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低蛋白质饲粮补加过瘤胃赖氨酸对多浪羊生长性能、养分表观消化率、瘤胃发酵参数及氮代谢的影响

动物营养学报 2024年第3期36卷 1756-1768页

作者：王明根朱振宇杨成俄广旭邓沭洋王继姝卢冬郭雪峰塔里木大学动物科学与技术学院阿拉尔843300 塔里木大学新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300

本试验旨在研究低蛋白质饲粮补加过瘤胃赖氨酸(RPLys)对多浪羊生长性能、养分表观消化率、瘤胃发酵参数及氮代谢的影响。将9只体况相近且安装永久性瘘管的多浪羊羯羊,采用3×3拉丁方设计,随机分为3组:CK组(饲喂14%蛋白质水平的饲粮)... 详细信息

本试验旨在研究低蛋白质饲粮补加过瘤胃赖氨酸(RPLys)对多浪羊生长性能、养分表观消化率、瘤胃发酵参数及氮代谢的影响。将9只体况相近且安装永久性瘘管的多浪羊羯羊,采用3×3拉丁方设计,随机分为3组:CK组(饲喂14%蛋白质水平的饲粮)、DP组(饲喂12%蛋白质水平的饲粮)、LP组(饲喂12%蛋白质水平饲粮+14.0 g/d RPLys)。试验分3期进行,每期28 d,其中预试期15 d,正试期13 d。结果表明:1)各组间的初重及干物质采食量(DMI)无显著差异(P>0.05),LP组的平均日增重(ADG)极显著高于CK组和DP组(P<0.01),CK组和DP组的ADG差异不显著(P>0.05),LP组的料重比(F/G)显著低于CK组和DP组(P<0.05),CK组和DP组的F/G差异不显著(P>0.05)。2)各组间干物质(DM)、中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)和粗脂肪(EE)表观消化率差异不显著(P>0.05);LP组粗蛋白质(CP)表观消化率极显著高于CK组和DP组(P<0.01),CK组CP表观消化率极显著高于DP组(P<0.01);LP组有机物(OM)表观消化率极显著高于CK组和DP组(P<0.01),CK组和DP组OM表观消化率差异不显著(P>0.05)。3)低蛋白质饲粮补加RPLys对多浪羊瘤胃氨态氮(NH3⁃N)、丁酸(BA)和戊酸(VA)含量无显著影响(P>0.05);DP组和LP组微生物蛋白(MCP)含量极显著高于CK组(P<0.01);LP组乙酸(AA)和丙酸(PA)含量极显著高于CK组和DP组(P<0.01),CK组和DP组AA和PA含量差异不显著(P>0.05);CK组乙酸/丙酸极显著高于LP组(P<0.01);LP组总挥发性脂肪酸(TVFA)含量极显著高于CK组和DP组(P<0.01),CK组和DP组TVFA含量差异不显著(P>0.05)。4)各组间多浪羊进食氮、尿氮、粪氮、总排出氮、沉积氮、氮利用率和氮生物学价值均差异不显著(P>0.05),但与CK组相比,DP组与LP组的粪氮有降低的趋势(0.05

关键词：低蛋白质饲粮过瘤胃赖氨酸表观消化率瘤胃发酵参数氮代谢

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一株盐碱绿藻的SE培养基优化

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新疆农业科学 2023年第10期60卷 2509-2520页

作者：陈凤董宇蔡宏宇张苏江雷曼红孙禹塔里木大学/新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

【目的】优化一株盐碱绿藻的SE培养基,为盐碱藻分子生物学资源的研究提供理论依据。【方法】对塔里木大学校园内东湖中分离纯化的一株盐碱绿藻进行培养基筛选,通过形态观察及分子鉴定,研究CaCl_(2)·2H_(2)O、KH_(2)PO_(4)、NaCl、N... 详细信息

