检索结果-内蒙古大学图书馆

大黄鱼(Larimichthys crocea)CRFB13基因的克隆与表达分析

应用海洋学学报 2018年第1期37卷 60-67页

作者：杨思司母尹楠丁连帅陈新华敖敬群国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

IFN-γ是哺乳动物的一个关键免疫调节因子,通过特异性地结合IFN-γ受体1(IFNGR1)和IFN-γ受体2(IFNGR2)组成的异源四聚受体复合物,来发挥其生物学功能.目前,在鱼类中已经克隆出IFNGR1基因的2个亚型:细胞因子受体家族B 13(CRFB13)和细胞... 详细信息

IFN-γ是哺乳动物的一个关键免疫调节因子,通过特异性地结合IFN-γ受体1(IFNGR1)和IFN-γ受体2(IFNGR2)组成的异源四聚受体复合物,来发挥其生物学功能.目前,在鱼类中已经克隆出IFNGR1基因的2个亚型:细胞因子受体家族B 13(CRFB13)和细胞因子受体家族B17(CRFB17).本研究从大黄鱼(Larimichthys crocea)中克隆得到了一个CRFB13基因(Lyc CRFB13),其开放阅读框全长1 158个核苷酸,编码由385个氨基酸组成的1个蛋白.Lyc CRFB13蛋白具有典型的II型细胞因子受体特征,包括1个信号肽、1个胞外的FN III-like结构域,1个单次跨膜结构域,以及胞内的JAK1和STAT1结合位点.氨基酸序列分析表明鱼类的CRFB13都具有JAK1和STAT1结合位点.系统进化分析表明鱼类的2种IFNGR1,CRFB13和CRFB17形成2个独立的分支,Lyc CRFB13和鱼类的CRFB13聚在一起,与雀鲷(Stegastes partitus)CRFB13的亲缘关系最近.组织分布显示Lyc CRFB13为组成型表达,在大黄鱼鳃中的表达量最高,而在小肠中的表达量最低.Poly(I:C)刺激后,大黄鱼鳃和头肾中CRFB13的mRNA转录水平都显著升高.此外,poly(I:C)和LPS还能够诱导大黄鱼头肾白细胞中Lyc CRFB13的表达,这些结果表明Lyc CRFB13可能在大黄鱼抗病毒、抗细菌免疫反应中发挥重要作用.

关键词：海洋生物学大黄鱼 IFN-γ受体 CRFB13 基因克隆表达分析

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

南大西洋热液区沉积物可培养细菌的多样性分析和产酶活性鉴定

引用

应用海洋学学报 2015年第3期34卷 427-433页

作者：杜雅萍李贵珍赖其良董纯明孙风芹刘秀片邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)... 详细信息

为获得深海可培养微生物资源,利用2216E培养基,采用涂布平板法从南大西洋热液区沉积物中分离可培养细菌,并通过16S rRNA基因进行分类鉴定.同时测定各菌株产淀粉酶、蛋白酶、果胶酶、木聚糖酶、褐藻酸酶和脂肪酶(三丁酸甘油酯和吐温80)的能力.分离共获得216株菌株,经16S rRNA基因序列比对,共获得71株不同的菌株.其中包括变形菌纲62株、放线菌纲3株、芽孢杆菌纲2株和拟杆菌纲4株,分布于27个属,41个种.酶活检测结果显示,具有淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶(底物为三丁酸甘油酯)和脂肪酶(底物为吐温80)的产酶细菌分别为18、14、25、32株,供测细菌中未检出产果胶酶、木聚糖酶和褐藻酸酶的菌株.这些菌株为进一步研究开发提供了深海微生物资源.

