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现代畜牧兽医 2024年第9期 1-5页

作者：刘淑华李超群梁樊鑫陈鑫候梦哲李莲瑞塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300

为了解新疆地区某猪场猪嗜血支原体的感染情况,试验采集新疆地区某猪场保育仔猪的抗凝血200份,采用血液压片、血涂片瑞氏染色镜检和普通PCR方法检测猪嗜血支原体,并利用猪嗜血支原体16SrRNA基因引物,以血液DNA为模板,扩增、克隆、鉴定... 详细信息

为了解新疆地区某猪场猪嗜血支原体的感染情况,试验采集新疆地区某猪场保育仔猪的抗凝血200份,采用血液压片、血涂片瑞氏染色镜检和普通PCR方法检测猪嗜血支原体,并利用猪嗜血支原体16SrRNA基因引物,以血液DNA为模板,扩增、克隆、鉴定后送测序,进行同源性比对与遗传进化分析。结果显示,经血液压片、血液涂片及PCR检测共检出58份猪嗜血支原体阳性样本;以猪嗜血支原体16SrRNA基因引物、血液DNA为模板成功克隆猪嗜血支原体基因,命名为XJP1(已被Genbank收录,登录号:PP526316)。同源性比对与遗传进化分析结果显示,XJP1与猪嗜血支原体(登录号:KC907396)、猪嗜血支原体(登录号:HQ259257)为同一分支,亲缘关系较近,同源性为96.9%~99.6%。研究表明,该猪场保育猪感染了猪嗜血支原体,试验结果将为该猪场防控猪嗜血支原体感染以及该病的深入研究提供基础数据。

关键词：猪嗜血支原体 16SrRNA序列新疆地区

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草原革蜱中马泰勒虫的分子检测和进化分析

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中国兽医科学 2023年第11期53卷 1431-1436页

作者：罗金赵帅阳车丽妍苟梦扬王彦龙昝晓庆刁沛文任巧云刘光远中国农业科学院兰州兽医研究所动物疫病防控全国重点实验室甘肃兰州730046 塔里木大学动物科学学院新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 宁夏大学农学院宁夏银川750021

为厘清马泰勒虫的生物媒介及分子进化特征,对收集的新疆部分区域蜱进行基因组DNA提取,利用989/990引物对上述基因组进行梨形虫18S rRNA的PCR检测,并对阳性产物测序。利用MEGA 11.0软件包中的Alignment Explorer CLUSTAL X进行多序列比对... 详细信息

为厘清马泰勒虫的生物媒介及分子进化特征,对收集的新疆部分区域蜱进行基因组DNA提取,利用989/990引物对上述基因组进行梨形虫18S rRNA的PCR检测,并对阳性产物测序。利用MEGA 11.0软件包中的Alignment Explorer CLUSTAL X进行多序列比对,Bootstrap Test of Phylogeny模块下的NJ法构建马泰勒虫不同地理株的进化树。PCR检测结果显示,在收集的80只草原革蜱中有4只感染了马泰勒虫,感染率为5.00%。序列分析表明,马泰勒虫分为2个主要基因型,1个亚型。世界范围内流行的主要是Ⅰ型,Ⅱ型在南非以及苏丹等地流行。此次检测到的新疆马泰勒虫与国内四川株以及哈萨克斯坦、西班牙、沙特阿拉伯、爱尔兰分离株处于相同的进化分支,其基因型均隶属于Ⅰ型。同样的隶属于Ⅰ型的还存在1个亚型(Ⅰ-A),该基因亚型的虫株在肯尼亚和意大利均有分布。马泰勒虫18S rRNA基因V4变异区多序列比对表明,15位点Ⅱ型较Ⅰ型有A的缺失,而且在18~22位点处有TCGAG到ACAGT的突变,48位点处存在G到T的突变。上述研究表明,首次检测到草原革蜱中马泰勒虫的感染。而此次检测到的马泰勒虫隶属于马泰勒虫Ⅰ型,该基因型的马泰勒虫是世界主要流行虫株。