【目的】优化一株盐碱绿藻的SE培养基,为盐碱藻分子生物学资源的研究提供理论依据。【方法】对塔里木大学校园内东湖中分离纯化的一株盐碱绿藻进行培养基筛选,通过形态观察及分子鉴定,研究CaCl_(2)·2H_(2)O、KH_(2)PO_(4)、NaCl、NaNO_(3)、MgSO_(4)·7H_(2)O以及pH对其生长的影响,并进行系统发育分析。【结果】盐碱绿藻为椭圆形藻。CaCl_(2)·2H_(2)O最适浓度为0.050 g/L,可溶性糖为24.34%,可溶性蛋白为16.55%,总叶绿素为2.000 g/L。KH_(2)PO_(4)最适浓度为0.175 g/L,可溶性糖为10.53%,可溶性蛋白为7.7%,总叶绿素为3.607 g/L。NaCl最适浓度为0.100 g/L,可溶性糖为11.82%,可溶性蛋白为8.57%,总叶绿素为3.385 g/L。NaNO_(3)最适浓度为0.250 g/L,可溶性糖为10.64%,可溶性蛋白为6.10%,总叶绿素为2.731g/L。MgSO_(4)·7H_(2)O最适浓度为0.375 g/L,可溶性糖为12.32%,可溶性蛋白为9.9%,总叶绿素为1.790 g/L。pH最适浓度为9.0,可溶性糖为16.57%,可溶性蛋白为9.46%,总叶绿素为1.985 g/L。1号藻的序列与新颖拟绿球藻属(Pseudochlorococcum sp.)聚簇成一支亲缘关系很相近。【结论】确定了1号盐碱绿藻的分类地位以及SE培养基优化后CaCl_(2)·2H_(2)O的浓度为0.050 g/L,KH_(2)PO_(4)的浓度为0.175 g/L,NaCl的浓度为0.100 g/L,NaNO_(3)的浓度为0.250 g/L,MgSO_(4)·7H_(2)O的浓度为0.375 g/L和pH为9.0。

关键词：盐碱绿藻 18S rDNA 形态特性培养基优化

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多浪羊ESR1基因多态性与产羔性状的关联性分析

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中国草食动物科学 2024年

作者：杨旻奇黄巧艳韩笑伍柏仰乌兰·合得尔邢凤塔里木大学动物科学与技术学院新疆生产建设兵团塔里木畜牧科重点实验室

为了揭示ESR1基因多态性与多浪羊产羔性状的关系，探究其对多浪羊产羔性状的作用，采用PCR直接测序的方法对ESR1基因外显子1和内含子4中2个单核苷酸多态性进行了研究，对这2个位点的基因型频率和等位基因频率进行了统计，分析其杂合度... 详细信息

为了揭示ESR1基因多态性与多浪羊产羔性状的关系，探究其对多浪羊产羔性状的作用，采用PCR直接测序的方法对ESR1基因外显子1和内含子4中2个单核苷酸多态性进行了研究，对这2个位点的基因型频率和等位基因频率进行了统计，分析其杂合度（He）、有效等位基因数（Ne）、多态信息含量（PIC）等遗传参数，并与多浪羊产羔数进行了相关分析。结果表明，在多浪羊单羔群体中，g.75378892 A＞T位点的优势等位基因为A，基因频率为0.64；g.75521224 T＞A位点的优势等位基因为T，基因频率为0.66。在多浪羊多羔群体中，g.75378892 A＞T位点的优势等位基因为A，基因频率为0.62；g.75521224 T＞A位点的优势等位基因为T，基因频率为0.64。g.75378892A>T位点的突变为错义突变，由异亮氨酸（Ile）突变为苯丙氨酸（Phe）。g.75378892 A＞T位点和内含子4上g.75521224 T＞A位点的多态信息含量均处于中度多态（0.25＜PIC＜0.50）。多浪羊ESR1基因g.75378892 A＞T突变位点的AT基因型个体的产羔数显著高于AA基因型个体(P<0.05)；g.75521224 T＞A突变位点的AT基因型个体的产羔数显著高于AA基因型个体和TT基因型个体(P<0.05)。由此推断， ESR1基因可以作为多浪羊多羔性状的候选基因。

