检索结果-内蒙古大学图书馆

中华肿瘤杂志 2023年第2期45卷 146-152页

作者：陈红霞任宁馨杨洁陈进娜陆启璇冯燕茹黄莹尹露茜林东昕李晔雄金晶谭文国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室、病因及癌变研究室、癌发生及预防分子机理北京市重点实验室北京100021 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院放疗科北京100021

目的探讨焦亡通路关键基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法抽取2005年1月至2015年6月中国医学科学院肿瘤医院347例Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者术后同步放化疗治疗前的外周血,提取DNA,采用Sequenom MassARRAY方法检测... 详细信息

目的探讨焦亡通路关键基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法抽取2005年1月至2015年6月中国医学科学院肿瘤医院347例Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者术后同步放化疗治疗前的外周血,提取DNA,采用Sequenom MassARRAY方法检测焦亡通路中的黑色素瘤缺乏因子2(AIM2)、半胱天冬酶1(CASP1)、CASP4、CASP5、CASP11、消皮素D(GSDMD)、消皮素E(GSDME)和含Nod样受体家族pyrin域蛋白3(NLRP3)共8个关键基因的43个标签单核苷酸多态(htSNP)的基因分型,采用非条件logistic回归模型分析htSNP基因型与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应发生的关系。结果347例患者术后接受持续5周的术后同步放化疗,发生中重度骨髓抑制101例(29.1%),发生中重度腹泻156例(45.0%),发生中重度放射性皮炎66例(19.0%)。手术方式、病灶距齿状线距离与直肠癌患者术后同步放化疗发生中重度腹泻和放射性皮炎有关(均P<0.01)。CASP4基因的rs11226565(OR=0.41,95%CI:0.21~0.79)、rs579408(OR=1.54,95%CI:1.03~2.29)和rs543923(OR=0.63,95%CI:0.41~0.98)3个遗传变异位点与中重度骨髓抑制发生有关;CASP11 rs10880868(OR=0.55,95%CI:0.33~0.91)和GSDME rs2954558(OR=1.52,95%CI:1.01~2.31)与中重度腹泻发生有关;GSDME rs2237314(OR=0.36,95%CI:0.16~0.83)、GSDME rs12540919(OR=0.52,95%CI:0.27~0.99)和NLRP3 rs3806268(OR=1.51,95%CI:1.03~2.22)与中重度放射性皮炎的发生有关。其余35个htSNP位点与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应发生无关(均P>0.05)。结论焦亡通路相关基因CASP4、CASP11、GSDME和NLRP3的遗传变异与Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者术后同步放化疗的不良反应发生有关,可能是直肠癌个体化治疗的潜在遗传标志物。

关键词：直肠肿瘤多态性,单核苷酸焦亡同步放化疗不良反应

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临床ⅠA期肺腺癌的基因突变特征及其与患者长期预后的关系

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中华肿瘤杂志 2024年第8期46卷 755-763页

作者：张丽刘梦雯李琳赵爽吴丽虹尹朝华李蒙高燕宁吴宁国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究、中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院影像诊断科北京100021 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科北京100021 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心儿科转化医学研究所上海200127 嘉华药锐科技(北京)有限公司北京102206 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室北京100021

目的探讨临床ⅠA期肺腺癌的基因突变特征及其与患者预后的关系,为早期肺腺癌患者的个体化治疗提供依据。方法收集2007年1月至2012年10月在中国医学科学院肿瘤医院接受手术切除且随访达10年以上或随访期间出现复发或转移的临床ⅠA期肺腺... 详细信息

