检索结果-内蒙古大学图书馆

分子植物育种 2023年

作者：何璐熊仁次马思洁杨叔青塔里木大学农学学院南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室塔里木大学园艺与林学学院南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室

本研究在前期的研究基础上，对9个SlROPs蛋白的基序组成、系统进化关系、蛋白理化特性及结构进行了分析。基于蛋白基序的组成可将SlROP分成六类，第一类、第二类、第三类、第四类各包含1个SlROP蛋白，第五类包含3个SlROPs蛋白，第六类包... 详细信息

本研究在前期的研究基础上，对9个SlROPs蛋白的基序组成、系统进化关系、蛋白理化特性及结构进行了分析。基于蛋白基序的组成可将SlROP分成六类，第一类、第二类、第三类、第四类各包含1个SlROP蛋白，第五类包含3个SlROPs蛋白，第六类包含2个SlROPs蛋白。系统进化关系显示，SlROP蛋白被分为4个进化分支，其中第I、III分支包括1个SlROP蛋白，第II分支包括3个SlROPs蛋白，第IV分支包括4个SlROPs蛋白。理化性质分析结果显示，SlROP蛋白长度介于197 ～211 aa之间；蛋白分子量介于21 463.75～23 587.2 Da；9个SlROPs蛋白均为碱性亲水蛋白；1个SlROP蛋白可定位于细胞质，其余8个SlROPs蛋白均可定位于细胞膜、细胞质和细胞核；9个SlROPs蛋白均不具有信号肽和跨膜结构域。蛋白结构分析结果显示，SlROPs蛋白的二级结构元件以无规则卷曲和α螺旋为主。综上所述，本研究的研究结果将为深入研究SlROPs蛋白的生物学功能提供一定的理论基础。

关键词：番茄小G蛋白ROP 系统进化关系理化特性蛋白结构

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海岛棉BGLU基因家族的鉴定及生物信息学分析

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分子植物育种 2024年

作者：杨开英秦泽王庆朋闫成才郝海婷冯鸿杰塔里木大学农学院南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室塔里木绿洲农业教育部重点实验室

β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase， BGLU)是一种纤维素水解酶，在植物生长发育、逆境应答和代谢调控等生理过程中。为探究海岛棉(Gossypium barbadense)中BGLU基因家族成员的生物学功能，本研究在海岛棉BGLU全基因组的水平上，通过BLAST... 详细信息

β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase， BGLU)是一种纤维素水解酶，在植物生长发育、逆境应答和代谢调控等生理过程中。为探究海岛棉(Gossypium barbadense)中BGLU基因家族成员的生物学功能，本研究在海岛棉BGLU全基因组的水平上，通过BLAST比对及HMM搜索对海岛棉BGLU基因家族共有的保守结构域进行筛选，使用NCBI、TBtools、MEGA等工具分析海岛棉BGLU基因家族的性质特征。结果表明，在海岛棉中共鉴定出了59个BGLU基因家族成员。其中，54个定位在液泡中，5个定位在液泡和叶绿体中。这些基因在22条染色体上呈不均匀分布，氨基酸数目在54到1103之间，不稳定系数在5.89到52.21之间，其启动子区包含了许多光响应元件、干旱诱导元件、低温诱导元件等。通过对海岛棉和拟南芥的107个BGLU基因进行系统进化分析，我们发现这107个BGLU基因明显地被划分为6个不同的进化分支，富集分析和功能注释结果显示海岛棉BGLU基因共富集到7个通路，功能注释主要集中在分子功能、细胞组分和生物工程方面。本研究为揭示海岛棉生长发育过程中的调节机制和胁迫响应提供了一定的参考。

关键词：海岛棉 BGLU基因家族生信分析

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三种林果枝干腐烂病发病皮层真菌群落比较

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西南农业学报 2024年第3期37卷 589-596页

作者：郝海婷王庆朋李猛闫成才代先兴祖丽胡玛尔·麦提喀迪尔塔里木大学农学院/南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】探究新疆核桃树、苹果树以及杨树枝干发生腐烂病后对枝干皮层真菌群落的影响,为微生物防治腐烂病提供参考依据。【方法】基于高通量ITS扩增子测序方法,以新疆核桃树、苹果树以及杨树3种林果健康枝干作为对照,分别分析3种林果发... 详细信息

