检索结果-内蒙古大学图书馆

生物化学与生物物理进展 2006年第12期33卷 1207-1214页

作者：张金伟曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

从南极普利兹湾深海900米深的沉积物中提取获得宏基因组DNA,并通过设计引物,从中克隆到全长为948bp的低温脂肪酶(lip3)开放阅读框完整序列,该基因编码一个由315个氨基酸残基组成、预计分子质量为34.557ku酶蛋白(Lip3);氨基酸序列上的GFG... 详细信息

从南极普利兹湾深海900米深的沉积物中提取获得宏基因组DNA,并通过设计引物,从中克隆到全长为948bp的低温脂肪酶(lip3)开放阅读框完整序列,该基因编码一个由315个氨基酸残基组成、预计分子质量为34.557ku酶蛋白(Lip3);氨基酸序列上的GFGNS(GXGXS)和G-N-S-M-G(GXSXG)在许多脂肪酶中有很高的保守性,它们是水解机制所必需的序列,也是丝氨酸水解酶中最保守的序列.构建了lip3基因重组表达载体,并在大肠杆菌中获得表达,采用镍离子亲和层析柱对表达的酶蛋白Lip3进行纯化,得到约35ku蛋白条带,酶学性质的分析表明,该酶的最适作用温度为25℃,在0℃时表现为最高活力的22%,最适pH值为8.0,对热敏感,35℃热处理60min剩余酶活为10%,以硝基苯棕榈酸酯为底物,Lip3的酶促反应常数Km值随着反应温度的升高而升高,是典型的低温酶.

关键词：南极深海沉积物宏基因组低温脂肪酶克隆与表达

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南极嗜冷假单胞菌7197的分离和无机焦磷酸酯酶（PPase）基因ppa的克隆

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高技术通讯 2007年第10期17卷 1067-1071页

作者：张金伟曾润颖国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

从南极普利兹湾深海沉积物中筛选到一株耐冷菌株7197。16S rDNA序列分析表明,该菌株属于假单胞菌属（Pseudomonas）。从该菌的全基因组DNA中克隆到编码无机焦磷酸酯酶（PPase）的ppa基因完整的开放阅读框（ORF）,其全长为531bp。该基因... 详细信息

从南极普利兹湾深海沉积物中筛选到一株耐冷菌株7197。16S rDNA序列分析表明,该菌株属于假单胞菌属（Pseudomonas）。从该菌的全基因组DNA中克隆到编码无机焦磷酸酯酶（PPase）的ppa基因完整的开放阅读框（ORF）,其全长为531bp。该基因编码一个由176AA残基组成的分子量预计为19631 Da的PPase蛋白质,其氨基酸序列与Psy-chrobacter sp.273-4的PPase有97%的相似性,与Neisseria meningitidisZ2491的PPase有79%的相似性,与Mannheimia succiniciproducens MBEL55E的PPase有75%的相似性。

关键词：南极耐冷菌假单胞菌属无机焦磷酸酯酶

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利用多重PCR同时检测WSSV和MBV两种对虾病毒的研究

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高技术通讯 2005年第5期15卷 101-104页

作者：徐丽美杨丰国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室，厦门361005

研究了检测斑节对虾(Penaeus monodon)的主要致病病原--对虾白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)及斑节对虾杆状病毒(monodon baculovirus,MBV)的技术.用多重PCR检测方法,设计了两对特异性引物,从不同虾池中收集斑节对虾,提... 详细信息

研究了检测斑节对虾(Penaeus monodon)的主要致病病原--对虾白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)及斑节对虾杆状病毒(monodon baculovirus,MBV)的技术.用多重PCR检测方法,设计了两对特异性引物,从不同虾池中收集斑节对虾,提取DNA模板,同时检测两种对虾病毒.研究结果表明:该方法检测灵敏度高、特异性好,可检测至每毫克组织100个病毒粒子;从对虾组织中提取的DNA模板对病毒DNA的扩增无抑制,适合于对虾中两种病毒的同时检测.

