检索结果-内蒙古大学图书馆

大连海洋大学学报 2024年第2期39卷 241-249页

作者：王姝然范厚勇徐嘉楠周天琦许丹郑跃平上海海洋大学水产与生命学院上海201306 上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海市水生野生动植物保护研究中心上海200092

为建立一种针对弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)敏感性高、特异性强的临床快速检测方法,根据该菌定居因子基因cfa的保守序列,设计特异性引物,采用重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA),并结合琼脂糖... 详细信息

为建立一种针对弗氏柠檬酸杆菌(Citrobacter freundii)敏感性高、特异性强的临床快速检测方法,根据该菌定居因子基因cfa的保守序列,设计特异性引物,采用重组酶聚合酶扩增技术(recombinase polymerase amplification,RPA),并结合琼脂糖凝胶电泳(AGE)和侧流层析试纸条(LFD)方法进行反应条件的优化及特异性与灵敏度的检测。结果表明:本研究中所建立的弗氏柠檬酸杆菌重组酶聚合酶扩增结合侧向流动试纸条(RPA-LFD)快速检测方法,在38℃条件下扩增20 min后,能特异性地检测到弗氏柠檬酸杆菌,对弗氏柠檬酸杆菌纯培养物和基因组DNA的最小检出限分别为1.5×102 CFU/mL和200 fg/μL,是常规PCR(cfa引物)检测灵敏度(20 pg/μL)的100倍;利用所建立的RPA-LFD法与常规PCR同时检测杂交鲟攻毒试验样本,两种方法的检测结果一致。研究表明,本研究中建立的弗氏柠檬酸杆菌RPA-LFD方法,操作简便、反应迅速、特异性好、灵敏度高,并且不需要昂贵的仪器,该方法可为未来弗氏柠檬酸杆菌细菌性疾病的早期诊断提供更有效的技术支持。

关键词：弗氏柠檬酸杆菌快速检测重组酶聚合酶扩增技术侧向流动试纸条

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三丁酸甘油酯对异育银鲫肠道转录组差异基因表达的影响

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基因组学与应用生物学 2021年第5期40卷 2029-2037页

作者：王雅丽姜莺颖肖鸿燕杨宗英孙晶郑瑞州吴丛迪杨先乐邱军强国家水生动物病原库上海海洋大学上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 江西省南昌市农业科学院南昌330038

为深入研究三丁酸甘油酯对异育银鲫肠道基因表达水平的影响,将异育银鲫随机分为2组,每组3个重复,分别投喂正常饲料和添加了1 g/kg TB的饲料,喂养8周后进行转录组测序分析。结果共获得2705个差异表达基因,其中上调表达基因522个,下调表... 详细信息

为深入研究三丁酸甘油酯对异育银鲫肠道基因表达水平的影响,将异育银鲫随机分为2组,每组3个重复,分别投喂正常饲料和添加了1 g/kg TB的饲料,喂养8周后进行转录组测序分析。结果共获得2705个差异表达基因,其中上调表达基因522个,下调表达基因2183个。随机选取12个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证,结果显示真实可靠。GO功能富集分析和KEGG pathway通路结果显示三丁酸甘油酯能够促进异育银鲫脂质和蛋白质的合成代谢,激活mTOR信号通路,大部分与生长代谢和生物调控的差异基因均显示上调。该研究结果为进一步探究三丁酸甘油酯对异育银鲫生长的调控机制提供了理论支撑。

关键词：三丁酸甘油酯转录组异育银鲫(Carassius auratus gibelio)

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扑草净、辛硫磷和亚甲基蓝制剂对凡纳滨对虾的急性毒性及组织病理改变

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生态毒理学报 2020年第6期15卷 279-289页

作者：周桂娴马荣荣杨宗英胡鲲上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 宁波大学宁波315000 南昌市农业科学院南昌330038

采用静水生物实验法评价扑草净、辛硫磷和亚甲基蓝对凡纳滨对虾(Pemaeus vannamei)的急性毒性风险,为其安全性评估和合理使用提供参考。水温28℃下,3种药物对凡纳滨对虾的24 h半数致死浓度(24 h-LC_(50))为13.517 mg·L^(-1)、6.32... 详细信息