【目的】探究新疆核桃树、苹果树以及杨树枝干发生腐烂病后对枝干皮层真菌群落的影响,为微生物防治腐烂病提供参考依据。【方法】基于高通量ITS扩增子测序方法,以新疆核桃树、苹果树以及杨树3种林果健康枝干作为对照,分别分析3种林果发生腐烂病后枝干皮层中真菌群落结构的变化,解析腐烂病与微生物群落的关系。【结果】新疆核桃树、苹果树以及杨树3种林果健康枝干的真菌群落多样性和丰富度都大于发病枝干,表明腐烂病对枝干皮层真菌群落产生了影响。门水平,核桃树、苹果树和杨树健康枝干与感病枝干皮层优势菌门均为子囊菌门(Ascomycota)。属水平,核桃树健康枝干皮层(WH)的优势属为链格孢属(Alternaria),发病枝干皮层(WD)的优势属为隐球壳属(Cryptosphaeria);杨树健康枝干皮层(PH)的优势属为球腔菌属(Mycosphaerella),发病枝干皮层(PD)的优势属为黑腐皮壳属(Valsa);苹果树健康枝干皮层(AH)的优势属为亚隔孢壳属(Didymella),发病枝干皮层(AD)的优势属为层孔菌属(Fomes)和黑腐皮壳属(Valsa)。【结论】发生腐烂病后,新疆核桃树、苹果树以及杨树3种林果枝干皮层真菌群落结构发生改变。该研究可为基于微生物群落的变化防治植物病害提供一定的理论依据。

关键词：扩增子测序真菌多样性核桃树苹果树杨树

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白梨PbrROP蛋白的分类及特性分析

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分子植物育种 2023年

作者：刘礼瑶熊仁次何璐杨叔青塔里木大学农学院南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室塔里木大学园艺与林学学院

小G蛋白ROP是一种与Rho相关的GTP酶，调控植物防卫反应。为了后期挖掘白梨中抗腐烂病相关ROP，本研究对前期筛选到的白梨中8个PbrROP蛋白的Rho功能域、开放阅读框及氨基酸序列相似度进行了预测和分析，并对其亚细胞定位、基序组成、系... 详细信息

小G蛋白ROP是一种与Rho相关的GTP酶，调控植物防卫反应。为了后期挖掘白梨中抗腐烂病相关ROP，本研究对前期筛选到的白梨中8个PbrROP蛋白的Rho功能域、开放阅读框及氨基酸序列相似度进行了预测和分析，并对其亚细胞定位、基序组成、系统进化关系、信号肽、跨膜结构域、蛋白磷酸化位点、糖基化位点、蛋白理化性质和蛋白结构等理化性质进行了分析。结果表明，根据蛋白基序组成将PbrROP分成两类，第一类包含2个PbrROP蛋白，第二类包含6个PbrROP蛋白。系统进化关系显示，AtROP蛋白和PbrROP蛋白被分为4个进化分支，其中分支I和分支III各包括1个AtROP蛋白，分支II包括3个AtROP蛋白和2个PbrROP蛋白，分支IV包括6个AtROP蛋白和6个PbrROP蛋白。蛋白理化性质结果显示，8个PbrROP蛋白的蛋白长度介于197～200aa之间、等电点介于9.11～9.42之间、分子量介于21472.76～22239.72Da之间、脂肪指数介于86.73～91.52之间、亲水性介于-0.160～-0.077之间及不稳定指数介于38.08～57.14之间。结果表明，8个PbrROP蛋白均为碱性亲水蛋白，其中有2个稳定蛋白，4个不稳定蛋白；8个PbrROP均定位于细胞膜、细胞质和细胞核且均不具有信号肽和跨膜结构域；rna34087-v1.1-pbr和rna17548-v1.1-pbr存在3个潜在N-糖基化位点，数量最多，其它PbrROP蛋白均只存在1个潜在N-糖基化位点。蛋白结构分析结果表明，8个PbrROP蛋白的二级结构元件均以无规则卷曲和α螺旋为主。综上所述，本试验的研究结果将为深入探究PbrROP蛋白的生物学功能提供依据，有助于后续挖掘白梨中抗腐烂病相关ROP蛋白，进而为后续抗病育种，综合防控提供途径，奠定强有力的理论基础，为蔷薇科健康可持续发展提供参考条件，使预测预报和防治更加精准有效，填补蔷薇科研究空白。