关键词：同时检测对虾病毒多重PCR WSSV 对虾白斑综合征病毒 syndrome 斑节对虾杆状病毒 PCR检测方法 DNA模板 virus 特异性引物检测灵敏度病毒DNA 致病病原 spot 研究结果病毒粒子提取组织虾池

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印度洋表层海水石油降解菌的多样性分析

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微生物学报 2010年第9期50卷 1218-1225页

作者：吴常亮王鑫邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室

【目的】为了研究印度洋石油降解菌多样性,并获得新的石油降解菌。【方法】本研究通过印度洋表层海水样品采集、以柴油与原油1：1混合物作为碳源,从中富集、分离筛选石油降解菌,并通过PCR-DGGE对13个站点富集菌群的菌群结构进行分析。... 详细信息

【目的】为了研究印度洋石油降解菌多样性,并获得新的石油降解菌。【方法】本研究通过印度洋表层海水样品采集、以柴油与原油1：1混合物作为碳源,从中富集、分离筛选石油降解菌,并通过PCR-DGGE对13个站点富集菌群的菌群结构进行分析。【结果】通过形态观察、生理生化反应和16SrRNA分析,共得到共29个属的51株不同的细菌,它们主要是属于α亚群和γ亚群。其中,Alcanivorax属（占18%）,Novosphingobium属（占10%）和Marinobacter（占6%）Thalassospira（占6%）为主要的优势菌。通过生态多样性分析表明,Shannon-Winner指数（H）为4.57968,说明其具有较高的多样性;均匀度指数（E）为0.8664771,表示其分布比较均匀。单菌实验表明,49株具有石油降解能力其中,Sinomonas,Knoellia,Mesoflavibacter等属的细菌为首次发现有降解能力。DGGE分析表明Alcanivorax属的细菌是印度洋表层海水中的重要石油降解菌。【结论】本研究首次揭示了印度洋表层海水中石油降解菌的多样性,并获取了若干在海洋石油污染生物修复中具有应用前景的降解菌。

关键词：印度洋生物降解石油海洋细菌多样性 DGGE

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南海南沙海域沉积物中可培养微生物及其多样性分析

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微生物学报 2008年第12期48卷 1578-1587页

作者：孙风芹汪保江李光玉刘秀片杜雅萍赖其良邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传重点实验室厦门361005

【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它... 详细信息

【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它们是Bacillus,Halobacillus,Brevibacillus,Paenibacillus,Pontibacillus和Thalassobacillus。其中芽孢杆菌(Bacillus)无论在数量上还是种类上都最多,分别属于34种,其中有8个可能的新种。此外,γ-Proteobacteria是分离率较高的另一亚群;其中,假单胞菌(Pseudomonas),海杆菌(Marinobacter),食烷菌(Alcanivorax)属的细菌最多。统计还发现,在深度750～2000 m之间,低GC含量的细菌最丰富,而深度2000 m以下,分离株则全部为γ-Proteobacteria。【结论】南沙沉积物可培养微生物中产芽孢细菌及γ-Proteobacteria比较丰富;其中,产芽孢细菌的多样性最高,具有进一步研究开发价值。

关键词：南海南沙海洋细菌生物资源生物多样性产芽孢菌芽孢杆菌

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北极表层海水中氯代十六烷降解菌的多样性

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微生物学报 2012年第8期52卷 1011-1020页

作者：王建宁董纯明赖其良林龙山邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005 国家海洋局第三海洋研究所海洋生物与生态实验室厦门361005

【目的】为了研究北极地区表层海水中氯代十六烷(C16H33Cl)降解菌的多样性,并获得新的卤代烃降解菌资源。【方法】以C16H33Cl为唯一碳源和能源在4℃和25℃下对表层海水样品进行富集,通过平板分离鉴定可培养菌株,并验证其降解能力;同时... 详细信息

