检索结果-内蒙古大学图书馆

台湾海峡 2007年第4期26卷 562-568页

作者：陈红陈新华国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,简称A.f)是一种能够以亚铁、单质硫、以及硫化物作为能量来源的化能自养菌,因为此特性,其是生物湿法冶金中主要浸矿菌种之一.本试验中,通过从4个不同来源样品中分离到了4株A.f菌,然... 详细信息

嗜酸氧化亚铁硫杆菌(Acidithiobacillus ferrooxidans,简称A.f)是一种能够以亚铁、单质硫、以及硫化物作为能量来源的化能自养菌,因为此特性,其是生物湿法冶金中主要浸矿菌种之一.本试验中,通过从4个不同来源样品中分离到了4株A.f菌,然后通过改变影响其生长的因素来比较其氧化亚铁以及硫的活性.试验中使用了6种不同条件,其中每个条件下仅改变一个影响因子,这些影响因子包括温度、离子强度、pH、重金属离子浓度、外加离子浓度、硫培养、浸矿培养.通过比较结果,发现不同条件下,4株菌表现均不一样,而活力最强的菌株也不一样.例如,A.f.3菌株在以亚铁为能量来源的时候,一般是活性最强的菌株,而A.f.2一般是活性最差的菌株;但是在用硫和黄铁矿为能量来源的时候,A.f.2的活性不再是最差的,硫培养时,A.f.2是活性最强的菌株.通过比较,人们可以筛选得到一个高活性以及工业应用价值更高的菌株.

关键词：海洋极端微生物 Acidithiobacillus ferrooxidans 亚铁氧化率

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海岸带沉积物环境中甲烷代谢菌的富集培养及混合菌群分析

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台湾海峡 2011年第3期30卷 386-393页

作者：于丽波姜丽晶汤熙翔国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

结合Hungate无氧分离技术,对海岸带沉积物中甲烷代谢菌进行了富集培养,分别为珠江口的甲烷产生菌和九龙江口的甲烷氧化菌及其他甲基氧化菌.其研究结果表明:在珠江口淇澳岛海岸带沉积物中,甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)为优势菌株,分... 详细信息

结合Hungate无氧分离技术,对海岸带沉积物中甲烷代谢菌进行了富集培养,分别为珠江口的甲烷产生菌和九龙江口的甲烷氧化菌及其他甲基氧化菌.其研究结果表明:在珠江口淇澳岛海岸带沉积物中,甲烷八叠球菌属(Methanosarcina)为优势菌株,分布于沉积物的上、中、下3个层位,并发现了部分序列与不可培养的泉古菌门(Crenarchaeota)的杂色泉古菌(miscellaneous crenarchaeotic group,MCG)的相似度为90%～99%.在九龙江口的海岸带沉积物环境中,噬甲基菌属(Methylophaga)为优势菌群,在富集产物菌群多样性中占60%～99%;还有一些相似度较低(为95%～97%)的菌群,为潜在的新种.

关键词：海洋微生物学甲烷产生菌甲基氧化菌沉积物杂色泉古菌(MCG) 富集培养珠江口九龙江口

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柴油食烷菌B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA对卤代化合物的降解

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微生物学报 2014年第9期54卷 1063-1072页

作者：李安章邵宗泽厦门大学生命科学学院福建厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所厦门市海洋生物遗传资源重点实验室--省部共建重点实验室培育基地国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建省海洋生物遗传资源重点实验室

【目的】柴油食烷菌(Alcanivorax dieselolei)B-5是重要的石油降解菌。为研究其对卤代化合物的降解范围和降解机制,【方法】以不同的卤代化合物作为唯一碳源,观察菌株B-5在其中的生长情况;通过多重序列比对、系统发育分析和三维结构同... 详细信息

【目的】柴油食烷菌(Alcanivorax dieselolei)B-5是重要的石油降解菌。为研究其对卤代化合物的降解范围和降解机制,【方法】以不同的卤代化合物作为唯一碳源,观察菌株B-5在其中的生长情况;通过多重序列比对、系统发育分析和三维结构同源建模,分析该菌株基因组内一个假定的卤代烷烃脱卤酶(Haloalkane dehalogenase,HLD)DadA;利用大肠杆菌异源表达、纯化DadA,并测定了其对46个卤代底物的酶活。【结果】菌株B-5能够利用C3-C18链长范围的多种卤代化合物为唯一碳源生长;在系统进化树中,DadA相对独立于其他HLD-II亚家族成员,但具有典型的HLD-II亚家族的催化五联体残基;DadA确实具有脱卤活性,但该酶特异性高,底物范围明显小于其他已鉴定的HLDs,仅对1,2,3-三溴丙烷、1,2-二溴-3-氯丙烷和2,3-二氯-1-丙烯有脱卤酶活。【结论】因为DadA对很多B-5菌株可以利用做碳源的卤代底物没有脱卤酶活,所以推测B-5菌中可能还有其他脱卤酶参与了卤代烷烃的降解。菌株B-5及其卤代烷烃脱卤酶DadA在卤代烷烃污染物的生物降解方面具有应用潜力。

