检索结果-内蒙古大学图书馆

基于引物交换反应的非标记荧光探针用于脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1的高灵敏检测

分析化学 2025年第3期53卷 464-471页

作者：王芸花王乐如杨力改陈佳政杜雨润侯嘉慧翟翔赵旭华于保锋山西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室

脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE 1)是一种多功能蛋白质，在DNA修复和基因表达调控中发挥重要作用。由于APE 1在多种癌症中过表达，因此可作为癌症生物标志物，用于辅助临床诊断、指导用药及预后... 详细信息

脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1(Apurinic/apyrimidinic endonuclease 1, APE 1)是一种多功能蛋白质，在DNA修复和基因表达调控中发挥重要作用。由于APE 1在多种癌症中过表达，因此可作为癌症生物标志物，用于辅助临床诊断、指导用药及预后监测。本研究采用引物交换反应（Primer exchange reaction, PER）策略，设计了一种非标记型荧光探针，用于APE 1活性的高灵敏检测。当体系中不存在APE 1时，催化发夹（Catalytic hairpin, HP）的结构稳定，无G-四链体（G-quadruplex）生成。此时，游离的硫磺素T(Thioflavin T,ThT)不发射荧光，体系的背景荧光很低。加入APE 1后，催化发夹上的无嘌呤/嘧啶（Apurinic/apyrimidinic,AP）位点被特异性识别并切割，断裂生成的短核酸序列可直接作为引物引发PER扩增，生成大量G-四链体。游离的ThT嵌入G-四链体结构并发出荧光，导致传感体系的荧光信号显著增强。PER扩增反应策略和催化发夹的低背景设计使此探针展现出很高的灵敏度，线性检测范围为0.001～0.07 U/mL，检出限（3σ）为0.0008 U/mL。此外，引物序列可由APE 1切割直接生成而不需要额外添加，这不仅提高了反应的特异性，还简化了操作步骤。非标记型荧光信号的使用大大降低了实验成本，实现了APE 1的快速检测。利用此荧光探针检测人血清样品中APE 1的含量，回收率在91%～104%之间，表明其在生物酶研究方面拥有巨大的应用潜力。

关键词：脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1 引物交换反应 G-四链体硫磺素T 非标记荧光探针

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泛凋亡在肿瘤中的研究进展

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生理学报 2025年第2期77卷 277-288页

作者：罗伊凌陈柳燕王耀彬周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室广西高校生物分子医学研究重点实验室

泛凋亡(PANoptosis)是一种由泛凋亡复合体调控的程序性细胞死亡，具有细胞焦亡、凋亡和(或)坏死性凋亡的关键特征。作为最复杂的程序性细胞死亡方式，泛凋亡涉及多种程序性细胞死亡之间的补偿作用，可以通过多种信号通路调节肿瘤细胞的... 详细信息

泛凋亡(PANoptosis)是一种由泛凋亡复合体调控的程序性细胞死亡，具有细胞焦亡、凋亡和(或)坏死性凋亡的关键特征。作为最复杂的程序性细胞死亡方式，泛凋亡涉及多种程序性细胞死亡之间的补偿作用，可以通过多种信号通路调节肿瘤细胞的增殖，迁移和侵袭等恶性表型的发生过程，从而影响恶性肿瘤的进展。研究发现泛凋亡在肿瘤进展和治疗中具有抑癌和促癌双重作用，因此深入研究泛凋亡在肿瘤发生、发展中的相关分子机制意义重大。本文综述了细胞凋亡、焦亡和坏死性凋亡的分子机制，总结了泛凋亡及其复合体的激活和调控机制以及泛凋亡在肿瘤发生、发展中的作用，以期为癌症治疗和预后评估提供新的思路。

关键词：细胞凋亡焦亡坏死性凋亡泛凋亡泛凋亡复合体肿瘤

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NUF2对泛癌的预后和免疫治疗效果的预测价值

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南方医科大学学报 2025年第1期45卷 137-149页

作者：王耀彬陈柳燕罗伊凌申继清周素芳广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室//广西高校生物分子医学研究重点实验室广西南宁530021

