检索结果-内蒙古大学图书馆

台湾海峡 2011年第1期30卷 17-20页

作者：罗淑娅李侃徐丽美国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

从东太平洋热液区E53站位的深海沉积物样品中分离出1株能在65℃生长的嗜热菌(DYth03).该菌的16S rDNA序列与地芽孢杆菌属(Geobacillus)内各种之间的同源性为98%以上.克隆得到DYth03的DNA聚合酶基因(DYth-pol),序列分析表明该基因全长为2... 详细信息

从东太平洋热液区E53站位的深海沉积物样品中分离出1株能在65℃生长的嗜热菌(DYth03).该菌的16S rDNA序列与地芽孢杆菌属(Geobacillus)内各种之间的同源性为98%以上.克隆得到DYth03的DNA聚合酶基因(DYth-pol),序列分析表明该基因全长为2 631 bp,G+C含量为55.5%,推测编码为876个氨基酸,与BstDNApolI的同源性最高(达98%).将该聚合酶基因克隆到pTTQ-h表达载体上,并在大肠杆菌DH1中进行表达.对纯化到的表达产物进行酶活性测定,结果表明该酶具有聚合酶活性和5’-3’外切酶活性.

关键词：海洋生物学嗜热菌地芽孢杆菌属(Geobacillus) 16S rDNA 耐热DNA聚合酶基因表达东太平洋

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红灯食烷菌(Alcanivorax hongdengensis)黄素结合单加氧酶(AlmA)的基因克隆及其烷烃诱导表达

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微生物学报 2010年第8期50卷 1051-1057页

作者：王万鹏邵宗泽厦门大学生命科学学院厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

【目的】研究海洋烷烃降解菌新种模式菌株Alcanivorax hongdengensis A-11-3降解长链烷烃的分子机制。【方法】PCR克隆编码黄素结合单加氧酶的基因序列,利用生物信息学软件对序列进行分析,运用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分析基因在不... 详细信息

【目的】研究海洋烷烃降解菌新种模式菌株Alcanivorax hongdengensis A-11-3降解长链烷烃的分子机制。【方法】PCR克隆编码黄素结合单加氧酶的基因序列,利用生物信息学软件对序列进行分析,运用RT-PCR和实时荧光定量PCR技术分析基因在不同烷烃诱导下的表达水平。【结果】从菌株A-11-3中克隆获得了两个黄素结合单加氧酶基因片段(almA1和almA2)。它们编码的氨基酸序列与菌株Acinetobacter ***17874的AlmA同源性分别为58.6%和53.2%。实时荧光定量PCR分析表明,almA1基因只在长链烷烃(C28-C32)的诱导下上调表达,而almA2基因中能在更宽范围的长链烷烃(C24-C34)和支链烷烃诱导下上调表达。两者均在C9-C22的烷烃诱导下没有上调表达。【结论】黄素结合单加氧酶可能是A-11-3降解长链烷烃和支链烷烃的关键酶。

关键词：食烷菌长链烷烃支链烷烃黄素结合单加氧酶(AlmA) 生物降解

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福建漳浦凡纳滨对虾海水养殖中后期水体细菌群落多样性分析

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海洋学报 2017年第8期39卷 89-98页

作者：胡东王丽萍赵苒邵宗泽厦门大学公共卫生学院福建厦门361102 国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

为分析凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)海水养殖过程中水体细菌群落多样性变化,本研究采用Illumina测序技术对福建漳浦县凡纳滨对虾海水养殖中后期水体样品进行16SrRNA基因高通量测序,同时进行水质参数测定。结果表明,养殖过程中,氨氮... 详细信息

为分析凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)海水养殖过程中水体细菌群落多样性变化,本研究采用Illumina测序技术对福建漳浦县凡纳滨对虾海水养殖中后期水体样品进行16SrRNA基因高通量测序,同时进行水质参数测定。结果表明,养殖过程中,氨氮(NH+4-N)、化学需氧量(COD)值波动较大,其他水质参数值波动较小。检测到的细菌种群归属于19个门、35个纲、80个目、135个科、254个属,说明该养殖水体中细菌群落具有高度的多样性。变形菌门和拟杆菌门是养殖期间主要优势类群,不同养殖时期细菌组成存在一定的波动,但没有明显的变化规律。蓝细菌在第67天、115天表现出高丰度,且其丰度在养殖期间变化较大(比例变化为0.7%~63.9%)。此外,益生菌和潜在致病菌丰度在养殖期间很低。冗余分析(Redundancy analysis,RDA)表明,对细菌群落影响最大的水质因子是化学需氧量与硝酸盐浓度比值(COD/NO-3)和COD;降低溶氧可以增加细菌丰富度。总之,本研究初步揭示了对虾养殖中后期水体微生物的演替规律,发现水质因子对养殖水体微生物组成具有显著影响,研究结果为凡纳滨对虾健康养殖提供一定的参考意义。

关键词：凡纳滨对虾微生物群落多样性 16SrRNA基因高通量测序水质因子

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对虾免疫功能指标的建立及其应用

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厦门大学学报（自然科学版） 2004年第3期43卷 385-388页

