检索结果-内蒙古大学图书馆

森林与环境学报 2020年第4期40卷 428-432页

作者：李云琴原晓龙李江王毅陈伟云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为研究3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因(HMGS)在思茅松二萜类生物合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从思茅松中获得3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因的cDNA序列。序列分析显示,该基因全长1 425 bp,编码474个氨基酸,属于HMGS基因家族... 详细信息

为研究3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因(HMGS)在思茅松二萜类生物合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从思茅松中获得3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A合酶基因的cDNA序列。序列分析显示,该基因全长1 425 bp,编码474个氨基酸,属于HMGS基因家族。序列比对分析显示PkHMGS基因所编码的氨基酸序列拥有HMGS家族蛋白特有的保守序列GNTEIEGVDSTNACYGGTA,与樟子松HMGS的蛋白序列同源性为99.79%。系统进化分析显示,思茅松与裸子植物的HMGS聚为1支,与樟子松的亲缘关系最近。荧光定量PCR分析表明,在思茅松的树皮中HMGS基因的表达明显受到割脂物理伤害的诱导,在高产脂思茅松松针表达量最高。结果为揭示思茅松高产脂的分子机理提供理论依据。

关键词：思茅松 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A 合酶基因克隆生物信息学分析

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滇牡丹(Paeonia delavayi)二氢黄酮醇4-还原酶基因的鉴定及表达

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分子植物育种 2020年第4期18卷 1083-1087页

作者：李云琴原晓龙陈中华王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了研究二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)对滇牡丹(Paeonia delavayi)花瓣中花色形成的作用,本研究采用RT-PCR技术首次从滇牡丹中克隆得到一个具有完整开放阅读框的二氢黄酮醇4-还原酶基因(PdDFR),生物信息学分析和转录模式分析显示,该基... 详细信息

为了研究二氢黄酮醇4-还原酶基因(DFR)对滇牡丹(Paeonia delavayi)花瓣中花色形成的作用,本研究采用RT-PCR技术首次从滇牡丹中克隆得到一个具有完整开放阅读框的二氢黄酮醇4-还原酶基因(PdDFR),生物信息学分析和转录模式分析显示,该基因全长1 050 bp,共编码349个氨基酸,其蛋白序列与黄牡丹(Paeonia lutea) DFR的蛋白序列具有99.00%的一致性。序列比对分析显示PdDFR基因存在一个由21个氨基酸组成的NADPH结合位点"VTGATGYIGSWLVKTLLERGN"。滇牡丹PdDFR蛋白与黄牡丹(Paeonia lutea, ALX35996.1)、蓖麻(Ricinus communis, XP015577076.1)、木薯(Manihot esculenta, XP021607-041.1)的DFR蛋白聚为一类;转录模式分析表明PdDFR基因在红色花瓣中有表达,在根、茎、叶中不表达。本研究通过对滇牡丹转录组数据的分析,分离并克隆得到PdDFR基因,为利用基因工程技术选育优良滇牡丹花卉品种提供理论参考。

关键词：滇牡丹(Paeonia delavayi) 二氢黄酮醇4-还原酶生物信息学分析

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滇牡丹查尔酮异构酶基因的克隆及表达分析

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北方园艺 2020年第22期 79-85页

作者：原晓龙李子光陆刚李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650204 昆明市海口林场云南昆明650114

以黄花滇牡丹为试材,克隆得到2条查尔酮异构酶基因(PdCHI1和PdCHI2)的cDNA全长,以生物信息学手段预测其功能,并检测这2条基因在花不同发育时期的表达量,以期了解滇牡丹花色的形成原因。结果表明:PdCHI1基因长654 bp,编码217个氨基酸;PdC... 详细信息

以黄花滇牡丹为试材,克隆得到2条查尔酮异构酶基因(PdCHI1和PdCHI2)的cDNA全长,以生物信息学手段预测其功能,并检测这2条基因在花不同发育时期的表达量,以期了解滇牡丹花色的形成原因。结果表明:PdCHI1基因长654 bp,编码217个氨基酸;PdCHI2基因长666 bp,编码221个氨基酸;PdCHI1与圆叶牵牛(Ipomoea purpurea,AAB86474)、脐橙(Citrus sinensis,BAA36552)、大豆(Glycine max,AAT94360)和百脉根(Lotus japonicus,BAC53984)等高等植物的Ⅰ型CHI蛋白聚为一支;PdCHI2与玉米(Zea mays,NP001151452)、大豆(Glycine max AAT94362)和葡萄(Vitis vinifera,XP002280158)的Ⅳ型CHI蛋白聚为一支。PdCHI1基因的表达量花蕾期最高,初花期和盛花期急剧降低,末花期的表达微量提升;而PdCHI2基因的表达量随着花的不断发育呈现逐渐降低的趋势。

