基因的表达量随着皮刺的不断发育均呈逐渐增长的趋势,表明这3个基因可能与皮刺的生长发育相关。qRT-PCR分析结果表明:ZaMYB10基因在皮刺中有特异表达。基因克隆结果表明:ZaMYB10基因具有长为1032 bp的完整的cDNA开放阅读框,其编码343个氨基酸。【结论】鉴定出39个竹叶花椒MYB转录因子,其均包含SANT保守结构域,根据表达模式判断,其中的ZaMYB10转录因子可能参与了竹叶花椒皮刺生长发育的调控。

关键词：竹叶花椒 MYB 皮刺生物信息学分析基因表达分析

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基于林分关键指标的云南省云南松地理分布格局

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西部林业科学 2021年第1期50卷 19-26页

作者：陈剑杨文忠张珊珊王有兵王磊郑畹王生李建伟云南省林业和草原科学院云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林草局重点实验室云南昆明650201 云南省林业调查规划院大理分院云南大理671000 云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省林业和草原科学院森林植物培育与开发利用省级重点实验室云南昆明650201

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范... 详细信息

云南松是云南省重要的森林资源,其林分普遍存在退化情况,对其提质增效已是紧迫的任务,但目前尚缺乏全省云南松林分质量及其地理分布格局的定量评价作为参考。本文用MaxEnt模型,结合350个云南松分布点和47个环境变量,获得云南松适生区范围;并通过Arcgis 10.2平台,在云南松适生范围区内对1500个云南松小班的3个关键指标,即公顷蓄积、年龄、生长速度进行插值和分级计算,获得全省范围内各指标分级及其地理分布格局。结果显示:总体上,云南松林分的公顷蓄积、生长速度处于较低的等级,而年龄结构为衰退型;生境退化、优良种源丧失、自然演替被打断等因素,是造成云南松在整体分布上年龄结构不合理、生长速度慢和公顷蓄积低等退化特征的原因;建议对现有云南松林进行提质增效,对优良种源进行集中经营,促进地带性植被演替进程的恢复。本研究为云南省森林资源的可持续经营提供参考。

关键词：云南松林分关键指标分布格局公顷蓄积年龄结构生长速度

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鳄梨中干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的表达分析

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分子植物育种 2025年第5期23卷 1488-1502页

作者：罗玛妮娅王毅张璋原晓龙王丽娟冯发玉徐令文郑元西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学生物与食品工程学院

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，... 详细信息

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，对其蛋白理化性质、系统进化树及基因表达谱分析，并对干旱和低温胁迫相关基因进行RT-qPCR验证。转录组分析结果表明，在干旱胁迫下有56个PaNACs表达，低温胁迫下共有53个PaNACs表达。系统进化树结果表明，PaNAC25和参与干旱胁迫的拟南芥ANAC019、ANAC055和ANAC072聚为1支，Pa NAC10、Pa NAC50和PaNAC51分别与刚毛柽柳ThNAC24、茶树CsNAC17、水稻Os NAC022聚为1支。RT-qPCR结果显示，鳄梨NAC转录因子中PaNAC10、PaNAC25、PaNAC50和PaNAC51参与干旱胁迫响应，Pa NAC35和Pa NAC69参与低温胁迫响应。本研究结果为进一步探究鳄梨NAC转录因子家族生物学特性及基因功能奠定基础，为揭示NAC基因参与非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：鳄梨(Persea americana) NAC转录因子转录组分析干旱低温胁迫

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牛樟芝AcFPS基因的克隆及最佳表达培养基筛选

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基因组学与应用生物学 2020年第11期39卷 5240-5246页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)是萜类化合物生物合成过程中的关键酶和限速酶,影响后续支路产物的代谢。为探究牛樟芝中AcFPS基因与萜类化合物生物合成间的关系,本研究从牛樟芝基因组中分离并克隆得到AcFPS基因... 详细信息

