检索结果-内蒙古大学图书馆

野生动物学报 2025年第1期46卷 50-62页

作者：韩松霖马跃李波刘微穆佳童徐艳春杨淑慧东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))... 详细信息

为优化穿山甲的分子鉴定方法,采用9种穿山甲54条Cyt b基因完整序列,评估了MEGA11软件中的7种模型和23种碱基替换类型所估算的遗传距离的物种分辨率、Cyt b基因全序列及各区域鉴别力。结果表明:K2P模型和p-distance模型基于颠换(T_(V))计算的遗传距离具有最优的物种分辨率;Cyt b基因全序列有较好的物种鉴别能力,其中,第301~400号和第851~950号的2个碱基序位片段组合时具有最高的物种分辨率,是鉴别9种穿山甲的最佳理论区段。现有的方法中推荐使用Kocher等的引物。今后在研发中采用多重PCR结合高通量测序对多片段组合进行分析,将会提高穿山甲的鉴别力。

关键词：穿山甲细胞色素b基因(Cyt b) 遗传距离物种鉴定

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十一个DNA甲基化位点对野生与圈养环颈雉鉴别能力的评价

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野生动物学报 2025年第1期46卷 135-142页

作者：林力钧王文慧张琦杜宇佳刘姿仪陈晓琳高鹏徐艳春杨淑慧东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040 武汉大学生命科学学院水稻国家重点实验室武汉430072

过度开发、非法猎捕和利用野生动物资源已经成为威胁生物多样性的重要因素。将野外非法获取的动物混入合法养殖动物中掩盖违法犯罪的行为层出不穷,因此需要从科学鉴定角度区分不同来源的动物。骨骼肌是非法猎捕和贸易的主要目标产品,但... 详细信息

过度开发、非法猎捕和利用野生动物资源已经成为威胁生物多样性的重要因素。将野外非法获取的动物混入合法养殖动物中掩盖违法犯罪的行为层出不穷,因此需要从科学鉴定角度区分不同来源的动物。骨骼肌是非法猎捕和贸易的主要目标产品,但尚没有有效的方法鉴别其来源。本研究以被归入《国家畜禽资源目录》的新型家禽,同时又是“三有”物种的环颈雉(Phasianus colchicus)为例,采用甲基化敏感性高分辨率熔解曲线技术(methylation-sensitive high resolution melting,MS-HRM)测试了26个甲基化水平在野生和圈养环颈雉之间具有潜在差异的位点,得到11个可以稳定检测的位点。统计分析发现,LOC116232884、NFATC2、FGF9-3、FGF9-2、MAPK8、DUSP10和MYCN七个位点在两组间的甲基化水平差异达到显著或极显著水平(P=0.000~0.004),各位点整体正确鉴别率为62.22%~82.78%,累积鉴别能力可达99.99993%。研究结果为建立鉴别野生和圈养环颈雉的方法提供了位点资源和检测方法,也为解决其他同类物种的鉴别问题提供了借鉴。

关键词：环颈雉来源鉴别野生圈养 DNA甲基化

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利用混合模板筛选多态性微卫星的北极狐群体遗传学分析

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经济动物学报 2021年第1期25卷 33-41+50页

作者：刘丽王东权徐艳春杨淑慧东北林业大学野生动物与自然保护地学院国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心

在群体遗传学研究中,微卫星是重要的分子标记之一,由于其在近缘物种间具有一定的通用性,因此常被跨物种使用,但测试其多态性的过程非常繁琐。本研究采用混合模板扩增的方法,快速简便地评估微卫星位点的多态性,为开展群体遗传学分析获得... 详细信息

在群体遗传学研究中,微卫星是重要的分子标记之一,由于其在近缘物种间具有一定的通用性,因此常被跨物种使用,但测试其多态性的过程非常繁琐。本研究采用混合模板扩增的方法,快速简便地评估微卫星位点的多态性,为开展群体遗传学分析获得有用的微卫星标记,以10只北极狐(Alopex lagopus)的DNA为材料,分别随机抽取2,3,5,8个和全部10个样品进行等量混合作为模板,用10个微卫星位点的引物进行扩增,以全自动测序仪进行电泳分型。结果表明:所有等位基因的电泳信号峰都清晰可辨。与单一模板扩增相比,混合模板扩增时,所有位点的复等位基因都能稳定地显示出来,不同批次试验之间的重现性达到100%。信号峰面积与等位基因频率呈线性正相关,可用以推断待测位点的基因频率分布情况。最高信号峰与最低信号峰的面积之比与混合样品数呈正相关,与多态信息含量呈负相关,提示混合样品的数量存在一定限度,到一定限度时低频等位基因无法检出。同时,通过这一关系,也可以推测位点的多态信息含量。本研究从10个位点中获得5个具有多态性的位点,3个可用于北极狐遗传分析。