目的探讨临床ⅠA期肺腺癌的基因突变特征及其与患者预后的关系,为早期肺腺癌患者的个体化治疗提供依据。方法收集2007年1月至2012年10月在中国医学科学院肿瘤医院接受手术切除且随访达10年以上或随访期间出现复发或转移的临床ⅠA期肺腺癌患者63例,采用全外显子组测序(WES)技术分析肺癌组织的基因突变谱,采用单因素和多因素Cox回归分析明确患者预后影响因素。结果在随访期间,63例患者中13例(20.6%)出现复发或转移。WES技术分析显示,肺癌组织中表皮生长因子受体突变频率最高,达65.1%(41/63),其次为肿瘤蛋白p53、异常类脂肪酸1、低密度脂蛋白受体相关蛋白1B、雷帕霉素机械靶点、磷脂酰肌醇4,5-双磷酸3-激酶催化亚单位γ(PIK3CG)及与SWI/SNF相关基质相关的依赖于肌动蛋白的染色质调节因子亚家族A成员4,突变频率分别为30.2%(19/63)、20.6%(13/63)、15.9%(10/63)、15.9%(10/63)、15.9%(10/63)和15.9%(10/63)。多因素Cox回归分析显示,PIK3CG突变(HR=21.52,95%CI:3.19~145.01)、平滑蛋白(SMO)突变(HR=35.28,95%CI:3.12~398.39)、β-连环蛋白1(CTNNB1)突变(HR=332.86,95%CI:15.76~7029.05)、集落刺激因子1受体(CSF1R)突变(HR=8109.60,95%CI:114.19~575955.17)、v-Raf小鼠肉瘤病毒癌基因同源B(BRAF)突变(HR=23.65,95%CI:1.86~300.43)为临床ⅠA期肺腺癌患者预后的独立危险因素。结论PIK3CG、SMO、CTNNB1、CSF1R、BRAF基因突变与临床ⅠA期肺腺癌的远期复发和转移密切相关,应给予具有这些基因突变的肺腺癌患者更为密切的临床关注。

关键词：肺肿瘤腺癌基因突变预后

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丙二酰辅酶A脱羧酶调控卵巢癌铂类耐药的机制及其临床应用价值

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癌变·畸变·突变 2025年第3期37卷 221-227+247页

作者：郑瑞淇胡洵崔潆郭会芹肖汀国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学全国重点实验室病因及癌变研究室国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科

目的：探讨丙二酰辅酶A脱羧酶(MLYCD)在调控卵巢癌铂类耐药的机制及其临床应用价值。方法：采用卵巢癌组织芯片进行免疫组织化学染色验证不同铂敏感性患者的MLYCD表达水平。利用临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)和癌症基因组图谱(TCGA)... 详细信息

目的：探讨丙二酰辅酶A脱羧酶(MLYCD)在调控卵巢癌铂类耐药的机制及其临床应用价值。方法：采用卵巢癌组织芯片进行免疫组织化学染色验证不同铂敏感性患者的MLYCD表达水平。利用临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库，探讨在不同铂敏感性卵巢癌患者中MLYCD蛋白和mRNA的表达水平及其与临床特征的关系，使用pRRophetic算法评估样本对顺铂的敏感性。选取与MLYCD表达显著相关的蛋白构建蛋白相互作用网络，用GEPIA2数据库检索转录水平上与MLYCD相关的基因，并使用京都基因与基因组百科全书和基因本体方法富集相关的信号通路。采用免疫浸润分析Estimate算法、肿瘤免疫功能障碍和排斥(TIDE)以及免疫表型评分(IPS)评估患者肿瘤组织的免疫浸润状况。使用Western blot验证铂类敏感/耐药卵巢癌细胞株中MLYCD蛋白的表达情况。结果：组织芯片免疫组织化学染色结果及CPTAC数据显示，铂类耐药患者中MLYCD表达水平较铂敏感者升高，并且随肿瘤分期亚阶段(P=0.046)的进展呈上升趋势。CPTAC和TCGA数据库分析结果均表明，MLYCD表达与顺铂耐药性呈正相关(r>0.3,P<0.05)。此外，MLYCD及其相互作用蛋白主要参与促进脂质分解代谢的代谢重编程。Estimate、TIDE和IPS评分显示，相较于低表达组，MLYCD高表达组的卵巢癌组织中，功能障碍性免疫细胞的浸润程度更高，抗肿瘤活性更低。Western blot实验结果显示铂耐药卵巢癌细胞株中MLYCD表达的显著升高(P<0.05)。结论：MLYCD在卵巢癌耐药组织中高表达，且其参与了脂质分解代谢重编程为卵巢癌细胞提供能量。MLYCD可作为卵巢癌铂类耐药标志物和潜在治疗靶点。