作者：何南海国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

对虾与其它的无脊椎动物一样,缺乏特异性免疫系统,而主要以天然的免疫反应为主.它们主要是通过酚氧化酶原激活系统,抗菌肽,凝集素等的作用来达到抗病抑菌,消除异物的目的.通过测定抗病的和注射微生物后的日本对虾几个免疫因子的活性,发... 详细信息

对虾与其它的无脊椎动物一样,缺乏特异性免疫系统,而主要以天然的免疫反应为主.它们主要是通过酚氧化酶原激活系统,抗菌肽,凝集素等的作用来达到抗病抑菌,消除异物的目的.通过测定抗病的和注射微生物后的日本对虾几个免疫因子的活性,发现它们的酚氧化酶,溶血作用,过氧化物酶,凝集作用等较普通的日本对虾有不同程度的提高.而注射微生物后在不同时间对这些免疫因子活性的测定,发现在注射后6h,日本对虾有较高的免疫反应.通过这几个指标的测定,对判断虾是否具有高免疫水平/抗病能力提供一个参考.

关键词：免疫指标免疫因子日本对虾酚氧化酶过氧化物酶

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深海热液区微生物矿化过程的功能群和分子机制

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微生物学通报 2017年第4期44卷 890-901页

作者：曾湘邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所福建厦门361005 国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

深海热液区富含铁、锌、铜等含金属矿物(硫化物、氧化物、碳酸盐等)和无机小分子气体(H_2S、H_2、CO_2、CH_4等),具有独特的生态系统。微生物是深海热液生态系统的主要生产者和重要组成,并以控制矿化和诱导矿化两种途径参与了深海热液... 详细信息

深海热液区富含铁、锌、铜等含金属矿物(硫化物、氧化物、碳酸盐等)和无机小分子气体(H_2S、H_2、CO_2、CH_4等),具有独特的生态系统。微生物是深海热液生态系统的主要生产者和重要组成,并以控制矿化和诱导矿化两种途径参与了深海热液区的生物地球化学循环。在深海热液区存在着不同类型的微生物参与了生物矿化过程,如硫氧化菌、金属氧化菌、硫还原菌和金属还原菌等。本文详述了这些微生物参与的生物矿化现象、菌群多样性和矿化过程的分子机制,并对研究微生物矿化的研究工作进行了展望。

关键词：深海热液区微生物矿化功能群分子机制生物地球化学循环

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发酵法产酶生产几丁寡糖的工艺研究

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厦门大学学报（自然科学版） 2010年第2期49卷 251-255页

作者：乔兴忠李永娴汤熙翔国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

利用前期获得并经基因工程改造的一株高效几丁质酶降解菌进行发酵产酶法降解几丁质胶体与膜分离相耦合制备几丁寡糖的中试研究.经过中试发酵工艺、酶反应工艺、分离纯化工艺的研究,最终确定了一条高效制备几丁寡糖的中试规模工艺流程,... 详细信息

利用前期获得并经基因工程改造的一株高效几丁质酶降解菌进行发酵产酶法降解几丁质胶体与膜分离相耦合制备几丁寡糖的中试研究.经过中试发酵工艺、酶反应工艺、分离纯化工艺的研究,最终确定了一条高效制备几丁寡糖的中试规模工艺流程,该流程中反应分离一体化,过程实现连续操作,降解酶可以连续使用,提高了收率,降低了成本,有利于实现产业化.通过该流程制备的几丁寡糖混合物含几丁2、3、4糖分别为71.3%、23.5%、2.4%.

关键词：发酵酶法几丁寡糖

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产酯酶海洋中度嗜盐菌Halomonas ***1-1的分离鉴定及其酶学性质

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热带海洋学报 2014年第1期33卷 69-73页

作者：王昭凯易志伟刘洋产竹华曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

以从海南三亚近海海水中采集的样品为研究对象,利用平板筛选法筛到一株产酯酶的中度嗜盐菌菌株LYG1-1。通过形态学、生理生化及16S rRNA序列分析,发现该菌株为革兰氏阴性菌,其最适生长温度为30℃,最适生长pH为7.5,最适NaCl浓度为10%。16... 详细信息

以从海南三亚近海海水中采集的样品为研究对象,利用平板筛选法筛到一株产酯酶的中度嗜盐菌菌株LYG1-1。通过形态学、生理生化及16S rRNA序列分析,发现该菌株为革兰氏阴性菌,其最适生长温度为30℃,最适生长pH为7.5,最适NaCl浓度为10%。16S rRNA基因序列分析显示,菌株LYG1-1与Halomonas salina亲缘性最近,16S rRNA基因序列相似性为99.72%。在含10%NaCl的0.05mol·L-1Tris-HCl(pH 8.0)缓冲液中,45℃条件下作用,酶活性最高,40℃处理24h仍保持83%的活性。金属离子浓度为5mmol·L-1时,Ca2+、Mg2+对菌株LYG1-1酶活具有明显的激活作用,Hg2+表现出强烈的抑制作用。

