检索结果-内蒙古大学图书馆

中国细胞生物学学报 2014年第11期36卷 1506-1513页

作者：廖维华陈仲叶梅霞马焕弟高凯雷炳琪安新民北京林业大学林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083

目前,关于杨树在真菌胁迫下其mi RNAs对基因的调控作用研究较少。准确快速地预测并鉴定mi RNA靶基因,对揭示真菌胁迫下mi RNAs在基因调控中的作用至关重要。该文根据mi RNA的进化保守性,通过靶基因预测软件ps RNATarget,以已知的毛果杨m... 详细信息

目前,关于杨树在真菌胁迫下其mi RNAs对基因的调控作用研究较少。准确快速地预测并鉴定mi RNA靶基因,对揭示真菌胁迫下mi RNAs在基因调控中的作用至关重要。该文根据mi RNA的进化保守性,通过靶基因预测软件ps RNATarget,以已知的毛果杨mi RNAs为探针,与毛白杨真菌胁迫下转录组的基因序列比对,找到其中347个mi RNAs的772个靶基因,分别编码与植物激素信号传导、植物病原互作、谷胱甘肽代谢等与植物抗病密切相关的蛋白。mi R393通过转录后水平作用于靶基因,调节生长素信号以响应多种外界刺激。该研究发现了mi R393的11个靶基因,主要参与生长素介导的信号通路;其中6个靶基因(SD1-13、CYP83B1、AFB2、TIR1、AFB3和PSBR)存在差异表达,这些基因是研究mi R393的生物学功能的关键候选基因。

关键词：毛白杨真菌胁迫 mi R393 靶基因

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转录组从头组装软件比较

转录组从头组装软件比较

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第二届全国计算生物学与生物信息学学术会议

作者：闫鹏程曾艳飞陈禹保北京市计算中心北京云计算关键技术与应用北京市重点实验室 100094 北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室北京 100091

高通量的转录组测序(RNA-seq)在模式和非模式物种的研究中已开始得到广泛应用。然而，在没有参考基因组序列的情况下，将海量的转录组短序列组装成正确的基因集面临很大困难。如今，已经出现不少针对转录组组装的工具。本研究利用实验... 详细信息

高通量的转录组测序(RNA-seq)在模式和非模式物种的研究中已开始得到广泛应用。然而，在没有参考基因组序列的情况下，将海量的转录组短序列组装成正确的基因集面临很大困难。如今，已经出现不少针对转录组组装的工具。本研究利用实验数据的分析对4种应用较多的组装软件进行了系统的比较，在准确性，易用性和计算资源消耗等几个方面进行了评价。比较发现：这4种软件对计算资源的消耗都比较高，计算时间较长，计算过程复杂不易使用。综合评估可以看出Trinity在转录组从头组装结果方面表现突出。

关键词：高通量测序从头组装转录组测序

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一种高效提取杨树发病树皮总RNA的方法及应用

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植物生理学报 2014年第2期50卷 223-228页

作者：侯佳孙丰硕吴秋明杨玉巧贺伟王延伟北京林业大学森林培育与保护教育部重点实验室北京100083 北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083 北京林业大学林木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083 北京林业大学国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083 濮阳市林业科学院河南濮阳457000

对杨树发病树皮总RNA的高效提取是开展杨树抗溃疡病基因表达调控的基础,为了探讨杨树发病树皮RNA的高效提取方法,本研究以欧美杨细菌性溃疡病菌侵染后的‘中林46’杨为材料,比较了包括本研究提出的RNA提取新方法(RNA试剂盒改良法)在内的... 详细信息

对杨树发病树皮总RNA的高效提取是开展杨树抗溃疡病基因表达调控的基础,为了探讨杨树发病树皮RNA的高效提取方法,本研究以欧美杨细菌性溃疡病菌侵染后的‘中林46’杨为材料,比较了包括本研究提出的RNA提取新方法(RNA试剂盒改良法)在内的6种方法提取的总RNA的质量和浓度。结果显示,通过RNA试剂盒改良法提取的总RNA 28S rRNA条带亮度约为18S rRNA条带亮度的2倍且浓度高,表明该方法更适合感染欧美杨细菌性溃疡病的‘中林46’杨发病树皮总RNA的提取。为了验证RNA试剂盒改良法对健康杨树树皮及不同胁迫处理、组织RNA提取的适用性,进一步用该方法提取了‘中林46’杨、‘107’杨、‘北京’杨健康树皮,低氮、低磷处理的毛白杨组培苗以及白玉兰花的总RNA。结果表明,用RNA试剂盒改良法均能获取高质量的总RNA。所提取的总RNA已成功用于感染欧美杨细菌性溃疡病的杨树树皮转录组测序,以及低氮处理的毛白杨组培苗RT-PCR和荧光定量PCR实验,表明用RNA试剂盒改良法提取的总RNA可以用于后续分子实验。