关键词：微卫星北极狐毛细管电泳多态性

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黑斑侧褶蛙蝌蚪皮肤抗菌肽最早表达时间的确定

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野生动物学报 2020年第4期41卷 1000-1008页

作者： Martina OPALIN 王情马跃王碧霄郭策徐艳春东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

两栖类动物的胚胎和蝌蚪期体表包被着由黏蛋白构成的胶体屏障,使其免受环境微生物的侵袭。这层屏障随着蝌蚪的发育逐渐变薄,保护作用逐渐减弱。与此同时,皮肤开始分泌抗菌肽作为补偿。但是,蝌蚪最早在哪个发育阶段开始分泌抗菌肽尚不清... 详细信息

两栖类动物的胚胎和蝌蚪期体表包被着由黏蛋白构成的胶体屏障,使其免受环境微生物的侵袭。这层屏障随着蝌蚪的发育逐渐变薄,保护作用逐渐减弱。与此同时,皮肤开始分泌抗菌肽作为补偿。但是,蝌蚪最早在哪个发育阶段开始分泌抗菌肽尚不清楚。为了回答这一问题,本研究以东北地区黑斑侧褶蛙(Pelophylax nigromaculatus)蝌蚪为对象,研究了各个发育时期皮肤组织结构的变化和抗菌肽的表达情况,结果显示,在蝌蚪孵化之后,皮肤仅由1—2层细胞构成,大量的巨型细胞分泌黏液和微小色素颗粒;随着发育进程,皮肤表皮层逐渐加厚,到T3期(Gosner 26期)之后疏松层和致密层均开始加厚,并出现简单的颗粒腺和黏液腺。也是从这一时期皮肤开始表达抗菌肽。到T4期(Gosner 27—45期)和幼蛙期已经具备了成年蛙近似的皮肤结构和抗菌肽合成功能,形成了完备的先天免疫屏障。这些结果表明,蝌蚪皮肤免疫必须从物理屏障转换为化学屏障才能保证其生存和成功登陆,任何影响这一转换过程的因素都会通过扰动其免疫能力而影响其生存力,这为深入理解气候变化或环境污染等生态背景下两栖类种群波动的机制提供新的视角。

关键词：黑斑侧褶蛙蝌蚪抗菌肽

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毛干DNA提取中四种细菌清除方法的比较研究

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野生动物学报 2020年第4期41卷 924-929页

作者：周永恒马跃崔靓玉徐艳春杨淑慧东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

毛发(无根)作为一种非损伤性的生物样本,在保护遗传学和分子生态学研究中发挥着十分重要的作用。以毛干中提取的DNA为模板做PCR扩增时,mtDNA片段扩增效果较好,但核基因的扩增成功率极低。人们将其归因于核DNA质低量少所致。然而我们在... 详细信息

毛发(无根)作为一种非损伤性的生物样本,在保护遗传学和分子生态学研究中发挥着十分重要的作用。以毛干中提取的DNA为模板做PCR扩增时,mtDNA片段扩增效果较好,但核基因的扩增成功率极低。人们将其归因于核DNA质低量少所致。然而我们在前期研究中发现,从毛干中得到的总DNA混有大量的细菌DNA,是导致核基因扩增困难的主要因素之一。为此我们尝试建立一种高效、快速、低成本,而且不影响DNA提取的清除毛干细菌的方法。本研究以蓝狐被毛为材料,经过普通清洗后,以4种方法处理毛干,随后使用磁珠法进行总DNA提取,并通过荧光定量PCR检测总DNA中细菌DNA的含量,以此评估4种方法的有效性。结果表明,未经处理的毛干(V#1—V#3样本)总DNA中,mtDNA和细菌pDNA的Ct值分别为(15.53±0.15)和(16.82±0.03),二者的比值为(0.923±0.009)。以SDS和NaOH(方案I)、溶菌酶(方案II)和triton X-100(方案III)处理的毛干样本,细菌DNA的含量没有明显降低。用65℃的4 mol/L NaOH溶液处理毛干样本20 s(方案IV),可把pDNA的拷贝数降低近1000倍,而动物DNA的拷贝数没有明显降低。延长处理时间至35 s以上会降低DNA的提取效果甚至提取失败。因此,我们推荐在提取毛干总DNA之前,采用方案IV处理毛干样品。

关键词：毛干清洗 DNA提取细菌DNA

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发酵床微生物群落构成及其对圈养绿狒狒的影响

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野生动物学报 2019年第3期40卷 571-579页

作者：潘麒嫣朱迎娣耿广耀徐艳春王爱善黄晶杨淑慧东北林业大学野生动物资源学院哈尔滨150040 上海动物园上海200335 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040

