检索结果-内蒙古大学图书馆

中华肿瘤杂志 2025年第1期47卷 108-117页

作者：罗振恺张琦马晓婷向仁伸陆帅兵孔德扬孙宇冯英瑛裴炜冯林朱玥璐杨林张海增国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院结直肠外科北京100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院内科北京100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021 国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院病理科北京100021

目的分析直肠神经内分泌瘤(R-NET)G2的临床病理特征,探讨其影响预后的因素并总结相关治疗经验。方法回顾性分析中国医学科学院肿瘤医院2003年1月至2023年9月收治的经病理学诊断确诊为R-NET G2患者的临床资料。采用Fisher精确检验与Kapla... 详细信息

目的分析直肠神经内分泌瘤(R-NET)G2的临床病理特征,探讨其影响预后的因素并总结相关治疗经验。方法回顾性分析中国医学科学院肿瘤医院2003年1月至2023年9月收治的经病理学诊断确诊为R-NET G2患者的临床资料。采用Fisher精确检验与Kaplan-Meier法对病理特征与预后间的关系进行分析。结果R-NET G2患者22例,随访时间为6~98个月,中位随访时间为42个月,随访期间有5例患者因肿瘤进展而死亡。患者的1、3、5年肿瘤特异性生存率分别为100.0%、92.9%、69.6%。22例患者中,有20例接受手术治疗,其中15例术后行辅助治疗;2例因肝、骨多发转移而行直接内科治疗。肿瘤长径≥2 cm、T2~3期、有淋巴结转移、有远处转移患者的5年生存率(分别为57.1%、68.8%、66.7%和63.6%)均短于肿瘤长径<2 cm、T1期、无淋巴结转移、无远处转移的患者(均为100.0%,均P<0.001)。此外,与无远处转移的患者相比,伴有肝转移患者的原发瘤长径较大,T分期较晚(P<0.05)。结论R-NET G2与G1相比恶性程度高,并且具有较高的转移倾向。临床医师应根据肿瘤大小、侵犯深度、淋巴结状态、存在远处转移以及远处转移的部位和程度等因素制定相应的诊疗策略。

关键词：直肠肿瘤神经内分泌瘤肝转移预后

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HSP90功能性抗体对胃癌干细胞干性特征作用的研究

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海南医科大学学报 2025年第1期31卷 16-24页

作者：王光辉张威刘永年舒雄柳诗雅冉宇靓刘辉琦青海大学医学院青海西宁810001 北京市创伤骨科研究所/北京积水潭医院北京100035 国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的:研究热休克蛋白90(HSP90)功能性抗体对胃癌干细胞干性特征的作用,并初步探讨相关机制。方法:无血清悬浮培养胃癌HGC27细胞获得细胞球细胞(Sphere细胞),HSP90功能性抗体9B8处理Sphere细胞,CCK-8法检测9B8对胃癌干细胞耐药、增殖的作... 详细信息

目的:研究热休克蛋白90(HSP90)功能性抗体对胃癌干细胞干性特征的作用,并初步探讨相关机制。方法:无血清悬浮培养胃癌HGC27细胞获得细胞球细胞(Sphere细胞),HSP90功能性抗体9B8处理Sphere细胞,CCK-8法检测9B8对胃癌干细胞耐药、增殖的作用,Trans-well小室检测9B8对胃癌干细胞迁移、侵袭的作用,甲基纤维素成球检测9B8对胃癌干细胞自我更新的作用,流式细胞术检测9B8对胃癌干细胞ALDH、CD44表达的作用,免疫荧光检测HSP90在胃癌干细胞中的表达,Western blot检测胃癌干细胞中HSP90、干性相关蛋白(SOX2、OCT4)、耐药相关蛋白(TOP2A、ABCG2)、上皮-间质转化(EMT)相关蛋白(Vimentin、Snail、E-cadherin)及PI3K/AKT/mTOR信号通路相关蛋白表达。结果:胃癌干细胞中HSP90、ALDH、CD44表达高于亲本细胞,且其增殖、耐药、迁移、侵袭及自我更新能力明显强于亲本细胞(P<0.01)。HSP90功能性抗体9B8处理组与对照组相比,胃癌干细胞增殖没有差异(P>0.05),但迁移、侵袭、耐药和自我更新能力显著低于对照组(P<0.01),ALDH、CD44表达比例明显下降(P<0.01)。HSP90功能性抗体处理组HSP90、ABCG2、TOP2A、Vimentin、Snail、PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT、mTOR、p-mTOR表达下降,E-cadherin表达增加。结论:HSP90功能性抗体9B8可能通过抑制AKT/PI3K/mTOR通路活性,影响胃癌干细胞相关干性基因/蛋白、耐药基因/蛋白、EMT相关基因/蛋白表达,进而影响胃癌干细胞自我更新、耐药、侵袭、迁移等干性特征,为胃癌干细胞靶向治疗提供了新的思路。

