检索结果-内蒙古大学图书馆

黑龙江畜牧兽医 2023年第12期 130-136,148页

作者：刘嘉伟陈红王淼贾小东方翟韩春梅塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300

为了探究损伤鹿茸的快速修复生长机制,挖掘与修复生长相关的候选基因,试验首先采集塔里木马鹿损伤后修复53 d(损伤组)与正常生长53 d(正常组)的茸组织,提取总RNA后,基于Illumi-na Nova Seq 6000高通量测序平台进行转录组测序,将过滤后... 详细信息

为了探究损伤鹿茸的快速修复生长机制,挖掘与修复生长相关的候选基因,试验首先采集塔里木马鹿损伤后修复53 d(损伤组)与正常生长53 d(正常组)的茸组织,提取总RNA后,基于Illumi-na Nova Seq 6000高通量测序平台进行转录组测序,将过滤后序列与参考基因组的序列比对后筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);然后对DEGs进行GO功能富集分析与KEGG信号通路富集分析;最后随机选取4个DEGs(IHH、IL2RA、BVES和LOC122686105基因)进行实时荧光定量PCR分析,验证转录组测序结果的可靠性。结果表明:损伤组与正常组之间存在56个DEGs;与正常组比较,损伤组有37个DEGs显著上调(|lb Fold Change|≥1,P<0.05),包括IHH、IL2RA、BVES、Wnt5b、COL9A2、CRMP5等,有19个DEGs显著下调(|lb Fold Change|≥1,P<0.05),包括LOC122686105、ALX3、VWF等;损伤组有23个显著上调(P<0.05)的GO二级条目,包括生物过程(biological process,BP)中的19个GO二级条目[骨骼系统发育(GO:0001501)、软骨发育(GO:0051216)等]、细胞成分(cellular component,CC)中的2个GO二级条目[肌纤维膜(GO:00042383)、闰盘(GO:0014704)]和分子功能(molecular function,MF)中的2个GO二级条目[蛋白结合(GO:0005515)、相同蛋白质结合(GO:0042802)],以及8个显著下调(P<0.05)的GO二级条目,包括BP中的7个二级条目[细胞外区域(GO:0005576)、化学稳态(GO:0048878)、骨骼生长(GO:0098868)等]和CC中的1个二级条目[蛋白的N端结合(GO:0047485)];损伤组有13条显著上调(P<0.05)的KEGG信号通路,包括Hedgehog信号通路、Wnt信号通路、类固醇的生物合成等,有9条显著下调(P<0.05)的KEGG信号通路,包括维生素的消化吸收、胆固醇代谢和PPAR信号通路等。在56个DEGs中,与鹿茸修复生长相关的候选基因有IHH、IL2RA、Wnt5b、COL9A2、CRMP5。经实时荧光定量PCR分析发现,与正常组比较,损伤组中IHH、IL2RA、BVES基因显著上调表达(P<0.05),LOC122686105基因显著下调表达(P<0.05),与DEGs定量结果变化趋势一致,转录组测序结果可靠。说明损伤状态会促进鹿茸骨骼系统与软骨的发育,IHH、IL2RA、Wnt5b、COL9A2、CRMP5等基因可能对损伤后鹿茸的快速修复生长起着直接或间接的作用。

关键词：塔里木马鹿鹿茸组织损伤修复转录组测序差异表达基因(DEGs)

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鸡源人葡萄球菌的分离鉴定及生物学特性分析

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中国家禽 2023年第3期45卷 52-58页

作者：张家浩邢潇月李虎刘祥杰杨睿智李莲瑞塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300

为确定新疆阿克苏地区某鸡场鸡精神不振、采食量减少和死亡的原因,试验对采集自该鸡场病死鸡内脏器官进行病原的分离鉴定,并进行动物致病性试验和药物敏感性试验,分析其致病力和耐药性。结果显示,从发病鸡内脏器官中分离到一株革兰氏阳... 详细信息

为确定新疆阿克苏地区某鸡场鸡精神不振、采食量减少和死亡的原因,试验对采集自该鸡场病死鸡内脏器官进行病原的分离鉴定,并进行动物致病性试验和药物敏感性试验,分析其致病力和耐药性。结果显示,从发病鸡内脏器官中分离到一株革兰氏阳性球菌,分离菌对复方新诺明、麦迪霉素、红霉素、诺氟沙星、环丙沙星、阿莫西林、青霉素、克林霉素、氨苄西林等药物表现为耐药,对部分头孢类、四环素类、氨基糖苷类、氯霉素类和多肽类药物表现为不同程度敏感;通过对分离菌进行形态学观察、生化试验、16S rRNA基因测序和同源性分析,确定该分离菌为人葡萄球菌。该分离菌可引起小鼠和雏鸡死亡,死亡雏鸡以肝脏肿大出血、胃黏膜出血等内脏器官出血为主要病理变化,与自然发病一致。研究首次在鸡上分离出人葡萄球菌,为鸡的人葡萄球菌病防治和合理用药提供依据。