关键词： ESR1基因 PCR测序 SNPs 遗传参数产羔数

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绵羊肺炎支原体核糖体蛋白30S rpsE基因的原核表达及多克隆抗体的制备

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畜牧与兽医 2024年第7期56卷 78-84页

作者：刘晓艳王永飞邓博文哈尔勒哈·阿曼太蔡江李有文塔里木大学动物科学与技术学院新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团南疆动物疫病诊断与防控工程实验室新疆阿拉尔843300

旨在了解绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae)30S rpsE蛋白的生物学特性及其蛋白免疫原性。用在线分析软件预测30S rpsE蛋白的理化性质、B细胞抗原表位、糖基化位点、二级结构及三级结构等;采用PCR方法从病羊鼻拭子样品中扩增得到... 详细信息

旨在了解绵羊肺炎支原体(Mycoplasma ovipneumoniae)30S rpsE蛋白的生物学特性及其蛋白免疫原性。用在线分析软件预测30S rpsE蛋白的理化性质、B细胞抗原表位、糖基化位点、二级结构及三级结构等;采用PCR方法从病羊鼻拭子样品中扩增得到30S rpsE基因片段,经NdeⅠ、XhoⅠ酶切纯化后,将其连接到pET-42b载体上,构建原核表达载体pET-42b-30S rpsE,使用不同浓度IPTG诱导蛋白在大肠杆菌BL21中表达;重组蛋白通过SDS-PAGE和Western blot进行鉴定,用镍层析法纯化蛋白后,与弗氏佐剂1∶1混合注射免疫家兔,然后采取全血,检测血清抗体效价及特异性。结果:经预测30S rpsE蛋白是亲水无信号肽的膜外蛋白,无跨膜结构域,有一个糖基化位点;成功构建了原核表达载体pET-42b-30S rpsE,表达的重组蛋白分子量约为25.9 ku,以包涵体和可溶性的形式存在;免疫家兔后血清抗体效价为1∶25 600,证实30S rpsE蛋白具有较好的免疫原性。

关键词：肺炎支原体 30S rpsE基因原核表达多克隆抗体

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饲粮中添加机采棉渣对肉兔生长性能、屠宰性能、肉品质和血清生化指标的影响

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动物营养学报 2025年第4期37卷 2627-2637页

作者：路顺萍吴启辉赵明鑫万婕王娇陈雪文张苏江塔里木大学动物科学与技术学院农业农村部环塔里木畜草资源利用重点实验室(部省共建)新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300 塔里木大学生命科学与技术学院阿拉尔843300

本试验旨在研究饲粮中添加不同水平机采棉渣对肉兔生长性能、屠宰性能、器官指数、肉品质和血清生化指标的影响。选择120只体重相近的健康35日龄断奶伊拉肉兔,随机分为4组,分别饲喂在基础饲粮中添加0(对照组)、10%、20%和30%机采棉渣的... 详细信息