【目的】为了研究北极地区表层海水中氯代十六烷(C16H33Cl)降解菌的多样性,并获得新的卤代烃降解菌资源。【方法】以C16H33Cl为唯一碳源和能源在4℃和25℃下对表层海水样品进行富集,通过平板分离鉴定可培养菌株,并验证其降解能力;同时利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析降解菌群结构。【结果】从12个北极表层海水样品中富集分离得到112株可培养菌株。经过降解实验验证,发现19株菌株能够降解氯代十六烷,其中食烷菌(Alcanivorax)、红球菌(Rhodococcus)表现出很好的乳化和降解现象,海杆菌(Marinobacter)也有较好的降解效果。DGGE分析显示,富集驯化的降解菌群中主要优势菌为Alcanivorax,Parvibaculum和Thioclava属的菌株。【结论】北极海水中卤代烃降解菌主要是α-proteobacteria,γ-proteobacteria,Actinobacteria和Bacteroidetes。文章首次报道了北极海水卤代烷烃降解菌多样性,研究结果对于认识北极环境中的降解菌资源与生物多样性有参考价值。

关键词：北极表层海水氯代十六烷生物降解多样性

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西南印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的富集分离与多样性分析

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微生物学报 2008年第10期48卷 1351-1355页

作者：陈双喜邵宗泽国家海洋局第三海洋研究所国家海洋局海洋生物遗传重点实验室厦门361005

【目的】为了筛选深海砷抗性菌,了解印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的多样性情况。【方法】通过砷富集培养,筛选出砷抗性菌;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析与构建16S rDNA克隆文库法两种手段分析了富集物中砷抗性菌的多样性。利用兼并引... 详细信息

【目的】为了筛选深海砷抗性菌,了解印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的多样性情况。【方法】通过砷富集培养,筛选出砷抗性菌;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析与构建16S rDNA克隆文库法两种手段分析了富集物中砷抗性菌的多样性。利用兼并引物PCR,从抗性菌株中克隆与砷抗性相关的基因。【结果】共筛选到8株砷抗性菌,分别属于γ-proteobacteria的5个不同的属。其中,菌株AS-I1-3的抗性最高,可以在26×10-3mol/L三价砷存在的情况下生长,该菌株的16S rDNA序列与菌株Pseudoalteromonas tetraodoni IAM同源性最高(100%)。DGGE分析显示,该菌是富集物中的最优势菌,其次是盐单胞菌(Halomonas)和海杆菌(Marinobacter)。16S rDNA克隆文库分析结果进一步证明,与菌株AS-I1-3序列相同的克隆子占整个克隆文库的72.5%;而与菌株AS-I1-5(Halomonas meridiana,100%)和菌株Mn-I1-6(Marinobacter vinifirmus,99%)序相同的克隆子分别占10%和7.5%。然而,利用兼并引物PCR,仅能从2株非优势菌中克隆到了与砷抗性相关的基因,表明菌群中的优势抗性菌可能有其他的抗性机制。【结论】在深海环境中存在着多种砷抗性菌,其中Pseudoalteromonas属的菌株是该富集条件下的砷抗性优势菌。这些砷抗性菌在大洋环境砷元素的生物地球化学循环中的作用有待进一步研究。

关键词：印度洋深海沉积物砷抗性菌生物多样性

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西南印度洋中脊热液区烃类有机质组成及其成因意义

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地学前缘 2015年第1期22卷 281-290页

作者：雷吉江初凤友于晓果李小虎陶春辉葛倩国家海洋局海底科学重点实验室浙江杭州310012 国家海洋局第二海洋研究所浙江杭州310012 国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

利用气相色谱（GC）、气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）测定了西南印度洋中脊49.6°E热液区热液产物中的可溶有机质,结合生物标志物和单体同位素分析,对烃类有机质的组成、来源及成因意义进行了探讨。硫化物烟囱体以正构烷烃（3.437~3.... 详细信息