关键词：人葡萄球菌耐药性分析分离与鉴定 16S rRNA 鸡源

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蛋白桑饲料加工技术及其在畜牧业中应用的研究进展

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饲料研究 2024年第6期47卷 132-136页

作者：刘书瑞邵奎元贾亚磊周小玲刘利林塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆戈壁屯田生态农业专业合作社新疆昆玉848100

蛋白桑是通过人工筛选和杂交培育出的新型桑树品种,已被定义为功能性饲料。蛋白桑蛋白质含量高、氨基酸含量丰富、适口性好,具有潜在的生态价值和饲料价值,开发前景十分广阔。相比鲜喂和干草饲喂,蛋白桑青贮存在很大优势。随着蛋白桑青... 详细信息

蛋白桑是通过人工筛选和杂交培育出的新型桑树品种,已被定义为功能性饲料。蛋白桑蛋白质含量高、氨基酸含量丰富、适口性好,具有潜在的生态价值和饲料价值,开发前景十分广阔。相比鲜喂和干草饲喂,蛋白桑青贮存在很大优势。随着蛋白桑青贮加工工艺逐步完善,研究发现在青贮中添加一些饲料添加剂如糖类、菌制剂、酶制剂等能够获得更好的青贮效果。蛋白桑能够提高动物的生长性能、机体免疫力及抗氧化功能,改善肉品质和蛋品质。文章综述了蛋白桑的营养价值、加工技术及其在动物饲料中的应用,为蛋白桑在畜牧业中的应用研究提供参考。

关键词：蛋白桑饲料畜牧业

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多浪羊GnRHR基因克隆、初情期组织表达研究及生物信息学分析

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中国畜牧杂志 2022年第6期58卷 149-154页

作者：张继虎隋志远李庆瑾张志帅邢凤塔里木大学动物科学学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

本研究旨在克隆多浪羊GnRHR(Gonadotropin Releasing Hormone Receptor,GnRHR)基因编码区,并用得到的CDS序列进行生物信息学分析,同时测定与繁殖相关组织中GnRHR基因的表达情况。利用RT-PCR和TA克隆的方法获得多浪羊GnRHR基因的编码区域... 详细信息

本研究旨在克隆多浪羊GnRHR(Gonadotropin Releasing Hormone Receptor,GnRHR)基因编码区,并用得到的CDS序列进行生物信息学分析,同时测定与繁殖相关组织中GnRHR基因的表达情况。利用RT-PCR和TA克隆的方法获得多浪羊GnRHR基因的编码区域,采用实时荧光定量PCR方法检测GnRHR基因在多浪羊初情期前、初情期和初情期后下丘脑、垂体、子宫、卵巢和输卵管5种组织的表达情况。本研究成功克隆获得多浪羊GnRHR基因编码区域。多浪羊GnRHR基因CDS序列长987 bp,编码328个氨基酸,与绵羊的同源性最高;对该序列进行生物信息学分析显示该蛋白分子式为C_(1762)H_(2696)N_(432)O_(446)S_(20);理论等电点(pI)为9.39;不稳定指数为32.51,为稳定疏水性蛋白;具有7个跨膜区域;二级结构主要为α-螺旋及无规则卷曲。荧光定量PCR检测到多浪羊GnRHR基因在初情期及初情期前后3个时期5种组织均有表达,垂体和卵巢高表达;初情期时垂体相对表达量极显著高于初情期前及初情期后。本研究结果为进一步深入了解GnRHR基因在绵羊初情期启动过程中发挥的作用及其具体功能提供依据。

关键词：多浪羊 GnRHR 克隆组织表达生物信息学分析

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阿克苏地区集约化奶牛场小肠结肠炎耶尔森菌污染情况调查

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塔里木大学学报 2024年第3期36卷 30-35页

作者：候梦哲李雪娇郝斌黎双邢潇月李莲瑞塔里木大学动物科学与技术学院/塔里木畜牧科技兵团重点实验室/新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300