本试验旨在研究饲粮中添加不同水平机采棉渣对肉兔生长性能、屠宰性能、器官指数、肉品质和血清生化指标的影响。选择120只体重相近的健康35日龄断奶伊拉肉兔,随机分为4组,分别饲喂在基础饲粮中添加0(对照组)、10%、20%和30%机采棉渣的饲粮,每组5个重复,每个重复6只(公母各占1/2)。预试期7 d,正试期60 d。结果表明:1)饲粮中添加机采棉渣对肉兔平均日采食量、腹泻率和死亡率均无显著影响(P>0.05)。与对照组相比,10%机采棉渣添加组终末体重和显著提高(P<0.05),料重比显著降低(P<0.05)。2)10%机采棉渣添加组肉兔宰前活重和全净膛率显著高于20%和30%机采棉渣添加组(P<0.05),半净膛重和全净膛重显著高于对照组和30%机采棉渣添加组(P<0.05),半净膛率显著高于其他各组(P<0.05)。3)饲粮中添加机采棉渣对肉兔心脏指数、肾脏指数、脾脏指数和胸腺指数均无显著影响(P>0.05)。30%机采棉渣添加组肝脏指数显著高于对照组以及10%和20%机采棉渣添加组(P<0.05),10%和20%机采棉渣添加组肝脏指数与对照组相比无显著差异(P>0.05)。4)饲粮中添加机采棉渣对肉兔背最长肌pH、肉色、滴水损失和剪切力均无显著影响(P>0.05)。10%机采棉渣添加组背最长肌蒸煮损失显著低于对照组和30%机采棉渣添加组(P<0.05)。5)30%机采棉渣添加组肉兔血清尿素氮含量显著高于对照组和10%机采棉渣添加组(P<0.05),且对照组与10%机采棉渣添加组之间差异不显著(P>0.05);20%和30%机采棉渣添加组血清谷丙转氨酶和谷草转氨酶活性显著高于对照组(P<0.05)。综上所述,饲粮中添加适宜水平机采棉渣可提高肉兔生长性能,改善屠宰性能和肉品质,对器官指数和血清生化指标无负面影响,以添加10%为宜。

关键词：机采棉渣肉兔生长性能屠宰性能肉品质血清生化指标

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棉副产品全混合发酵饲料工艺参数优化

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饲料研究 2024年第12期47卷 97-104页

作者：王明根白天天朱振宇杨成赵林波刘俊峰卢冬郭雪峰塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

试验旨在探索棉副产品全混合发酵饲料工艺参数,为提高棉副产品综合利用效率、解决新疆南疆地区饲料不足的问题提供思路。试验采用3×5双因素设计,设置28.57%(C1)、31.51%(C2)和34.21%(C3)3个玉米粉添加组,每组分别添加1.0(B1)、2.0(... 详细信息

试验旨在探索棉副产品全混合发酵饲料工艺参数,为提高棉副产品综合利用效率、解决新疆南疆地区饲料不足的问题提供思路。试验采用3×5双因素设计,设置28.57%(C1)、31.51%(C2)和34.21%(C3)3个玉米粉添加组,每组分别添加1.0(B1)、2.0(B2)、3.0(B3)、4.0(B4)、5.0 g(B5)屎肠球菌冻干粉,每组3个重复,加水预发酵2 d,测定pH值后加入棉副产品全混合饲料的其他部分,控制水分含量为70%,室温下发酵30 d,开封后测定发酵品质、营养成分、游离棉酚(FG)及有机酸含量。结果表明:全部发酵饲料感官品质较好,C1B3、C2B3、C2B4组为优等。不同玉米粉添加量对干物质、粗蛋白、酸性洗涤纤维和中性洗涤纤维含量影响极显著(P<0.01);不同屎肠球菌添加量对干物质、粗蛋白、酸性洗涤纤维和中性洗涤纤维含量影响极显著(P<0.01);玉米粉和屎肠球菌交互作用对粗蛋白含量有极显著影响(P<0.01),对酸性洗涤纤维和中性洗涤纤维含量有显著影响(P<0.05)。不同屎肠球菌添加量对FG含量影响显著(P<0.05)。不同玉米粉添加量对乳酸(LA)、丁酸(BA)和总挥发性脂肪酸含量影响极显著(P<0.01),不同屎肠球菌添加量对LA、乙酸(AA)、丙酸(PA)和总挥发性脂肪酸含量影响极显著(P<0.01),玉米粉和屎肠球菌交互作用仅对LA、AA和总挥发性脂肪酸含量具有极显著影响(P<0.01)。采用隶属函数法综合对各项指标进行评估,C3B3发酵效果最佳。研究表明,添加34.21%玉米粉、3.0 g屎肠球菌、17.20%棉籽粕、28.35%棉花秸秆、19.38%棉籽壳、0.66%预混料、0.07%CaCO3和0.13%NaCl,含水量控制为70%时,棉副产品全混合饲料发酵效果较好。

