检索结果-内蒙古大学图书馆

西部林业科学 2018年第2期47卷 21-25,38页

作者：原晓龙陈剑华梅李云琴王娟杨宇明王毅云南省林业科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Nor... 详细信息

为了挖掘岩生树花地衣型真菌转录组数据中的NRPS基因,找出其潜在化合物或蛋白,以岩生树花地衣型真菌的转录组数据为基础,分析获得一个新的NRPS基因(Ri NRPS)。利用BLAST比对、分子系统进化及anti SMASH、NRPS predictor、Na PDo S、Norine等生物信息学分析手段对岩生树花地衣型真菌Ri NRPS基因进行分析,结果显示,Ri NRPS基因相对分子质量为702 699.9,等电点5.83,为不稳定蛋白;其开放阅读框总长19 098bp,编码6 362个氨基酸;该蛋白不存在信号肽,为非分泌蛋白,定位于细胞质基质中;可能合成HC-toxin合成酶,可能的催化反应是以Orn(鸟氨酸)、Gln(谷氨酰胺)、Gln(谷氨酰胺)、Cys(半胱氨酸)4个氨基酸作为底物合成环状四肽,此环状四肽可能是一种具毒素活性的多肽、其结构式为C21H32N4O6。研究结果为以后岩生树花NRPS基因的挖掘及非核糖体多肽类物质的生物合成提供参考。

关键词：岩生树花 RiNRPS基因 HC-toxin合成酶生物信息学分析

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黄花杓兰菌根真菌rDNA ITS的多样性

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浙江农林大学学报 2015年第5期32卷 815-820页

作者：缪福俊蒋宏王宏虬原晓龙陈剑杨宇明王娟云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650201 西南林业大学林学院云南昆明650224

杓兰属Cypripedium植物因具较高的观赏和药用价值而长期被过度采集,已成为濒危植物。菌根真菌是其栽培和保育能否成功的重要协同因子。采用免培养技术对滇西北4个不同居群的黄花杓兰Cypripedium flavum毛根的真菌进行核糖体脱氧核糖核... 详细信息

杓兰属Cypripedium植物因具较高的观赏和药用价值而长期被过度采集,已成为濒危植物。菌根真菌是其栽培和保育能否成功的重要协同因子。采用免培养技术对滇西北4个不同居群的黄花杓兰Cypripedium flavum毛根的真菌进行核糖体脱氧核糖核酸内转录间隔区(rDNA ITS)区段扩增。结果表明:从4个居群的毛根中共克隆得到366个真菌ITS-taxa,其中白水河居群93个,石卡雪山居群90个,天生桥居群103个,纳帕村居群80个;黄花杓兰毛根系统中存在丰富多样的菌根真菌类型,分别涉及胶膜菌属Tulasnella,伏革菌属Corticium,瘤菌根菌属Epulorhiza和丝核菌属Rhizoctoia 4个属及一类归属未定的真菌(uncultured mycorrhizal fungi);胶膜菌属对于黄花杓兰具有一定的寄主专一性特征,可能对黄花杓兰的生长有促生作用。以上结果为菌肥的研制和黄花杓兰植物的栽培与保育工作提供科学依据。

关键词：微生物学黄花杓兰菌根真菌 rDNA ITS 胶膜菌属多样性

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外来入侵植物肿柄菊群落动态变化特征

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生态学杂志 2020年第2期39卷 469-477页

作者：陈剑王四海杨卫吴超云南省林业科学院云南省森林植物资源培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201 西南林业大学/国家高原湿地研究中心昆明650224