关键词：白梨 ROP 系统进化关系蛋白理化特性蛋白结构

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新疆阿克苏苹果园金纹细蛾发生规律研究

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果树学报 2024年第9期41卷 1829-1835页

作者：苟长青达先鹏席琳乔冯宏祖塔里木大学·南疆特色果树高效优质栽培与深加工技术国家地方联合工程实验室·农业农村部阿拉尔作物有害生物科学观测实验站·南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】摸清新疆阿克苏地区苹果园金纹细蛾的发生规律,为该虫的综合治理提供科学依据。【方法】选择不同树龄、不同品种、不同间作方式的苹果园,利用性诱剂诱捕法和田间调查法,研究金纹细蛾的发生危害规律。【结果】金纹细蛾在阿克苏地... 详细信息

【目的】摸清新疆阿克苏地区苹果园金纹细蛾的发生规律,为该虫的综合治理提供科学依据。【方法】选择不同树龄、不同品种、不同间作方式的苹果园,利用性诱剂诱捕法和田间调查法,研究金纹细蛾的发生危害规律。【结果】金纹细蛾在阿克苏地区1年发生6代,第一代成虫发生期为5月上旬至6月上旬,第二代6月中旬至7月中旬,第三代7月中旬至8月上旬,第四代8月中旬至8月下旬,第五代9月上旬至10月。不同类型的果园中金纹细蛾危害程度和发生量不同,其中20年树龄果园>5年树龄果园、清耕果园>间作1年生绿肥作物果园>间作多年生绿肥作物果园、红色之爱果园>红富士果园。【结论】金纹细蛾以蛹在危害叶片虫斑内化蛹越冬,在阿克苏地区1年发生6代,其中7—8月危害较严重,老龄果园、清耕果园发生重,对不同品种的嗜好性也有差异。

关键词：苹果园新疆金纹细蛾发生规律

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辣椒小G蛋白CaROP的生物信息学分析

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新疆农业科学 2024年第1期61卷 165-175页

作者：马思洁朱天生何璐杨叔青塔里木大学农学院新疆阿拉尔843300 南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】研究辣椒内小G蛋白CaROP的生物学功能、蛋白理化性质、蛋白结构及系统发育关系。【方法】运用ProtParam、ProtScale、SignalP5.0、TMHMM、NetPhos3.1和NetCGlyc1.0等生物信息学软件分析9个CaROP蛋白的蛋白理化特性;运用SOPMA和S... 详细信息

【目的】研究辣椒内小G蛋白CaROP的生物学功能、蛋白理化性质、蛋白结构及系统发育关系。【方法】运用ProtParam、ProtScale、SignalP5.0、TMHMM、NetPhos3.1和NetCGlyc1.0等生物信息学软件分析9个CaROP蛋白的蛋白理化特性;运用SOPMA和SWISS-MODEL等生物信息学软件预测分析9个CaROP蛋白的结构;运用生物信息学软件MEGA11分析9个CaROP蛋白的系统发育关系。【结果】9个CaROP蛋白的亲水性总平均值均小于0,均为亲水蛋白,其中6个为稳定的亲水蛋白;9个CaROP蛋白均无信号肽,即均为非分泌性蛋白;9个CaROP蛋白无跨膜结构域,即均非膜蛋白;9个CaROP蛋白均存在磷酸化位点,均无糖基化位点。9个CaROP蛋白的主要二级结构原件为无规则卷曲和α-螺旋,其次是β-折叠,最后是β-转角。9个CaROP蛋白聚为4个分支,其中分支Ⅰ和分支Ⅲ各包括1个CaROP蛋白。分支Ⅱ包括2个CaROP蛋白,其余5个CaROP蛋白均聚于分支Ⅳ中。【结论】9个CaROP蛋白具有完整的Rho功能域,均为非分泌性亲水蛋白。9个CaROP蛋白在系统进化树中共聚为了4个分支,其三级结构建模的预测结果也均较为理想,9个CaROP蛋白结构较稳定。