关键词：海洋生物学细菌多样性酶活鉴定热液区南大西洋

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

东太平洋海洋微生物种群多样性初步研究

引用

海洋湖沼通报 2008年第2期 75-81页

作者：李明叶德赞黄翔玲国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

以东太平洋海洋微生物群落为研究对象,用稀释平板分离法,从海水中分离得到67株细菌。在形态观察的基础上选取48株进行培养,然后进行16S rDNA基因扩增,并用限制性内切酶RsaI和MspI对PCR产物进行ARDRA(Amplified rDNA restriction analys... 详细信息

以东太平洋海洋微生物群落为研究对象,用稀释平板分离法,从海水中分离得到67株细菌。在形态观察的基础上选取48株进行培养,然后进行16S rDNA基因扩增,并用限制性内切酶RsaI和MspI对PCR产物进行ARDRA(Amplified rDNA restriction analysis)多态性分析,共得到10种不同的操作分类单元(Operational Taxonomic Unit,OTU)。其中OTU4和OTU10所包含的菌株分别占总分离物的35.4%和18.8%,为优势分离菌。优势分离菌的ERIC-PCR基因组指纹图分析表明,前者的17株分离物共有10种不同的指纹图类型,而后者的9株分离物有3种。结果显示,东太平洋海域的海水和底质沉积物具有明显的微生物种群多样性特征。

关键词：海洋微生物种群多样性 ARDRA ERIC-PCR

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒荧光病毒样颗粒的构建

引用

应用海洋学学报 2015年第3期34卷 411-418页

作者：侯路红林梵宇国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是对虾养殖业中主要的致病病毒之一.在原核系统中表达该病毒的衣壳蛋白,发现其能够自组装成与天然病毒大小、形态相似的病毒样颗粒.本研究通过在衣壳蛋白原核表达质粒上融合表达增强型绿色荧光... 详细信息

对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)是对虾养殖业中主要的致病病毒之一.在原核系统中表达该病毒的衣壳蛋白,发现其能够自组装成与天然病毒大小、形态相似的病毒样颗粒.本研究通过在衣壳蛋白原核表达质粒上融合表达增强型绿色荧光蛋白(EGFP),并在两融合蛋白之间插入一段接头序列(linker),使自组装不受空间位阻的影响.通过原核表达纯化,成功得到IHHNV的荧光病毒样颗粒(f VLPs).电镜下观察样品具有完整的二十面体形态,免疫金标实验发现EGFP成功展示在病毒样颗粒外表面.

关键词：海洋生物学对虾传染性皮下及造血组织坏死病毒荧光病毒样颗粒融合蛋白接头序列

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

凡纳滨对虾消化道中白斑综合症病毒主要靶器官的鉴定

引用

应用海洋学学报 2015年第1期34卷 97-102页

作者：李文婷戴俊逸李钫杨丰国家海洋局第三海洋研究所、国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

白斑综合症病毒（white spot syndrome virus,WSSV）是对虾养殖业中最具破坏力的致病病毒.本实验用含WSSV的克氏原螯虾（Procambarus clarkii）肌肉投喂健康凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）,模拟自然条件下对虾经摄食感染WSSV的过程... 详细信息

白斑综合症病毒（white spot syndrome virus,WSSV）是对虾养殖业中最具破坏力的致病病毒.本实验用含WSSV的克氏原螯虾（Procambarus clarkii）肌肉投喂健康凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）,模拟自然条件下对虾经摄食感染WSSV的过程.在口服攻毒后不同时间分别取消化系统的不同器官通过荧光定量PCR测定各器官中病毒的拷贝数,发现攻毒后12~24 h病毒在食道或中肠中的病毒量仅增加了3~5倍,而在贲门胃和幽门胃中的病毒量增加了100倍以上.进一步的扫描电镜分析表明,病毒粒子对贲门胃和幽门胃内壁均具有很强的粘附能力,而对食道和中肠内壁的粘附能力很弱,且脱去了囊膜的WSSV核衣壳失去了与对虾消化道粘附的能力.以上结果说明WSSV经摄食后主要入侵的靶器官是胃,且病毒囊膜蛋白在病毒与宿主消化道器官的相互作用中起到了重要的作用.

关键词：海洋生物学白斑综合症病毒(WSSV) 荧光定量PCR 扫描电镜凡纳滨对虾靶器官

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

三大洋深海沉积物样品可培养真菌多样性研究

引用

应用海洋学学报 2015年第1期34卷 103-110页

作者：徐炜李广伟黄翔玲骆祝华国家海洋局第三海洋研究所、国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

深海真菌是深海微生物的重要组成之一,在深海环境生态系统中起着非常重要的作用,但目前人们对于深海沉积物中的真菌群落多样性关注较少.本研究对来自东太平洋、南大西洋和西南印度洋(三大洋)的15个沉积物样品进行真菌的分离培养,共获得... 详细信息