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立... 详细信息

外来入侵植物群落动态变化特征能反映当前入侵状态和发展态势,预示着入侵的后果和趋势,可为入侵植物的影响评估和防治提供依据。为了查明我国热带和亚热带地区普遍生长的外来入侵植物肿柄菊[Tithonia diversifolia(Hemsl.)***]群落建立和变化特征,通过对肿柄菊群落分布典型地段的随机样方取样,分析不同茎级分枝在群落中的组成和相互影响关系,以及每丛枝数、枝长、丛密度、枝密度、每枝花序量、果序密度、地上生物量和土壤养分随群落平均基茎增粗的变化规律。结果表明:(1)群落中肿柄菊基茎较粗分枝增多对较细分枝的产生有抑制作用,群落发展到一定阶段后群落中较粗茎级的分枝控制着群落发展。(2)群落平均基茎粗与丛密度和枝密度呈显著负相关(P<0.01),与群落地上生物量呈显著正相关(P<0.01),与群落的果序密度没有相关性(P>0.1)。(3)随着肿柄菊群落平均基茎的增粗,土壤中全钾和有效磷含量显著增加(P<0.05),土壤有机质、全氮和水解性氮含量有减少趋势,但表现不显著(P>0.1)。随着群落定居时间增长,丛密度和枝密度降低,群落地上生物量持续增加,单位面积群落果序量不变,肿柄菊形成稳定的入侵群落,并且土壤养分含量会持续发生着改变。

关键词：肿柄菊群落建立群落特征地上生物量土壤养分

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基于高效液相色谱法对不同提取条件下竹叶黄酮中牡荆苷含量的分析

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西南林业大学学报（自然科学） 2016年第5期36卷 164-168页

作者：华梅谭芮王毅缪福俊陈剑马惠芬杨宇明王娟云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

用高效液相色谱对竹叶黄酮中牡荆素进行分析,并对其含量进行了测定,同时研究了提取溶剂比、料液比和提取时间对牡荆素含量的影响。结果表明:最佳的提取条件为,提取溶剂比为70%乙醇水,料液比为1∶20,提取时间为2.0 h。采用牡荆苷作为外标... 详细信息

用高效液相色谱对竹叶黄酮中牡荆素进行分析,并对其含量进行了测定,同时研究了提取溶剂比、料液比和提取时间对牡荆素含量的影响。结果表明:最佳的提取条件为,提取溶剂比为70%乙醇水,料液比为1∶20,提取时间为2.0 h。采用牡荆苷作为外标物,建立牡荆苷标准曲线方程:m=4.725×10-7A+0.042 5(R2=0.999)。在最佳的提取条件下,采用大孔树脂对提取物进行纯化,对竹叶黄酮中牡荆素的含量进行测定,灰金竹中牡荆素的含量为(1.01%±0.07%)。

关键词：竹叶黄酮牡荆素提取条件外标法高效液相色谱

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蒜头果中CYP71基因克隆与果实不同发育时期的表达分析

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广西植物 2020年第4期40卷 501-508页

作者：原晓龙陈中华李云琴王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护与繁育重点实验室昆明650201

由氨基酸衍生的氰苷是由植物细胞色素P450单加氧酶(CYP)催化氨基酸生成的次生代谢产物,与植物的防御和抗逆境胁迫相关。该研究通过分析蒜头果转录组数据,从中分离并克隆得到1条细胞色素P450基因(命名为MoCYP71,GenBank登录号为MK172858)... 详细信息