关键词：辣椒小G蛋白ROP 蛋白理化特性蛋白结构系统发育关系

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核桃腐烂病拮抗菌Pseudomonas chlororaphis的筛选、鉴定及其防病促生效果

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果树学报 2025年第1期42卷 170-184页

作者：刘志金单路路玛丽艳姑丽·吐尔迪李彤康启航张锐董宁陈小飞塔里木大学农学院·南疆有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学园艺与林学学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团林业和草原工作总站乌鲁木齐830013

【目的】为有效控制核桃腐烂病的发生与发展,从新疆温宿县核桃园土壤中分离既对核桃腐烂病有很好防效,又对核桃种子萌芽具有促进作用的拮抗细菌。【方法】通过稀释涂布平板法进行分离培养、平皿对峙筛选,通过形态学和分子生物学方法进... 详细信息

【目的】为有效控制核桃腐烂病的发生与发展,从新疆温宿县核桃园土壤中分离既对核桃腐烂病有很好防效,又对核桃种子萌芽具有促进作用的拮抗细菌。【方法】通过稀释涂布平板法进行分离培养、平皿对峙筛选,通过形态学和分子生物学方法进行鉴定,以及通过室内离体枝条、盆栽和田间盆栽试验探究防病促生作用。【结果】筛选出1株生防菌WS-04,通过形态学观察、生理生化特性测定及分子鉴定,最终确定菌株WS-04为绿针假单胞菌Pseudomonas chlororaphis。研究发现WS-04能使病原菌菌丝发生断裂和解体,使菌丝无法正常生长,对核桃腐烂病菌Cytospora chysosperma的抑菌效果达87.00%,其发酵液对核桃腐烂病的防效也达到84.96%,还具有一定的热稳定性。经过拮抗菌株发酵滤液浸泡处理的核桃种子,萌芽率和发芽率与对照相比都有显著提高(p<0.05),且有效地降低了坏种率。菌株发酵滤液能促进核桃幼苗苗高、主根长、须根数、叶片面积和干质量的显著增加,其依次增加了25.40%、83.33%、48.02%、24.76%和98.40%。【结论】从核桃园土壤中分离并筛选出一株具有广谱抗菌且对核桃种子和幼苗具有促生作用的生防细菌。研究成果为核桃腐烂病的生物防治提供了新的菌株来源。

关键词：核桃腐烂病拮抗细菌促生作用

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基于MaxEnt模型的柳树植原体病害在我国的适生区预测及定量风险分析

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新疆农业科学 2023年第5期60卷 1235-1243页

作者：李静霞张学祥李丰马思洁张萍朱天生塔里木大学农学院/南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】基于MaxEnt模型的柳树植原体病害在我国的适生区预测及定量风险分析。【方法】利用最大熵模型(MaxEnt),结合ArcGIS软件,预测柳树植原体病害在中国的适生区范围,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)... 详细信息

【目的】基于MaxEnt模型的柳树植原体病害在我国的适生区预测及定量风险分析。【方法】利用最大熵模型(MaxEnt),结合ArcGIS软件,预测柳树植原体病害在中国的适生区范围,并通过受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)验证模型精度,并结合刀切法(jackknife test)筛选主导环境变量。同时建立有害生物风险量化分析体系,计算柳树植原体病的风险性危害值并对其进行评价。【结果】柳树植原体病MaxEnt模型预测结果的ROC曲线下面积(AUC)平均值为0.979 5,模型预测结果可靠。柳树植原体病害在我国的适生区在22°36′~49°10′N、73°40′~135°05′°E的中温带、暖温带、高原气候区,主要集中在我国的西北、华中、华东、西南、华北和东北地区。其中高度适生区主要集中在西北、华中、华东地区,中度适生区主要集中在东北地区和华中地区中部;低度适生区主要集中在东北和西南地区,非适生区主要集中在华南和港澳台地区。最冷季平均温度(Bio11)、最干月降水量(Bio14)对柳树植原体病在中国的分布状况影响最大,贡献率分别为72.1%和17.4%;等温性(Bio3)、最干季度降水量(Bio17)、最冷季度降水量(Bio19)、最干季度平均温度(Bio9)有一定影响,贡献率依次为3.7%、3.7%、1.9%、1.2%。低温、干旱的区域有利于柳树植原体病的发生。建立5个准则层、14个指标层的多指标综合评价体系,并对各指标层定量分析,柳树植原体病在我国的风险性危害值(R值)为1.997,属于中度危险林业有害生物。【结论】柳树植原体病风险性较高,需要尽快建立监测体系并针对该病害采取有效控制措施。