关键词：生物降解石油降解菌柴油食烷菌B-5 卤代化合物卤代烷烃脱卤酶

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产复合酶菌株Pseudomonas ***197产酶发酵条件的研究

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台湾海峡 2005年第4期24卷 520-525页

作者：张金伟曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

从南极普利兹湾深海900m的沉积物中筛选到一株同时产多种低温复合酶的菌株NJ197,作者对其进行碳源、氮源、无机盐、起始pH值、培养时间、接种量等发酵条件的优化实验．实验结果证明,在以0．5％可溶性淀粉为碳源,以0．5％豆饼粉为氮源... 详细信息

从南极普利兹湾深海900m的沉积物中筛选到一株同时产多种低温复合酶的菌株NJ197,作者对其进行碳源、氮源、无机盐、起始pH值、培养时间、接种量等发酵条件的优化实验．实验结果证明,在以0．5％可溶性淀粉为碳源,以0．5％豆饼粉为氮源,无机盐:0．424％NH4H2PO4、0．075％K2HPO4、0．02％MgSO4、0．5％CaCO3,起始 pH值8．5,接种36h种龄的种子10％,20℃、250r／min的条件下在旋转摇床中培养 72h,产复合酶菌株产脂肪酶和淀粉酶活性最高．最佳的生理条件下复合酶中的碱性脂肪酶和淀粉酶的产量分别提高到22．4U／cm3和30．9U／cm3,该产复合酶菌株可以作为诱变育种、基因工程菌改造的出发菌株,在洗涤和制革工业中有良好的应用前景．

关键词：生物工程产酶发酵条件假单胞菌低温复合酶碱性脂肪酶碱性淀粉酶

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厦门地区近海温泉嗜热菌的分离、鉴定

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台湾海峡 2007年第1期26卷 61-70页

作者：杨波陈新华国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

嗜热菌是一类特殊的极端环境微生物.本文所用的实验样品采集于厦门地区两个近海温泉的4个不同位点,通过16SrDNA序列分析对所分离到的312株细菌进行了归类总结,鉴定出嗜热栖热菌、嗜热脂肪泥土芽孢杆菌、嗜高温纤维分解菌、泥土芽孢杆菌... 详细信息

嗜热菌是一类特殊的极端环境微生物.本文所用的实验样品采集于厦门地区两个近海温泉的4个不同位点,通过16SrDNA序列分析对所分离到的312株细菌进行了归类总结,鉴定出嗜热栖热菌、嗜热脂肪泥土芽孢杆菌、嗜高温纤维分解菌、泥土芽孢杆菌属、水生栖热菌、假单胞菌属、木糖氧化无色杆菌、uncultured sheep mite bacte-rium、uncultured gamma proteobacterium等9种嗜热菌株,其中嗜高温纤维分解菌和嗜热栖热菌是主要的可培养优势菌群.其生长温度均在60-85℃,中性pH值.从而得出厦门地区近海温泉样品中的微生物生长类群信息,并发现了某些可能的新菌群,有助于了解该地区近海温泉特有环境下的可培养的微生物群落类型.

关键词：嗜热菌 16SrDNA序列分析分离鉴定

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东太平洋海隆深海热液区沉积物微生物多样性的研究

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台湾海峡 2008年第3期27卷 271-277页

作者：刘欣邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

提取东太平洋海隆区深海热液系统沉积物样品的总DNA,构建沉积物中的细菌16S rDNA克隆文库,通过PCR-RFLP分析与序列测定,对沉积物中的微生物类群及其与环境的关系进行了分析.结果表明,该海区沉积物中的36个克隆代表的22种基因型分别属于... 详细信息

提取东太平洋海隆区深海热液系统沉积物样品的总DNA,构建沉积物中的细菌16S rDNA克隆文库,通过PCR-RFLP分析与序列测定,对沉积物中的微生物类群及其与环境的关系进行了分析.结果表明,该海区沉积物中的36个克隆代表的22种基因型分别属于7个主要类群,其中变形菌(Proteobacteria)的γ-亚群为优势菌群,α-和β-亚群也均有分布;而硫氧化相关共生菌的属(sul-fur-oxidizing symbionts)为优势种属.系统发育分析表明,在该沉积物中细菌主要是跟共生有关、跟C、S代谢相关,大多还能在无氧和高温环境的条件下生存,说明采样点具有典型的深海热液生态系统的特点,甲烷代谢和硫代谢在该区域的深海物质能量循环中占据着重要地位.另外大量新的极端微生物的存在,预示着该区域的微生物资源有着非常大的开发潜力.