由氨基酸衍生的氰苷是由植物细胞色素P450单加氧酶(CYP)催化氨基酸生成的次生代谢产物,与植物的防御和抗逆境胁迫相关。该研究通过分析蒜头果转录组数据,从中分离并克隆得到1条细胞色素P450基因(命名为MoCYP71,GenBank登录号为MK172858),对其进行生物信息学分析并检测该基因在果实不同发育时期的表达情况。结果表明:MoCYP71基因含1572 bp,编码523个氨基酸,该基因的cDNA序列与咖啡(Coffea eugenioides,XM027319282)、小果咖啡(Coffea arabica,XM027213456)中的CYP71基因的mRNA序列均有88%的一致性;MoCYP71蛋白的相对分子质量为58976.54,理论等电点pI为8.10,分子式为C2675H4184N704O744S27,不稳定系数(Ⅱ)为40.84,是一种不稳定蛋白;该蛋白不存在信号肽,存在于分泌途径,含有两个跨膜结构,分别位于20~37和311~333位的氨基酸为跨膜疏水螺旋,锚定于细胞器上;该蛋白含有CYP家族的保守结构域,包括脯氨酸富集区(PPSPPRLP)、K螺旋(KETFR)、I螺旋(GGIDTS)、PERF域(PERF)和识别结构域血红素结合域(FGAGRRICPG),与可可、榴莲、高粱等的CYP71E家族的蛋白(GenBank登录号分别为EOX92908.1、XP022773875.1和AAC39318.1)聚为一支;在花谢后,MoCYP71基因表达量逐渐降低,花谢后1个月>2个月>3个月,但在花谢后4个月的表达量急剧增加。以上结果对研究蒜头果的对虫害的防御、组织成熟及蒜头果中有效次生代谢产物的发掘具有重要意义。

关键词：蒜头果 CYP71基因氰苷生物信息学分析基因表达

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多脉含笑和醉香含笑挥发油的化学成分研究

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广东农业科学 2011年第23期38卷 110-113页

作者：马惠芬司马永康郝佳波陈少瑜韩明跃李丹徐亮周彬柴勇云南省林业科学院/云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室云南昆明650204

为深入了解多脉含笑和醉香含笑开发利用价值,采用同时蒸馏萃取法(SDE)分别提取多脉含笑叶、果实以及醉香含笑的叶和花的挥发油,运用毛细管气相色谱-质谱联用法结合计算机检索对其挥发油进行了化学成分分析。多脉含笑的叶和果中共鉴定出3... 详细信息

为深入了解多脉含笑和醉香含笑开发利用价值,采用同时蒸馏萃取法(SDE)分别提取多脉含笑叶、果实以及醉香含笑的叶和花的挥发油,运用毛细管气相色谱-质谱联用法结合计算机检索对其挥发油进行了化学成分分析。多脉含笑的叶和果中共鉴定出34种挥发性化合物,其中叶26种、果22种,醉香含笑的叶和花中鉴定出42种挥发性化合物,叶和花都为27种。多脉含笑的叶和果挥发油的主要成分为α-金合欢烯、β-橄榄烯、香树烯、大根香叶烯B、大根香叶烯D、朱栾倍半萜和β-榄香烯等;醉香含笑叶和花的挥发油主要成分为6,9-十八碳二烯酸甲酯、异长叶烯、橙花叔醇、α-古巴-11-醇、α-金合欢烯、β-橄榄烯、异石竹烯、δ-杜松醇、庚醛和大根香叶烯B等。多脉含笑和醉香含笑挥发油中都富含大量在香料和医药行业有重要用途的高生物活性化合物。

关键词：多脉含笑醉香含笑挥发油同时蒸馏萃取气相色谱-质谱联用

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思茅松控制授粉关键技术

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林业实用技术 2010年第12期 23-24页

作者：陈伟陈绍安陈宏伟唐社云杨斌史富强云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育实验室昆明650204 云南省林业科学院昆明650204

从思茅松开花特性、亲本选择、花粉采集、授粉过程、种子采收、档案管理等方面论述了思茅松控制授粉关键技术。

关键词：思茅松控制授粉关键技术

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云南蓝果树叶绿体基因组密码子偏好性分析

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西北林学院学报 2020年第4期35卷 26-31,124页

作者：原晓龙康洪梅王毅云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

以云南蓝果树叶绿体基因组为研究对象,采用Codon W 1.4.2等软件,通过分析云南蓝果树叶绿体基因组52个基因密码子的偏好性,探究影响密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:1)Codon W和CUSP软件分析显示密码子第3位碱基GC含量为28.40%,... 详细信息