关键词：滇牡丹查尔酮异构酶克隆基因表达

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外来入侵植物肿柄菊群落动态变化特征

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生态学杂志 2020年第2期39卷 469-477页

作者：陈剑王四海杨卫吴超云南省林业科学院云南省森林植物资源培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学/国家高原湿地研究中心昆明650224

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立... 详细信息

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立和变化特征,通过对肿柄菊群落分布典型地段的随机样方取样,分析不同茎级分枝在群落中的组成和相互影响关系,以及每丛枝数、枝长、丛密度、枝密度、每枝花序量、果序密度、地上生物量和土壤养分随群落平均基茎增粗的变化规律。结果表明:(1)群落中肿柄菊基茎较粗分枝增多对较细分枝的产生有抑制作用,群落发展到一定阶段后群落中较粗茎级的分枝控制着群落发展。(2)群落平均基茎粗与丛密度和枝密度呈显著负相关(P<0.01),与群落地上生物量呈显著正相关(P<0.01),与群落的果序密度没有相关性(P>0.1)。(3)随着肿柄菊群落平均基茎的增粗,土壤中全钾和有效磷含量显著增加(P<0.05),土壤有机质、全氮和水解性氮含量有减少趋势,但表现不显著(P>0.1)。随着群落定居时间增长,丛密度和枝密度降低,群落地上生物量持续增加,单位面积群落果序量不变,肿柄菊形成稳定的入侵群落,并且土壤养分含量会持续发生着改变。

关键词：肿柄菊群落建立群落特征地上生物量土壤养分

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竹叶花椒查尔酮合成酶基因克隆与表达

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分子植物育种 2020年第16期18卷 5300-5305页

作者：关淑文王毅郝佳波原晓龙陆斌西南林业大学昆明650224 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)是植物次生代谢途径中的关键酶。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法成功地从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CHS基因的全长cDNA序列,命名为ZaCHS (NCBI登录号... 详细信息

查尔酮合成酶(chalcone synthase, CHS)是植物次生代谢途径中的关键酶。本研究依据转录组数据设计特异性引物,采用RT-PCR方法成功地从竹叶花椒(Zanthoxylum armatum)中克隆得到一个全新的CHS基因的全长cDNA序列,命名为ZaCHS (NCBI登录号:MK953733)。序列分析结果表明,ZaCHS包含完整的cDNA开放阅读框(OFR),由1 173 bp组成,编码390个氨基酸。Blast比对结果显示该蛋白属于CHS家族蛋白;系统进化树结果显示竹叶花椒ZaCHS与芸香科植物甜橙、克里曼丁桔等的CHS亲缘关系较近。荧光定量PCR检测显示,ZaCHS在竹叶花椒中的表达量从高到低分别为:嫁接树的叶、嫁接树的茎、实生树的茎、实生树的叶。通过对竹叶花椒CHS基因进行克隆与分析,为后续深入研究竹叶花椒类黄酮代谢途径相关基因、CHS基因表达调控以及CHS基因家族进化提供帮助。

关键词：竹叶花椒查尔酮合成酶嫁接基因功能分析

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西南桦肉桂酰辅酶A还原酶基因的克隆与表达分析

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西部林业科学 2020年第5期49卷 18-22,29页

作者：李云琴金智伟严毅原晓龙王毅张劲峰云南省林业和草原科学院云南昆明650201 昆明市海口品林场云南海品650114 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因(BaCCR),该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃... 详细信息

为研究肉桂酰辅酶A还原酶基因(CCR)在西南桦木质素合成中的作用机制,采用RT-PCR技术从西南桦中克隆得到1个具完整开放阅读框的肉桂酰CoA还原酶基因(BaCCR),该基因全长975 bp,编码324个氨基酸。序列比对分析显示西南桦CCR蛋白序列与胡桃、欧洲栓皮栎、梅、甜樱桃的蛋白序列相似性均在80%以上。BaCCR拥有CCR蛋白的NADP结合域和底物结合域KNWYCYGK。进化分析表明,BaCCR与梅、甜樱桃、亚洲棉、葡萄聚为一个枝系。转录模式分析表明,BaCCR基因在根和小枝中高量表达。

关键词：西南桦肉桂酰辅酶A还原酶基因克隆基因表达

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基于简化基因组技术的云南蓝果树群体遗传分析

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植物研究 2019年第6期39卷 899-907页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多... 详细信息

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多样性。经过遗传变异检测,本次研究中共获得SNP位点98498个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5,次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点6309个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对云南蓝果树完成了群体的遗传分析,其中:系统进化树分析将云南蓝果树划分为3大类,研究分析了云南蓝果树各分类的私人等位基因数目(Private)、平均观测杂合度(H o)、平均期望杂合度(H e)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(F IS)5个遗传多样性参数;群体结构和主成分分析进一步证明了,云南蓝果树现存植株之间亲缘关系较远,遗传多样性差异较大,具有很高的遗传资源保存价值。本研究结果将为基于遗传管理的云南蓝果树就地保护、遗传资源保存和种群重建等保护工程提供科学依据。