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌... 详细信息

目的探讨NUF2表达水平与肿瘤预后的关系及在肿瘤微环境中的作用。方法综合利用人类蛋白质图谱(HPA)、癌症基因组图谱(TCGA)、基因型-组织表达计划(GTEx)、癌细胞系百科全书(CCLE)、TIMER的数据集,采用生物信息学方法挖掘NUF2的潜在致癌作用,包括剖析NUF2在各种类型肿瘤组织中的表达水平、预后价值及免疫价值;采用RT-qPCR、Western blotting、免疫组化(IHC)等实验检测NUF2在肝癌细胞系和肝癌患者癌组织及血液中的表达情况。利用基因本体论(GO)、基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)探索NUF2及相关基因的分子机制并在肝癌中构建了NUF2的竞争性内源RNA(ceRNA)网络。结果与正常组织相比,NUF2表达在27种肿瘤中上调并与多种类型肿瘤的临床分期相关(P<0.05)。在部分肿瘤中,NUF2的表达上调与肿瘤患者的不良预后(总体生存期、疾病特异性生存期、无病生存期和无进展生存期)相关(P<0.05)。NUF2表达水平与多种肿瘤的肿瘤突变负荷、微卫星不稳定、浸润免疫细胞(B细胞、髓样树突状细胞、中性粒细胞、CD4+T细胞)、免疫细胞maker基因(CCR7、CD163、CD19、CD4、CD79A、CD8A、CD8B、IRF5、ITGAX和MS4A4A)以及免疫检查点基因(CTLA4、HAVCR2、LAG3、PDCD1和PDCD1LG2)呈正相关(P<0.05)。RT-qPCR等实验结果显示NUF2在肝癌细胞系、肝癌患者癌组织和血液中表达上调(P<0.05),其中肝癌患者经手术治疗之后,使得血液中NUF2表达下调(P<0.05)。GO和KEGG富集分析表明,NUF2相关基因与染色体分离、微管运动以及细胞周期相关(P<0.05)。GSEA分析提示,在肝癌中NUF2高表达与甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢以及调控神经活性配体受体相互作用有关(P<0.05)。结论NUF2在27种肿瘤中表达上调并与部分肿瘤的临床分期、不良预后有关。此外NUF2的表达与多种肿瘤的免疫细胞浸润密切相关,可能作为这些癌症免疫治疗效果的潜在预测因子。

关键词： NUF2 泛癌分析免疫浸润预后

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ULK3基因在前列腺癌中的生物信息学分析及其在DU145中的表达

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基因组学与应用生物学 2025年第1期44卷 80-91页

作者：邹雨轩张云博孙梦李梦佳韩洋洋新疆医科大学基础医学院生物学教研室乌鲁木齐830017 新疆地方病分子生物学重点实验室乌鲁木齐830017

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STR... 详细信息

本研究旨在利用生物信息学方法分析ULK3在前列腺癌(prostate cancer,PCa)中的潜在作用,并通过构建稳定敲降ULK3的前列腺癌细胞株DU145,探究ULK3对前列腺癌细胞增殖的影响。通过在线数据库TCGA、UALCAN分析ULK3在PCa中的表达情况;利用STRING数据库分析与ULK3相关的互作蛋白质,并对ULK3差异表达基因进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA);通过GO、KEGG分析,探讨ULK3的潜在作用机制;通过miRNet平台预测调控ULK3的微RNA(miRNA),并构建PCa中潜在的ULK3-miRNA-mRNA调控网络;利用TIMER 2.0数据库分析ULK3在PCa中与免疫浸润的关系。基于上述生物信息学分析,对PCa细胞DU145进行ULK3敲降处理,并通过实时定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)和Western blot检测ULK3下调效率;通过划痕实验和MTT法检测ULK3稳定下调对前列腺癌细胞增殖的影响。结果显示,ULK3在PCa癌组织中比在正常前列腺组织中高表达;通过富集分析发现ULK3的表达与多种生物学功能有关,其中主要作用的通路有范可尼贫血途径和Notch信号通路;通过免疫浸润分析发现ULK3高表达时多种免疫细胞的浸润水平显著下降。此外,成功构建敲降ULK3的前列腺癌细胞系DU145,通过划痕实验和MTT法发现敲降ULK3后对DU145细胞的迁移和增殖起到抑制作用。以上结果表明ULK3在前列腺癌中发挥重要生物学作用,敲降ULK3可能对PCa存在抑制作用,这为后续PCa的基础研究与临床治疗提供了新的思路。

关键词： ULK3 前列腺癌(PCa) 生物信息学慢病毒增殖

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“TCA”课程思政模式的育人评价量规体系构建及应用

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中国生物化学与分子生物学报 2025年第1期41卷 53-67页

作者：王郢吕灵慧魏仁吉张翔茹懿阎博沈岚孙茂梁亮赵晶武汉大学课程思政教学研究示范中心武汉430072 空军军医大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室西安710032

高等教育“新医科”建设迫切需要科学评价课程育人效果。本文前期建立基础医学课程通用的“TCA”思政模式,以生物化学名词三羧酸循环中的“TCA”(三羧酸)类比育人的“一心三力”(T-思考力与合作力、C-鉴别力、A-敬畏心),引导学生建立正... 详细信息