关键词：卵巢癌铂类耐药丙二酰辅酶A脱羧酶免疫微环境

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原发性肺腺癌患者外周血端粒酶逆转录酶阳性白细胞检测方法的建立

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癌变．畸变．突变 2024年第6期36卷 431-437,443页

作者：谢佩佩张颀张小利万朵张文程书钧张开泰国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室北京100021 国家癌症中心/国家癌症临床研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院免疫室北京100021

目的:建立一种基于端粒酶逆转录酶(TERT)活性的外周血白细胞亚群检测方法,以评估恶性肿瘤患者外周血中白细胞的增殖潜能。方法:改造的重组I型单纯疱疹病毒(HSV1-hTERTp-eGFP)能够特异性地在TERT启动子高转录活性的白细胞中复制,并表达... 详细信息

目的:建立一种基于端粒酶逆转录酶(TERT)活性的外周血白细胞亚群检测方法,以评估恶性肿瘤患者外周血中白细胞的增殖潜能。方法:改造的重组I型单纯疱疹病毒(HSV1-hTERTp-eGFP)能够特异性地在TERT启动子高转录活性的白细胞中复制,并表达绿色荧光蛋白(GFP),通过观察绿色荧光识别具有高增殖潜力的TERT阳性白细胞,评估机体的免疫增殖潜能。分别将100、500、1 000个经HSV1-hTERTp-eGFP病毒感染24 h后的Jurkat阳性细胞,加入到未经病毒感染的2.5×106个外周血白细胞中,作为模拟样品进行检测,设置3个平行组,并对阳性细胞的回收率、重复性、线性回归系数等指标进行检验。同时,采集5例良性肺结节患者外周血,设置3个平行组,检测每组1 mL外周血中的TERT阳性白细胞比例,通过计算组内变异系数评估外周血样本检测技术的可靠性。此外,利用本检测技术,对80例良性肺结节患者及80例原发性肺腺癌患者外周血TERT阳性白细胞百分比进行检测和分析。结果:Jurkat细胞系能够被HSV1-hTERTp-eGFP病毒感染并启动GFP的表达,可以作为模拟样本进行技术验证。100、500、1 000个Jurkat细胞的模拟样品平均检出阳性细胞数分别为80.3、448.2、920.6个,回收率分别为80.3%、89.6%和92.1%;3次重复实验的批间变异系数分别为11.3%、7.2%、4.4%,而3个平行实验组内的批内变异系数均小于10%;5例良性肺结节患者外周血TERT阳性细胞百分比的组内变异系数也均在10%以内。说明本检测技术准确度高,且具有良好的稳定性。在80例良性肺结节患者中,随着年龄的增长,TERT阳性白细胞的百分比呈下降趋势(r=-0.61;P<0.01)。与良性肺结节患者对照组相比,早期肺腺癌患者的TERT阳性白细胞百分比降低(P<0.01);与非浸润性肺腺癌患者相比,浸润性肺腺癌患者的TERT阳性白细胞的比例显著降低(P<0.01)。结论:肺腺癌患者的外周血存在免疫细胞增殖能力下降的现象,且在浸润性肺腺癌患者中表现更明显。这一发现可能与年龄相关的免疫衰老有密切联系,为理解浸润性肺腺癌患者较差的预后提供了新视角,并为深入探索免疫衰老机制指明了方向。

