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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：叶思诚谭晓风袁军张雪洁石斌中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 北京林业大学研究生院北京 100083

以沙培油茶嫁接苗为试材,建立了油茶根系组织和根系分泌物有机酸检测方法,并测定了不同供磷条件下油茶根系组织和分泌物中的有机酸.结果表明：利用溶液培养法收集根系分泌有机酸和利用水浴超声萃取根系组织中的有机酸效果较好;建立的油... 详细信息

以沙培油茶嫁接苗为试材,建立了油茶根系组织和根系分泌物有机酸检测方法,并测定了不同供磷条件下油茶根系组织和分泌物中的有机酸.结果表明：利用溶液培养法收集根系分泌有机酸和利用水浴超声萃取根系组织中的有机酸效果较好;建立的油茶根系组织和根系分泌物10种有机酸高效液相色谱检测方法线性相关系数为0.9990～ 0.9999,回收率为82.3％～ 108.4％,相对标准偏差为0.72％～ 3.46％,检测限为1～ 193 μg/l,符合高效液相色谱测定的要求,适用于油茶根系组织和分泌物中多种有机酸的快速同时测定;应用该方法检测发现无磷处理下根系组织和分泌物中10 中有机酸含量均显著高于有磷处理,说明低磷促进有机酸在油茶根系组织中积累和向根外分泌.

关键词：高效液相色谱法根系分泌物有机酸低磷油茶

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油茶CoUXS1基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

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中国农学通报 2012年第22期28卷 39-44页

作者：曾艳玲谭晓风王保明龙洪旭刘凯曾晓峰中南林业科技大学森林培养与保护教育部重点实验室长沙410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙410004

为了揭示油茶UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因的序列特点和结构功能,为该基因的深入研究和开发应用奠定基础。根据油茶种子EST文库中调取的UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术获得该基因全长cDNA克隆,并对其序列进行... 详细信息

为了揭示油茶UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因的序列特点和结构功能,为该基因的深入研究和开发应用奠定基础。根据油茶种子EST文库中调取的UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术获得该基因全长cDNA克隆,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明:该基因阅读框为1032bp,编码344个氨基酸,具有典型的UXS家族模体序列。与海岛棉GhUXS3基因亲缘关系最近,定位于细胞质,有较强的亲水性,将该基因命名为CoUXS1,GenBank登录号为JN017094。

关键词：油茶 UXS cDNA 系统进化分析结构域功能预测

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五节芒CCoAOMT和4CL的克隆和表达分析

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华北农学报 2012年第4期27卷 29-35页

作者：常瑞娜汪杏芬陈鸿鹏南京大学生命科学院江苏南京200091 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所上海200032 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙410004

木质素是细胞壁的重要组成部分,在植物的生长发育和抵御病原微生物的侵害方面发挥着重要的作用,但木质素结构稳定,成为生物质能源转化的障碍。以五节芒(Miscanthus floridulus)为材料克隆得到了木质素合成过程中的关键酶CCoAOMT基因全长... 详细信息

木质素是细胞壁的重要组成部分,在植物的生长发育和抵御病原微生物的侵害方面发挥着重要的作用,但木质素结构稳定,成为生物质能源转化的障碍。以五节芒(Miscanthus floridulus)为材料克隆得到了木质素合成过程中的关键酶CCoAOMT基因全长CDS序列和4CL基因的CDS半长序列,并对其CDS和氨基酸序列与其他物种进行了比对分析。相应的qRT-PCR分析显示,2个基因在五节芒的幼苗期、抽穗期的茎节、成熟叶片、幼穗都有表达,且与木质素的合成有一定的相关性。间苯三酚溶液染色结果亦显示,2个基因的表达规律与茎秆的木质化进程一致。五节芒CCoAOMT和4CL基因的克隆和表达分析将为进一步研究其生物学功能和改良能源作物奠定基础。

关键词：五节芒木质素咖啡酰辅酶A-O-甲基转移酶(CCoAOMT) 4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)

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基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究

基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究

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第十届中国林业青年学术论坛

作者：刘果谢耀坚张党权谷振军国家林业局桉树研究开发中心广东湛江524022 中南林业科技大学(a)林业生物技术湖南省重点实验室(b)经济林育种与栽培国家林业局重点实验室(c)经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室湖南长沙410004