为了改善冬季灵长类的福利,我们以绿狒狒为例,在上海动物园制做了发酵床来替代传统的硬质地面。2月中旬至3月下旬,监测了发酵床、笼舍和外部游客通道等处的环境温度变化、动物对发酵床的利用以及发酵床表层、25 cm、50 cm、75 cm深处的... 详细信息

为了改善冬季灵长类的福利,我们以绿狒狒为例,在上海动物园制做了发酵床来替代传统的硬质地面。2月中旬至3月下旬,监测了发酵床、笼舍和外部游客通道等处的环境温度变化、动物对发酵床的利用以及发酵床表层、25 cm、50 cm、75 cm深处的微生物群落结构,评估发酵床对绿狒狒的影响。结果显示,发酵床经历一个生温发酵期后,逐渐进入稳定期,内部温度稳定在28℃—30℃之间。绿狒狒改变以往挤在取暖设备附近的行为,大部分时间都在发酵床上活动,翻动发酵床,寻找并采食里面滋生的各种甲虫和蠕虫。从发酵床上共检测到41个门的细菌。表层的细菌群落结构最为复杂,OTU数量、Chao1指数和Shannon指数都高于其他3个深度。在绿狒狒挖掘最大深度范围内,共检测到13个属的有益菌,总相对丰度为42.26%;潜在致病菌有4个属,总相对丰度为11.08%。试验期间,绿狒狒从行为、消化机能(基于粪便的判断)、精神状态等方面未见异常。上述研究结果说明,发酵床作为笼舍的地面对绿狒狒是安全的,并在冬季带来更好的福利。

关键词：发酵床绿狒狒细菌群落安全

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鹿科动物角形态定量描述方法的研究

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野生动物学报 2018年第4期39卷 745-753页

作者：梁思雨杨淑慧徐艳春东北林业大学野生动物资源学院哈尔滨150040 国家林业与草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

鹿角是雄鹿对抗天敌、争夺配偶或领地的武器,也是性选择的炫耀工具。其形状和大小的演化与物种身体结构和行为模式的分化有关,而身体结构和行为模式的分化又与生境适应关系密切,所以鹿角的演化是揭示鹿类进化机制的重要方面。但是,传统... 详细信息

鹿角是雄鹿对抗天敌、争夺配偶或领地的武器,也是性选择的炫耀工具。其形状和大小的演化与物种身体结构和行为模式的分化有关,而身体结构和行为模式的分化又与生境适应关系密切,所以鹿角的演化是揭示鹿类进化机制的重要方面。但是,传统的研究中一直缺乏有效的方法来定量描述鹿角的形状,使很多深入的研究受到限制。本文系统研究了13种鹿类的角,建立了17项形态描述指标,以0/1方式生成数据。采用卡方距离(χ2Distance),以Average Linkage、Single Linkage、Complete Linkage和Ward's Minimum Variance等4种聚类方法进行形态聚类。结果显示,鹿角的形状分为两大分支,一是以麂族为核心的简单型角,二是以鹿族、驼鹿族和空齿鹿族为核心的复杂型角,并呈现出从简单到复杂的变化趋势。这些趋势与鹿类动物系统进化谱系没有明确的关系,但能够客观地反映出各种鹿角的形态特征,用于定量分析。这些指标的量化简单、易行,为鹿角形状有关的研究和鉴定提供一种实用工具。

关键词：鹿角形态指标进化

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蓝狐母系起源及谱系重建

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野生动物学报 2021年第4期42卷 1007-1014页

作者：聂子涵武晓宇孙锴樊攀魏来刘志平李波东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 哈尔滨华隆蓝狐育种有限公司哈尔滨150129 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

蓝狐是圈养北极狐(Vulpex lagopus)的主要品种。因缺少科学有效的遗传管理,引进种兽后代逐年退化,造成反复引种的依赖性局面。为保持蓝狐种群的优良性状,开展科学选种选育、降低近交的概率,分析122只引进芬兰蓝狐的线粒体DNA D-Loop区29... 详细信息

蓝狐是圈养北极狐(Vulpex lagopus)的主要品种。因缺少科学有效的遗传管理,引进种兽后代逐年退化,造成反复引种的依赖性局面。为保持蓝狐种群的优良性状,开展科学选种选育、降低近交的概率,分析122只引进芬兰蓝狐的线粒体DNA D-Loop区294 bp序列,结合已发表的野生、圈养北极狐种群单倍型数据进行母系追踪,应用11个微卫星位点的复合扩增对其中53只进行单亲亲权鉴定。结果表明:蓝狐种群仅有1种单倍型,血统单一,与瑞典养殖种群、西伯利亚野生种群关系密切。11个微卫星位点累计排除概率达到0.9999,成功为11只仔狐找到生物学父亲。同时发现,母狐经2次输精后成功受孕的概率较高(64%),以及同窝仔狐中存在多重父权的现象。因此,线粒体和微卫星等分子手段的引入,可以为蓝狐的遗传管理提供科学有效的依据。