以云南蓝果树叶绿体基因组为研究对象,采用Codon W 1.4.2等软件,通过分析云南蓝果树叶绿体基因组52个基因密码子的偏好性,探究影响密码子使用偏性形成的主要因素。结果表明:1)Codon W和CUSP软件分析显示密码子第3位碱基GC含量为28.40%,ENC值>45的基因有39个,说明密码子偏好以AT结尾,且存在较弱偏性。2)中性绘图分析显示,GC12与GC3的相关系数为0.1612,相关性不显著,说明密码子第1、第2位与第3位碱基组成存在显著差异。3)ENC绘图结合ENC比值频率表显示,大部分基因距离标准曲线较远,说明密码子偏好性主要受选择的影响。4)PR2-plot分析显示密码子第3位碱基使用频率方面,T>A,G>C,说明密码子偏好性受多重因素影响。5)确定UUG、UCA、GCU、AAU、GAU和GGA为最优密码子。综上所述,云南蓝果树叶绿体基因组密码子的使用主要受选择的影响,受其他如突变等因素的影响较弱。

关键词：云南蓝果树叶绿体基因组密码子偏好性选择最优密码子

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中缅木莲与大果木莲种子形态特征及萌发特性的比较

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西北林学院学报 2009年第6期24卷 33-37页

作者：付玉嫔陈少瑜吴涛郝佳波司马用康云南省林业科学院国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用实验室云南昆明650204

为了探讨大果木莲的濒危机制,以非濒危同属近缘种中缅木莲为对照,对二者的生境、种子特征及萌发特性进行了比较研究。结果表明：大果木莲聚合果大小约为中缅木莲的2倍,蓇葖果数量约为其1/2,理论种子生产力（胚珠数）为其61%,实际种子生... 详细信息

为了探讨大果木莲的濒危机制,以非濒危同属近缘种中缅木莲为对照,对二者的生境、种子特征及萌发特性进行了比较研究。结果表明：大果木莲聚合果大小约为中缅木莲的2倍,蓇葖果数量约为其1/2,理论种子生产力（胚珠数）为其61%,实际种子生产力（结实量）为其58.8%,萌发时间较中缅木莲长10~15 d,二者萌发率都在60%以上,但大果木莲的萌发率变异高达39.6%。大果木莲生境多为石灰岩山地,岩石裸露较多,环境潮湿,萌发更新环境较中缅木莲恶劣。

关键词：大果木莲中缅木莲濒危种子形态特征萌发率种子生产力

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基于简化基因组测序的野生竹叶花椒遗传多样性分析

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分子植物育种 2023年

作者：尹庆丰王毅呼延丽郝佳波蒙进芳陆斌西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室

为探究36份花椒资源间的遗传关系，本研究基于Illumina NovaSeq测序平台并利用ddRAD-seq (Double digest restriction site-associated DNA sequencing)技术对36分花椒资源进行了测序。结果显示，测序Q20值均值为98.00%，测序Q30值均值为93.72%，平均GC含量为36.01%；经过过滤和筛选共获得78 222 636个高质量SNP，其中纯合突变率平均值为91.17%；杂合突变率平均值为8.98%；SNP频谱分析显示碱基转换突变为主要SNP突变型。基于SNP进行的群体主成分分析、群体遗传结构分析以及群体发育树分析结果能够相互验证，可将36份花椒资源分为4个类群。在群体遗传多样性分析中发现，群体间的分化指数Fst在0.07～0.80之间，属于中等偏强且存在较大程度的遗传分化，遗传多样性差异较大。本研究利用ddRAD-seq技术解析的36份花椒资源群体遗传结构和群体遗传多样性，所筛选的SNP标记提供了丰富的信息，有助于完善花椒分子标记数据库，也为后续花椒遗传图谱构建、分子标记辅助选择育种、系统发育研究以及优良品种选育提供了基础。

关键词：简化基因组竹叶花椒 SNP 系统发育树遗传多样性分析

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