关键词：柳树植原体病害适生分析风险评估

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6株核桃腐烂病菌的分子鉴定及生物学特性比较

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山东农业科学 2024年第12期56卷 98-104页

作者：靳启明闫成才王庆朋王喆苟长青王兰冯宏祖郝海婷塔里木大学/农业部阿拉尔作物有害生物科学观测实验站/南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

为探究核桃腐烂病菌的分类地位及生物学特性,本研究基于分子生物学方法对6株菌落形态有差异的核桃腐烂病菌进行多基因联合鉴定,并进一步探究其致病性及生物学特性的差异。系统进化树显示,44-9-2B与Cytospora melnikii聚为一支,且自举支... 详细信息

为探究核桃腐烂病菌的分类地位及生物学特性,本研究基于分子生物学方法对6株菌落形态有差异的核桃腐烂病菌进行多基因联合鉴定,并进一步探究其致病性及生物学特性的差异。系统进化树显示,44-9-2B与Cytospora melnikii聚为一支,且自举支持率为100%;菌株44-1-2C、51-1-3C与***聚为一支;菌株49-2-1A、49-9-4D、53-1-3F与Valsa sordida聚为一支。致病性检测表明,44-9-2B致病性最强,也最先产生分生孢子角,其次为菌株44-1-2C和51-1-3C,最后是菌株53-1-3F。生物学特性研究表明,6株致病菌最适生长温度均为28℃,最适pH值为6,光照对6株致病菌的生长有促进作用,各致病菌的最适氮、碳源不同。该研究结果可为核桃树腐烂病的防治提供理论依据。

关键词：核桃腐烂病分子鉴定生物学特性致病性

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蔷薇科小G蛋白ROP的鉴定、分类及特征分析

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华北农学报 2023年第S01期38卷 8-17页

作者：刘礼瑶熊仁次何璐马思洁杨叔青塔里木大学农学院新疆阿拉尔843300 南疆农业有害生物综合治理兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学园艺与林学学院新疆阿拉尔843300

为全面系统地挖掘蔷薇科小G蛋白ROP,在分子水平上为蔷薇科抗病育种提供候选基因。物种系统进化关系分析、ROP蛋白全基因组筛查、Rho功能域分析、蛋白聚类分析及理化性质分析分别运用了NCBI、iTOLv6、GDR、SMART、MEGA 11.0和Maximum-lik... 详细信息

为全面系统地挖掘蔷薇科小G蛋白ROP,在分子水平上为蔷薇科抗病育种提供候选基因。物种系统进化关系分析、ROP蛋白全基因组筛查、Rho功能域分析、蛋白聚类分析及理化性质分析分别运用了NCBI、iTOLv6、GDR、SMART、MEGA 11.0和Maximum-likelihood algorithm1及Protparam和Expasy等数据库及生物信息学在线软件。11种蔷薇科植物聚为6个亚支;11种蔷薇科植物中筛查到80个ROP蛋白;80个蔷薇科ROP蛋白和11个拟南芥ROP蛋白聚为6个进化分支;蛋白长度、等电点、分子量、脂肪指数及不稳定指数分别为143~215 aa、5.59~9.63、15.73599~23.87859 ku、85.28~94.95和27.96~57.14。80个蔷薇科ROP蛋白在草莓中数量最多,甜樱桃最少;蔷薇科ROP蛋白分布于第Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ分支中,拟南芥ROP蛋白分布于Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ分支中,即分支Ⅵ为蔷薇科特异性分支,分支Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ为拟南芥特异性分支。

关键词：蔷薇科小G蛋白ROP 全基因组筛查 Rho功能域系统进化关系蛋白理化特征

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