关键词：屎肠球菌棉副产品发酵效果工艺优化

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产细菌素屎肠球菌F11.1G的生物学特性分析

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微生物学通报 2024年第8期51卷 3119-3132页

作者：万颖王明根朱振宇白天天杨成郭雪峰塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木大学新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技兵团重点实验室新疆阿拉尔843300

【背景】随着滥用抗生素导致耐药问题日益严重,逐渐破坏动物健康与生态环境。为应对这一全球性公共威胁,多国禁止把抗生素作为食品和饲料添加剂,益生菌的替代使用应运而生。【目的】对产细菌素屎肠球菌(Enterococcus faecium)F11.1G的... 详细信息

【背景】随着滥用抗生素导致耐药问题日益严重,逐渐破坏动物健康与生态环境。为应对这一全球性公共威胁,多国禁止把抗生素作为食品和饲料添加剂,益生菌的替代使用应运而生。【目的】对产细菌素屎肠球菌(Enterococcus faecium)F11.1G的生物学特性作全面分析,以保证该菌株在生产中的合理及安全应用。【方法】通过热稳定性试验、耐酸试验和耐胆盐试验测定其耐热、耐酸和耐胆盐性能;通过药敏试验探究其耐受药物能力;通过表面疏水性试验、自凝聚性试验间接探究其对细胞的黏附能力;通过蛋白酶耐受试验研究其在蛋白酶作用下活性作用的强弱。【结果】屎肠球菌F11.1G发酵上清液具有较强的热稳定性,在110℃条件下仍然能够发挥抑菌作用,而最佳生长温度为37℃。当pH 5.9时,菌株生长情况较好且存活率最高,随着pH的降低,其生长受到抑制,当pH值降低为1.8时,菌株仍可生长,但存活率仅有9%。胆盐浓度在0.10%时存活率达140.0%,胆盐浓度在0.15%时,存活率达126.6%,而胆盐浓度在0.20%时,存活率为96.6%;菌株对头孢吡肟、丁胺卡那、庆大霉素、诺氟沙星、红霉素、罗红霉素、多黏菌素B、林可霉素、链霉素、新霉素、甲硝唑、克林霉素、制霉菌素、甲氧苄啶、阿奇霉素和卡那霉素耐受;对头孢他啶、左氧氟沙星、环丙沙星中度敏感;对青霉素、头孢唑啉、头孢呋辛、氯霉素、四环素、多西环素、替考拉宁、克拉霉素和呋喃妥因高度敏感。菌株F11.1G对正己烷、二甲苯、乙酸乙酯和二氯甲烷的疏水率分别为84.29%、25.75%、31.26%和15.08%。菌株F11.1G在3、6、9、12、15和18 h的自凝聚率分别为51%、54%、76%、80%、83%和84%。在蛋白酶K作用下,对大肠杆菌(Escherichia coli)和沙门氏菌(Salmonella)的抑菌效果明显减弱,抑菌圈直径分别为13.05 mm和11.28 mm,抑菌率下降幅度分别为52%和58%,而在胰蛋白酶、胃蛋白酶的作用下未产生抑菌圈,抑菌效果几乎完全丧失。【结论】屎肠球菌F11.1G具有良好的耐高温、耐酸、耐胆盐能力,对丁胺卡那、庆大霉素、诺氟沙星、红霉素和罗红霉素等16种药物耐受,对正己烷有较高的疏水率且自凝聚性良好,经胰蛋白酶、胃蛋白酶处理后抑菌活性丧失,证明该抑菌物质为蛋白类或肽类,为微生态制剂的安全应用提供基础数据。