高等教育“新医科”建设迫切需要科学评价课程育人效果。本文前期建立基础医学课程通用的“TCA”思政模式,以生物化学名词三羧酸循环中的“TCA”(三羧酸)类比育人的“一心三力”(T-思考力与合作力、C-鉴别力、A-敬畏心),引导学生建立正确的认知观、科学观和生命观。据此,本文进一步探讨如何科学评价“一心三力”育人效果,以反馈“TCA”思政建设质效。针对大班课个体差异化、学习反馈碎片化、元认知升维难测的育人评价难点,采用增值性评价、矩阵化评价、可迁移性评价策略,从思考质量、思维创造性、合作能力、思维迭代性、思维辩证性和岗位责任6个方面评价“一心三力”。通过借鉴和改造教育学和心理学中18个成熟的评价工具,构建包含30个一级指标的评价量规体系(11个新设计、10个部分改构、9个直接采用),同时列出49个二级指标和98个三级指标增强评价过程的可操作性。上述整套“一心三力”评价量规应用于空军军医大学五年制本科生物化学教学,可视化评价魔力生化圈创意作品中体现的思考力与合作力、大班互动双师课堂中体现的鉴别力、高阶虚拟仿真实验任务中体现的敬畏心,结果显示,生化教学对学生的改变不仅有知识的积累,更包括价值观和认知观等育人性目标的实现。课程中加入创意性表现评价、合作学习和临床病例等教学创新,能够使学生人际交往能力、合作能力、思考质量、思维创造性、思维迭代性和思维辩证性等在不同程度上得到提升。生化课程育人的效果具有长效性,能够对学生长远的认知方式和生活方式产生良性变化。由此,借助科学的育人评价量规,教师能够及时知晓教学效果,促进教学决策的进一步优化。

关键词： TCA思政模式量规体系量化评价质性评价思考力合作力鉴别力敬畏心

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细胞与分子基础实验课程“情景式”教学模式探索

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生物学杂志 2025年第2期 112-117页

作者：钱美睿缪金林黄婉陈志南蒋建利空军军医大学基础医学院细胞生物学教研室国家分子医学转化中心

细胞与分子基础整合课程开设配套实验课程目的是提高学生对所学重难点的融会贯通和对实践能力的灵活应用，培养学生提出问题和解决问题的创新科研思维。文章分析该课程实验教学现状，包括教学方式模式化、教学内容冗余且连续性差、实验... 详细信息

细胞与分子基础整合课程开设配套实验课程目的是提高学生对所学重难点的融会贯通和对实践能力的灵活应用，培养学生提出问题和解决问题的创新科研思维。文章分析该课程实验教学现状，包括教学方式模式化、教学内容冗余且连续性差、实验内容陈旧以及教学效果评价维度单一等问题，并从课程设计，实验内容和考核目标3个方面探讨具体的实验教学改革实践，按照新时代背景下高校大学生创新创业能力培养，以临床病例为导向进行“情景式”实验课教学设计；基于科研思维培养教学模式重构实验内容；以科研思维为主、实验技能为辅建立多重维度考核方式，提升教学设计的实效性和创新性，促进细胞与分子基础课程建设，有效培养学生创新科研思维和科研素养，为培养具有科研创新精神和实践能力的医学人才提供新的思路和实践依据。

关键词：细胞与分子基础实验教学改革实践 “情景式”实验课教学设计创新科研思维

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印记基因簇Dlk1-Dio3：揭示非酒精性脂肪性肝病发病机制的新视角

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中国生物化学与分子生物学报 2025年

作者：肖思嘉郑永霞王文喜浙江工业大学药学院药物制剂系嘉兴大学医学院生物化学与分子生物学教研室

非酒精性脂肪肝（nonalcoholic fatty liver disease， NAFLD）是全球日益严重的慢性肝病，其发病机制复杂，诊断和治疗面临诸多挑战。近年来，全基因组研究揭示了表观遗传修饰在NAFLD发生中的重要作用，尤其是印记基因的参与。NAFLD的... 详细信息