关键词：肺腺癌端粒端粒酶逆转录酶免疫衰老

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微卫星不稳定性与结直肠癌发生机制、治疗及预后关系的研究进展

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癌变．畸变．突变 2024年第4期36卷 320-324页

作者：孔德扬裴炜冯林张海增国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院结直肠外科北京100021 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室北京100021

微卫星不稳定(MSI)型结直肠癌(CRC)是一种由DNA错配修复系统缺陷引起的肿瘤亚型,约占所有结直肠癌的15%。MSI CRC在临床和病理学上表现出独特的特点,包括更频繁地出现在近端结肠、分化程度低、肿瘤分期较早、高BRAF突变率和淋巴细胞浸... 详细信息

微卫星不稳定(MSI)型结直肠癌(CRC)是一种由DNA错配修复系统缺陷引起的肿瘤亚型,约占所有结直肠癌的15%。MSI CRC在临床和病理学上表现出独特的特点,包括更频繁地出现在近端结肠、分化程度低、肿瘤分期较早、高BRAF突变率和淋巴细胞浸润等。MSI CRC具有特殊的肿瘤微环境,特别是免疫及耗竭相关基因的高表达,为免疫检查点阻断治疗(ICB)提供了理想靶标,从而能够在免疫治疗中显著受益。虽然MSI通常与早期CRC患者的良好预后相关,但在转移性疾病中可能指示了不良的预后。当前研究凸显了微卫星状态与BRAF突变状态结合作为预后生物标志物的重要性,并表明BRAF突变可能减弱MSI相关的预后优势。MSI CRC显示出对包括5-氟尿嘧啶和表皮生长因子受体(EGFR)抗体等传统治疗药物的抵抗性,但对抗血管内皮生长因子(VEGF)治疗反应更为积极。随着对MSI CRC认识的加深,ICB治疗正在成为一二线治疗以及新辅助治疗的重要策略,为患者提供了一种可能替代传统方法的治疗选择。本文综述了MSI在CRC发生机制、临床病理特征、肿瘤微环境特征、临床治疗及预后等多方面的研究进展,阐明了MSI在CRC治疗策略和疗效预测中的重要意义,强调了根据不同微卫星状态对CRC进行个性化治疗的必要性。

关键词：微卫星不稳定型结直肠癌发生机制临床特点免疫微环境免疫治疗

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凋亡通路基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应有关

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中华肿瘤杂志 2020年第5期42卷 376-382页

作者：尹露茜杨洁冯燕茹黄莹封婷陈进娜陈红霞林东昕李晔雄金晶谭文国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院放疗科100021

目的探讨凋亡通路相关基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法选择362例接受术后同步放化疗的Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者,同步放化疗前抽取静脉血,采用Sequenom MassARRAY检测凋亡通路中的Fas细胞表面死亡受体(FAS)、Fa... 详细信息