关键词：胃癌干细胞干性特征 HSP90功能性抗体

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TOMM40L促进三阴性乳腺癌细胞增殖和迁移并与不良预后相关

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基础医学与临床 2025年第5期 575-582页

作者：张柯陆江宁孙立新遇珑孙力超冉宇靓国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室

目的探讨TOMM40L在三阴性乳腺癌(TNBC)的表达情况与临床特征的相关性。方法利用UALCAN和TCGA数据库中的转录组数据评估TOMM40L在TNBC组织中的表达差异。采用单因素及多因素Cox回归分析并建立Nomogram模型评价TOMM40L在TNBC患者中的预... 详细信息

目的探讨TOMM40L在三阴性乳腺癌(TNBC)的表达情况与临床特征的相关性。方法利用UALCAN和TCGA数据库中的转录组数据评估TOMM40L在TNBC组织中的表达差异。采用单因素及多因素Cox回归分析并建立Nomogram模型评价TOMM40L在TNBC患者中的预后价值。通过蛋白质印迹法和实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)验证TOMM40L在TNBC细胞系中的差异表达。利用特异性小分子干扰RNA(siRNA)敲降TOMM40L以分析其在TNBC细胞增殖和迁移中的作用。通过GO、KEGG及GSEA分析TOMM40L在TNBC中的潜在信号通路。结果与非TNBC肿瘤组织相比，TOMM40L在TNBC组织中高表达(P<0.001)。蛋白质印迹法和qPCR结果显示，TNBC细胞系中mRNA及蛋白质表达水平显著高于非TNBC细胞系(P<0.001)。CCK-8法和Transwell小室法实验结果表明，TOMM40L敲降后TNBC细胞系(LTT和MDA-MB-468)中的增殖、迁移能力显著降低。功能富集分析结果表明TOMM40L参与糖代谢相关途径。结论 TOMM40L在TNBC细胞系和组织中高表达且与不良预后相关，此外，敲降TOMM40L可显著抑制TNBC细胞系的增殖和迁移。

关键词：三阴性乳腺癌 TOMM40L 临床意义

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肺癌免疫治疗精准化策略中的多模态影像组学与人工智能协同研究进展

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中国肿瘤临床与康复 2025年第4期 219-228页

作者：范文文仲佳白桦王志杰张红梅王洁国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院影像诊断科国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤内科分子肿瘤学国家重点实验室AMS肺癌转化研究重点实验室

医学影像在肺癌患者的管理中起着关键作用，广泛应用于早期检测、精确诊断、治疗规划、疗效监测和影像引导的介入治疗。大部分医学影像资料采用数字成像和通信医学标准格式进行存储，确保了数据的即时可访问性及其在定性和定量分析中的... 详细信息

医学影像在肺癌患者的管理中起着关键作用，广泛应用于早期检测、精确诊断、治疗规划、疗效监测和影像引导的介入治疗。大部分医学影像资料采用数字成像和通信医学标准格式进行存储，确保了数据的即时可访问性及其在定性和定量分析中的应用。随着研究的推进，医学影像目前已包含丰富的与传统病理、血液学、基因组学和蛋白质组学数据正交互补的生物医学信息。影像组学作为一种新兴研究领域，专注于将常规医疗影像转化为可进行高级数据分析的定量生物医学数据。这些数据通过整合其他生物医学信息，并应用先进的生物统计学与人工智能（AI）技术，已被证明能够作为肺癌的风险评估、诊断、预后评估和治疗反应监测的快速、准确的无创生物标志物。文章综述了影像组学在肺癌研究中的关键应用，并特别关注了AI技术的融合所带来的优势、挑战和潜在的限制。

