澜沧梨藤竹(Melocalamus arrectus)是滇西南及滇南地区常见竹种之一,具有重要的生态价值。本研究采用简化基因组测序(double digest RAD sequencing,ddRAD-seq)技术对澜沧梨藤竹的3个种群27个个体进行了遗传多样性研究。通过质量控制分...
详细信息
澜沧梨藤竹(Melocalamus arrectus)是滇西南及滇南地区常见竹种之一,具有重要的生态价值。本研究采用简化基因组测序(double digest RAD sequencing,ddRAD-seq)技术对澜沧梨藤竹的3个种群27个个体进行了遗传多样性研究。通过质量控制分析和过滤,共获得6136569个SNP,杂合率均值为29.53%,纯合率均值为70.47%,转换与颠换比值(Ts/Tv)平均值为2.45,说明SNP变异以转换为主。遗传多样性分析显示3个种群有较低的遗传多样性(π=0.174,He=0.162,Ho=0.160,F_(IS)=0.045,PIC=0.394,等位基因频率均值为0.885)。两两种群间分化指数均值为0.0347,基因流(N_(m))均值为6.95,表明种群间的遗传分化很小,基因流动广泛;3个种群遗传距离均值为0.0161,反映澜沧梨藤竹种群间遗传差异小,亲缘关系较近。系统发育分析将澜沧梨藤竹分为3个支系,主成分判别分析(DAPC)将澜沧梨藤竹分为2个支系,个体间遗传多样性差异较小;群体结构分析显示澜沧梨藤竹被分为2组,2组个体间存在不同程度的基因交流。本研究为澜沧梨藤竹遗传多样性提供数据支撑,有助于发现近亲繁殖、遗传多样性丧失的迹象,对其遗传资源保护、管理和遗传改良提供参考。
类钙调磷酸酶B蛋白(calcineurin B-like protein,CBL)为植物钙离子感受器之一,与其特异性互作蛋白激酶CIPK(CBL-interacting protein kinase)结合形成CBL-CIPK特异性受体,在植物生长发育及非生物胁迫等过程中发挥重要作用。本研究从前...
详细信息
类钙调磷酸酶B蛋白(calcineurin B-like protein,CBL)为植物钙离子感受器之一,与其特异性互作蛋白激酶CIPK(CBL-interacting protein kinase)结合形成CBL-CIPK特异性受体,在植物生长发育及非生物胁迫等过程中发挥重要作用。本研究从前期转录组数据中得到PmCBL9和PmCIPK32两个基因,对基因理化性质、系统进化树、蛋白多序列比对及激素处理下的表达模式进行分析。结果表明,PmCBL9和PmCIPK32蛋白分别编码267和440个氨基酸,亚细胞分别定位于叶绿体和细胞质;系统进化树及多序列比对显示PmCIPK32与裸子植物白云杉关系较近,CBL或CIPK蛋白含有各自特征结构域。PmCBL9和PmCIPK32基因在Ca^(2+)、ABA、GA_(3)、MeJA、SA处理下均被诱导表达,但表达模式存在差异。PmCBL9和PmCIPK32基因在Ca^(2+)处理下与对照相比均下调表达,而在4个外源激素加Ca^(2+)处理下较单独Ca^(2+)处理基因表达量均有提高。在ABA、GA_(3)、MeJA、SA单独处理下PmCIPK32基因表达量均高于各激素加Ca^(2+)处理;PmCBL9基因则在GA_(3)和SA单独处理下基因表达量高于相应激素加Ca^(2+)处理,而在ABA和MeJA单独处理过程中存在低于激素加Ca^(2+)处理,其中在SA处理下PmCBL9和PmCIPK32基因均明显上调表达。以上研究结果为马尾松CBL和CIPK基因家族功能深入研究提供参考。
暂无评论