法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase,FPS)是萜类化合物生物合成过程中的关键酶和限速酶,影响后续支路产物的代谢。为探究牛樟芝中AcFPS基因与萜类化合物生物合成间的关系,本研究从牛樟芝基因组中分离并克隆得到AcFPS基因,并对其蛋白进行生物信息学分析,比较AcFPS基因在含不同碳、氮源添加物培养基上的表达量。结果表明,AcFPS基因含5个外显子、4个内含子,其外显子拼接总长1095 bp,编码364个氨基酸;AcFPS是一种位于细胞质中无信号肽和跨膜结构的蛋白,该蛋白含有4个保守序列,分别为DomainⅠ(GGKLNRG LSVVD)、DomainⅡ(DDMMD)、DomainⅢ(KFSLQKHXLIVIXKT)、DomainⅣ(DDFLD);牛樟芝AcFPS与污叉丝孔菌(XP007371273)、白腐菌(XP008044628)、绣球菌(XP027616692)、根纤维孔菌(XP012183648)和绵腐卧孔菌(XP024343411)等多孔菌目真菌的FPS蛋白聚为一支;以果糖为碳源、以番茄浸粉为氮源能有效诱导AcFPS基因的表达。本研究为深入解析牛樟芝萜类化合物合成分子机制及其异源表达提供了依据。

关键词：牛樟芝 AcFPS基因基因克隆最佳表达培养基筛选

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蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2021年第3期41卷 15-22页

作者：原晓龙刘音康洪梅陈中华李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南省水文水资源局昆明分局/云南省水环境监测中心昆明市分中心云南昆明650051

为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基G... 详细信息

为了解蒜头果叶绿体基因组密码子的使用偏性,利用Codon W 1.4.2和CUSP软件对蒜头果叶绿体基因组中33个基因的密码子进行中性绘图,应用ENC−plot、PR2−plot绘图分析并确定了其最优密码子。结果表明:蒜头果叶绿体基因组密码子的第3位碱基GC含量为28.43%,远低于第1位(47.74%)和第2位(41.05%),RSCU值大于1的密码子有30个,其中12个以A结尾,16个以U结尾,说明蒜头果叶绿体基因组的编码基因偏好以A和U结尾。GC_(12)和GC_(3)的相关系数为0.1646,相关性不显著,回归系数为0.0004;有效密码子数(ENC)范围为40.39~54.86,大于45的有25个,ENC比值主要分布在−0.05~0.05之外。蒜头果叶绿体基因组中的大部分基因分布在PR2平面图的下半部或右下半部,说明蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性更多地受选择的影响,同时亦受其他因素的影响。蒜头果叶绿体基因组的最优密码子确定为UUU、UUA、GUA等18个。

关键词：蒜头果叶绿体基因组密码子偏好性

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滇牡丹主要分布区11个居群果实特征的比较

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江西农业大学学报 2023年第3期45卷 619-630页

作者：杜春余潇牟亚萍李进张鹏远原晓龙王娟西南林业大学林学院云南昆明 650224 西南林业大学园林园艺学院云南昆明 650224 西南林业大学生命科学学院云南昆明 650224 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明 650201 西南林业大学绿色发展研究院云南昆明 650224

目的滇牡丹作为珍贵的油用野生牡丹资源，具有巨大的开发潜能，研究其果荚及结实特征可为滇牡丹育种工作提供帮助。方法以11个野生居群的滇牡丹果荚及种子为研究对象，统计果荚及种子性状数据，采用描述统计、相关性、K-均值聚类及... 详细信息

目的滇牡丹作为珍贵的油用野生牡丹资源，具有巨大的开发潜能，研究其果荚及结实特征可为滇牡丹育种工作提供帮助。方法以11个野生居群的滇牡丹果荚及种子为研究对象，统计果荚及种子性状数据，采用描述统计、相关性、K-均值聚类及方差分析等方法对数据进行分析。结果果荚及种子各性状变异系数（CV）变化范围9.15%~72.96%，其中果荚重具有最大的平均变异系数（53.54%），其次为发育种子数（52.68%）及败育种子数（51.39%），丽江利苴（DLG）居群在11个居群中拥有最大的平均果荚长度（7.49 cm），果荚宽度（6.66 cm）及果荚重（27.83 g）。采用K-均值聚类的方法对滇牡丹种子质量分级标准进行探究，结果表明Ⅰ级种子（单粒重>1.26 g、种子宽>1.25 cm、种子长>1.38 cm），Ⅱ级种子（单粒重0.84~1.26 g、种子宽1.10~1.25 cm、种子长1.22~1.38 cm），Ⅲ级种子（0.60 g单粒重~结论滇牡丹果荚性状变异丰富，果荚重、发育种子数及败育种子数等性状较其他性状具有较大的变异，11个居群中DLM与DLG两个居群在果荚及种子性状、结实特征上均优于其他居群，而昆明梁王山（DLW）居群表现最差。

关键词：滇牡丹果荚性状种子性状种子分级

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蒜头果FAD2基因的克隆与功能分析

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基因组学与应用生物学 2020年第5期39卷 2134-2140页