关键词：癌,非小细胞肺免疫检查点抑制剂免疫治疗个体化治疗人工智能预测标志物

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中国肝癌一级预防专家共识（2018）

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中华肿瘤杂志 2018年第1期40卷 550-557页

作者：中华预防医学会肿瘤预防与控制专业委员会感染相关肿瘤防控学组中华预防医学会慢病预防与控制分会中华预防医学会健康传播分会曲春枫不详国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室免疫室北京100021

肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一，其病因主要包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒感染和黄曲霉毒素，蓝藻毒素和多种可干预的个体行为方式在肝癌发生发展中也具有重要作用，实施肝癌病因的一级预防措施是在中国降低其疾病负担的重要途径。... 详细信息

肝癌是我国最常见的恶性肿瘤之一，其病因主要包括乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒感染和黄曲霉毒素，蓝藻毒素和多种可干预的个体行为方式在肝癌发生发展中也具有重要作用，实施肝癌病因的一级预防措施是在中国降低其疾病负担的重要途径。根据中国肝癌的流行病学特征，结合在中国人群中开展并获得的肝癌一级预防措施的证据，专家共识探讨了乙肝疫苗接种，包括针对不同HBV感染状态母亲的新生儿及儿童的乙肝疫苗接种程序；慢性乙型、丙型肝炎患者的抗病毒治疗；预防和避免黄曲霉毒素及蓝藻毒素暴露；改变高危致癌风险相关的生活方式等，以期推进中国肝癌的有效预防。

关键词：肝肿瘤一级预防专家共识

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基于肿瘤基因图谱计划挖掘食管鳞癌数据

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中华肿瘤杂志 2018年第7期40卷 517-522页

作者：何思源王小兵焦宇辰国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室 100021

目的利用肿瘤基因图谱计划（TCGA）数据库中食管鳞癌数据，探讨正常食管上皮细胞和食管鳞癌细胞中差异表达的基因及其与患者预后的关系。方法在TCGA数据库中检索81例食管鳞癌的转录组数据和患者的临床资料。采用edgeR软件鉴定正常组织... 详细信息

目的利用肿瘤基因图谱计划（TCGA）数据库中食管鳞癌数据，探讨正常食管上皮细胞和食管鳞癌细胞中差异表达的基因及其与患者预后的关系。方法在TCGA数据库中检索81例食管鳞癌的转录组数据和患者的临床资料。采用edgeR软件鉴定正常组织和肿瘤组织间差异表达的基因，对差异表达基因行功能富集分析，应用String数据库构建蛋白间的互相作用网络。基于表达值构建基因共表达网络和基因表达水平的高低对患者进行分组，分析各组患者的预后。结果在TCGA数据库中共鉴定到2788个差异表达基因，其中1168个基因在肿瘤组织中表达水平上调，1620个基因在肿瘤组织中表达水平下调。上调的基因富集到细胞周期、DNA复制和错配修复等通路，下调的基因富集到代谢相关通路。蛋白互相作用网络分析获得包含707个基因及其3428个互作关系，食管鳞癌组织中发生拷贝数扩增的基因与其他一些重要基因存在相互作用。基因共表达分析检测到10个共表达模块，其中棕色模块的核糖体蛋白基因与肿瘤所在食管部位有关（P=0．003）。TNFRSFIOB高表达组和TNFRSFl0B低表达组患者的3年生存率分别为82．5％和15．1％，DDXl8高表达组和DDXl8低表达组患者的3年生存率分别为82．4％和15．2％，差异均有统计学意义（均P〈0．1）。结论TCGA食管鳞癌数据库中，与核糖体蛋白相关的基因与食管鳞癌发生的部位有关。TNFRSFl0B和DDXl8的低表达与患者的预后差有关，其可能成为食管鳞癌患者潜在的预后分子标志物。