关键词：云南蓝果树简化基因组测序 SNP 群体遗传分析遗传管理

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几种植物生长调节剂配方对三台核桃生长及结果的影响

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中国南方果树 2020年第3期49卷 143-145页

作者：郝佳波刘治邦董静杨新陆斌云南省林业科学院昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 云南省昌宁县林业局云南昌宁678100 云南省大姚县林业局云南大姚675400

初步探讨几种植物生长调节剂配方对三台核桃树势及产量的影响,以期通过科学合理的生长调节剂施用,让云南主栽品种之一的三台核桃实现提早结实、丰产。通过6组生长调节剂配方及清水作为对照对7行三台核桃树进行2次叶面喷施,观测其树势及... 详细信息

初步探讨几种植物生长调节剂配方对三台核桃树势及产量的影响,以期通过科学合理的生长调节剂施用,让云南主栽品种之一的三台核桃实现提早结实、丰产。通过6组生长调节剂配方及清水作为对照对7行三台核桃树进行2次叶面喷施,观测其树势及产量的相关性状并进行统计分析。结果表明,所有配方对控制树势均具有显著效果,配方6即"多效唑+国光甲+优丰"不仅对三台核桃有显著的控冠作用,而且还具有显著的增产效果。

关键词：核桃泡核桃植物生长调节剂树势产量

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红汁乳菇中一个聚酮合酶基因的鉴定和表达分析

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微生物学杂志 2020年第5期40卷 18-25页

作者：原晓龙罗婷王毅李云琴杨文忠云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

聚酮化合物具有丰富的生物活性,为了解红汁乳菇(Lactarius hatsudake)中聚酮合酶基因,从红汁乳菇基因组中分离并克隆得到LhPKS1基因,通过生物信息学分析推测其功能,并通过RT-PCR验证该基因的表达量。结果显示,LhPKS1基因全长cDNA含有603... 详细信息

聚酮化合物具有丰富的生物活性,为了解红汁乳菇(Lactarius hatsudake)中聚酮合酶基因,从红汁乳菇基因组中分离并克隆得到LhPKS1基因,通过生物信息学分析推测其功能,并通过RT-PCR验证该基因的表达量。结果显示,LhPKS1基因全长cDNA含有6036 bp,编码2011个氨基酸残基,结构域顺序依次为SAT-KS-AT-PT-ACP-TE,该蛋白无跨膜结构和信号肽,聚类分析显示LhPKS1蛋白与参与生物合成苔色酸的真菌PKS蛋白聚为一支。在以10%肌醇、2%和10%的山梨醇为碳源添加物及以番茄浸粉为氮源添加物时,该基因表达量较高。研究有助于通过LhPKS1基因的过表达及异源表达,为大量获取苔色酸类化合物及其骨架提供参考。

关键词：红汁乳菇(Lactarius hatsudake) 聚酮合酶生物信息学分析克隆表达

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滇牡丹中3个类查尔酮合成酶基因的克隆与表达

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浙江农业学报 2019年第9期31卷 1478-1484页

作者：原晓龙李云琴王毅云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

从开黄花的滇牡丹转录组中分离了3个CHS基因,利用生物信息学预测其基因功能,并比较不同花发育时期CHS基因的表达量。结果显示:3个CHS基因的cDNA全长分别为1173、1185、1128bp,依次命名为PdCHS1(GenBank登录号MK516264)、PdCHS2(GenBank... 详细信息

从开黄花的滇牡丹转录组中分离了3个CHS基因,利用生物信息学预测其基因功能,并比较不同花发育时期CHS基因的表达量。结果显示:3个CHS基因的cDNA全长分别为1173、1185、1128bp,依次命名为PdCHS1(GenBank登录号MK516264)、PdCHS2(GenBank登录号MK516265)和PdCHS3(GenBank登录号MK516266),分别编码390、394和375个氨基酸;这3个CHS基因编码的蛋白均为无信号肽的非分泌蛋白,均含查尔酮合成酶活性位点基序(G/A)FGPG。聚类结果显示,滇牡丹中的3个CHS蛋白归属于不同分支。基因表达结果显示,PdCHS1基因在花蕾期和花蕊中表达量较高,PdCHS2基因在末花期和初花期表达量较高,PdCHS3基因在末花期和花蕾期表达量较高。这3个CHS基因分别参与不同次生代谢产物的合成,推测PdCHS1参与柚皮素查尔酮,PdCHS2参与芪类化合物,PdCHS3参与聚酮类化合物的生物合成。

关键词：滇牡丹查尔酮合成酶基因生物信息学次生代谢

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