作者：李云琴陈中华原晓龙王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

FAD2是亚油酸合成的关键酶,是控制高油酸特性的重要基因。本研究采用RT-PCR技术在蒜头果中成功克隆得到一个FAD2基因,命名为MoFAD2,GenBank登录号为MK210593。其含有1329 bp开放阅读框,编码442个氨基酸。序列比对分析显示MoFAD2拥有FAD... 详细信息

FAD2是亚油酸合成的关键酶,是控制高油酸特性的重要基因。本研究采用RT-PCR技术在蒜头果中成功克隆得到一个FAD2基因,命名为MoFAD2,GenBank登录号为MK210593。其含有1329 bp开放阅读框,编码442个氨基酸。序列比对分析显示MoFAD2拥有FAD2家族特有的3个保守的组氨酸中心位点,蒜头果FAD2与中粒咖啡(Coffea canephora)FAD2的蛋白序列同源性为80.00%。系统进化树分析显示MoFAD2与石榴(Punica granatum)、珙桐(Davidia involucrata)聚为一支。荧光定量PCR分析表明MoFAD2在果实和叶中均有表达,但在蒜头果果实膨大期的表达量最高。研究为将来更好地开发利用蒜头果油用价值和进一步开展FAD2在不饱和脂肪酸生物合成过程中的调控作用研究奠定基础。

关键词：蒜头果 FAD2 基因克隆功能分析

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西南桦叶绿体基因组密码子偏好性分析

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基因组学与应用生物学 2020年第12期39卷 5758-5764页

作者：原晓龙李云琴王毅张劲峰云南省林业和草原科学院昆明650201 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

密码子偏好性广泛存在于各种植物中。本研究利用Codon W和在线软件CUSP分析西南桦(Betula alnoides)叶绿体基因组中的45条蛋白编码序列。结果显示,西南桦叶绿体基因组的ENC值在36.86~56.10之间,密码子第3位上的GC含量为27.80%,RSCU>... 详细信息

密码子偏好性广泛存在于各种植物中。本研究利用Codon W和在线软件CUSP分析西南桦(Betula alnoides)叶绿体基因组中的45条蛋白编码序列。结果显示,西南桦叶绿体基因组的ENC值在36.86~56.10之间,密码子第3位上的GC含量为27.80%,RSCU>1的密码子中有23个以A或U作为结尾,说明其密码子偏好以AU结尾;ENC与密码子第3位碱基的GC含量呈显著相关;3种图形分析均表明西南桦叶绿体基因组密码子偏好性受突变影响较大;最优密码子以C结尾的有7个,G结尾的有2个,U结尾的有1个。本研究为西南桦无性系地理种源鉴定、保持种源多样性提供了科学依据。

关键词：西南桦(Betula alnoides) 叶绿体基因组密码子偏好性突变

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云南蓝果树叶绿体基因组密码子偏好性分析

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西北林学院学报 2020年第4期35卷 26-31,124页

作者：原晓龙康洪梅王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以云南蓝果树叶绿体基因组为研究对象,采用Codon W 1.4.2等软件,通过分析云南蓝果树叶绿体基因组52个基因密码子的偏好性,探究影响密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:1)Codon W和CUSP软件分析显示密码子第3位碱基GC含量为28.40%,... 详细信息

以云南蓝果树叶绿体基因组为研究对象,采用Codon W 1.4.2等软件,通过分析云南蓝果树叶绿体基因组52个基因密码子的偏好性,探究影响密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:1)Codon W和CUSP软件分析显示密码子第3位碱基GC含量为28.40%,ENC值>45的基因有39个,说明密码子偏好以AT结尾,且存在较弱偏性。2)中性绘图分析显示,GC12与GC3的相关系数为0.1612,相关性不显著,说明密码子第1、第2位与第3位碱基组成存在显著差异。3)ENC绘图结合ENC比值频率表显示,大部分基因距离标准曲线较远,说明密码子偏好性主要受选择的影响。4)PR2-plot分析显示密码子第3位碱基使用频率方面,T>A,G>C,说明密码子偏好性受多重因素影响。5)确定UUG、UCA、GCU、AAU、GAU和GGA为最优密码子。综上所述,云南蓝果树叶绿体基因组密码子的使用主要受选择的影响,受其他如突变等因素的影响较弱。

关键词：云南蓝果树叶绿体基因组密码子偏好性选择最优密码子

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