关键词：草原革蜱马泰勒虫 18S rRNA 分子检测进化分析

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基于高通量转录组测序的斑重唇鱼SSR分布及序列特征分析

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南方农业学报 2023年第3期54卷 806-814页

作者：葛锐强壮聂竹兰李丽魏杰塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室--省部共建国家重点实验室培育基地新疆阿拉尔843300 塔里木珍稀鱼类研究中心新疆阿拉尔843300

【目的】基于高通量转录组测序分析斑重唇鱼SSR分布及序列特征,为斑重唇鱼SSR分子标记开发、遗传多样性、遗传连锁图谱、种质资源鉴定和分子辅助育种提供理论数据。【方法】使用Illumina NovaSeq高通量测序平台对斑重唇鱼皮肤组织进行... 详细信息

【目的】基于高通量转录组测序分析斑重唇鱼SSR分布及序列特征,为斑重唇鱼SSR分子标记开发、遗传多样性、遗传连锁图谱、种质资源鉴定和分子辅助育种提供理论数据。【方法】使用Illumina NovaSeq高通量测序平台对斑重唇鱼皮肤组织进行转录组测序,利用Trinity对获得的高质量测序数据进行序列组装,再用MISA对筛选得到的1 kb以上的Unigenes进行SSR分布及序列特征分析。【结果】斑重唇鱼转录组共获得244.42 Gb Cleandata,组装后获得55182条Unigenes,其中8903条Unigenes含有SSR位点,含有SSR的Unigenes比例为16.13%,共含有12899个SSR位点,从中除去616个复合型SSR位点,共获得12283个完美型SSR位点,存在单核苷酸~六核苷酸6种重复基元类型,其中单核苷酸重复基元数目最多,为6654个,占比为54.17%,二核苷酸~六核苷酸随着核苷酸重复数的增多依次减少,分别是32.30%、12.04%、1.38%、0.07%和0.03%。斑重唇转录组中共有348种不同重复基元,其中最丰富、种类最多的是三核苷酸重复基元,共有145种;单核苷酸是数量最多重复基元类型,其重复基元数量最多的是(A)10型。SSR的长度范围较大,为10~75 bp,总长度为157088 bp,SSR相对丰度为0.19%,其中长度为10 bp的SSR数量最多,有3232个,占比为26.31%;其次是12、11和14 bp,占比分别为21.73%、12.02%和10.06%。【结论】斑重唇鱼转录组中SSR位点数量多,出现频率较高,多态性较好,可用来开发斑重唇鱼类分子标记,且不同核苷酸重复基元类型数量差异较大,且分布特征差异明显。

关键词：斑重唇鱼转录组测序 SSR 序列特征重复基元

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策勒黑羊X染色体多胎性状的关联分析

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黑龙江农业科学 2024年第3期 39-45页

作者：彭玉薇王尚龙王渊锋王权锋杨建礼马正委佐建明刘书东塔里木大学动物科学与技术学院/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 和田地区津垦牧业科技有限公司新疆策勒848300

为促进多胎性状策勒黑羊品种的培育,以策勒黑羊多胎性状和X染色体分子标记为对象,探究策勒黑羊多胎性状在X染色体上的遗传解析。选择100只策勒黑羊进行基因分型,利用PLINKv1.90进行质量控制,同时对X染色体上的SNP位点和策勒黑羊的多胎... 详细信息