关键词：细菌素屎肠球菌F11.1G 生物学特性替抗

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多浪羊PROKR 2基因克隆、生物信息学及组织差异表达分析

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中国畜牧兽医 2024年第4期51卷 1339-1348页

作者：黄巧艳李伟王鑫昆邢凤塔里木大学动物科学学院阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300

【目的】克隆多浪羊促动力素受体2(prokineticin receptor 2,PROKR2)基因,并检测初情期启动过程中PROKR 2基因在多浪羊不同组织中的表达水平,为探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的作用提供依据。【方法】以初情期后多浪羊下丘脑c... 详细信息

【目的】克隆多浪羊促动力素受体2(prokineticin receptor 2,PROKR2)基因,并检测初情期启动过程中PROKR 2基因在多浪羊不同组织中的表达水平,为探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的作用提供依据。【方法】以初情期后多浪羊下丘脑cDNA为模板,PCR扩增PROKR 2基因并克隆测序。利用DNAMAN软件对测序结果进行拼接,采用MegAlign软件进行物种间相似性比对并构建系统进化树,并利用生物信息学软件预测多浪羊PROKR2蛋白理化性质和结构功能。使用实时荧光定量PCR技术检测PROKR 2基因在多浪羊下丘脑、垂体、卵巢、输卵管及子宫中初情期前、初情期及初情期后的表达水平。【结果】克隆获得PROKR 2基因序列大小为2641 bp,包括5′-UTR 143 bp、3′-UTR 1343 bp和CDS区1155 bp,编码384个氨基酸,与GenBank中绵羊预测mRNA序列(登录号:XM_004014342.5)相似性为99.83%。系统进化树表明,多浪羊PROKR 2基因的遗传距离与山羊最近,与鸡最远。生物信息学分析表明,PROKR2蛋白为疏水稳定碱性蛋白,有7个跨膜结构,属于跨膜蛋白,存在31个磷酸化位点,主要在质膜上发挥作用。多浪羊PROKR2蛋白与GnRH1、PROK1、ANOS1等蛋白存在相互作用关系。实时荧光定量PCR结果显示,在多浪羊下丘脑各时期中PROKR 2基因表达量均显著高于其他组织(P<0.05),且在初情期后的表达量最高;垂体中PROKR 2基因表达量无显著变化(P>0.05);子宫中PROKR 2基因在初情期前的表达量显著高于初情期和初情期后(P<0.05);卵巢和输卵管中PROKR 2基因在初情期的表达量显著高于初情期前和初情期后(P<0.05)。【结论】试验成功克隆了多浪羊PROKR 2基因CDS区序列,PROKR2蛋白属于疏水稳定碱性蛋白,含有7个跨膜结构,主要在下丘脑中表达,且在卵巢和输卵管中的总趋势为先升后降。研究结果可为进一步探究PROKR 2基因在绵羊初情期启动过程中的调控作用提供参考。

关键词：多浪羊 PROKR 2基因克隆初情期表达

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盐、碱胁迫下高丹草苗期生理特征及转录组学分析

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生物技术通报 2023年第6期39卷 199-207页

作者：孔德真段震宇王刚张鑫席琳乔新疆农垦科学院作物研究所谷物品质与遗传改良兵团重点实验室石河子832000 塔里木大学新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室阿拉尔843300

高丹草(Sorghum bicolor×S. sudanense hybrids)具有抗旱和耐盐碱特性,逐渐成为畜牧业重要的饲料作物,明确高丹草耐盐、耐碱分子调控机制对高丹草分子辅助育种具有重要意义。本文对高丹草种子进行不同浓度的NaCl和Na_(2)CO_(3)胁迫... 详细信息