深海真菌是深海微生物的重要组成之一,在深海环境生态系统中起着非常重要的作用,但目前人们对于深海沉积物中的真菌群落多样性关注较少.本研究对来自东太平洋、南大西洋和西南印度洋(三大洋)的15个沉积物样品进行真菌的分离培养,共获得175株真菌,包括93株酵母菌和82株丝状真菌.基于形态学观察和ITS序列的系统发育分析显示,93株酵母分别属于红冬孢酵母属(Rhodosporidium)和胶红酵母属(Rhodotorula)的两个种[海洋红酵母(Rhodosporidium paludigenum)和胶红酵母(Rhodotorula mucilaginosa)].82株丝状真菌分别属于曲霉属(Aspergillus)、枝孢属(Cladosporium)、青霉属(Penicillium)、链格孢属(Alternaria)、镰刀菌(Fusarium)、支顶孢属(Acremonium)、茎点霉属(Phoma)、麦轴梗霉属(Tritirachium)、毛壳菌属(Chaetomium)、外瓶霉属(Exophiala)、侧齿霉属(Engyodontium)、肉片齿菌属(Sistotrema)、裂褶菌属(Schizophyllum)、腥掷抱菌属(Tilletiopsis)和Hormonema.其中曲霉属为丝状真菌中的优势属,占总菌株的47.6%.上述研究结果表明大洋深海沉积物中存在着较为丰富的真菌资源,有助于加深我们对于不同大洋区域深海环境中真菌群落结构的认识.

关键词：海洋生物学深海沉积物可培养真菌多样性 ITS序列

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

对虾白斑综合症病毒极早期基因的研究进展

引用

生物技术通报 2014年第8期30卷 52-58页

作者：冉晓卓李钫国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局生物遗传资源重点实验室厦门361005

对虾白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)是危害对虾养殖业的主要病原之一。WSSV在侵染宿主细胞的过程中,极早期基因(immediate-early gene)对病毒复制增殖起着非常重要的作用。在这个过程中,一方面极早期基因编码的蛋白通... 详细信息

对虾白斑综合症病毒(white spot syndrome virus,WSSV)是危害对虾养殖业的主要病原之一。WSSV在侵染宿主细胞的过程中,极早期基因(immediate-early gene)对病毒复制增殖起着非常重要的作用。在这个过程中,一方面极早期基因编码的蛋白通过与细胞调控因子相互作用,调节细胞信号通路,为病毒的增殖提供更合适的环境;另一方面,极早期蛋白直接调控病毒基因的转录和表达。综述列举了WSSV的21个极早期基因,并将重点介绍其中5个研究比较深入的基因:ie1、wsv051、wsv083、wsv249和wsv403。

关键词： WSSV极早期基因 ie1 wsv051 wsv083 wsv249 wsv403

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

一株印度洋深海食烷菌(Alcanivorax sp．P40)的烷烃羟化酶基因的克隆

引用

台湾海峡 2008年第2期27卷 141-146页

作者：赖其良袁军邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传重点实验室福建厦门361005

以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieselo... 详细信息

以印度洋深层海水,用柴油和石油作为混合碳源经富集培养、分离获得一株具有很强的柴油降解能力的菌株P40.菌株P40革兰氏染色阴性,接触酶和氧化酶为阳性,能还原硝酸盐,不能还原亚硝酸盐.16S rDNA B lastn结果表明其与Alcanivorax dieseloleiB-5T(柴油食烷菌)及***1A具有最高相似性,均为99.8%.菌株P40的gyrB序列与***1A同源性也高达99.2%,而与***-5T只有86.9%.此外,从菌株P40中克隆到两个烷烃羟化酶alkB基因片断,分别命名为P40a-lkB1和P40a-lkB2.其中P40a-lkB1与报道的***-5T中的alkB同源性较高,达96.3%,而与同为深海来源的菌株NO1A的alkB的同源性更是达100%,P40a-lkB2则与*** ensisSK2T(泊库岛食烷菌)的alkB1同源性最高,但仅为65%.

