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果树学报 2025年第3期42卷 508-525页

作者：张珊珊阮孙美杨文忠云南省林业和草原科学院·国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

【目的】富民枳(Poncirus polyandra)为柑橘属近缘种,是嫁接时广泛使用的抗性砧木,属云南省特有的极小种群野生植物。WRKY家族是植物中特有且最大的转录因子之一,在植物应对非生物胁迫过程中发挥着重要的作用。研究富民枳WRKY基因家族,... 详细信息

【目的】富民枳(Poncirus polyandra)为柑橘属近缘种,是嫁接时广泛使用的抗性砧木,属云南省特有的极小种群野生植物。WRKY家族是植物中特有且最大的转录因子之一,在植物应对非生物胁迫过程中发挥着重要的作用。研究富民枳WRKY基因家族,为解析富民枳WRKY基因功能以及筛选抗旱基因提供理论依据。【方法】基于富民枳基因组数据,利用生物信息学方法对富民枳WRKY基因家族成员进行全基因组鉴定,系统分析该家族成员的理化性质、序列特征、系统进化关系、染色体定位、共线性、基因结构和顺式作用元件等以及qRT-PCR分析干旱胁迫下的表达模式。【结果】在富民枳基因组中共鉴定到46个WRKY家族基因,命名为PpWRKY1~PpWRKY46,染色体定位分析显示,WRKY家族基因不均匀地分布在9条染色体上。亚细胞定位预测表明,富民枳WRKY家族成员主要定位于细胞核上。WRKY结构域多序列比对分析显示,只有Ⅱc亚组的PpWRKY15和PpWRKY21的典型七肽序列发生单氨基酸变异。共线性分析结果表明,富民枳和枳有88对共线性基因;片段复制是PpWRKY基因家族扩张的主要驱动力。顺式作用元件分析表明,PpWRKY家族基因启动子区域含有大量胁迫类和激素类响应顺式作用元件。基于富民枳近缘种枳的WRKY家族基因在干旱胁迫下的转录组数据,在富民枳中筛选到PpWRKY8、PpWRKY12、PpWRKY13、PpWRKY19、PpWRKY23、PpWRKY27、PpWRKY28、PpWRKY30和PpWRKY41共9个同源抗旱候选基因,最后通过qRTPCR分析表明,这9个基因均受干旱胁迫诱导显著表达。蛋白互作预测结果表明,有12个PpWRKY蛋白可能通过MYB转录因子介导ABA信号参与调控气孔运动来影响植物的耐旱性。【结论】鉴定到9个可能参与调控干旱胁迫的PpWRKY基因,为解析WRKY基因在富民枳干旱胁迫响应中的功能提供新信息,并为培育耐旱柑橘品种提供抗旱基因资源。

关键词：富民枳 WRKY基因干旱胁迫生物信息学表达分析

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富民枳bZIP基因家族的鉴定和干旱胁迫表达

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东北林业大学学报 2025年第4期53卷 12-22页

作者：张珊珊张攀杨文忠国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室(云南省林业和草原科学院) 昆明650201

为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚... 详细信息

为深入研究富民枳bZIP基因家族在干旱胁迫中发挥的功能及筛选抗旱基因,采用生物信息学的方法对富民枳bZIP基因家族进行分析。结果表明:富民枳中鉴定到53个bZIP基因,不均匀地分布在9条染色体上。根据系统进化分析,这些基因可划分为10个亚族,不同亚族的内含子数目及保守基序差异较大。共线性分析表明,富民枳bZIP基因之间存在片段复制事件,富民枳bZIP与拟南芥和枳分别存在62和69个同源基因对。GO和KEGG富集分析表明,PpbZIPs成员响应ABA和渗透压刺激,参与植物激素信号转导途径。顺式作用元件分析表明,PpbZIPs基因启动子含大量的干旱响应元件和ABA响应元件。利用枳的转录组数据,筛选了8个富民枳bZIP抗旱候选基因。qRT-PCR分析结果表明,在干旱胁迫下,除了PpbZIP46其余7个基因表达均显著上升,表明这些基因参与了干旱胁迫响应。受干旱胁迫诱导上调表达的7个PpbZIPs基因,可能是重要的抗旱基因,研究结果为挖掘富民枳bZIP抗旱基因提供参考。

关键词：富民枳 bZIP 干旱胁迫系统进化表达分析

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竹叶花椒‘跃宏1号’无性系选育与栽培

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西部林业科学 2025年第2期54卷 89-92,102页

作者：呼延丽陆斌杜春花郭永清郑跃宏云南省林业和草原科学院云南昆明650201 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201 云南跃宏椒业科技发展有限公司云南文山663099