关键词：食管肿瘤肿瘤鳞状细胞基因差异表达预后

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蛋白酶活化受体2在卵巢上皮性癌中的表达及意义

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中华肿瘤杂志 2023年第1期45卷 64-73页

作者：刘双环马怡茗张亚男赵新华汪红英李斌国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院妇科北京100021 国家癌症中心、国家肿瘤临床医学研究中心、中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的探讨蛋白酶活化受体2(PAR2)在卵巢上皮性癌中的表达及意义。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库(410例卵巢上皮性癌患者)和组织基因型表达(GTEx)数据库(88例正常人)中PAR2 mRNA的表达水平。收集2009—2019年于中国医学科学院肿瘤... 详细信息

目的探讨蛋白酶活化受体2(PAR2)在卵巢上皮性癌中的表达及意义。方法收集癌症基因组图谱(TCGA)数据库(410例卵巢上皮性癌患者)和组织基因型表达(GTEx)数据库(88例正常人)中PAR2 mRNA的表达水平。收集2009—2019年于中国医学科学院肿瘤医院接受手术治疗卵巢癌患者(149例)的癌组织及临床病理资料,对患者肿瘤组织进行PAR2蛋白免疫组化染色,分析PAR2 mRNA及蛋白表达与临床病理特征及预后的关系,通过富集分析研究PAR2参与的基因功能及相关信号通路。生存分析采用Kaplan-Meier法和Log rank检验,影响因素分析采用Cox比例风险回归模型。结果 TCGA和GTEx数据库结果显示,卵巢上皮性癌组织中PAR2 mRNA的表达水平(3.05±0.72)高于正常卵巢组织(0.33±0.16,P=0.004)。149例患者的免疫组化结果显示,PAR2呈强阳性19例,阳性77例,弱阳性21例,阴性32例。初始手术减瘤效果及初始治疗效果与PAR2 mRNA及PAR2蛋白的表达有关(均P<0.05)。PAR2 mRNA高表达组(PAR2 mRNA≥0.88)患者的中位无进展生存时间(14.9个月)低于低表达组(PAR2 mRNA<0.88;17.1个月,P=0.033);PAR2 mRNA高表达组患者的中位总生存时间(36个月)低于低表达组(40个月,P=0.011)。多因素分析显示,初始手术减瘤效果、初始治疗效果是无进展生存和总生存的独立影响因素(均P<0.05)。PAR2蛋白高表达组(PAR2≥0.90)患者的中位无进展生存时间(6.5个月)低于PAR2蛋白低表达组(PAR2<0.90;9.5个月,P=0.016)。PAR2高表达组患者的中位总生存时间(43个月)低于低表达组(55个月,P=0.038)。多因素分析显示,PAR2蛋白表达水平、初始手术减瘤效果、化疗耐药是无进展生存和总生存的独立影响因素(均P<0.05)。基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析显示,PAR2的靶基因主要富集于细胞间连接相关的功能上,占40.0%(6/15)。基因富集分析表明,在PAR2 mRNA高表达卵巢癌患者中Wnt/β-catenin信号通路(P=0.023)、MAPK通路(P=0.029)及糖酵解相关通路(P=0.018)存在富集。结论 PAR2表达与卵巢癌初始手术满意减瘤、初始治疗效果及患者预后有关,PAR2可能参与Wnt/β-catenin信号通路调控细胞间连接来促进卵巢癌侵袭及转移。

关键词：卵巢恶性肿瘤蛋白酶活化受体2 癌症基因组图谱数据库减瘤手术预后 Wnt信号通路

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肿瘤转移相关基因1对宫颈癌HeLa细胞放疗敏感性的作用及机制

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中华肿瘤杂志 2022年第9期44卷 962-967页

作者：孙芳洲王劲松李春晓王婷张竞尧周彦彤王海娟钱海利国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的探讨肿瘤转移相关基因1(MTA1)对宫颈癌HeLa细胞放疗敏感性的影响及其分子机制。方法对MTA1敲降的HeLa细胞及对照HeLa细胞进行转录测序,获得差异表达基因并对其进行基因集富集分析和GO聚类分析。采用流式细胞术检测MTA1过表达的HeLa... 详细信息