林木SSR标记的引物筛选工作量大，十分费时且消耗大量实验材料。本研究采用基因组DNA混合池技术，将研究对象的若干个基因组DNA样品等量混合后，作为单一模板进行SSR的PCR扩增，能显著降低实验的工作量和成本。以选择的150对EST-SSR引... 详细信息

林木SSR标记的引物筛选工作量大，十分费时且消耗大量实验材料。本研究采用基因组DNA混合池技术，将研究对象的若干个基因组DNA样品等量混合后，作为单一模板进行SSR的PCR扩增，能显著降低实验的工作量和成本。以选择的150对EST-SSR引物为对象，对6个桉树基因组DNA样品进行等量混合，进行PCR扩增筛选引物，结果表明，与常规筛选方法相比，基因组DNA混合池方法大幅度缩短了实验周期，显著减少了基因组DNA的消耗，可用于大量林木SSR引物的快速高效筛选。

关键词：基因组DNA混合池引物筛选 EST-SSR,PCR

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油桐β-酮脂酰-ACP合酶Ⅲ基因克隆及其序列分析

油桐β-酮脂酰-ACP合酶Ⅲ基因克隆及其序列分析

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：严方方谭晓风龙洪旭中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙 410004

β-酮脂酰-ACP合酶－KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶.本研究以近成熟的油桐种子为材料,利用改良CTAB法提取总RNA,并根据GenBank 中蓖麻等已知的β-酮脂酰-ACP合酶基因KASⅢ 的序列设计引物,利用简并PCR、RACE 等技术克隆得到油桐种子中... 详细信息

β-酮脂酰-ACP合酶－KAS是脂肪酸合成中的一种缩合酶.本研究以近成熟的油桐种子为材料,利用改良CTAB法提取总RNA,并根据GenBank 中蓖麻等已知的β-酮脂酰-ACP合酶基因KASⅢ 的序列设计引物,利用简并PCR、RACE 等技术克隆得到油桐种子中KASⅢ基因全长cDNA.该基因序列全长1901bp,开放阅读框为1209bp,编码403个氨基酸,通过与其他物种的KASⅢ氨基酸序列比对,油桐KASⅢ基因与与麻疯树的同源性最高,达90％.软件预测表明,KASⅢ蛋白等电点为5.78,存在跨膜结构域,整个蛋白质基本上是表现出亲水性的.

关键词：油桐 KASⅢ 基因克隆序列分析:结构预测

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桉叶不饱和脂肪酸的提取研究及成分分析

桉叶不饱和脂肪酸的提取研究及成分分析

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第十届中国林业青年学术论坛

作者：杨巧丽谢耀坚谭晓风张婧黄赤夫吴志华国家林业局桉树研究开发中心广东湛江524000 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙410000 国家林业局桉树研究开发中心广东湛江524000 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室长沙410000 肯塔基大学医学中心口腔学院肯塔基州莱克星顿40503

目的：研究桉叶不饱和脂肪酸的最佳提取方法.方法：用不同的溶剂、物料粒度、料液比、浸泡时间及萃取时间对桉叶不饱和脂肪酸进行提取的正交试验,筛选出最优的提取方案并对提取物甲酯化处理后通过GC-MS分析其成分.结果：在进行了五因素... 详细信息

目的：研究桉叶不饱和脂肪酸的最佳提取方法.方法：用不同的溶剂、物料粒度、料液比、浸泡时间及萃取时间对桉叶不饱和脂肪酸进行提取的正交试验,筛选出最优的提取方案并对提取物甲酯化处理后通过GC-MS分析其成分.结果：在进行了五因素四水平的16个正交试验之后,研究得到当溶剂为丙酮、物料粒度为100-200目、料液比为1：15、浸泡时间为8h及超声波处理1.5h时得到最佳提取,提取率为14.9％,GC-MS分析,鉴定出6个化合物,其中有5个脂肪酸类化合物,其中不饱和脂肪酸2种(亚油酸和亚麻酸),含量为36.01mg/10g.结论：桉叶中含有重要的不饱和脂肪酸,具有开发利用价值.