关键词：东太平洋海隆深海热液区 16S rDNA 基因文库 RFLP

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同源重组和重组酶Rad51的调控

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生物化学与生物物理进展 2016年第12期43卷 1154-1162页

作者：周化民孙旭利陈建明厦门大学生命科学学院细胞应急生物学国家重点实验室厦门361102 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

同源重组是细胞非常重要的生命活动,参与维持基因组的完整性与稳定性,且与人类健康密切相关.同源重组的研究不断取得进步.本文讨论了同源重组的模式,重组酶RecA/Rad51的作用机制以及Rad51调节蛋白对Rad51入核及Rad51参与重组过程中的单... 详细信息

同源重组是细胞非常重要的生命活动,参与维持基因组的完整性与稳定性,且与人类健康密切相关.同源重组的研究不断取得进步.本文讨论了同源重组的模式,重组酶RecA/Rad51的作用机制以及Rad51调节蛋白对Rad51入核及Rad51参与重组过程中的单链结合、同源配对、入侵及链交换阶段的调控,将有利于我们对同源重组的深入了解.

关键词：同源重组 RacA Rad51 Rad51调节蛋白调节

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我国近海中度嗜盐菌的分离筛选及其产酶多样性分析

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海洋学报 2014年第2期36卷 115-122页

作者：产竹华刘洋王昭凯钟添华曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

为了解我国近海中度嗜盐菌系统发育多样性及产酶特性，从天津、山东、江苏、福建、海南等地近海采集样品为研究对象，分离筛选得到108株中度嗜盐菌，其中有26株至少产一种酶。通过对其形态特征、生理生化、16S rRNA 基因序列及系统进化... 详细信息

为了解我国近海中度嗜盐菌系统发育多样性及产酶特性，从天津、山东、江苏、福建、海南等地近海采集样品为研究对象，分离筛选得到108株中度嗜盐菌，其中有26株至少产一种酶。通过对其形态特征、生理生化、16S rRNA 基因序列及系统进化树进行分析，将26株菌鉴定为细菌域的Halomonas、Idiomarina、Virgibacillus、Pontibacillus、Oceanobacillus、Halobacillus和 Marinilactibacillus属的菌株。它们与相应属的模式菌株16S rRNA基因序列相似性在97％～100％不等，其中有些菌株可能代表不同的分类单元。底物特异性试验表明，分离的26株中度嗜盐菌13株产蛋白酶，19株产淀粉酶，13株产酯酶，4株产纤维素酶。其中6株产3种酶，11株产2种酶。研究结果表明中度嗜盐菌具有系统发育和产酶多样性，同时蕴藏着较多新的微生物类群，为嗜盐微生物资源应用开发提供了参考。

关键词：中度嗜盐菌系统进化分析 16SrRNA基因序列产酶多样性

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流行性造血器官坏死病毒(EHNV)PCR快速检测试剂盒的研制

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台湾海峡 2011年第1期30卷 128-131页

作者：黄辉三李明玉母尹楠敖敬群陈新华国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

以流行性造血器官坏死病毒(EHNV)中的主衣壳蛋白基因保守区序列作为扩增靶序列,设计合成了一对特异性引物,应用快速的模板制备方法和优化PCR扩增条件,建立了EHNV病毒PCR快速检测技术,并开发成简便、快速、实用的检测试剂盒.该试剂盒的... 详细信息

以流行性造血器官坏死病毒(EHNV)中的主衣壳蛋白基因保守区序列作为扩增靶序列,设计合成了一对特异性引物,应用快速的模板制备方法和优化PCR扩增条件,建立了EHNV病毒PCR快速检测技术,并开发成简便、快速、实用的检测试剂盒.该试剂盒的检测灵敏度相当于31个病毒粒子,模板制备时间约30 min,约4 h即可得到准确的结果;且无非特异性扩增带,适用于由EHNV病毒感染的鱼类苗种和水产品的检疫及水质环境的监测.

关键词：生物技术虹彩病毒流行性造血器官坏死病毒(EHNV) PCR检测试剂盒

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PI3K-Akt信号通路与病毒感染

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生物技术通报 2013年第6期29卷 53-62页

作者：刘荣雕阮灵伟国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

控制细胞内关键信号传导通路是病毒在感染过程中调控众多细胞功能的一种重要方式。PI3K-Akt是细胞内重要的信号通路,一些病毒利用该信号通路与宿主免疫系统进行博弈,进而成功实现对宿主细胞的感染,胁迫宿主细胞为其复制增殖服务,并且最... 详细信息

控制细胞内关键信号传导通路是病毒在感染过程中调控众多细胞功能的一种重要方式。PI3K-Akt是细胞内重要的信号通路,一些病毒利用该信号通路与宿主免疫系统进行博弈,进而成功实现对宿主细胞的感染,胁迫宿主细胞为其复制增殖服务,并且最终导致宿主生理代谢功能紊乱,甚至是诱发癌症生成。因此,了解PI3K-Akt信号通路在病毒感染过程中的调控作用,对理解一些病毒感染及发病机制,以及相关病毒疾病的预防和治疗具有重要意义。综述PI3K-Akt信号通路与病毒感染的相关研究进展。

关键词： PI3K-Akt 病毒感染免疫癌症

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