为促进多胎性状策勒黑羊品种的培育,以策勒黑羊多胎性状和X染色体分子标记为对象,探究策勒黑羊多胎性状在X染色体上的遗传解析。选择100只策勒黑羊进行基因分型,利用PLINKv1.90进行质量控制,同时对X染色体上的SNP位点和策勒黑羊的多胎性状进行关联分析,选取P<0.01的SNP位点进行标记,将筛选出的SNP位点附近的基因进行注释和分析,获得X染色体多胎性的候选基因。结果表明,有14个SNPs与策勒黑羊X染色体多胎性状在全基因组范围内显著相关。共筛选出20个候选基因,对20个候选基因进行生物学功能分析,多胎性状相关联的候选基因6个,其中,FTH1基因已有文献报道是多胎性状的候选基因。

关键词：策勒黑羊多胎性状 X染色体候选基因

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多浪羊POMC基因克隆及其在初情期不同组织中的表达研究

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四川农业大学学报 2021年第5期39卷 646-651页

作者：李庆瑾隋志远张继虎张志帅高庆华邢凤塔里木大学动物科学学院/新疆生产建设塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】研究POMC基因在绵羊初情期时不同组织的表达水平及规律。【方法】对多浪羊进行初情期发情鉴定,采集初情期下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫、脾、肺、肾和大脑9种组织,提取其组织RNA,对POMC基因进行cDNA克隆和组织表达分析;对... 详细信息

【目的】研究POMC基因在绵羊初情期时不同组织的表达水平及规律。【方法】对多浪羊进行初情期发情鉴定,采集初情期下丘脑、垂体、卵巢、输卵管、子宫、脾、肺、肾和大脑9种组织,提取其组织RNA,对POMC基因进行cDNA克隆和组织表达分析;对多浪羊POMC氨基酸与其他物种POMC氨基酸序列进行比较,制作系统发育树;应用qPCR技术检测POMC基因在下丘脑、垂体、卵巢、输卵管和子宫5种组织中的表达水平。【结果】获得多浪羊POMC基因两条cDNA序列,长度分别为1 078、1 108 bp,两条cDNA序列编码区(CDS)相同,均为792 bp,编码263个氨基酸。同源性比对分析得出多浪羊POMC氨基酸序列与绵羊、牛、山羊的同源性分别为99.62%、96.6%、96.3%,与猪、马、人的同源性分别为89.51%、83.08%、79.78%。qPCR和组织表达谱分析结果表明POMC基因在9种组织均有表达,其中在垂体和下丘脑中表达量比较高,显著高于其他组织(P<0.05)。【结论】试验结果对于进一步探索POMC基因与绵羊初情期之间的关系提供了理论依据。

关键词：多浪羊 POMC基因初情期基因克隆

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超微量DNA模板扩增鉴定绵羊早期胚胎性别体系优化

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中国畜牧杂志 2022年第2期58卷 97-101页

作者：陶维昆黄飞刘波赵建清方翟高庆华新疆塔里木大学动物科学学院新疆阿拉尔843300 新疆塔里木大学生命科学学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

本实验旨在运用超微量胚胎DNA模板扩增SRY基因鉴定绵羊早期胚胎性别PCR体系和方法优化。根据绵羊Y染色体性别决定SRY基因的723 bp的保守序列设计引物,析因法建立巢式PCR体系,联合扩增SRY和GAPDH基因,经绵羊静脉血液和胚胎超微量DNA样本... 详细信息

本实验旨在运用超微量胚胎DNA模板扩增SRY基因鉴定绵羊早期胚胎性别PCR体系和方法优化。根据绵羊Y染色体性别决定SRY基因的723 bp的保守序列设计引物,析因法建立巢式PCR体系,联合扩增SRY和GAPDH基因,经绵羊静脉血液和胚胎超微量DNA样本调整测试灵敏度后,切割40枚绵羊桑椹胚的少量胚细胞进行性别鉴定,并对PCR产物进行测序对比。结果显示:通过2%的琼脂糖电泳检测,除363 bp的GAPDH基因扩增条带公母羊皆出现外,只有公羊出现209 bp的雄性特异扩增条带。本实验建立的绵羊早期胚胎性别鉴定方法体系灵敏度可以达到约10 pg(3~4个细胞),对胚胎进行性别鉴定的准确率为100%。