采用静水生物实验法评价扑草净、辛硫磷和亚甲基蓝对凡纳滨对虾(Pemaeus vannamei)的急性毒性风险,为其安全性评估和合理使用提供参考。水温28℃下,3种药物对凡纳滨对虾的24 h半数致死浓度(24 h-LC_(50))为13.517 mg·L^(-1)、6.32μg·L^(-1)和5.769 mg·L^(-1);48 h-LC_(50)分别为5.050 mg·L^(-1)、1.03μg·L^(-1)和4.698 mg·L^(-1),安全浓度为0.211 mg·L^(-1)、0.0083μg·L^(-1)和0.935 mg·L^(-1)。用扑草净、辛硫磷和亚甲基蓝48 h-LC_(50)浓度的1/10进行暴露实验,在0、2、4和6 d取肝胰腺组织和肠道组织做病理切片,得到染毒时间和组织发生病理变化的关系。扑草净暴露4 d和6 d后,凡纳滨对虾肝胰腺出现了少量小管结构破坏,管壁细胞缺失,肠道粘膜层的上皮细胞溶解量增多,胞质呈空泡状。辛硫磷暴露4 d和6 d后,凡纳滨对虾的肝胰腺组织有肝管排列疏松,管壁不完整,细胞缺失,少量管壁细胞脱落入管腔等现象;肠道组织也出现了大面积溶解,局部可见上皮细胞脱落等不良现象。随着亚甲基蓝暴露时间增加,凡纳滨对虾肝胰腺和肠道的组织病变越严重,在暴露4 d和6 d后肝胰腺组织的部分肝管结构破坏,细胞缺失,少量管壁细胞坏死,胞核固缩深染或碎裂溶解;肠道组织在暴露6 d后,黏膜层上皮完全丧失,肠腔内可见少量脱落的上皮细胞。

关键词：扑草净辛硫磷亚甲基蓝凡纳滨对虾急性毒性组织病理变化

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三丁酸甘油酯对异育银鲫生长性能及免疫功能的影响

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基因组学与应用生物学 2020年第5期39卷 2042-2049页

作者：姜莺颖崔亮杨宗英孙晶郑瑞洲钟锐杨先乐邱军强上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 江西省南昌市农业科学院南昌330038

为研究三丁酸甘油酯(tributyrin,TB)对异育银鲫生长和免疫的影响,以基础饲料作为对照,分别在基础饲料中添加0.5 g/kg、1 g/kg、1.5 g/kg、2 g/kg TB配制成4种实验饲料。实验选择健康、体重相近(43.58±1.6)g的异育银鲫450尾,随机分... 详细信息

为研究三丁酸甘油酯(tributyrin,TB)对异育银鲫生长和免疫的影响,以基础饲料作为对照,分别在基础饲料中添加0.5 g/kg、1 g/kg、1.5 g/kg、2 g/kg TB配制成4种实验饲料。实验选择健康、体重相近(43.58±1.6)g的异育银鲫450尾,随机分为5组,每组3个重复,每个重复30尾。预试期2周,正试期8周,实验结束后检测其生长性能和免疫指标。结果表明:各实验组异育银鲫的增重率、特定生长率与对照组相比都得到提高,其中添加1 g/kg TB效果最佳,显著降低了饵料系数(p<0.05)。各实验组的头肾和脾脏指数在添加量为0.5~1.0 g/kg范围内显著高于对照组(p<0.05)。各实验组的肝胰脏中一氧化氮含量均低于对照组、过氧化氢酶含量均高于对照组,且除2 g/kg TB外其他实验组均差异显著(p<0.05);肝胰脏中超氧化物歧化酶活性在添加量为1 g/kg和1.5 g/kg显著高于对照组(p<0.05),超过2 g/kg时则会抑制其活性,但差异不显著(p>0.05);各实验组的肝胰脏中丙二醛和溶菌酶的含量均低于对照组,且在添加量为1 g/kg TB时差异显著(p<0.05)。综合来看,添加适量的TB能提高异育银鲫的生长性能,增强其免疫能力,当添加量为1.02 g/kg时效果最佳。

关键词：三丁酸甘油酯异育银鲫生长性能免疫指标

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宏基因组学技术在水产动物病毒鉴定中的应用

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江苏农业学报 2019年第1期35卷 229-237页

作者：彭司华江守文孙丹吴智超陈洁上海海洋大学水产与生命学院上海201306 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室/上海海洋大学上海201306 农业部国家水生动物病原库/上海海洋大学上海201306 科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心/上海海洋大学上海201306