目的探讨凋亡通路相关基因的遗传变异与直肠癌患者术后同步放化疗不良反应的关系。方法选择362例接受术后同步放化疗的Ⅱ~Ⅲ期直肠癌患者,同步放化疗前抽取静脉血,采用Sequenom MassARRAY检测凋亡通路中的Fas细胞表面死亡受体(FAS)、Fas配体(FASL)、凋亡蛋白活性因子1(APAF1)、Bcl-2相关X蛋白(BAX)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体受体1(TRAILR1)、肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体受体2(TRAILR2)和半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶7(CASP7)基因共29个标签单核苷酸多态位点(htSNP)的基因型,分析基因型与放化疗不良反应之间的关系。基因型与放化疗不良反应的关联分析采用非条件Logistic回归模型。结果362例患者接受全直肠系膜切除手术后,行照射总剂量为50 Gy、化疗方案为卡培他滨单药的同步放化疗。106例(29.3%)发生≥2级骨髓抑制,FAS rs1468063(OR=1.51,95%CI为1.07~2.15,P=0.020)、APAF1 rs11296996(OR=0.69,95%CI为0.49~0.98,P=0.039)、BAX rs4645904(OR=0.69,95%CI为0.50~0.97,P=0.030)与该不良反应发生有关。161例(44.5%)患者发生≥2级的腹泻,APAF1 rs11296996(OR=1.42,95%CI为1.02~2.00,P=0.040)和rs74619561(OR=2.16,95%CI为1.27~3.68,P=0.005)、CASP7 rs12263370(OR=1.67,95%CI为1.05~2.66,P=0.029)和rs12247479(OR=1.85,95%CI为1.12~3.08,P=0.017)、TRAIL rs112822654(OR=0.68,95%CI为0.48~0.96,P=0.027)与该不良反应发生有关。其余位点与直肠癌放化疗不良反应的发生无关(均P>0.05)。直肠癌患者的性别与中重度骨髓抑制的发生有关(P=0.046);手术方式、病灶距齿状线距离与中重度腹泻的发生有关(均P<0.001),也与中重度放射性皮炎的发生有关(均P<0.05)。结论凋亡通路相关基因FAS、APAF1、BAX、TRAIL和CASP7遗传变异与直肠癌患者接受术后同步放化疗不良反应的发生有关,可能作为直肠癌个体化治疗的潜在遗传生物标志物。

关键词：直肠肿瘤多态性,单核苷酸凋亡同步放化疗不良反应

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肺腺癌患者血浆中低丰度丝切蛋白-1的表达及其临床意义

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癌变·畸变·突变 2025年第3期37卷 202-208页

作者：季杰马晟黄桂汶肖汀国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学全国重点实验室病因及癌变研究室南京医科大学第一临床医学院

目的：探讨肺腺癌患者血浆中低丰度丝切蛋白-1(cofilin-1)与肺腺癌临床病理指标及预后的关系。方法：选取24例具有完整临床信息的肺腺癌患者和52例经术后病理诊断确诊为良性肺部疾患(17例肺结核、25例炎性肉芽肿、10例错构瘤)患者。收... 详细信息

目的：探讨肺腺癌患者血浆中低丰度丝切蛋白-1(cofilin-1)与肺腺癌临床病理指标及预后的关系。方法：选取24例具有完整临床信息的肺腺癌患者和52例经术后病理诊断确诊为良性肺部疾患(17例肺结核、25例炎性肉芽肿、10例错构瘤)患者。收集患者的外周血，通过试剂盒纳米磁珠对样本中的低丰度蛋白进行富集，随后进行高分辨质谱鉴定。应用目标-诱饵(TDfdr)算法在R软件中进行差异表达基因的筛选，将伪发现率控制在0.05以内。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载598例肺腺癌组织RNA表达谱和临床数据，进行Kaplan-Meier生存分析和Log-rank检验。结果：在患者血浆低丰度蛋白中，通过质谱鉴定共获得6 563个蛋白，经过TDfdr算法筛选后获得105个差异表达蛋白(其中39个在肺癌血浆样本中低表达，66个高表达)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示，肺癌样本组低表达蛋白主要参与维持细胞的物质交换、结构稳定及正常运动功能的相关通路，这些通路参与构成了组织发育、稳态和损伤修复的分子基础。而高表达蛋白主要参与和代谢重编程、细胞分裂及运动迁移等功能相关的通路，这些通路有助于维持癌细胞的存活与生长，促进癌细胞的增殖与转移。生物信息学分析发现肌动蛋白解聚因子cofilin-1在肺腺癌患者血浆中高表达(P<0.05),TCGA数据库中肺腺癌队列的生存分析结果显示cofilin-1高表达与患者总生存期呈负相关(r=-1.48,P<0.05)。结论：肺腺癌患者与良性肺部疾病患者血浆低丰度蛋白表达存在较大差异，cofilin-1在肺腺癌血浆和组织中高表达，且与患者不良预后相关，是一种潜在的肺腺癌血浆分子标志物。