为选育具有丰产、早实、品质优良,少刺、生长旺盛等特性且适合文山州及气候相似地区种植的竹叶花椒优良无性系。根据群众报优,在竹叶花椒实生种群中选出的优良单株,采用“初选→无性繁殖与子代测定→复选、决选→品比试验→区域性试验... 详细信息

为选育具有丰产、早实、品质优良,少刺、生长旺盛等特性且适合文山州及气候相似地区种植的竹叶花椒优良无性系。根据群众报优,在竹叶花椒实生种群中选出的优良单株,采用“初选→无性繁殖与子代测定→复选、决选→品比试验→区域性试验”的技术路线开展选育工作。选育出的‘跃宏1号’竹叶花椒优良无性系经无性繁殖嫁接4代,子代性状具有稳定性和一致性的特点。其主要园艺性状:早实(嫁接当年初果)、丰产(果穗长、果粒多、株产鲜果12.5 kg)、少刺(枝刺4.1个·dm^(-1),无叶刺);果实挥发油含量高(16.9 mL·100 g^(-1))。‘跃宏1号’品质达国家林业行业标准规定的特级花椒要求。

关键词：竹叶花椒 ‘跃宏1号’ 优良品种选育栽培技术

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小五台山植物资源多样性保护与可持续管理

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中国野生植物资源 2025年第1期44卷 102-110页

作者：白晓航朱珣之东南大学建筑学院江苏南京210096 云南省林业和草原科学院国家林业和草原局珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室云南昆明650204 江苏省中国科学院植物研究所江苏南京210014

目的:完善小五台山植物资源的本底资料,探明可持续管理中的现实问题。方法:对河北小五台山国家级自然保护区全面踏查,采用植物区系地理学研究方法对种子植物科、属、种的类型和分布开展区系分析。结果:(1)从植物生长型看,保护区内草本... 详细信息

目的:完善小五台山植物资源的本底资料,探明可持续管理中的现实问题。方法:对河北小五台山国家级自然保护区全面踏查,采用植物区系地理学研究方法对种子植物科、属、种的类型和分布开展区系分析。结果:(1)从植物生长型看,保护区内草本植物种类繁多(70.82%),灌木次之(18.20%);从植物生活型看,地面芽植物所占的比例最大(45.39%),其次是高位芽植物(28.43%)和地下芽植物(11.72%);(2)世界分布的科在该植被区系所占比例最大(55.07%),温带分布的属在该植被区系所占的比例最大(66.82%),植物温带成分发达、以北温带分布类型居首、进化历史较长、所含木本植物的属数较多;(3)该区域具有珍贵的野生濒危植物资源,在食用、药用、观赏、工业等方面具有潜在应用价值;(4)以资源评估为基础、生态保护为核心、开发利用为支撑,多元管理为途径,共同促进该区域植物资源可持续管理。结论:小五台山植物资源多样性保护需要注重林分结构与空间配置、服务效益与功能协调、生态过程与多样性维持、林分健康与系统平衡,完善区域生态保护体系建设、维护森林生态系统的原真性和完整性。

关键词：小五台山植物区系可持续管理资源保护自然保护区

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石斛新品种‘云雪檀’和‘鑫禾紫龙’

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园艺学报 2025年第3期52卷 817-818页

作者：江期川钟华杨卫周彬毕玮卢正玖云南省林业和草原科学院国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 昆明市林业和草原科学研究所昆明650223 德宏鑫禾农业科技开发有限责任公司云南芒市678499

‘云雪檀’和‘鑫禾紫龙’是从浅紫红色花的檀香石斛(Dendrobiumanosmum)自交后代中选育出的不同花色的新品种。茎丛生,圆柱形,茎长33~48 cm,具数节,节间长1.5~2.2 cm,茎粗0.4~0.9 cm,不分枝。叶二列状互生,长椭圆形,长7.1~10.5 cm,宽1.... 详细信息

‘云雪檀’和‘鑫禾紫龙’是从浅紫红色花的檀香石斛(Dendrobiumanosmum)自交后代中选育出的不同花色的新品种。茎丛生,圆柱形,茎长33~48 cm,具数节,节间长1.5~2.2 cm,茎粗0.4~0.9 cm,不分枝。叶二列状互生,长椭圆形,长7.1~10.5 cm,宽1.9~3.4 cm。总状花序,每1~2朵花为一束,花横径6.8~8.2 cm。‘云雪檀’的花萼片、花瓣、唇瓣均呈白色(2015RHS NN155D),唇瓣无眼;‘鑫禾紫龙’的呈深紫红色(2015RHS 64A)。花期4—6月,适宜热带亚热带地区或温室种植。