目的探讨肿瘤转移相关基因1(MTA1)对宫颈癌HeLa细胞放疗敏感性的影响及其分子机制。方法对MTA1敲降的HeLa细胞及对照HeLa细胞进行转录测序,获得差异表达基因并对其进行基因集富集分析和GO聚类分析。采用流式细胞术检测MTA1过表达的HeLa细胞和对照HeLa细胞在10 Gy X射线照射前后的细胞凋亡情况,克隆形成实验和实时无标记动态细胞分析(RTCA)技术检测细胞的增殖情况。选取差异表达基因编码的蛋白构建蛋白相互作用网络,采用免疫荧光实验检测γ-H2AX的表达情况,采用Western blot法检测γ-H2AX、β-CHK2、PARP和cleaved caspase 3的表达水平。结果转录组测序分析获得差异表达基因649个,其中402个基因在MTA1敲降的HeLa细胞中表达上调,247个基因表达下调。与MTA1相关的差异表达基因富集于DNA损伤修复过程,GO聚类分析提示,DNA损伤修复富集于第2位。流式细胞术检测结果显示,10 Gy X射线照射后,MTA1过表达的HeLa细胞凋亡率[(15.67±0.81)%]低于对照HeLa细胞[(40.27±2.73)%,P<0.001]。RTCA结果显示,过表达MTA1的HeLa细胞经2 Gy X射线照射后,细胞增殖能力高于对照HeLa细胞(P=0.024)。克隆形成实验显示,过表达MTA1的HeLa细胞经2 Gy X射线照射前后的克隆数分别为(176±7)个和(137±7)个,均高于对照细胞[分别为(134±4)个和(75±4)个,均P<0.05]。免疫荧光实验结果显示,未经X射线照射的MTA1过表达及对照HeLa细胞中的γ-H2AX几乎无表达,经过10 Gy X射线照射后48 h,对照HeLa细胞中可见明显γ-H2AX表达,且MTA1过表达HeLa细胞中γ-H2AX表达相对较低。Western blot结果显示,10 Gy X射线照射后,过表达MTA1的HeLa细胞中β-CHK2的表达水平(1.04±0.06)高于对照HeLa细胞(0.58±0.25,P=0.036),过表达MTA1的HeLa细胞中γ-H2AX、PARP和cleaved caspase 3的表达水平分别为0.52±0.13、0.52±0.22和0.63±0.18,均低于对照HeLa细胞(分别为0.87±0.06,0.78±0.12和0.90±0.12,均P>0.05)。结论过表达MTA1能降低宫颈癌HeLa细胞对X射线的敏感性,MTA1可能通过降低cleaved caspase 3的表达抑制细胞凋亡、增加β-CHK2表达促进DNA修复。

关键词：宫颈肿瘤 HeLa细胞肿瘤转移相关基因1 放疗敏感性

来源：评论

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正常线粒体移植对三阴性乳腺癌细胞增殖凋亡及干性的影响

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中华肿瘤杂志 2024年第9期46卷 878-888页

作者：马亮亮张柯陆江宁孙立新遇珑冉宇靓孙力超国家癌症中心国家肿瘤临床医学研究中心中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的观察正常细胞和三阴性乳腺癌细胞线粒体形态,提取正常细胞线粒体,探讨线粒体移植对三阴性乳腺癌细胞增殖、凋亡和干性的影响。方法使用透射电子显微镜观察细胞线粒体形态,用线粒体提取试剂盒提取线粒体,Western blot鉴定线粒体蛋白... 详细信息