关键词：印度洋食烷菌烷烃羟化酶促旋酶 alkB gyrB

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

深海嗜热异化铁还原菌Caloranaerobacter ferrireducens DY22619^T对不同铁氧化物的铁还原特性

引用

海洋学报 2016年第8期38卷 83-92页

作者：李曦曾湘张昭邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005 厦门市海洋生物遗传资源重点实验室(省部共建重点实培育基地) 福建厦门361005 福建省海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005 福建省海洋生物资源开发利用协同创新中心福建厦门361005

异化铁还原微生物在铁元素的地球化学循环中具有重要意义。深海热液活动是大洋铁元素的重要来源,目前深海热液环境中铁代谢相关微生物研究很少。本文对一株分离自深海热液区的嗜热异化铁还原菌新种Caloranaerobacter ferrireducens DY22... 详细信息

异化铁还原微生物在铁元素的地球化学循环中具有重要意义。深海热液活动是大洋铁元素的重要来源,目前深海热液环境中铁代谢相关微生物研究很少。本文对一株分离自深海热液区的嗜热异化铁还原菌新种Caloranaerobacter ferrireducens DY22619T的铁还原特性进行分析,比较了该菌对无定形羟基氧化铁、无定形铁氧化物和针铁矿3种不同铁氧化物的铁还原速率;并利用透射电镜对矿化产物进行矿物形貌、组成元素和晶型的分析。研究发现该菌生长在指数期至稳定期时,铁还原速率最快,其中对无定形羟基氧化铁和无定形铁氧化物的还原速率较高,达2.82μmol/h和2.15μmol/h;透射电镜结果表明,该菌可将3种不同胞外铁氧化物均还原矿化形成颗粒状磁铁矿,由针铁矿矿化形成的磁铁矿少但粒径最大,而由无定形铁氧化物形成的磁铁矿晶面不同于另外两种铁氧化物。结果表明,该菌有很强的铁还原和矿化能力,能厌氧呼吸还原三价铁氧化物,但是铁氧化物的性质对该菌胞外铁还原能力和矿化形成的磁铁矿的性质有重要影响。本研究为认识深海热液环境中异化铁还原菌在铁元素的地球化学循环和生物成矿过程提供了参考。

关键词： Caloranaerobacterferrireducens Fe(Ⅲ)还原磁铁矿生物成矿

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

一株深海热液环境来源的PAHs降解菌TVG9-Ⅶ的系统发育与降解基因

引用

微生物学报 2011年第11期51卷 1548-1554页

作者：董纯明陈亮廖悦婷邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005 厦门大学生命科学院厦门361005

【目的】对一株深海热液环境来源的多环芳烃(PAHs)降解菌进行系统发育分析并对其降解特性和降解机制进行研究。【方法】对16S rRNA基因进行扩增和测序,进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析;利用GC-MS测定其对PAHs的降解率;通过构建... 详细信息

【目的】对一株深海热液环境来源的多环芳烃(PAHs)降解菌进行系统发育分析并对其降解特性和降解机制进行研究。【方法】对16S rRNA基因进行扩增和测序,进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析;利用GC-MS测定其对PAHs的降解率;通过构建基因组Fosmid文库,克隆PAHs降解基因簇;并利用RT-PCR和qPCR研究关键降解酶基因在不同PAHs诱导下的表达情况。【结果】从西南太平洋劳盆地热液沉积物中分离到一株PAHs降解菌株TVG9-Ⅶ,系统发育分析结果表明,该菌株属于新鞘氨醇杆菌属(Novosphingobium),与该属的Novosphingobium indicum H25T系统发育关系最为密切,它们的16S rRNA基因序列相似性高达99.7%。该菌株在21 d内对菲、荧蒽和芘的降解率分别为95.2%,57.3%和69.6%。从Fosmid文库中筛选得到一个负责PAHs降解的上游基因簇,包含了PAHs起始降解双加氧酶大小亚基(pheA1a/b)基因和一个脱氢酶基因;RT-PCR和qPCR实验表明,双加氧酶大亚基基因pheA1a在菲的诱导下上调表达4.2倍,而在萘及高环荧蒽和芘的诱导下无上调。【结论】菌株TVG9-Ⅶ是Novosphingobium属深海热液来源的PAHs降解菌,具有良好的降解特性,特别是对高环PAHs的降解效果较好。

关键词：深海热液区新鞘氨醇杆菌多环芳烃降解基因簇双加氧酶

来源：评论

学校读者我要写书评

暂无评论

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：