检索结果-内蒙古大学图书馆

植物遗传资源学报 2020年第3期21卷 767-774页

作者：吴涛陈少瑜肖良俊宁德鲁潘莉贺娜朱云凤云南省林业和草原科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 云南省林业和草原科学院经济林研究所昆明650201

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon... 详细信息

利用SSR分子标记技术对云南省14个州市1061份核桃种质资源进行遗传多样性分析,在此基础上,通过最小距离逐步取样法构建核心种质并进行了核心种质的多样性检测。结果表明,19对SSR引物共检测到322个等位基因,每对引物平均16.95个,Shannon信息指数(I)平均为1.3375,期望杂合度(He)平均为0.6040,Nei′s遗传多样性指数(Nei)平均为0.6043,数据表明云南核桃种质资源具有较为丰富的遗传多样性。遗传多样性在各州市分布不均,其中,迪庆州核桃资源的遗传多样性相对最高,最低的是临沧地区。基于遗传距离的UPGMA聚类结果,以5%~30%的取样比例分别构建初级种质(PC)、次级种质(SC)、核心种质-1(CC-1)、核心种质-2(CC-2)等4个核心种质,经遗传多样性分析及t检验,最终确定10.84%取样比例、115份样本量的核心种质-1(CC-1)为云南核桃资源的核心种质。

关键词：核桃 SSR分子标记种质资源遗传多样性核心种质

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七彩红竹二氢黄酮醇4-还原酶基因IhDFR1的克隆及表达分析

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植物生理学报 2014年第4期50卷 447-452页

作者：缪福俊陈剑孙浩王毅王晨晨原晓龙杨宇明王娟云南省林业科学院、国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 中国科学院沈阳应用生态研究所沈阳110016 西南林业大学林学院昆明650224

二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)是植物花色素苷合成途径中的关键酶,在植物花色的形成过程中起重要作用。依据七彩红竹转录组数据设计特异引物,采用RT-PCR技术从七彩红竹中克隆获得了一个新的DFR基因cDNA全长,命名为IhDFR1(登录号为KF728205)... 详细信息

二氢黄酮醇4-还原酶(DFR)是植物花色素苷合成途径中的关键酶,在植物花色的形成过程中起重要作用。依据七彩红竹转录组数据设计特异引物,采用RT-PCR技术从七彩红竹中克隆获得了一个新的DFR基因cDNA全长,命名为IhDFR1(登录号为KF728205)。序列分析结果表明,IhDFR1基因cDNA全长945 bp,编码314个氨基酸。生物信息学预测显示,该基因编码的蛋白具有典型的DFR蛋白功能结构域,存在2个特异结合位点,属于非Asn/Asp型DFR酶,与禾本科植物中的DFR具有较高的相似性。对不同发育时期七彩红竹的IhDFR1基因进行时空表达的结果显示,只有在竹秆颜色呈现红紫色时,IhDFR1基因才有表达。以上结果初步显示IhDFR1蛋白可能作为一个重要的酶参与竹秆花色素苷的代谢调控,同时为进一步研究七彩红竹花色素苷产生的分子机理和综合开发利用奠定了基础。

关键词：七彩红竹花色素苷二氢黄酮醇4-还原酶基因表达

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岩生树花地衣型真菌NRPS基因的生物信息学分析

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西部林业科学 2018年第2期47卷 21-25,38页

作者：原晓龙陈剑华梅李云琴王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Nor... 详细信息

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌Ri NRPS基因进行分析,结果显示,Ri NRPS基因相对分子质量为702 699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19 098bp,编码6 362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。

关键词：岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶生物信息学分析

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木质藤本植物黑老虎的居群结构与动态

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东北林业大学学报 2015年第9期43卷 23-29,51页

作者：付玉嫔司马永康祁荣频郝佳波毛云玲尹艾萍陈少瑜刘冬芬张荣贵国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业科学院) 昆明650201 红河州林业科学研究所

为了了解木质藤本药食兼用植物黑老虎的居群结构及动态，采用典型样地法，以径级结构代替年龄结构及方差均值比率法研究了云南分水岭国家级自然保护区、云南大围山自然保护区和云南无量山自然保护区等3个黑老虎居群的年龄结构、高度结... 详细信息