关键词： SRY基因超微量绵羊早期胚胎胚胎切割性别鉴定

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小鼠骨髓和鹿茸来源间充质干细胞基本生物学特征比较

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塔里木大学学报 2023年第3期35卷 12-17页

作者：张荠允方翟贾小东刘嘉伟侯正创韩春梅塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

为研究塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs)的生物学特征,本试验对来源于小鼠骨髓和塔里木马鹿茸的2种MSCs进行了体外培养,检测比较了其生长曲线;同时利用光学显微镜和透射电镜对细胞形态特征、结构、细胞器组成和数量进行观察对比。研究发... 详细信息

为研究塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs)的生物学特征,本试验对来源于小鼠骨髓和塔里木马鹿茸的2种MSCs进行了体外培养,检测比较了其生长曲线;同时利用光学显微镜和透射电镜对细胞形态特征、结构、细胞器组成和数量进行观察对比。研究发现鹿茸MSCs体外培养呈“S”形生长趋势,增殖速度极显著高于小鼠BMSCs(P<0.01)。鹿茸MSCs形态呈梭形,排列规律,形态均一;小鼠BMSCs形态不规则,呈三角形,多边形;鹿茸MSCs胞体、胞核面积分别为963.053μm^(2)和134.093μm^(2),极显著高于小鼠BMSCs的551.026μm^(2)和79.938μm^(2)(P<0.01);鹿茸MSCs的核质比为0.167,显著低于小鼠BMSCs的0.206(P<0.05);超微结果显示鹿茸MSCs胞体面积较大,细胞器种类简单,线粒体、内质网等细胞器形态具备早期幼稚细胞发育特征。塔里木马鹿茸MSCs增殖能力高于小鼠BMSCs,在开发利用方面具备更广泛的优势。

关键词：塔里木马鹿茸间充质干细胞(MSCs) 生物学特性超微结构

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食土奶牛和健康奶牛行为与饲粮、粪便、土壤和血液中矿物元素含量关系的比对研究

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畜牧与兽医 2022年第4期54卷 47-52页

作者：贾梦可李运杰吴建国李豫何昕潘洁谷豪帅钱文熙塔里木大学动物科学学院新疆阿拉尔843300 新疆天润沙河牧业有限公司新疆阿拉尔843015 新疆建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

试验旨在研究奶牛食土原因与饲粮、粪便、土壤和血液中矿物元素的关系。通过对食土奶牛进行观察和分组,按照产奶量、泌乳天数等条件分组,食土奶牛为试验组,正常奶牛为对照组,每组6头奶牛。采集饲粮、粪便及土壤样品,测定样本中微量元素... 详细信息

试验旨在研究奶牛食土原因与饲粮、粪便、土壤和血液中矿物元素的关系。通过对食土奶牛进行观察和分组,按照产奶量、泌乳天数等条件分组,食土奶牛为试验组,正常奶牛为对照组,每组6头奶牛。采集饲粮、粪便及土壤样品,测定样本中微量元素(Fe、Zn、Mn、Cu)、常量元素(K、Ca、Mg、P)和粗蛋白质(CP)的含量。结果表明:1)饲粮中P、Zn、Mn、Cu的含量能满足奶牛营养需要量,其中Zn、Cu显著高于营养需要量(P<0.05);Mg和CP显著低于奶牛营养需要量(P<0.05),K、Ca、Fe极显著低于奶牛营养需要量(P<0.01)。2)食土组土壤样品中K、Mg、Mn含量均低于对照组,差异不显著(P>0.05),Ca、Fe、Zn、Cu、P含量均高于对照组,差异不显著(P>0.05)。3)食土组奶牛粪便中各元素含量均高于对照组;其中K、Ca、Mg显著高于对照组(P<0.05)。4)血液中K、Fe、Zn、Cu元素含量均高于对照组;其中K和Fe显著高于对照组(P<0.05)。结论:奶牛饲粮中K、Ca、Mg、Fe和CP不能满足奶牛的营养需要量时可能会导致奶牛食土。