关键词： RNA提取杨树侵染树皮

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银杏不同组织器官及愈伤组织培养中端粒酶活性测定

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北京林业大学学报 2014年第3期36卷 95-99页

作者：慕莹赵晓燕景丹龙宋涵陆海刘頔北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京市颐和园管理处三峡大学生物技术研究中心

为了研究端粒酶在植物细胞分裂中的作用,探讨端粒酶活性与细胞分裂能力的相关性,本研究以银杏为材料,通过改良的TRAP法分别测定了银杏不同组织器官(种胚、叶片、小孢子、愈伤组织)的端粒酶活性,研究发现具有旺盛分裂能力的愈伤组织具有... 详细信息

为了研究端粒酶在植物细胞分裂中的作用,探讨端粒酶活性与细胞分裂能力的相关性,本研究以银杏为材料,通过改良的TRAP法分别测定了银杏不同组织器官(种胚、叶片、小孢子、愈伤组织)的端粒酶活性,研究发现具有旺盛分裂能力的愈伤组织具有较高的端粒酶活性。同时以银杏的成熟种胚为材料,采用培养基MS+1.0 mgL6-BA+2.0 mgL NAA诱导出银杏的愈伤组织并采用培养基MS+1.0 mgL 6-BA+2.0 mgL NAA+0.3 mgL 2,4-D+0.2%活性炭进行继代,检测不同代银杏愈伤组织的端粒酶活性,发现不同代愈伤组织均具有较高端粒酶活性。初代愈伤组织的端粒酶活性较高,但愈伤组织继代初期端粒酶活性降低,而后缓慢升高,恢复并超越初代愈伤组织水平后,端粒酶活性处于一个相对稳定的状态,表明愈伤组织继代培养后期细胞具有旺盛且稳定的分裂增殖能力。

关键词：银杏愈伤组织诱导组织培养端粒酶活性

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华北落叶松种子园不同世代间遗传多样性变化

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植物遗传资源学报 2014年第5期15卷 940-947页

作者：于大德袁定昌张登荣范英明李旦张鸿景张金凤林木育种国家工程实验室/林木花卉遗传育种教育部重点实验室/国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室/北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 四川省凉山州凉北林业局西昌615000 河北省林业科学研究院石家庄050061

华北落叶松是我国华北地区营造针叶树丰产林的首选树种,我国自20世纪60年代开始营建华北落叶松种子园,现部分种子园已建至第3代。但选优导致的种子园亲子代群体间的遗传多样性水平变化情况并不清楚,其分子水平的群体遗传基础也不明确,... 详细信息

华北落叶松是我国华北地区营造针叶树丰产林的首选树种,我国自20世纪60年代开始营建华北落叶松种子园,现部分种子园已建至第3代。但选优导致的种子园亲子代群体间的遗传多样性水平变化情况并不清楚,其分子水平的群体遗传基础也不明确,造成高世代育种及造林工作中种质资源不清等问题。本研究利用10对EST-SSR引物,分析了河北省龙头山林场华北落叶松良种基地种子园中1代、2代、3代优树群体的遗传多样性。每对引物的等位位点数为2-5个不等。1、2、3代的平均有效等位位点数分别为1.9204个、1.81个、2.0693个,Shannon指数分别为0.7127、0.7052、0.7908,且群体中杂合子过量。结果表明,1-3代种子园群体遗传多样性水平没有明显的差异,子代群体与亲代群体间遗传分化较小,遗传变异主要存在于每代群体内,而非世代群体间。

关键词：华北落叶松种子园遗传多样性微卫星(SSR)

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河北省华北落叶松天然群体遗传多样性分析

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植物遗传资源学报 2014年第3期15卷 465-471页