关键词：肺腺癌血浆低丰度蛋白蛋白质组丝切蛋白-1 预后

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分析鉴定胃食管交界处腺癌发生与进展的关键基因

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基础医学与临床 2021年第6期41卷 831-836页

作者：王雨芊陈亚玫杨洁林媛骆盈盈张少森吴晨国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室北京100021 北京大学北京未来基因诊断高精尖创新中心生物医学前沿创新中心北京100871

目的探究中国人群胃食管交界处腺癌(ACGEJ)在基因组与转录组水平的改变,挖掘肿瘤发生和进展过程中的关键基因。方法研究纳入58例于林州肿瘤医院和林州食管癌医院收集的ACGEJ患者的肿瘤组织及癌旁组织样本,通过转录组测序对样本进行基因... 详细信息

目的探究中国人群胃食管交界处腺癌(ACGEJ)在基因组与转录组水平的改变,挖掘肿瘤发生和进展过程中的关键基因。方法研究纳入58例于林州肿瘤医院和林州食管癌医院收集的ACGEJ患者的肿瘤组织及癌旁组织样本,通过转录组测序对样本进行基因表达水平的差异分析和GSVA通路富集分析。使用LASSO回归对差异基因与患者的预后进行关联分析,并且构建nomogram生存预测模型。结果发现在ACGEJ的癌与癌旁组织中共有737个基因差异表达(|log2FC|>1.2,Q<0.05),这些基因富集在肿瘤生长、转移、代谢等通路上。其中有9个基因(ASF1B、ACTN1、KNL1、SAPCD2、TP53I11、DMBT1、CNFN、ID2和DPT)与患者预后显著相关。基于这9个基因共表达模式构建了ACGEJ患者的生存预测模型并可将患者分为高、低风险两组,且低风险组生存时间显著高于高风险组(P<0.01)。结合患者年龄、肿瘤临床分期和预后关联基因集构建了预测性良好的nomogram生存预测模型。结论研究鉴定出多个与ACGEJ进展和预后相关的关键失调基因,这些鉴定出的关键基因有望成为治疗的潜在靶点和预后预测的生物标志物。

关键词：胃食管交界处腺癌转录组测序关键基因生存预测

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POLK基因遗传变异与小细胞肺癌患者铂类药物化疗后的生存相关

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中华肿瘤杂志 2019年第2期41卷 112-117页

作者：陈进娜封婷杨洁李洪敏袁芃马飞尹露茜林东昕徐兵河谭文国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室病因及癌变研究室癌发生及预防分子机理北京市重点实验室100021

目的探讨参与跨损伤DNA合成的POLK基因的遗传变异与小细胞肺癌(SCLC)患者铂类药物化疗疗效及预后的关系。方法通过Sequenom MassARRAY检测1 030例接受铂类药物化疗的SCLC患者POLK基因的5个标签单核苷酸多态(htSNP)的基因型,比较不同基... 详细信息