关键词：石斛檀香石斛杂交品种

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鳄梨中干旱与低温胁迫相关NAC转录因子的表达分析

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分子植物育种 2025年第5期 1488-1502页

作者：罗玛妮娅王毅张璋原晓龙王丽娟冯发玉徐令文郑元西南林业大学林学院云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室西南林业大学生物与食品工程学院

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，... 详细信息

NAC转录因子是植物转录因子家族中的重要成员之一，对植物生长发育和非生物胁迫响应具有重要作用。本研究通过本地BLAST与鳄梨基因组比对分析获得72个鳄梨NAC (PaNAC)转录因子，利用二代转录组测序获得鳄梨干旱和低温胁迫转录组数据，对其蛋白理化性质、系统进化树及基因表达谱分析，并对干旱和低温胁迫相关基因进行RT-qPCR验证。转录组分析结果表明，在干旱胁迫下有56个PaNACs表达，低温胁迫下共有53个PaNACs表达。系统进化树结果表明，PaNAC25和参与干旱胁迫的拟南芥ANAC019、ANAC055和ANAC072聚为1支，Pa NAC10、Pa NAC50和PaNAC51分别与刚毛柽柳ThNAC24、茶树CsNAC17、水稻Os NAC022聚为1支。RT-qPCR结果显示，鳄梨NAC转录因子中PaNAC10、PaNAC25、PaNAC50和PaNAC51参与干旱胁迫响应，Pa NAC35和Pa NAC69参与低温胁迫响应。本研究结果为进一步探究鳄梨NAC转录因子家族生物学特性及基因功能奠定基础，为揭示NAC基因参与非生物胁迫调控提供科学依据。

关键词：鳄梨(Persea americana) NAC转录因子转录组分析干旱低温胁迫

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云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长的自毒效应

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林业科学研究 2014年第4期27卷 502-507页

作者：张珊珊向振勇康洪梅杨文忠国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室云南昆明650201

云南蓝果树为中国特有极度濒危一级保护植物,为探讨云南蓝果树濒危机理并进行有效保护,通过野外原位实验和室内受控实验相结合的方法,研究云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长是否有自毒效应。结果表明:野外条件下,云南蓝果树的种子萌发受... 详细信息

云南蓝果树为中国特有极度濒危一级保护植物,为探讨云南蓝果树濒危机理并进行有效保护,通过野外原位实验和室内受控实验相结合的方法,研究云南蓝果树对种子萌发及幼苗生长是否有自毒效应。结果表明:野外条件下,云南蓝果树的种子萌发受野外枯枝落叶和自身种皮的显著抑制;室内受控实验发现,云南蓝果树的根、茎、叶和种皮浸提液对种子萌发都有不同程度的显著抑制作用,其中,根的抑制作用最强(80.90%),种皮的抑制作用最弱(13.59%),而且云南蓝果树的根、茎、叶浸提液和根际土壤对幼苗生长(株高、叶片数和生物量)也表现出显著的抑制作用。

关键词：云南蓝果树极度濒危种自毒效应种子萌发幼苗生长

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干旱胁迫下AMF对云南蓝果树幼苗生长和光合特征的影响

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生态学报 2016年第21期36卷 6850-6862页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠向振勇云南省林业科学院珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室昆明650201

采用盆栽试验与称重控水法,将土壤相对含水量分别控制在田间最大持水量的100%、91.68%、82.85%、60.00%、41.86%和21.28%,并在这6个不同的土壤相对含水量条件下,分别设添加苯菌灵(杀真菌剂)(低AMF)和不添加苯菌灵(高AMF)处理,研究干旱... 详细信息

采用盆栽试验与称重控水法,将土壤相对含水量分别控制在田间最大持水量的100%、91.68%、82.85%、60.00%、41.86%和21.28%,并在这6个不同的土壤相对含水量条件下,分别设添加苯菌灵(杀真菌剂)(低AMF)和不添加苯菌灵(高AMF)处理,研究干旱胁迫下AMF对极小种群野生植物云南蓝果树幼苗生长和光合特征的影响,揭示云南蓝果树濒危的微生物学机制,为云南蓝果树保护措施的制定与实施奠定基础。结果表明,添加苯菌灵处理显著降低了不同水分条件下的AMF侵染率,说明试验中AMF处理的实生苗在生长和光合特征上的差异是苯菌灵处理下侵染率下降导致的;随着干旱胁迫的加剧,云南蓝果树幼苗的根部AMF侵染率显著降低、叶面积等生长指标和净光合速率(Pn)等光合参数都发生显著变化;高AMF处理可以显著增加水分充足和轻度干旱胁迫条件下云南蓝果树幼苗的大部分生长指标和光合参数,而对重度胁迫下的云南蓝果树幼苗没有显著影响,说明重度干旱胁迫对其影响大于AMF的影响;另外,整合了可塑性指数分析和隶属函数分析两种方法对其抗旱性进行评价,云南蓝果树幼苗基本上无法通过调节形态和光合能力来适应水分环境的变化,但是高AMF处理可使云南蓝果树幼苗具有较强的可塑性和更强的抗旱性。实验结果为云南蓝果树的科学保育及种苗繁育提供了理论依据。