目的观察正常细胞和三阴性乳腺癌细胞线粒体形态,提取正常细胞线粒体,探讨线粒体移植对三阴性乳腺癌细胞增殖、凋亡和干性的影响。方法使用透射电子显微镜观察细胞线粒体形态,用线粒体提取试剂盒提取线粒体,Western blot鉴定线粒体蛋白,线粒体膜电位检测试剂盒检测线粒体活性。用MitoTracker Green或MitoTracker Deep Red荧光探针标记活细胞线粒体,在12、24、96 h用激光共聚焦显微镜观察线粒体进入三阴性乳腺癌LTT细胞的程度;线粒体移植24 h后利用细胞计数试剂盒8(CCK-8)、平板克隆、流式细胞术、细胞成球实验检测线粒体移植对三阴性乳腺癌细胞增殖、凋亡和干性的影响。结果透射电子显微镜观察到正常细胞线粒体为长杆状、棒状,三阴性乳腺癌细胞线粒体肿胀及基质空泡样。Western blot结果显示,线粒体编码的细胞色素C氧化酶I蛋白存在于提取的线粒体中,线粒体中热休克蛋白60的含量高于细胞质。多模式微孔板检测仪结果显示,提取的线粒体JC-1聚合物/单体为1.67±0.06,高于对照组(0.35±0.04,P<0.001)。线粒体移植后,12、24、96 h在LTT细胞中可观察到外源性线粒体。CCK-8实验结果显示,在移植48 h后,LTT细胞A值为0.27±0.13,低于对照组(0.62±0.36,P=0.023)。线粒体移植120 h时,LTT细胞A值仍低于对照组(均P<0.01)。经线粒体移植处理的LTT细胞形成的克隆细胞数为(21.33±7.31)个,低于对照组(35.22±13.59,P=0.016)。流式细胞术结果显示,线粒体移植24 h后,LTT细胞早期凋亡比例为(30.07±2.15)%,高于对照组[(2.07±1.58)%,P<0.001],在MDA-MB-468细胞中,早期凋亡比例是(24.47±5.22)%,高于对照组[(7.83±2.06)%,P=0.007]。此外,细胞成球实验中,线粒体移植的LTT细胞成球数量为(46.25±5.40)个,低于对照组[(62.58±6.43)个,P<0.001]。结论正常线粒体可以通过共培养方式进入到三阴性乳腺癌细胞中,抑制三阴性乳腺癌细胞增殖和干性,促进三阴性乳腺癌细胞凋亡。

关键词：乳腺肿瘤三阴性乳腺癌线粒体移植细胞增殖细胞凋亡细胞干性

来源：评论

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食管癌化疗耐药相关基因的初步筛选及其临床意义

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解放军医学杂志 2019年第3期44卷 222-227页

作者：南鹏李春晓孙芳洲窦娜郭建宾王海娟国家癌症中心/国家肿瘤临床医学研究中心/中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院分子肿瘤学国家重点实验室北京100021

目的初步筛选食管癌细胞中的耐药相关基因,分析其与食管癌患者预后不良的相关性,探讨其调控食管癌耐药的潜在机制。方法分析GDSC数据库中收录的食管癌细胞系对药物敏感性的数据,筛选出同时对顺铂和多西他赛相对敏感或耐药的细胞系;借助... 详细信息

目的初步筛选食管癌细胞中的耐药相关基因,分析其与食管癌患者预后不良的相关性,探讨其调控食管癌耐药的潜在机制。方法分析GDSC数据库中收录的食管癌细胞系对药物敏感性的数据,筛选出同时对顺铂和多西他赛相对敏感或耐药的细胞系;借助R语言edgeR软件包,以log2(变化倍数)大于1或小于–1且P<0.05为筛选标准,对两组细胞系转录组数据进行差异表达基因分析;选择在耐药组中相对高表达的基因进行GO生物学过程富集聚类分析,了解其可能调控的与耐药相关的信号通路;结合文献报道,获得新的可能与化疗耐药相关的基因。在食管癌患者肿瘤组织的转录组数据中分析所获得的基因的表达水平与患者临床病理特征及预后的相关性,最终通过STRING数据库在线预测与筛选获得的基因表达产物互作的蛋白,分析其发挥作用的潜在机制。结果初步筛选获得同时对顺铂和多西他赛相对耐药和敏感的食管癌细胞系各5株;分析耐药和敏感两组细胞系的转录组数据,最终共筛选获得1097个差异表达基因,包括在耐药组中高表达的基因532个、低表达的基因565个。将耐药组高表达的基因进行GO富集分析,发现受体蛋白酪氨酸激酶通路被显著富集,该通路中的差异表达基因FGR的表达水平与临床食管癌患者肿瘤T分期(P=0.021)、临床分期(P=0.007)及预后(P=0.0021)显著相关。蛋白相互作用分析表明,FGR与多个蛋白直接或间接互作,FGR可能主要以激酶的形式发挥作用。结论受体蛋白酪氨酸激酶通路与食管癌细胞耐药显著相关,该信号通路中的FGR基因表达水平与食管癌患者的临床病理分期及预后显著相关,其可能通过磷酸化下游靶蛋白进而调控食管癌细胞的耐药。

关键词：食管癌耐药受体蛋白酪氨酸激酶信号通路 FGR基因

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