小肠结肠炎耶尔森菌为嗜冷菌,能够在低温、低氧的环境下生存,是一类食源性病原体,能够感染人及多种动物。本研究旨在了解新疆阿克苏地区部分集约化奶牛场小肠结肠炎耶尔森菌污染情况,在2022年期间采集阿克苏地区部分奶牛养殖场奶牛粪便... 详细信息

小肠结肠炎耶尔森菌为嗜冷菌,能够在低温、低氧的环境下生存,是一类食源性病原体,能够感染人及多种动物。本研究旨在了解新疆阿克苏地区部分集约化奶牛场小肠结肠炎耶尔森菌污染情况,在2022年期间采集阿克苏地区部分奶牛养殖场奶牛粪便、原料乳、饲草、采乳设备、环境样品,共计240份。采用形态学观察、生化鉴定、分子生物学的方法对小肠结肠炎耶尔森菌进行分离与鉴定。结果表明共分离出23株小肠结肠炎耶尔森菌,3个县市均分离出该菌,且分离率相近,均约为9%。本试验能为阿克苏地区部分集约化奶牛场小肠结肠炎耶尔森菌的防治、杀灭提供理论依据和参考价值。

关键词：小肠结肠炎耶尔森菌污染调查奶牛

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多浪羊CNP基因克隆及其在初情期组织表达特性分析

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中国畜牧兽医 2022年第4期49卷 1402-1412页

作者：张志帅隋志远张继虎李庆瑾邢凤塔里木大学动物科学学院阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300

【目的】克隆多浪羊C型利钠肽(CNP)基因,并进行生物信息学分析,探讨其在多浪羊初情期启动前后下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中的表达规律,以期为研究CNP基因在多浪羊初情期启动过程中的作用机制提供参考。【方法】参考GeneBank中绵... 详细信息

【目的】克隆多浪羊C型利钠肽(CNP)基因,并进行生物信息学分析,探讨其在多浪羊初情期启动前后下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中的表达规律,以期为研究CNP基因在多浪羊初情期启动过程中的作用机制提供参考。【方法】参考GeneBank中绵羊CNP基因的序列(登录号:XM_027974523.1)设计引物,以初情期前、初情期、初情期后的多浪羊为试验对象,采用RT-PCR技术扩增多浪羊CNP基因并进行克隆测序;用DNAMAN软件同其他物种进行相似性比对,并使用Mega 5.0构建系统发育树。用生物信息学软件分析CNP基因的核苷酸序列及其编码蛋白的疏水性、信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域等理化性质和二级结构、三级结构信息;用实时荧光定量PCR技术检测多浪羊下丘脑、垂体、输卵管、卵巢、子宫中CNP基因的表达量。【结果】多浪羊CNP基因序列大小为2227 bp,其中包括5′-UTR 50 bp、3′-UTR 914 bp和CDS区1263 bp。相似性比对和系统发育树结果显示,多浪羊与山羊的亲缘关系最近,与鸡的亲缘关系最远;多浪羊CNP基因共编码420个氨基酸,其编码蛋白是亲水性蛋白质,无跨膜结构域和信号肽。多浪羊CNP蛋白的二级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲;三级结构预测显示CNP蛋白无配体结构;实时荧光定量PCR结果显示,在初情期启动的3个发育阶段,下丘脑中CNP基因表达量显著高于其他组织(P<0.05);初情期下丘脑中CNP基因的表达量显著低于初情期前(P<0.05);子宫中初情期前CNP基因的表达量显著高于初情期和初情期后(P<0.05)。【结论】本研究成功克隆了多浪羊CNP基因,其主要在下丘脑和子宫中表达;在初情期前、初情期、初情期后的发育过程中,下丘脑组织中CNP基因的表达量先降低再升高,提示CNP基因可能在初情期的启动过程中参与调控。

关键词：多浪羊 C型利钠肽基因克隆

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OXT基因在策勒黑羊卵巢不同生理时期的表达差异及生物信息学分析

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中国畜牧杂志 2023年第12期59卷 212-218页

作者：周稳韩志鹏白新宇张璐璐王彩军王权锋杨建礼马正委佐建明刘书东刘春洁塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 和田地区津垦牧业科技有限公司新疆策勒848300

本研究旨在通过分析OXT基因的生物信息功能及其在策勒黑羊卵巢组织不同生理时期的表达量,为其在绵羊卵泡发育过程中调控功能的研究奠定基础。根据绵羊OXT基因序列,设计特异性引物,用MEGA5.1软件构建OXT蛋白的系统进化树,并通过生物信息... 详细信息