利用气相色谱（GC）、气相色谱-质谱联用仪（GC-MS）测定了西南印度洋中脊49.6°E热液区热液产物中的可溶有机质,结合生物标志物和单体同位素分析,对烃类有机质的组成、来源及成因意义进行了探讨。硫化物烟囱体以正构烷烃（3.437~3.962μg/g）为主要烃类,L/H〈1,C22以上烷烃具有轻微奇碳数优势（CPI=1.140~1.209）,NAR接近0;生物标志物类型丰富（Sq、IS40、烷基环己烷）,C31藿烷22S/（R＋S）高达0.77,且缺少17β（H）,21β（H）构型藿烷;低碳数饱和脂肪酸为主要脂肪酸类型,异构/反异构脂肪酸含量显著,缺少单不饱和脂肪酸。热液蚀变岩以异构烷烃（2.094μg/g）为主要烃类,正构烷烃以低碳数（L/H=1.33）、偶碳优势（CPI=0.377）为特征;脂肪酸以单不饱和脂肪酸为主。结果表明,海洋原生生物体是49.6°E热液区主要的烃类有机质输入源,热液流体温度及化学条件是控制热液喷口区原生生物群落分布及热液产物中烃类有机质组成的主要因素。生物标志物类型显示硫化物烟囱体中具有产甲烷古菌与硫酸盐还原菌共存的现象,反映出热液流体中富含H2,表明49.6°E热液区具有非生物合成烃类的可能。

关键词：超慢速扩张洋脊热液喷口烃类有机质生物标志物

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环境内分泌干扰物——邻苯二甲酸酯的生物降解研究进展

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应用与环境生物学报 2008年第6期14卷 890-897页

作者：骆祝华黄翔玲叶德赞国家海洋局第三海洋研究所厦门361005 国家海洋局海洋生物遗传资源重点实验室厦门361005

邻苯二甲酸酯是一类重要的合成有机物,主要用作增塑剂来提高塑料树脂的机械性能尤其是柔韧性.近年来,由于在全球范围内的广泛使用,在环境中的普遍存在,以及其内分泌干扰毒性,邻苯二甲酸酯受到了人们越来越多的关注.微生物降解被认为是... 详细信息

邻苯二甲酸酯是一类重要的合成有机物,主要用作增塑剂来提高塑料树脂的机械性能尤其是柔韧性.近年来,由于在全球范围内的广泛使用,在环境中的普遍存在,以及其内分泌干扰毒性,邻苯二甲酸酯受到了人们越来越多的关注.微生物降解被认为是邻苯二甲酸酯完全矿化的主要途径.邻苯二甲酸酯的降解机制与途径已经在细菌中得到广泛的研究,但是在真菌领域的报道还很少见.本文主要概述了邻苯二甲酸酯的环境污染现状,介绍了其对人和动物的健康危害,并且综述了邻苯二甲酸酯微生物降解的研究进展,包括降解菌的种类、降解的代谢途径及相应的分子机制,以及真菌对邻苯二甲酸酯的降解研究等.

关键词：邻苯二甲酸酯内分泌干扰物生物降解增塑剂环境污染

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重组鲈鱼生长激素的分离纯化及抗体制备

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高技术通讯 2001年第5期11卷 13-16页

作者：曾润颖刘小青杨丰国家海洋局第三海洋研究所海洋生物工程重点实验室厦门361005

用IPTG诱导鲈鱼生长激素基因工程菌E coli RV30 8,使重组鲈鱼生长激素得以表达并分泌到周质空间。利用渗透休克法从菌液中提取间质蛋白 ,经DEAE SepharoseCL 6B、聚丙烯酰胺凝胶电泳及SephadexG 75纯化后得到单一电泳纯的重组鲈鱼生长激... 详细信息

用IPTG诱导鲈鱼生长激素基因工程菌E coli RV30 8,使重组鲈鱼生长激素得以表达并分泌到周质空间。利用渗透休克法从菌液中提取间质蛋白 ,经DEAE SepharoseCL 6B、聚丙烯酰胺凝胶电泳及SephadexG 75纯化后得到单一电泳纯的重组鲈鱼生长激素 ,并将此激素作为抗原制备抗体 ,可应用于鱼类血液中生长激素含量的测定。

关键词：重组鲈鱼生长激素纯化抗体分离制备

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