目的探讨参与跨损伤DNA合成的POLK基因的遗传变异与小细胞肺癌(SCLC)患者铂类药物化疗疗效及预后的关系。方法通过Sequenom MassARRAY检测1 030例接受铂类药物化疗的SCLC患者POLK基因的5个标签单核苷酸多态(htSNP)的基因型,比较不同基因型与化疗疗效及预后的关系。基因型与化疗疗效之间的关联分析采用非条件Logistic回归模型,基因型与远期生存之间的关联分析采用Cox比例风险回归模型。结果1 030例SCLC患者中接受顺铂+依托泊苷(EP方案)化疗558例,接受卡铂+依托泊苷(CE方案)化疗472例,其中化疗有效788例,无效242例,有效率为76.5%。中位随访22.0个月,全组死亡673例,生存224例,失访133例,中位生存时间为22.5个月。Karnofsky功能状态(KPS)评分≤80分患者的有效率为72.0%,低于KPS评分>80分的患者(80.1%;OR=0.64,P=0.002)。局限期患者的有效率为81.6%,高于广泛期患者(71.0%;OR=1.81,P<0.001)。POLK基因5个htSNP位点遗传变异与SCLC患者化疗近期疗效均无关(均P>0.05)。年龄>56岁(HR=1.25,P=0.005)、广泛期(HR=1.67,P<0.001)、化疗无效(HR=1.72,P<0.001)患者死亡风险增加,KPS评分>80分(HR=0.84,P=0.021)、有放射治疗(HR=0.70,P<0.001)的患者死亡风险降低。POLK基因rs73120833位点与SCLC患者铂类药物化疗后的总生存有关,与携带T等位基因的患者相比,携带C等位基因患者的死亡风险降低(HR=0.87,P=0.021),而rs10077427、rs3756558、rs4549504和rs5744545位点与总生存无关(均P>0.05)。携带rs73120833 TC基因型和CC基因型的患者合并后,与携带TT基因型的患者比较,死亡风险明显降低(HR=0.84,P=0.024)。结论POLK基因rs73120833位点遗传变异与SCLC患者总生存有关,可能是预测SCLC患者含铂类药化疗预后的潜在遗传标志。

关键词：小细胞肺癌 P0LK基因多态性,单核苷酸铂类化疗疗效预后

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食管鳞状细胞癌中驱动基因的多组学关联分析

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医学研究杂志 2020年第1期49卷 100-103,107页

作者：席奕轶施新泽林霖郭文佳刘天媛王雨芊林东昕吴晨国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院/北京协和医学院肿瘤医院、分子肿瘤学国家重点实验室、病因及癌变研究室、癌发生及预防分子机理北京市重点实验室北京100021

目的探讨食管鳞癌驱动基因的体细胞突变、拷贝数改变、基因表达和DNA甲基化等多个分子层面的改变及其交互影响。方法从肿瘤基因组图谱计划(TCGA)下载95例食管鳞癌多组学数据,结合实验室前期91例患者测序结果进行分析;根据驱动基因突变... 详细信息

目的探讨食管鳞癌驱动基因的体细胞突变、拷贝数改变、基因表达和DNA甲基化等多个分子层面的改变及其交互影响。方法从肿瘤基因组图谱计划(TCGA)下载95例食管鳞癌多组学数据,结合实验室前期91例患者测序结果进行分析;根据驱动基因突变将患者分组,对两组患者的基因表达水平进行非配对t检验;通过Spearman秩相关进行拷贝数改变、DNA甲基化与驱动基因表达水平的关联分析;通过Log-Rank检验对突变组和非突变组患者生存曲线进行比较。结果多维度数据关联分析结果显示,驱动基因TP53、RB1、ZNF750和PTCH1的表达水平在突变组与非突变组间比较,差异有统计学意义(P=0.011,FC=1.43;P=0.045,FC=0.44;P=0.012,FC=2.20;P=0.011,FC=2.62);驱动基因CUL3、PIK3CA、RBPJ、FBXW7、CDKN2A、PTEN、RB1和CERBBP的表达水平与其拷贝数改变呈显著正相关;多个驱动基因表达受启动子和基因体甲基化的共同调控,并且在两部分数据中存在差异;驱动基因CREBBP(P=0.000)和FAT1(P=0.002)的突变与患者预后相关,可作为食管鳞癌潜在的预后标志物。结论通过对食管鳞癌多组学数据的整合分析,阐述了食管鳞癌中体细胞突变、拷贝数改变、DNA甲基化与20个驱动基因表达水平的关联,并发现CREBBP和FAT1的突变可能成为食管鳞癌患者潜在的预后标志物。这些结果为进一步探究驱动基因在食管鳞癌中的功能机制奠定了一定基础。

关键词：食管鳞状细胞癌驱动基因多组学预后

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