作者：范英明张登荣于大德张炎董明亮张鸿景张金凤林木育种国家工程实验室/林木、花卉遗传育种教育部重点实验室/国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室/北京林业大学生物科学与技术学院北京100083 四川省西昌市凉北林业局西昌615000 河北省林业科学研究院石家庄050061

以来自河北8个群体共312个华北落叶松天然个体为材料,利用10对SSR引物对群体进行扩增,所得数据用于其遗传多样性和遗传结构的研究。结果表明：10对SSR位点共检测到42个位点,平均每个位点有4.2个等位基因,位点的等位基因数（Na）为2～6... 详细信息

以来自河北8个群体共312个华北落叶松天然个体为材料,利用10对SSR引物对群体进行扩增,所得数据用于其遗传多样性和遗传结构的研究。结果表明：10对SSR位点共检测到42个位点,平均每个位点有4.2个等位基因,位点的等位基因数（Na）为2～6个。群体平均等位基因数为3.36,Shannon指数（I）平均为0.749,观察杂合度Ho为0.405、期望杂合度He为0.423,来自河北北部的围场台子水和吉字以及兴隆雾灵山的多样性水平最高,南部的阜平群体多样性水平最低。AMOVA分子差异分析显示3%的遗传变异存在于群体间,97%的遗传变异则存在于群体内,基因分化系数Gst仅为0.028,表明华北落叶松在河北的群体分化很低。聚类结果表明河北围场两个群体为一类,蔚县、隆化和涿鹿为一类,阜平和赤城为一类,兴隆雾灵山群体距离其他较远。多样性北部群体较高,南部较低,表明华北落叶松可能的衍化方向是从北向南,印证了北部可能是起源中心的结论。

关键词：华北落叶松 SSR分子标记遗传多样性群体结构

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代谢组学在植物逆境胁迫研究中的应用

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世界林业研究 2014年第5期27卷 11-17页

作者：倪建伟杨秀艳张华新倪元颖武海雯魏琦林木遗传育种国家重点实验室北京100091 国家林业局盐碱地研究中心北京100091 中国农业大学食品科学与营养工程学院北京100083

代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学之后新兴的一门交叉学科,是系统生物学的一个重要分支,近年来在研究植物逆境胁迫方面得到了广泛的应用。文中介绍了代谢组学的检测技术、数据处理及分析方法,概述了其在植物逆境胁迫下的研... 详细信息

代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学之后新兴的一门交叉学科,是系统生物学的一个重要分支,近年来在研究植物逆境胁迫方面得到了广泛的应用。文中介绍了代谢组学的检测技术、数据处理及分析方法,概述了其在植物逆境胁迫下的研究概况,包括温度、盐分、干旱、病原菌和其他逆境,以及多种逆境综合胁迫等,展望了代谢组学的发展前景;利用代谢组学分析植物在逆境条件下代谢物的变化,推测应答胁迫植物对代谢途径的调整,可为研究植物耐受性和适应逆境机理提供分析方法。

关键词：代谢组学逆境胁迫植物代谢代谢产物

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杉木第3代种质资源自由授粉子代生长性状遗传变异及早期选择

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南京林业大学学报(自然科学版) 2014年第6期38卷 38-42页

作者：郑仁华施季森肖晖黄金华苏顺德许鲁平欧阳磊张志才叶代全方扬辉福建省林业科学研究院国家林业局南方山地用材林培育重点实验室国家林业局杉木工程技术研究中心南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室福建省洋口国有林场福建省沙县官庄国有林场

为评价和利用杉木种质资源,对8年生杉木第3代种质资源自由授粉子代测定林进行调查分析,在生长性状评价的基础上对优良种质进行选择。结果表明:杉木林分生长良好,8年生时平均树高、胸径、单株立木材积分别为9.31 m、11.88 cm、0.062 91 ... 详细信息