关键词：桉叶不饱和脂肪酸正交试验提取成分分析

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油桐种子三个发育时期的转录组分析

油桐种子三个发育时期的转录组分析

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：谭晓风龙洪旭蒋桂雄张琳曾艳玲陈昊严方方李泽中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004

本研究应用高通量测序平台Illumina HISEQ 2000对油桐代表性地方品种—泸溪葡萄桐种子发育的三个时期转录组进行测序,经组装分析共获得58439条Unigene,平均长度889nt.其中有41059条基因可注释到各蛋白数据库,根据COG 库比对结果,可将Uni... 详细信息

本研究应用高通量测序平台Illumina HISEQ 2000对油桐代表性地方品种—泸溪葡萄桐种子发育的三个时期转录组进行测序,经组装分析共获得58439条Unigene,平均长度889nt.其中有41059条基因可注释到各蛋白数据库,根据COG 库比对结果,可将Unigene按功能分为25 类,其中脂类转运和代谢类有639条;通过与KEGG 数据库比对,对22134条Unigene 进行了Pathway 注释,涉及的Pathway 有128 类,包括生化代谢通路,次生代谢物的生物合成,脂肪酸合成、不饱和脂肪酸的生物合成等代谢途径.基因差异表达分析表明,不同时期样本的基因上调与下调表达均有明显差异.这些分析为油桐重要基因的挖掘及其调控机制、表达模式的研究提供基础数据,为进一步油桐良种选育提供科学依据.

关键词：油桐转录组 Illumina HISEQ 2000 Unigene Pathway

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外源赤霉素对油茶春梢生长特性的影响

外源赤霉素对油茶春梢生长特性的影响

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：陈显李建安中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙 410004 经济林栽培与育种国家林业局重点实验室湖南长沙 410004

采用不同浓度的外源赤霉素处理油茶幼苗,结果表明：外源赤霉素能促进油茶春梢的萌发,以200mg/L 浓度处理效果最好;显著促进了油茶春梢的生长,其中150mg/L 浓度处理效果最明显;对春梢数量有一定的抑制作用;对春梢直径的影响不显著。春梢... 详细信息

采用不同浓度的外源赤霉素处理油茶幼苗,结果表明：外源赤霉素能促进油茶春梢的萌发,以200mg/L 浓度处理效果最好;显著促进了油茶春梢的生长,其中150mg/L 浓度处理效果最明显;对春梢数量有一定的抑制作用;对春梢直径的影响不显著。春梢的生长动态变化呈双峰型曲线,有明显的“停滞期”,喷施赤霉素可以改善其生长状况,其中150mg/L处理使枝梢保持平稳的生长趋势,200mg/L 处理缩短了“停滞期”时间。

关键词：赤霉素油茶枝梢生长

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菲油果扦插技术的研究

菲油果扦插技术的研究

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：高伟袁德义范晓明高超中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室湖南长沙 410004 经济林栽培与育种国家林业局重点实验室湖南长沙 410004

菲油果(Feijoa sellowiana Berg)是近年来在新西兰、美国等国家流行的一个新兴水果，果实富含碘，营养价值高，被称为“智力水果”。以菲油果当年生枝条为插穗，分别用黄土、沙土、蛭石作为基质，采用不同植物生长调节剂、浓度和切口方... 详细信息

菲油果(Feijoa sellowiana Berg)是近年来在新西兰、美国等国家流行的一个新兴水果，果实富含碘，营养价值高，被称为“智力水果”。以菲油果当年生枝条为插穗，分别用黄土、沙土、蛭石作为基质，采用不同植物生长调节剂、浓度和切口方式对其扦插生根率进行了研究。结果表明：以蛭石作为基质更有利于插穗生根;100mg/l 的IBA 处理菲油果插穗并采取两端斜切的切口处理方式能使其效果达到最佳，生根率可达87％。

关键词：菲油果扦插植物生长调节剂

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转录组数据组装及功能注释

转录组数据组装及功能注释

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中国林学会经济林分会2012年学术年会

作者：乌云塔娜刘慧敏杜红岩中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 中南林业科技大学林学院湖南长沙 410004 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室湖南长沙 410004 中国林业科学院经济林研究中心河南郑州 450009

对优良品种进行了转录组测序、组装和功能注释.对杜仲国审良种‘华仲6号’果实和叶片进行转录组测序和生物信息学分析,共获得了106,264,108个reads、7,491,046,464Nucleotides (nt)、1316317个Contig、292591个Scaffold、185403个Unigene 片段;对All-Unigene功能注释分别获得了67119个、67119个和4948个CDS、protein 和EST 的Unigene;GO、COG、KEGG 分类分别注释了72893、42359、43715个Unigene.

关键词：杜仲转录组测序生物信息学分析功能注释

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