为了了解木质藤本药食兼用植物黑老虎的居群结构及动态，采用典型样地法，以径级结构代替年龄结构及方差均值比率法研究了云南分水岭国家级自然保护区、云南大围山自然保护区和云南无量山自然保护区等3个黑老虎居群的年龄结构、高度结构和空间分布格局，编制了特定时间生命表，绘制了存活曲线。结果表明：黑老虎3个居群的年龄结构分为5级，总体呈倒金字塔形，年龄结构中都无I级幼苗，幼藤储备也很少，中成年藤和老年藤的比例占到了60％～80％．均属于衰退型居群：其高度结构受支柱木和林冠层高度的影响，不同居群的高度结构包括的级数不同，但发育都是连续的；3个居群的分布格局不同，分水岭居群呈现集群分布，无量山居群和大围山居群呈随机分布，当前的生长可分为幼藤、中成年藤和老藤3个时期，存活曲线呈现凸形，正处于衰退状态。极弱的更新能力和较少的居群数量预示黑老虎居群的生存和繁育都面临极大的挑战，且具有濒危植物所具有的特征．应加强保护和人工引种驯化。

关键词：黑老虎木质藤本居群格局居群动态生命表存活曲线

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外来入侵植物肿柄菊群落动态变化特征

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生态学杂志 2020年第2期39卷 469-477页

作者：陈剑王四海杨卫吴超云南省林业科学院云南省森林植物资源培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学/国家高原湿地研究中心昆明650224

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立... 详细信息

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立和变化特征,通过对肿柄菊群落分布典型地段的随机样方取样,分析不同茎级分枝在群落中的组成和相互影响关系,以及每丛枝数、枝长、丛密度、枝密度、每枝花序量、果序密度、地上生物量和土壤养分随群落平均基茎增粗的变化规律。结果表明:(1)群落中肿柄菊基茎较粗分枝增多对较细分枝的产生有抑制作用,群落发展到一定阶段后群落中较粗茎级的分枝控制着群落发展。(2)群落平均基茎粗与丛密度和枝密度呈显著负相关(P<0.01),与群落地上生物量呈显著正相关(P<0.01),与群落的果序密度没有相关性(P>0.1)。(3)随着肿柄菊群落平均基茎的增粗,土壤中全钾和有效磷含量显著增加(P<0.05),土壤有机质、全氮和水解性氮含量有减少趋势,但表现不显著(P>0.1)。随着群落定居时间增长,丛密度和枝密度降低,群落地上生物量持续增加,单位面积群落果序量不变,肿柄菊形成稳定的入侵群落,并且土壤养分含量会持续发生着改变。

关键词：肿柄菊群落建立群落特征地上生物量土壤养分

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短柄草基因组调查测序

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分子植物育种 2023年

作者：杨跃仙段利武马山俊曾昭朝原晓龙王毅云南林业职业技术学院云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信... 详细信息

短柄草(Brachypodium sylvaticum (Huds.) Beauv.)是禾本科中一种体型较小的可自花结实的二倍体多年生植物，是多年生草本植物中优秀的候选模式植物。为大规模全基因组测序及其组装策略提供研究基础、确定其基因组大小及复杂程度提供信息，本研究采用流式细胞术和二代测序技术的数据约简法(Ken-monomeric unit， K-mer)分析评估短柄草基因组大小，并分析其基因组的特征信息。研究结果显示，(1)以玉米作为内参，流式细胞测定短柄草基因组大小约为349.35 Mb；(2)高通量测序获得原始数据23.85 Gb，处理后得到约21.41 Gb的Clean data，数据质量良好；(3) K-mer分析显示短柄草基因组大小约为385.45 Mb，杂合度较低(0.3%)，GC含量为45.85%；(4) NT数据库比对发现二穗短柄草(B. distachyon)、安第斯短柄草(B. andinum)、大麦(Hordeum vulgare)亲缘关系较近。本研究为短柄草的全基因组de novo测序策略提供有效依据，也为未来短柄草分子育种及高效牧草培育奠定基础。

关键词：短柄草流式细胞术全基因组Survey分析基因组大小(C值)

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基于高效液相色谱法对不同提取条件下竹叶黄酮中牡荆苷含量的分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第5期36卷 164-168页

作者：华梅谭芮王毅缪福俊陈剑马惠芬杨宇明王娟云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

用高效液相色谱对竹叶黄酮中牡荆素进行分析,并对其含量进行了测定,同时研究了提取溶剂比、料液比和提取时间对牡荆素含量的影响。结果表明:最佳的提取条件为,提取溶剂比为70%乙醇水,料液比为1∶20,提取时间为2.0 h。采用牡荆苷作为外标... 详细信息

用高效液相色谱对竹叶黄酮中牡荆素进行分析,并对其含量进行了测定,同时研究了提取溶剂比、料液比和提取时间对牡荆素含量的影响。结果表明:最佳的提取条件为,提取溶剂比为70%乙醇水,料液比为1∶20,提取时间为2.0 h。采用牡荆苷作为外标物,建立牡荆苷标准曲线方程:m=4.725×10-7A+0.042 5(R2=0.999)。在最佳的提取条件下,采用大孔树脂对提取物进行纯化,对竹叶黄酮中牡荆素的含量进行测定,灰金竹中牡荆素的含量为(1.01%±0.07%)。