本研究旨在通过分析OXT基因的生物信息功能及其在策勒黑羊卵巢组织不同生理时期的表达量,为其在绵羊卵泡发育过程中调控功能的研究奠定基础。根据绵羊OXT基因序列,设计特异性引物,用MEGA5.1软件构建OXT蛋白的系统进化树,并通过生物信息学软件预测该蛋白理化性质、结构以及亚细胞定位和蛋白互作,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测策勒黑羊卵泡期、黄体期以及妊娠早期卵巢组织中OXT基因表达量。生物信息学分析发现,策勒黑羊OXT基因CDS区序列全长为378 bp,编码126个氨基酸,没有CpG岛,理论等电位为5.54,OXT蛋白是不稳定的疏水性蛋白,相对保守的神经垂体肽激素,其存在1个跨膜结构域和1个信号肽。OXT蛋白定位于细胞外,在细胞核和线粒体中也有表达,可与GNRH1、POMC、TRH、AVP、CRH、PRL、LNPEH等蛋白发生互作。qRT-PCR结果显示,OXT基因在策勒黑羊黄体期卵巢中的表达量极显著高于卵泡期和妊娠早期,且妊娠早期OXT基因表达量显著高于卵泡期,说明OXT基因在绵羊卵泡发育方面发挥重要作用。本研究结果为研究OXT基因表达和促进优势化卵泡生长及排卵作用机制奠定基础,并为解析策勒黑羊常年发情提供分子生物学参考。

关键词：策勒黑羊 OXT基因生物信息学

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葡萄籽原花青素对多浪羊精液常温保存效果的研究

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中国畜牧杂志 2022年第11期58卷 170-175页

作者：郝文晏航吴启辉王惠娥塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

为研究葡萄籽原花青素(GSPs)对多浪羊精液常温保存效果的影响,本实验采用电刺激采精法收集18月龄健康多浪羊公羊精液,在基础稀释液中添加0(对照组)、0.01、0.03,0.05、0.07、0.09、0.12、0.14g/LGSPs作为稀释液进行常温(18℃)保存,每隔... 详细信息

为研究葡萄籽原花青素(GSPs)对多浪羊精液常温保存效果的影响,本实验采用电刺激采精法收集18月龄健康多浪羊公羊精液,在基础稀释液中添加0(对照组)、0.01、0.03,0.05、0.07、0.09、0.12、0.14g/LGSPs作为稀释液进行常温(18℃)保存,每隔24h检测精子存活率、活力、畸形率、顶体完整性和质膜破损率等指标,在保存24、72、120 h时检测总抗氧化能力(T-AOC)活性和丙二醛(MDA)含量。结果显示:添加0.05~0.14 g/L GSPs可提高多浪羊精子活率、活力、质膜破损率、顶体完整率和T-AOC活性(P<0.05),极显著降低(P<0.05)精子畸形率和MDA含量,其中以0.09 g/L GSPs为最佳,精液有效保存时间为120 h。120 h时0.09 g/L GSPs组多浪羊精子活率、活力、质膜破损率、顶体完整率和T-AOC活性分别为80.21%、70.49%、30.75%、67.4%和2.12 U/mL,精子畸形率和MDA含量为20.36%和1.90 nmol/mL。本实验条件下,葡萄籽原花青素能有效提高多浪羊精液常温保存效果,最适添加浓度为0.09 g/L。

关键词：多浪羊精液常温保存葡萄籽原花青素精液品质

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甜高粱与苜蓿不同比例混贮对卡拉库尔羊瘤胃中微生物的影响

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饲料研究 2022年第21期45卷 1-7页

作者：陈凤柏梁耀马艳王娇董宇杨宝钰张苏江塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

试验旨在探究甜高粱与苜蓿不同比例混贮对卡拉库尔羊瘤胃中的4种细菌、4种真菌和7种原虫的影响。试验选择30只体重为(25.95±1.37) kg、健康的4月龄卡拉库尔羊,随机分成5组,每组6个重复,每个重复1只羊。SS-AF-Ⅰ组(甜高粱100%)、SS-... 详细信息