关键词：蓝狐线粒体DNA 微卫星亲权鉴定遗传管理

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基于线粒体Cyt b基因和CR序列的养殖貉(Nyctereutes procyonoides)种群遗传多样性和结构分析

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野生动物学报 2021年第2期42卷 403-410页

作者：魏宏达李波魏来刘志平姜春明史迎秋徐艳春东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040 哈尔滨华隆蓝狐育种有限公司哈尔滨150040

貉(Nyctereutes procyonoides)是一种重要的经济动物。经过50年的人工驯养繁育,国内养殖种群不断扩大,但对其遗传多样性和结构了解很少,难以开展有效的遗传管理。本研究分析了东北、华北地区养殖貉种群(N=160)的线粒体细胞色素b(Cyt b)... 详细信息

貉(Nyctereutes procyonoides)是一种重要的经济动物。经过50年的人工驯养繁育,国内养殖种群不断扩大,但对其遗传多样性和结构了解很少,难以开展有效的遗传管理。本研究分析了东北、华北地区养殖貉种群(N=160)的线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(CR)序列,并与已经发表的同源序列进行比较。结果定义了5个Cyt b基因和6个CR序列单倍型,其中与俄罗斯产乌苏里亚种共享单倍型分别是3个和4个。种群遗传多样性分析表明,养殖貉种群单倍型多样性处于临界点(Hd=0.50)、核苷酸多样性处于较高水平(Pi>0.5%),但二者均明显低于俄罗斯野生乌苏里貉种群。这种遗传多样性模式可能主要是由奠基者效应(founder effect)导致的。此外,红褐色型貉遗传多样性水平显著低于野生型和白色型貉。系统发育分析表明国内养殖貉种群分为3个世系,主要是乌苏里亚种、与同亚种的俄罗斯野生种群亲缘关系密切。研究还发现有1个单倍型(CH5-DH5)与越南产指名亚种共享同一个单倍型世系。这说明建群引种中可能偶然引入了华南地区分布的指名亚种。综上分析,我国养殖貉种群已经出现遗传多样性下降的迹象,需要监控种群遗传多样性的变化,引入具有新基因型的野生貉种,制定科学的交配模式,避免近交衰退。

关键词：貉遗传多样性遗传结构 Cyt b基因控制区(CR)

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一例雉科鸟类跨属杂交及其亲本物种的鉴定

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野生动物学报 2020年第4期41卷 1036-1046页

作者：杜焓瑜匡高翔马跃叶永红李荣李广龙徐艳春东北林业大学野生动物与自然保护地学院哈尔滨150040 重庆动物园重庆400050 国家林业和草原局野生动植物检测中心哈尔滨150040 国家林业和草原局林产工业规划设计院北京100010 国家林业和草原局野生动物保护与利用工程技术研究中心哈尔滨150040

动物园的混群饲养和展览模式导致鸟类跨种甚至跨属杂交频繁发生,明确杂交个体的亲本物种与其繁殖管理密切相关。2019年重庆动物园发现1只自然交配产生的雉科鸟类杂交个体,从其形态特征上初步推测亲本可能为环颈雉(Phasianus colchicus)... 详细信息

动物园的混群饲养和展览模式导致鸟类跨种甚至跨属杂交频繁发生,明确杂交个体的亲本物种与其繁殖管理密切相关。2019年重庆动物园发现1只自然交配产生的雉科鸟类杂交个体,从其形态特征上初步推测亲本可能为环颈雉(Phasianus colchicus)、蓝孔雀(Pavo cristatus)或贵妃鸡(Gallus gallus domesticus)。本研究以此样本为例,建立了一套鉴定流程。首先,通过分子生物学方法确定了杂交个体的性别为雄性;然后,比较了该个体与3个疑似亲本物种雄性群体的8项形态学指标的欧氏距离,经过聚类分析判定其亲本为环颈雉和贵妃鸡。其次,采用线粒体细胞色素b基因(Cyt b)序列,计算该个体与3个疑似亲本物种的K2P遗传距离,构建NJ系统树显示该个体的母本为环颈雉。然后进一步利用15个微卫星位点,基于Nei氏遗传距离构建NJ树,发现该杂交个体与贵妃鸡遗传距离最近(0.166),与蓝孔雀的距离较远(0.535),判定其父本为贵妃鸡。以上研究为杂交个体亲本物种的鉴定提供两套可行的方案,形态学方案简单、低成本,但无法进一步区分父本和母本,且在测量过程中可能会造成动物应激反应;分子生物学方法可通过非损伤性采样避免应激,结果准确可靠,但成本较高,且受到微卫星标记的位点资源和种间通用性的限制。管理实践中可根据需要选择使用,或联合使用。

关键词：雉科跨属杂交亲本物种鉴定

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