关键词：海洋中度嗜盐菌酯酶 16SrRNA

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普里兹湾沉积物样品产油真菌筛选及胞内脂肪酸成分分析

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应用海洋学学报 2016年第2期35卷 157-165页

作者：黄昌旭黄翔玲骆祝华国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

对中国第29次南极科学考察获得的南极普里兹湾海域23个站位的深海沉积物样品进行了真菌分离培养,共获得了11个属的21株真菌,分别是:青霉属(Penicillium,9株)、枝孢属(Cladosporium,3株)、支顶孢属(Acremonium,1株)、短梗霉属(Aureobasid... 详细信息

对中国第29次南极科学考察获得的南极普里兹湾海域23个站位的深海沉积物样品进行了真菌分离培养,共获得了11个属的21株真菌,分别是:青霉属(Penicillium,9株)、枝孢属(Cladosporium,3株)、支顶孢属(Acremonium,1株)、短梗霉属(Aureobasidium,1株)、孢盘菌属(Botryotinia,1株)、散囊菌属(Eurotiales,1株)、外瓶霉属(Exophiala,1株)、镰孢菌属(Fusarium,1株)、丛赤壳属(Nectria,1株)、茎点霉属(Phoma,1株)、帚枝霉属(Sarocladium,1株).南极普里兹湾海域的真菌多样性较高,其中青霉属菌株最多,占总菌株比例为42.85%,是普里兹湾真菌中的优势属,其次为枝孢属菌株,占总菌株比例为14.29%.分别用尼罗红和氯化三苯基四氮唑(TTC)对这21株菌进行产油筛选,得到8株产油菌,分属于Penicillium(2株)、Aureobasidium(1株)、Cladosporium(1株)、Eurotiales(1株)、Exophiala(1株)、Fusarium(1株)、Sarocladium(1株)等7个属,这些产油菌产油量大致在20.1%到52.0%之间.对这8株菌的产油量和胞内脂肪酸成分进行分析,结果表明:这些产油菌所含的基本为短链脂肪酸,且不饱和脂肪酸含量较高,适合作为生物柴油的生产菌株.

关键词：海洋生物学多样性产油菌南极不饱和脂肪酸普里兹湾

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红螯螯虾网格蛋白轻链的克隆及制备抗体的检测

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应用海洋学学报 2016年第2期35卷 205-210页

作者：黄家骏李钫杨丰国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

网格蛋白为三脚蛋白复合体,其介导的内吞作用是病毒侵染细胞的常用途径之一.而对虾白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)是对虾养殖业的主要病原,为了研究分析WSSV的侵染机制及进入宿主细胞的途径,在本研究中,克隆得到红螯螯... 详细信息

网格蛋白为三脚蛋白复合体,其介导的内吞作用是病毒侵染细胞的常用途径之一.而对虾白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)是对虾养殖业的主要病原,为了研究分析WSSV的侵染机制及进入宿主细胞的途径,在本研究中,克隆得到红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)网格蛋白轻链的c DNA全长,并将其命名为Cq CLC(Genbank登录号为KR075008).进化树分析表明,其与黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的网格蛋白轻链进化距离较近.此外,在其蛋白序列中选择抗原性较好的片段合成多肽,并以此制备单克隆抗体,而后经免疫荧光和western blot检测从中筛选出具有特异性的抗体,为进一步对WSSV侵染虾细胞机制及入胞途径的研究奠定了基础.

关键词：海洋生物学红螯螯虾网格蛋白轻链克隆进化树分析抗体特异性

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海洋来源荧光性假单胞菌高产脓菌素培养基及发酵条件优化

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应用海洋学学报 2016年第2期35卷 166-173页

作者：商伟伟侯路红国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

对4种假单胞菌产脓菌素培养基进行筛选,确定琥珀酸钠培养基为基础培养基,并考察了添加不同物质对假单胞菌脓菌素产量的影响,结果表明,向琥珀酸钠培养基中添加甘油、海盐、硝酸铵时对铁载体产量有明显的促进作用.采用正交实验法获得了高... 详细信息

对4种假单胞菌产脓菌素培养基进行筛选,确定琥珀酸钠培养基为基础培养基,并考察了添加不同物质对假单胞菌脓菌素产量的影响,结果表明,向琥珀酸钠培养基中添加甘油、海盐、硝酸铵时对铁载体产量有明显的促进作用.采用正交实验法获得了高产脓菌素的最佳发酵培养基配方:4g/dm^3琥珀酸钠,6 g/dm^3K2HPO4,3 g/dm^3KH2PO4,1 g/dm^3(NH4)2SO4,1 g/dm^3NH4NO3,5 g/dm^3海盐,1.5%甘油.其脓菌素产量最高可达到265 mg/dm^3,约是基础培养基产量的7倍以上,此培养基成分简单不含复杂的有机氮源,脓菌素产量高,有利于脓菌素的进一步分离纯化与制备.同时本实验对其发酵条件进行优化研究,结果确定最佳发酵条件:培养基起始p H值为6.9,接种量1.0%,培养温度为25℃,转速为220 r/min,发酵时间为28 h.

关键词：海洋生物学假单胞菌脓菌素培养基优化发酵条件

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