近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病... 详细信息

近年来水产养殖生产中病毒性疾病的发生越来越严重,所以对水产动物病毒的深入研究成为水产研究者的一个重要课题。随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的快速下降,基于宏基因组学技术的水产动物病毒鉴定技术逐渐成为水产动物病毒鉴定的主要技术之一。本文总结了基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的主要方法,详细综述了鉴定技术的实现流程,评述了几种基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的优缺点,并对基于宏基因组学的水产动物病毒鉴定技术的未来发展方向进行了展望。

关键词：水产动物病毒宏基因组学病毒鉴定二代测序

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通过宏基因组学发现生物催化剂

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应用与环境生物学报 2019年第2期25卷 463-472页

作者：彭司华孙丹袁文亮卫偲上海海洋大学水产与生命学院发育生物学系上海201306 水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室(上海海洋大学) 上海201306 农业部国家水生动物病原库(上海海洋大学) 上海201306 科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心(上海海洋大学) 上海2013065 上海理工大学光电信息与计算机工程学院上海200093

现在大多数化学合成使用对环境有害的有机溶剂.如果用酶作为生物催化剂,则可在化学合成反应中少使用或不使用有机溶剂,所以使用酶作为催化剂更环保.随着宏基因组学的发展,以及二代测序成本的持续大幅度下降,基于宏基因组学获得生物催化... 详细信息

现在大多数化学合成使用对环境有害的有机溶剂.如果用酶作为生物催化剂,则可在化学合成反应中少使用或不使用有机溶剂,所以使用酶作为催化剂更环保.随着宏基因组学的发展,以及二代测序成本的持续大幅度下降,基于宏基因组学获得生物催化剂已经成为最重要的方法.本文综述基于宏基因组学发现生物催化剂的各种方法,对目前世界上采用的各种筛选方法进行归纳,共总结出两大类方法:一是基于宏基因组文库的筛选方法,另一种是基于序列的遗传筛选方法.进一步对这两类方法细分为具体的7种筛选方法,并对各种方法的优缺点逐一进行回顾和评述.同时,对各种基于宏基因组学筛选生物催化剂的方法得到的结果进行统计分析,指出表型选择法筛选是采用最多的方法,有很大的实用价值.认为直接二代测序进行生物信息学筛选的方法也是有潜力的一种筛选方法,三代测序技术将在基于宏基因组学的生物催化剂筛选中发挥重要作用.(图2表8参92)

关键词：宏基因组学生物催化剂酶微生物二代测序三代测序

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宏基因组学在抗生素抗性基因鉴定中的应用

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基因组学与应用生物学 2019年第9期38卷 4102-4109页

作者：彭司华吴智超孙丹谭双配王怡鸣文登鑫上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室上海201306 上海海洋大学农业部国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心上海201306 上海海洋大学水产与生命学院发育生物学系上海201306

随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的下降,基于宏基因组学的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)鉴定技术逐渐成为主流技术。本综述总结了基于宏基因组学的抗生素抗性基因鉴定的主要技术和方法,详细综述了各种... 详细信息

随着宏基因组学技术的不断发展,以及测序成本的下降,基于宏基因组学的抗生素抗性基因(antibiotic resistance genes, ARGs)鉴定技术逐渐成为主流技术。本综述总结了基于宏基因组学的抗生素抗性基因鉴定的主要技术和方法,详细综述了各种鉴定技术的实现流程,并评述了各种方法的优缺点。本研究认为基于功能宏基因组学方法可以发现现有ARGs数据库没有记录的新的抗生素抗性基因。基于机器学习技术比基于AGRs数据库比对和搜索的软件有更高的敏感性和特异性。基于ARGs数据库搜索的方法优点是操作简单,对于生物信息学技能欠缺的研究者选择在线计算工具也是明智的选择。

关键词：抗生素抗性基因抗生素宏基因组学二代测序

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中华绒螯蟹肝胰腺坏死症病理学诊断及两种病原的检测

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淡水渔业 2019年第5期49卷 56-64页

作者：刘力硕杨宗英胡鲲杨先乐上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 南昌市农业科学院南昌330038

为探究中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肝胰腺坏死症病理特征和发病规律,确定该病临床诊断标准,实验从80只自然发病的中华绒螯蟹肝胰腺坏死综合征病蟹中,选取12只具有典型临床症状且病变程度不同的病蟹,解剖检查并采集肝胰腺、鳃、肌肉... 详细信息