高丹草(Sorghum bicolor×S. sudanense hybrids)具有抗旱和耐盐碱特性,逐渐成为畜牧业重要的饲料作物,明确高丹草耐盐、耐碱分子调控机制对高丹草分子辅助育种具有重要意义。本文对高丹草种子进行不同浓度的NaCl和Na_(2)CO_(3)胁迫,统计不同浓度下发芽率变化;高丹草幼苗进行200 mmol/L的NaCl和Na_(2)CO_(3)胁迫处理,不同时间段对整株幼苗可溶性糖、脯氨酸(PRO)、过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)和总超氧化物歧化酶(T-SOD)生理指标测定和转录组学表达分析。结果表明,相同浓度中性盐(NaCl)胁迫高丹草种子发芽率、根长均大于碱性盐(Na_(2)CO_(3))胁迫。随着胁迫时间延长,POD和CAT在中性盐胁迫时表现出逐渐下降趋势,碱性盐胁迫时呈逐渐增加趋势;PRO、可溶性糖和T-SOD在中性盐胁迫表现出逐渐增大趋势,碱性盐胁迫时表现出逐渐减小趋势。转录组学分析发现,在中性盐胁迫6、12和24 h后,分别鉴定出241个、293个和149个DEG,碱性盐胁迫后,分别鉴定出664个、641个和728个DEG。GO和KEGG聚类分析显示,盐和碱胁迫处理下参与氧化还原酶合成、渗透胁迫、细胞膜组分、细胞氧化解毒等相关DEG在高丹草苗期生长过程中应对盐碱胁迫响应发挥关键性作用,DEG主要集中在激素信号转导、光合代谢、氧化还原、糖代谢、核酸修复、苯丙烷生物合成等过程与非生物胁迫或逆境相关。盐碱胁迫条件下,高丹草幼苗应对环境刺激通过激素信号转导和氧化还原酶解毒。糖代谢和还原酶合成转运在耐盐碱品种中起到了重要作用。

关键词：高丹草盐碱胁迫转录组生理特性

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基于Illumina Bovine SNP 50K芯片对比利时蓝牛的遗传规律解析

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黑龙江畜牧兽医 2024年第20期 45-52,62,125,126页

作者：王雪艳李小鹏韩亚辉刘悦欣陶雪雨韩志鹏杨睿智张成龙周稳徐新如刘书东塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室新疆阿拉尔843300

为了研究大型肉牛比利时蓝牛生长发育的遗传规律,筛选优异基因,试验基于Illumina Bovine SNP 50K芯片数据,采用PLINK软件对270头比利时蓝牛常染色体数据进行基因组长纯合片段(ROH)检测并基于选择信号分析,通过核苷酸多态性检测取前5%的... 详细信息

为了研究大型肉牛比利时蓝牛生长发育的遗传规律,筛选优异基因,试验基于Illumina Bovine SNP 50K芯片数据,采用PLINK软件对270头比利时蓝牛常染色体数据进行基因组长纯合片段(ROH)检测并基于选择信号分析,通过核苷酸多态性检测取前5%的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,基于牛参考基因组(ARS-UCD1.2)对结果SNPs进行基因注释,对候选基因进行GO功能注释与KEGG信号通路富集分析,并计算染色体上ROH长度占基因组总长度的比例(FROH)。结果表明:在全部270个个体数据中共检测出1893个ROH片段,平均长度13.2311 Mb,平均FROH为0.0392;得到与生长发育相性状相关的基因有NEB、TET2、NEK11、NCKAP1、MYH15、EIF4A2、bta-miR-1248-1、DCAF8、PRORP、DOCK3、SYT15、MYEF2、ZDHHC13,与公牛生育能力相关的基因有CFAP61、DNAL1、BAG1。说明通过对比利时蓝牛生长发育性状相关分子标记的解析可以为比利时蓝牛遗传改良提供理论指导。

关键词：比利时蓝牛 Illumina Bovine SNP 50K芯片长纯合片段选择信号分析基因注释基因功能富集分析

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