为评价和利用杉木种质资源,对8年生杉木第3代种质资源自由授粉子代测定林进行调查分析,在生长性状评价的基础上对优良种质进行选择。结果表明:杉木林分生长良好,8年生时平均树高、胸径、单株立木材积分别为9.31 m、11.88 cm、0.062 91 m3,年均生长量分别达到1.16 m、1.49 cm、0.007 86 m3。各年度树高、胸径、单株立木材积的遗传变异系数分别为2.157%6.061%、1.826%2.769%、4.895%6.907%,家系遗传力分别为0.3480.690、0.1670.328、0.2170.367。从参试的97个家系中选择出25个速生优良家系,其8年生时平均树高、胸径、单株立木材积分别为9.70 m、12.60 cm、0.072 21 m3,分别较群体均值大4.19%、6.06%、14.78%,遗传增益分别为1.88%、1.98%和5.42%。这一结果可为杉木第3代种子园建园材料选择提供依据。

关键词：杉木第3代种质资源子代测定遗传变异早期选择

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拟南芥转录因子WRKY18在花粉发育中的功能分析

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电子显微学报 2014年第2期33卷 156-162页

作者：荀志丽李雪萍张丹丹陆海刘頔北京林业大学生物科学与技术学院林木育种国家工程实验室林木花卉遗传育种教育部重点实验室国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083 河南科技大学林学院河南洛阳471003

WRKY蛋白是近年来在植物中发现的一类转录因子家族,本研究从拟南芥中克隆得到转录因子WRKY18的DNA序列,利用荧光体式显微镜观察酵母单杂交菌落,确定了该转录因子与DNA序列TTGACT结合。分别通过半定量、实时荧光定量PCR技术检测其在不同... 详细信息

WRKY蛋白是近年来在植物中发现的一类转录因子家族,本研究从拟南芥中克隆得到转录因子WRKY18的DNA序列,利用荧光体式显微镜观察酵母单杂交菌落,确定了该转录因子与DNA序列TTGACT结合。分别通过半定量、实时荧光定量PCR技术检测其在不同组织及花药发育不同时期的表达,发现该转录因子为组成型表达。该基因在成熟拟南芥根、茎、叶、花的各个组织中均有表达,而在花药发育的9、10时期表达量显著高于其它时期。分别使用扫描电子显微镜和光学显微镜观察比较突变体与野生型植株的花粉形态差异和花粉萌发情况,发现WRKY18对拟南芥花粉发育有重要影响,WRKY18缺失造成拟南芥花粉外形异常、花粉萌发率降低。本研究对进一步分析转录因子WRKY18在拟南芥花粉发育过程中的表达与调控作用具有一定的基础意义。

关键词：拟南芥转录因子 WRKY18 表达分析花粉发育

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孟江油茶初选种质的变异分析与优株的选择

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经济林研究 2014年第2期32卷 47-52页

作者：王黎明杨善勋王荣刚李悦北京林业大学林木育种国家工程实验室北京100083 北京林业大学树木花卉遗传育种教育部重点实验室北京100083 北京林业大学国家林业局树木花卉育种与生物工程重点开放实验室北京100083 广西壮族自治区三江县林业局营林技术推广站广西三江545500 广西壮族自治区三江县林业局同乐乡林业站广西三江545500

孟江油茶是局限分布于广西孟江河流域的优良中果油茶种质,尚未实现品种化。在孟江油茶重要分布区实地调查的基础上,初选了树体生长及果实产量表现均优的植株58棵,分析了初选优树生长和种实性状的变异情况。结果表明,孟江油茶无论是在树... 详细信息

孟江油茶是局限分布于广西孟江河流域的优良中果油茶种质,尚未实现品种化。在孟江油茶重要分布区实地调查的基础上,初选了树体生长及果实产量表现均优的植株58棵,分析了初选优树生长和种实性状的变异情况。结果表明,孟江油茶无论是在树体生长还是在果实性状上,都存在着相当大的变异性。主成分分析结果显示,其种子含油率与种仁含油率、干籽质量、干仁质量、冠幅冠高比、二回枝角、单位主梢分枝数、果实含油率、出仁率均有较大的正相关关系;而分枝长度、叶长、冠型、叶宽、单位主梢叶数和分枝角度,在选择中这些性状指标所提供的有效信息相对较小,可以排除在孟江油茶的选择指标之外。文中还以主要变异指标建立综合评价模型进行综合分析与评价,最终评选出的5个产油效率最高的优良种质为MY10、MY14、MY17、MY42、MY21,这5个优良种质可适用于无性扩繁。

关键词：孟江油茶种质变异优株选择主成分分析

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