为探究中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)肝胰腺坏死症病理特征和发病规律,确定该病临床诊断标准,实验从80只自然发病的中华绒螯蟹肝胰腺坏死综合征病蟹中,选取12只具有典型临床症状且病变程度不同的病蟹,解剖检查并采集肝胰腺、鳃、肌肉三种病灶组织样品,进行了组织病理学研究,对肝胰腺和肌肉组织进行了病原检测实验。剖检结果显示,病蟹体表发黑,肝胰腺有肿大、部分白化、完全白化、坏死萎缩症状,副肢肌肉萎缩,部分个体腮部变黑。病理学研究结果显示,肝小管发生不同程度有规律的病变,患病早期的肝小管上皮细胞增生,中期部分肝小管空泡化,中后期全部肝小管上皮细胞空泡化,最终肝小管上皮细胞坏死溶解,认为肝胰腺为该病的主要受损器官,同时可依据肝小管组织病理变化,将该病完整病程划分为四个阶段并命名;鳃组织出现局部充血、水肿、鳃小叶上皮融合等症状,个体差异性较大,未发现规律性病变;副肢肌肉纤维随着肝胰腺病变的恶化而逐步萎缩。病原检测结果,白斑综合征病毒(WSSV)在病蟹肝胰腺和肌肉组织中的检出率为91.7%和83.3%,微孢子虫在病蟹肝胰腺和肌肉组织中的检出率为33.3%和0%,结果表明:WSSV和微孢子虫分别属于携带和继发性感染的可能性较大。实验结果倾向于支持非生物因素作为该病致病因子的观点。

关键词：中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis) 肝胰腺坏死症肝胰腺组织病理 PCR 微孢子虫白斑综合征病毒(WSSV)

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长读长测序技术在宏基因组学研究中的应用

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生命科学 2018年第8期30卷 896-905页

作者：孙丹袁文亮彭司华上海海洋大学水产与生命学院发育生物学系水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室农业部国家水生动物病原库科学技术部海洋生物科学国际联合研究中心上海理工大学光电信息与计算机工程学院

由于很多微生物无法单独分离培养,研究微生物群落整体的宏基因组学是目前揭示微生物多样性的重要方法。长读长测序技术可以覆盖重复序列和复杂结构,获得短读长无法检测的基因组信息。现着重介绍了两类长读长测序技术,即基于第三代测序... 详细信息

由于很多微生物无法单独分离培养,研究微生物群落整体的宏基因组学是目前揭示微生物多样性的重要方法。长读长测序技术可以覆盖重复序列和复杂结构,获得短读长无法检测的基因组信息。现着重介绍了两类长读长测序技术,即基于第三代测序技术的单分子长读长测序技术和基于片段相互联系的合成长读长测序技术,并进一步介绍了长读长测序技术在宏基因组学领域的应用。

关键词：宏基因组长读长测序技术合成长读长第三代测序技术微生物

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三丁酸甘油酯对异育银鲫生长性能及免疫功能的影响

三丁酸甘油酯对异育银鲫生长性能及免疫功能的影响

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2018年中国水产学会学术年会

作者：姜莺颖孙晶郑瑞洲杨宗英杨先乐胡鲲邱军强上海海洋大学国家水生动物病原库水产科学国家级实验教学示范中心农业部淡水水产种质资源重点实验室江西省南昌市农业科学院

以基础饲料作为对照,分别在基础饲料中添加0.5g/kg、1g/kg、1.5g/kg、2g/kgTB,配制成4种试验饲料。试验选择健康、体重相近(43.58±1.6)g的异育银鲫450尾,随机分为5组,每组3个重复,每个重复30尾。正试期8周。结果表明:各试验组异育... 详细信息

以基础饲料作为对照,分别在基础饲料中添加0.5g/kg、1g/kg、1.5g/kg、2g/kgTB,配制成4种试验饲料。试验选择健康、体重相近(43.58±1.6)g的异育银鲫450尾,随机分为5组,每组3个重复,每个重复30尾。正试期8周。结果表明:各试验组异育银鲫的生长性能都得到提高,其中添加1g/kg和1.5g/kgTB可显著提高异育银鲫的增重率、特定生长率,降低饵料系数(P<0.05)。各试验组的肝胰腺中一氧化氮含量均低于对照组、过氧化氢酶含量均高于对照组;1g/kg和1.5g/kg试验组的肝胰脏中超氧化物歧化酶活性显著高于对照组(P<0.05);各试验组的肝胰腺中丙二醛和溶菌酶的含量均低于对照组,且在添加量为1g/kgTB时差异显著(P<0.05)。综合来看,当添加量为1g/kg时效果最佳。

关键词：三丁酸甘油酯异育银鲫生长性能免疫指标

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