关键词：丛枝菌根真菌干旱胁迫生长指标光合特征云南蓝果树

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蒜头果根际细菌群落结构与功能特征对其健康状态的响应

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植物生态学报 2023年第7期47卷 1020-1031页

作者：张仲富王四海杨卫陈剑云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室昆明650201 国家林业和草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室昆明650201

为了解蒜头果(Malania oleifera)植株根际微生物组成和功能特征与蒜头果健康状态的关系,该研究采集了阔叶林、人工种植林和喀斯特森林下的5种不同生境的健康和非健康蒜头果植株根际土壤样品,运用Illumina高通量测序技术进行细菌测序,并... 详细信息

为了解蒜头果(Malania oleifera)植株根际微生物组成和功能特征与蒜头果健康状态的关系,该研究采集了阔叶林、人工种植林和喀斯特森林下的5种不同生境的健康和非健康蒜头果植株根际土壤样品,运用Illumina高通量测序技术进行细菌测序,并用FAPROTAX进行功能预测分析。研究结果表明:1)扩增子序列变异体(ASV)分析结果显示,在门水平上不同生境的细菌组成存在一定差异,其中相对丰度最高的前5个门的细菌类群为酸杆菌门、变形菌门、放线菌门、绿弯菌门和黏菌门。健康植株和非健康植株的根际细菌组成有显著的差异,且细菌群落的优势菌群发生显著的变化。2)非度量多维尺度分析显示不同健康状态蒜头果的根际细菌组成有显著差异,冗余分析结果显示健康植株的样本沿第一轴分布,两轴共解释了25.83%的细菌群落变异,土壤速效磷含量、总钾含量和pH是影响健康植株根际细菌群落物种组成的主要因子。非健康植株的冗余分析结果显示两轴累积解释了51.84%的细菌群落物种组成变异,土壤总钾含量和速效磷含量是影响其物种组成的重要因子。3)相关性热图显示健康植株根际土壤pH、速效磷含量和全钾含量与绿弯菌门、浮霉菌门、Methylomirabilota和Desulfobacterota等主要类群的相对丰度显著相关。非健康植株的土壤pH、速效氮含量、速效磷含量、总磷含量和全钾含量与绿弯菌门、酸杆菌门、Desulfobacterota、Latescibacterota和芽单胞菌门等主要类群的相对丰度显著相关。4)FAPROTAX功能预测结果显示光营养、光能自养、芳香化合物降解、蓝藻细菌和含氧光能自养等细菌功能群相对丰度在健康植株的根际土壤中明显下降,而发酵、尿素分解和人类病原菌等细菌功能群相对丰度则明显升高,说明不同健康状态植株的根际细菌发生了显著的变化。

关键词：蒜头果根际细菌细菌群落细菌功能高通量测序技术

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基于简化基因组技术的云南蓝果树群体遗传分析

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植物研究 2019年第6期39卷 899-907页

作者：张珊珊康洪梅杨文忠云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室/国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育国家林业局重点实验室

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多... 详细信息

极小种群野生植物云南蓝果树是国家和云南省实施极小种群野生植物保护工程的代表性物种。为有效保护其遗传资源,本研究通过二代测序技术,对其进行简化基因组测序,开发一批特异性高的单核苷酸多态性标记,分析现存群体的遗传结构和遗传多样性。经过遗传变异检测,本次研究中共获得SNP位点98498个,通过样品最低测序深度>2,样品缺失率<0.5,次要基因型频率(MAF)>0.05筛选以后,得到有效SNP位点6309个。基于过滤后的SNP,运用生物信息学分析方法,对云南蓝果树完成了群体的遗传分析,其中:系统进化树分析将云南蓝果树划分为3大类,研究分析了云南蓝果树各分类的私人等位基因数目(Private)、平均观测杂合度(H o)、平均期望杂合度(H e)、核苷酸多样性(π)和平均近交系数(F IS)5个遗传多样性参数;群体结构和主成分分析进一步证明了,云南蓝果树现存植株之间亲缘关系较远,遗传多样性差异较大,具有很高的遗传资源保存价值。本研究结果将为基于遗传管理的云南蓝果树就地保护、遗传资源保存和种群重建等保护工程提供科学依据。

关键词：云南蓝果树简化基因组测序 SNP 群体遗传分析遗传管理

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