关键词：竹叶黄酮牡荆素提取条件外标法高效液相色谱

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球孢白僵菌发酵液抗人体致病细菌活性研究

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西部林业科学 2019年第1期48卷 18-22,28页

作者：李娟虞泓王毅云南大学云南昆明650091 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了探究球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液的抗菌活性以及不同培养基对其抗菌效果的影响,用乙酸乙酯萃取球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液,旋干后得到提取物,采用抑菌圈法测定其对6种耐药性人体致病细菌以及8种普通人体致病细菌的抗菌活性,并通过单... 详细信息

为了探究球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液的抗菌活性以及不同培养基对其抗菌效果的影响,用乙酸乙酯萃取球孢白僵菌YFCCFQ001发酵液,旋干后得到提取物,采用抑菌圈法测定其对6种耐药性人体致病细菌以及8种普通人体致病细菌的抗菌活性,并通过单菌多产物策略,改变培养基碳氮源,检测抗菌效果的变化。结果表明:球孢白僵菌YFCCFQ001提取物对4种耐药性致病细菌(溶血性葡萄球菌、大肠埃希菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌)和8种普通致病细菌均有抗菌活性(其中关于球孢白僵菌对副溶血性弧菌、短小芽孢杆菌、无乳链球菌、福氏志贺氏菌、乙型副伤寒沙门氏菌的抗菌活性未见文献报道)。不同氮源对其抗菌活性影响显著,其中胰蛋白胨抗菌效果最好,对3种耐药性致病细菌和6种普通致病细菌均有活性。研究发现了球孢白僵菌对耐药性致病细菌的抗菌活性,以及不同培养基对球孢白僵菌发酵液抗菌活性的影响,为真菌中新型抗菌天然产物的寻找和利用提供新的思路。

关键词：球孢白僵菌 OSMAC策略抗菌活性耐药性致病细菌人体致病细菌

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滇西南地区旱冬瓜优良种源的早期选择研究

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西部林业科学 2012年第3期41卷 75-79页

作者：史富强陈宏伟袁莲珍杨斌陈伟陈绍安李江孟梦冯弦云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650201

在镇沅、龙陵、瑞丽3个试验点,通过对15个种源99个旱冬瓜家系18个月的幼林的树高、胸径及材积的测定与分析,结果表明,(1)在旱冬瓜的地理种源间存在着丰富的遗传变异,不同种源幼林期在树高、胸径、材积生长上均存在着显著差异,表明在滇... 详细信息

在镇沅、龙陵、瑞丽3个试验点,通过对15个种源99个旱冬瓜家系18个月的幼林的树高、胸径及材积的测定与分析,结果表明,(1)在旱冬瓜的地理种源间存在着丰富的遗传变异,不同种源幼林期在树高、胸径、材积生长上均存在着显著差异,表明在滇西南地区开展旱冬瓜优良种源的选择十分必要。(2)在3个试验点表现较好、较稳定的种源是瑞丽种源,材积的实际增益分别为,镇沅试验点34.2%、龙陵试验点40.2%、瑞丽试验点45.4%,瑞丽旱冬瓜种源可作为滇西南地区旱冬瓜人工造林的采种种源。

关键词：滇西南地区旱冬瓜种源早期选择聚类分析

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黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C中Ⅵ型分泌蛋白的生物信息学分析

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华中农业大学学报 2016年第4期35卷 42-48页

作者：韩长志王娟西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室昆明650224 云南省林业科学院/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸... 详细信息

为明确黄单胞菌Xanthomonas campestris *** 756C(Xcr)中存在的Ⅵ型分泌蛋白(Tss)数量及其所具有的信号肽、保守motif等信息以及该菌中Tss与其他病菌中同源序列之间的遗传关系,利用关键词对Xcr蛋白质数据库进行搜索,并对Xcr中Tss氨基酸序列开展信号肽、跨膜结构域以及保守基序(motif)的生物信息学分析,同时,对Xcr中所含有的Tss与其他病原菌中同源序列之间的遗传关系进行分析。明确Xcr中存在3个Tss,分别命名为TssA、TssB、TssC,上述Tss均含有高于50%比例的!螺旋结构,均定位在细胞膜上以及具有3个保守motif,而就信号肽而言,仅TssC含有明显的信号肽序列。Xcr中的Tss与Xcc、Xca等黄单胞菌属病菌中的Tss具有较近的亲缘关系。

关键词： Xanthomonas campestris pv.raphani 756C Ⅵ型分泌系统 Ⅵ型分泌蛋白黄单胞菌属

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