目的通过对肿瘤干细胞(CSCs)研究文献进行计量学分析,探索CSCs领域的研究热点和研究趋势。方法基于Web of Science核心数据库,通过CiteSpace对发表文章年度分布、作者、机构、国家、期刊、被引情况和关键词等进行分析,并对关键词的词频...
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目的通过对肿瘤干细胞(CSCs)研究文献进行计量学分析,探索CSCs领域的研究热点和研究趋势。方法基于Web of Science核心数据库,通过CiteSpace对发表文章年度分布、作者、机构、国家、期刊、被引情况和关键词等进行分析,并对关键词的词频、中心性和聚类情况进行探讨。结果(1)筛选后共纳入8131篇文献,中国是发文量最多的国家,中山大学是发文量最多的机构。(2)CSCs在乳腺癌、胰腺癌中的研究;CSCs分选和鉴定分子标志物ALDH和基因PTEN、Sox2、C-myc、EZH2的研究;EMT诱导产生CSCs并促进肿瘤转移的机制研究;CSCs防御化学药物、放射、靶向药物攻击导致耐受的细胞和分子机制的研究;Wnt/β-catenin信号通路和肿瘤微环境调节CSCs分化的机制研究;靶向抑制CSCs治疗恶性肿瘤的药物研究是CSCs领域研究的热点。(3)CSCs干性研究-CSCs生物学机制研究-CSCs应用于肿瘤的治疗是CSCs的研究趋势。结论EMT诱生CSCs促进肿瘤转移、CSCs抵抗化学药物的攻击、间充质干细胞对CSCs调节、CSCs的代谢、靶向CSCs抑制剂的研究是CSCs领域现在和未来研究的重点和方向。
目的探讨免疫和基质细胞相关基因对三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后的影响。方法利用ESTIMATE算法计算GEO数据库中TNBC样本的免疫评分,使用R包中的limma包筛选差异表达基因。GEO数据库和KM-plotter网站进行生存分...
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目的探讨免疫和基质细胞相关基因对三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)预后的影响。方法利用ESTIMATE算法计算GEO数据库中TNBC样本的免疫评分,使用R包中的limma包筛选差异表达基因。GEO数据库和KM-plotter网站进行生存分析,寻找与TNBC无病生存期显著相关的基因。通过免疫组织化学染色和RT-qPCR验证其中部分基因的表达水平。结果功能富集和蛋白-蛋白相互作用网络分析显示这些基因主要参与免疫应答。R包中survival包生存分析显示,36个基因中有14个基因与TNBC的DFS显著相关。Cox-LASSO分析筛选出4个与TNBC预后相关的基因。时间依赖的受试者工作特征分析显示,1年生存率的曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.95,表明4个基因具有很好的预后预测能力。结论含杆状病毒IAP重复3(baculoviral IAP repeat containing 3,BIRC3)基因、CD8抗原(CD8 antigen,CD8A)基因、颗粒溶素(granulysin,GNLY)基因和含三方基序22(tripartite motif containing 22,TRIM22)基因这4个基因可能与TNBC的免疫微环境相关,是TNBC潜在的预后和治疗标志物。
目的:探讨E3泛素连接酶DTL(dentideless E3 ubiquitin ligase)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及预后价值。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载获得374例HCC组织和50例癌旁正常组...
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目的:探讨E3泛素连接酶DTL(dentideless E3 ubiquitin ligase)在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达及预后价值。方法:从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载获得374例HCC组织和50例癌旁正常组织的转录组数据;从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载GSE121248数据集,获得包括70例HCC组织和37例癌旁正常组织的转录组数据。比较HCC组织与癌旁正常组织中DTL的表达水平。采用Kaplan-Meier法进行生存分析,并采用log-rank检验比较DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者总生存率、无进展间期生存率的差异。HCC患者不良预后的危险因素采用Cox回归分析。绘制DTL表达水平诊断HCC的受试者操作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线。利用基于多因素Cox回归分析的列线图预测DTL对HCC患者预后的影响。同时对DTL高表达组与DTL低表达组HCC组织的差异表达基因进行GSEA富集分析。结果:DTL在HCC组织中的表达水平高于癌旁正常组织(P<0.001)。DTL高表达组与DTL低表达组HCC患者年龄、人种、AFP水平、病理分级、病理分期、T分期差异均有统计学意义(P均<0.05)。Kaplan-Meier法生存分析结果显示,与DTL低表达组HCC患者相比,DTL高表达组HCC患者总生存率和无进展间期生存率均较短(P=0.005,P<0.001)。ROC曲线显示,DTL表达水平对HCC有较强的诊断能力[曲线下面积(area under the curve,AUC)为0.96]。通过构建列线图发现,DTL表达的C指数为0.663(95%CI为0.54~0.61)。GSEA富集分析结果显示,DTL可能通过影响细胞周期、染色体维持、DNA复制、G2/M检查点、有丝分裂期、TP53转录调控等通路影响HCC的发生发展。
目的:通过肝癌代谢研究进行文献计量学分析,探索近5年肝癌代谢领域的研究热点和趋势。方法:基于Web of Science核心数据库,通过CiteSpace对2016年至2020年发表文章的年度分布、国家、机构、作者、期刊、基金、被引情况和关键词等进行可...
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目的:通过肝癌代谢研究进行文献计量学分析,探索近5年肝癌代谢领域的研究热点和趋势。方法:基于Web of Science核心数据库,通过CiteSpace对2016年至2020年发表文章的年度分布、国家、机构、作者、期刊、基金、被引情况和关键词等进行可视化分析,并对关键词的词频、中心性和聚类情况进行探讨。结果:筛选后共纳入5 087篇文献并呈逐年增长趋势,中国是发文量最多的国家,复旦大学是发文量最多的机构,资助该领域最多的基金资助机构是中国国家自然科学基金委员会。AMPK、AKT/mTOR等信号通路调节代谢重编的机制研究;调控代谢的转录因子HIF-1α、癌基因(p53、c-myc)和长链非编码RNA的研究;针对糖酵解途径的葡萄糖转运和关键酶的研究;谷氨酰胺分解、三羧酸循环、磷酸戊糖途径、线粒体代谢的研究;二甲双胍等调节肿瘤代谢的药物研究;新型标志物分子的研究;代谢性疾病与肝癌相关性的研究是肝癌代谢领域研究的热点。糖酵解-代谢综合征-脂肪酸代谢-代谢酶抑制剂是肝癌代谢领域的研究趋势。结论:有氧糖酵解、AMPK、AKT/m TOR信号通路、HIF-1α、p53和c-myc、代谢性疾病、标志物分子和二甲双胍等药物研究是肝癌代谢的研究热点,脂肪酸代谢、代谢酶抑制剂研究是肝癌代谢领域的重点研究方向。
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