试验旨在探究甜高粱与苜蓿不同比例混贮对卡拉库尔羊瘤胃中的4种细菌、4种真菌和7种原虫的影响。试验选择30只体重为(25.95±1.37) kg、健康的4月龄卡拉库尔羊,随机分成5组,每组6个重复,每个重复1只羊。SS-AF-Ⅰ组(甜高粱100%)、SS-AF-Ⅱ组(甜高粱80%,苜蓿20%)、SS-AF-Ⅲ组(甜高粱60%,苜蓿40%)、SS-AF-Ⅳ组(甜高粱40%,苜蓿60%)、SS-AF-Ⅴ组(甜高粱20%,苜蓿80%)。预试期15 d,正式试验期75 d。饲养试验结束后,每组随机选择3只羊采取瘤胃液,运用实时荧光定量PCR技术探究瘤胃菌群的变化。结果显示:SS-AF-Ⅱ组羊瘤胃中的产琥珀酸丝状杆菌、黄色瘤胃球菌的菌群丰度显著高于其他各组(P<0.05);SS-AF-Ⅳ组白色瘤胃球菌、溶纤维丁酸弧菌的菌群丰度显著高于其他各组(P<0.05);SS-AF-Ⅴ组产琥珀酸丝状杆菌、白色瘤胃球菌的丰度显著低于其他各组(P<0.05)。SS-AF-Ⅴ组木聚糖酶菌、新丽鞭毛菌、奥式霉菌、盲肠鞭毛菌的丰度显著高于其他各组(P<0.05);SS-AF-Ⅰ组木聚糖酶菌、新丽鞭毛菌、奥式霉菌、盲肠鞭毛菌的丰度显著低于其他各组(P<0.05)。SS-AF-Ⅴ组内毛虫、双叶内毛虫、无尾内毛虫、双毛虫的丰度显著高于其他各组(P<0.05);SS-AF-Ⅰ组内毛虫、双叶内毛虫、无尾前毛虫、双毛虫的丰度显著高于其他各组(P<0.05);SS-AF-Ⅰ组尾刺内毛虫、双凹内毛虫、 Entodinium chattenjeei的丰度显著高于SS-AF-Ⅱ组(P<0.05)。研究表明,SS-AF-Ⅳ组的日粮能够有效提高卡拉库尔羊瘤胃中降解纤维素菌群的数量,改善瘤胃微生物的菌群结构。

关键词：甜高粱苜蓿卡拉库尔羊混合青贮瘤胃微生物

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基于高通量转录组测序的斑重唇鱼SSR分布及序列特征分析

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南方农业学报 2023年第3期54卷 806-814页

作者：葛锐强壮聂竹兰李丽魏杰塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地新疆阿拉尔843300 塔里木珍稀鱼类研究中心新疆阿拉尔843300

【目的】基于高通量转录组测序分析斑重唇鱼SSR分布及序列特征,为斑重唇鱼SSR分子标记开发、遗传多样性、遗传连锁图谱、种质资源鉴定和分子辅助育种提供理论数据。【方法】使用Illumina NovaSeq高通量测序平台对斑重唇鱼皮肤组织进行... 详细信息

【目的】基于高通量转录组测序分析斑重唇鱼SSR分布及序列特征,为斑重唇鱼SSR分子标记开发、遗传多样性、遗传连锁图谱、种质资源鉴定和分子辅助育种提供理论数据。【方法】使用Illumina NovaSeq高通量测序平台对斑重唇鱼皮肤组织进行转录组测序,利用Trinity对获得的高质量测序数据进行序列组装,再用MISA对筛选得到的1 kb以上的Unigenes进行SSR分布及序列特征分析。【结果】斑重唇鱼转录组共获得244.42 Gb Cleandata,组装后获得55182条Unigenes,其中8903条Unigenes含有SSR位点,含有SSR的Unigenes比例为16.13%,共含有12899个SSR位点,从中除去616个复合型SSR位点,共获得12283个完美型SSR位点,存在单核苷酸~六核苷酸6种重复基元类型,其中单核苷酸重复基元数目最多,为6654个,占比为54.17%,二核苷酸~六核苷酸随着核苷酸重复数的增多依次减少,分别是32.30%、12.04%、1.38%、0.07%和0.03%。斑重唇转录组中共有348种不同重复基元,其中最丰富、种类最多的是三核苷酸重复基元,共有145种;单核苷酸是数量最多重复基元类型,其重复基元数量最多的是(A)10型。SSR的长度范围较大,为10~75 bp,总长度为157088 bp,SSR相对丰度为0.19%,其中长度为10 bp的SSR数量最多,有3232个,占比为26.31%;其次是12、11和14 bp,占比分别为21.73%、12.02%和10.06%。【结论】斑重唇鱼转录组中SSR位点数量多,出现频率较高,多态性较好,可用来开发斑重唇鱼类分子标记,且不同核苷酸重复基元类型数量差异较大,且分布特征差异明显。

关键词：斑重唇鱼转录组测序 SSR 序列特征重复基元

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