关键词：奶牛食土矿物元素微量元素

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山羊痘病毒036(gtpv-036)基因的克隆及序列分析

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现代畜牧科技 2023年第3期 69-74页

作者：张汐周正国赵垚鑫王永飞李有文塔里木大学动物科学与技术学院新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学动物科学与技术学院新疆生产建设兵团南疆动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300

为研究山羊痘病毒036(gtpv-036)基因的生物学特征,试验利用PCR法扩增gtpv-036基因,经NdeΙ、XhoΙ双酶切后与PET 42b同源重组构建其原核表达载体,并用菌液PCR和测序鉴定,测序结果进行生物信息学分析,预测其蛋白生物学特性。结果表明:成... 详细信息

为研究山羊痘病毒036(gtpv-036)基因的生物学特征,试验利用PCR法扩增gtpv-036基因,经NdeΙ、XhoΙ双酶切后与PET 42b同源重组构建其原核表达载体,并用菌液PCR和测序鉴定,测序结果进行生物信息学分析,预测其蛋白生物学特性。结果表明:成功构建原核表达载体PET 42b-gtpv-036,测序结果显示036基因大小为285 bp,与山羊痘gtpvIsolateIndia等参考株系同源性为97.9%~100%,遗传进化树表明其与gtpv处于同一分支,亲源关系最近,测序比对发现其基因有2个碱基发生了突变,推测氨基酸序列:从第37位和95位异亮氨酸密码子是“ATA”分别突变成异亮氨酸氨酸“ATT”和天冬氨酸氨酸“CTA”;预测山羊痘病036蛋白亚细胞定位在细胞质;蛋白信号肽的剪切位点位于第23和24号氨基酸之间;蛋白磷酸化位点有10个;蛋白二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,其次β-折叠,三级结构以α-螺旋为主,推测山羊痘病gtpv-036蛋白功能可能是巯基氧化酶。这为制备山羊痘病毒疫苗研究和为研发新型药物提供理论基础。

关键词：山羊痘病毒036 克隆序列分析

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新疆铁门关市部分地区散养奶牛嗜血支原体和泰勒虫感染情况的调查

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动物医学进展 2022年第3期43卷 124-128页

作者：郎平陈宏伟姜云罗慧丽赵爱云张秀萍齐萌塔里木大学动物科学学院/兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团第二师畜牧兽医工作站新疆铁门关841023

为了解新疆铁门关市3个镇散养奶牛嗜血支原体和泰勒虫感染分布,选取85头1岁~2岁奶牛进行血液样本采集,提取其全基因组DNA,用PCR检测血液DNA样本,对阳性样本进行基因碱基序列分析。结果表明,奶牛嗜血支原体和泰勒虫的总感染率为23.5%(20/... 详细信息

为了解新疆铁门关市3个镇散养奶牛嗜血支原体和泰勒虫感染分布,选取85头1岁~2岁奶牛进行血液样本采集,提取其全基因组DNA,用PCR检测血液DNA样本,对阳性样本进行基因碱基序列分析。结果表明,奶牛嗜血支原体和泰勒虫的总感染率为23.5%(20/85),天湖镇和河畔镇奶牛总感染率分别为39.5%(15/38)和26.3%(5/19),双丰镇奶牛未检测出血液病原。鉴定出3种病原,温氏支原体(n=13)、牛嗜血支原体未定种(n=11)和环形泰勒虫(n=7),病原混合感染率为9.4%(8/85);温氏支原体、牛嗜血支原体未定种和环形泰勒虫均存在3种基因型序列。说明新疆铁门关市奶牛嗜血支原体和泰勒虫感染存在多样分布特征。

关键词：嗜血支原体泰勒虫感染聚合酶链反应序列分析

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