非酒精性脂肪肝（nonalcoholic fatty liver disease， NAFLD）是全球日益严重的慢性肝病，其发病机制复杂，诊断和治疗面临诸多挑战。近年来，全基因组研究揭示了表观遗传修饰在NAFLD发生中的重要作用，尤其是印记基因的参与。NAFLD的亲本来源效应表明，印记基因在其发病过程中发挥关键作用。Dlk1-Dio3基因簇作为最大的印记基因簇之一，因其在胚胎发育和代谢调控中的核心作用，成为研究的重点。本综述探讨了Dlk1-Dio3基因簇的结构与功能，及其在NAFLD发病中的潜在作用。该基因簇通过复杂的调控网络影响肝的脂代谢、糖代谢、炎症反应和氧化应激等生物过程，在NAFLD的“二次打击”中发挥关键作用。具体而言，DLK1作为负调控因子，抑制脂肪细胞分化，从而减少肝的脂质积累；而DIO3则通过调节甲状腺激素转化促进脂肪细胞分化，增加肝的脂质积聚。此外，Dlk1-Dio3基因簇通过调控多个microRNA（例如miR-370、miR-122等）调控脂肪代谢。miR-370通过抑制CPT1α加剧脂肪积聚；miR-122上调SREBP-1c，促进脂肪酸合成；miR-379/410簇则通过降低脂质清除能力，增加脂肪积累。长非编码RNA MEG3也在NAFLD中发挥重要作用。MEG3通过上调SIRT6促进脂肪酸氧化，减少脂滴堆积；并通过结合miR-21抑制Wnt/mTOR信号通路，减轻脂质合成。在胰岛素抵抗方面，DLK1通过激活PI3K/Akt/mTOR通路抑制糖异生并促进脂肪酸氧化，从而减轻肝的脂肪负担。DIO3则通过调节甲状腺激素影响胰岛素敏感性，促进NAFLD的发展。同时，Dlk1-Dio3基因簇在调控氧化应激和炎症反应中也具有重要作用，DLK1通过抑制炎症因子表达和激活抗氧化信号，减轻肝的氧化应激损伤。综上所述，Dlk1-Dio3基因簇在NAFLD的发生与发展中扮演着多维度的角色，提供了潜在的生物标志物和治疗靶点。

关键词：非酒精性脂肪肝 Dlk1-Dio3簇印记基因

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高糖抑制蛋白KIAA0753和CCSAP表达并通过钙信号阻断小鼠胚胎成骨细胞前体细胞MC3T3-E1的成骨分化

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中国药理学通报 2025年第3期41卷 456-465页

作者：王吉春钱正霞李梦雪汪长东重庆医科大学基础医学院分子医学与肿瘤研究中心重庆400016 重庆医科大学生物化学与分子生物学教研室重庆400016 重庆医科大学附属第一医院麻醉科重庆400016

目的探究高糖对蛋白KIAA0753和CCSAP的影响,以及高糖条件下KIAA0753和CCSAP与成骨分化以及钙信号通路三者之间的联系。方法利用5.5和25 mmol·L^(-1)葡萄糖浓度的成骨培养基诱导小鼠胚胎成骨细胞前体细胞(MC3T3-E1),通过Western blo... 详细信息

目的探究高糖对蛋白KIAA0753和CCSAP的影响,以及高糖条件下KIAA0753和CCSAP与成骨分化以及钙信号通路三者之间的联系。方法利用5.5和25 mmol·L^(-1)葡萄糖浓度的成骨培养基诱导小鼠胚胎成骨细胞前体细胞(MC3T3-E1),通过Western blot检测KIAA0753和CCSAP蛋白表达情况;转染过表达质粒进入人胚肾细胞(HEK-293T),免疫共沉淀检测蛋白KIAA0753和CCSAP相互作用;利用成骨培养基分别在不同葡萄糖浓度和不同诱导时间处理MC3T3-E1细胞,试剂盒检测碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性,Western blot检测KIAA0753、CCSAP、骨桥蛋白(osteopontin,OPN)、骨钙素(osteocalcin,OCN)等蛋白的表达情况,然后再设置5.5、25 mmol·L^(-1)和25 mmol·L^(-1)+OE-CCSAP组MC3T3-E1细胞,依次检测KIAA0753、OCN、OPN蛋白的表达情况以及ALP活性;利用高通量基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中糖尿病鼠模型数据集筛选差异基因进行生物信息学分析;对MC3T3-E1细胞分别设置5.5、25 mmol·L^(-1)和25 mmol·L^(-1)+OE-KIAA0753组,Western blot检测钙离子-钙调蛋白依赖性蛋白激酶Ⅱ(calcium/calmodulin-dependent protein kinaseⅡbeta,CAMK2B)、受磷蛋白(phospholamban,PLN)蛋白的表达。结果与5.5 mmol·L^(-1)组相比,25 mmol·L^(-1)抑制成骨细胞中KIAA0753和CCSAP蛋白表达,且蛋白KIAA0753和CCSAP存在相互作用。同时25 mmol·L^(-1)也抑制成骨细胞ALP、OPN、OCN蛋白表达,在25 mmol·L^(-1)的条件下过表达CCSAP上调KIAA0753、OCN、OPN、ALP的表达。糖尿病鼠模型的差异基因主要富集在“信号受体、信号调控”等方面。25 mmol·L^(-1)葡萄糖抑制成骨细胞中CAMK2B、PLN蛋白的表达,且在25 mmol·L^(-1)的条件下过表达KIAA0753上调CAMK2B、PLN蛋白的表达。结论高糖抑制KIAA0753和CCSAP蛋白表达,抑制小鼠胚胎成骨细胞前体细胞成骨分化和钙信号传导,过表达CCSAP挽救高糖对成骨分化的抑制作用以及过表达KIAA0753逆转高糖对钙信号通路的抑制作用。

关键词：糖尿病 KIAA0753 CCSAP 蛋白相互作用成骨分化钙信号

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基于专业视角探索医学生物化学课程建设

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基础医学教育 2025年第1期27卷 33-37页

作者：王淑静黄冬梅屈小亚厦门医学院基础医学部生物化学与分子生物学教研室厦门361023

生物化学是临床医学专业重要的专业基础课。其课程建设是以专业培养目标为依据,遵循临床医学专业发展和课程本身知识体系内容特点。文章基于专业、教师、学生三个主体,知识、技能、素养三个目标,课前、课中、课后三个时段,实验、科研、... 详细信息

生物化学是临床医学专业重要的专业基础课。其课程建设是以专业培养目标为依据,遵循临床医学专业发展和课程本身知识体系内容特点。文章基于专业、教师、学生三个主体,知识、技能、素养三个目标,课前、课中、课后三个时段,实验、科研、临床三个环节,形成性评价、终结性评价、思政性评价三个体系,对生物化学课程教学目标、教学内容、教学方法、教学模式系统谋划,多角度、多渠道、全方位构建课程教育体系,有助于实现临床医学专业人才培养。

关键词：生物化学教学改革专业建设课程建设临床医学人才培养

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TRIM24蛋白在人肾透明细胞癌组织中的表达及其临床意义

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吉林大学学报(医学版) 2025年第2期51卷 486-492页

作者：耿海营于焱代春美温有锋李宁锦州医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室沈阳医学院病理学与病理生理学教研室锦州医科大学生命科学院药物研究所锦州医科大学生命科学院生物人类学研究所沈阳医学院辽宁省人类族群特异性及重要疾病表型组学重点实验室沈阳医学院沈阳市表型组学研究重点实验室沈阳医学院生物化学与分子生物学教研室

目的:探讨三重基序蛋白24 (TRIM24)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达,阐明TRIM24蛋白与ccRCC患者临床病理特征和预后的关联。方法:选取术前均未行放化疗的90例ccRCC患者的癌组织和癌旁正常组织。采用组织芯片技术和免疫组织化学法检测... 详细信息

目的:探讨三重基序蛋白24 (TRIM24)在肾透明细胞癌(ccRCC)组织中的表达,阐明TRIM24蛋白与ccRCC患者临床病理特征和预后的关联。方法:选取术前均未行放化疗的90例ccRCC患者的癌组织和癌旁正常组织。采用组织芯片技术和免疫组织化学法检测ccRCC组织中TRIM24蛋白表达水平,分析ccRCC组织与癌旁正常组织中TRIM24蛋白表达水平的差异。计算TRIM24蛋白表达评分及其平均值,并根据平均值将ccRCC患者分为TRIM24蛋白低表达组和TRIM24蛋白高表达组;分析TRIM24蛋白表达水平与患者不同临床病理特征之间的关联,分析TRIM24蛋白表达水平与患者预后之间的关系。结果:免疫组织化学法,TRIM24蛋白在ccRCC患者癌组织细胞核和细胞质中均有表达,且癌组织中TRIM24蛋白表达水平与癌旁正常组织比较差异均有统计学意义(P<0.05);ccRCC组织细胞核中TRIM24蛋白表达水平与患者年龄、性别和肿瘤大小有关联(P<0.05);KaplanMeier生存分析,TRIM24蛋白在ccRCC组织细胞质中高表达、年龄大和病理分级高的患者总生存期短于TRIM24蛋白低表达、年龄小和病理分级低的患者(P<0.05);多因素Cox回归分析,与TRIM24蛋白低表达和病理分级低的患者比较,ccRCC组织细胞质中TRIM24蛋白高表达和病理分级高的患者预后较差(P<0.05)。结论:ccRCC癌组织的细胞质中TRIM24高表达和病理分级高的患者术后生存率较低,预后较差。

关键词：肾透明细胞癌三重基序蛋白24 免疫组织化学病理分级预后

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