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柽柳根际土壤链霉菌Streptomyces ***76323基因簇分析及代谢产物分离

中国抗生素杂志 2024年第11期49卷 1281-1288页

作者：陈乙煌任佳杨浩杰李缘卓王建明罗晓霞塔里木大学生命科学与技术学院阿拉尔843300 塔里木盆地生物资源保护利用省部共建国家重点实验室阿拉尔843300

目的利用链霉菌Streptomyces ***76323的基因组序列信息,分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物,为发现潜在新抗生素奠定基础。方法采用Illumina Novaseq对TRM76323菌株进行全基因组测序,结合antiSMASH、CARD、OrthoFinder... 详细信息

目的利用链霉菌Streptomyces ***76323的基因组序列信息,分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物,为发现潜在新抗生素奠定基础。方法采用Illumina Novaseq对TRM76323菌株进行全基因组测序,结合antiSMASH、CARD、OrthoFinder、Peppan软件进行基因组分析,进行代谢潜力、抗性基因和基因组差异预测,为指导新的微生物来源的天然产物的发现提供重要的理论指导,并利用现代分离技术获得代谢产物。结果TRM76323菌株的基因组序列由7,338,911 bp组成,G+C含量为72.1%,共31个生物合成基因簇,有糖肽类耐药等抗性基因、分离获得化合物β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛、环二肽和邻苯二甲酸二丁酯。结论柽柳根际土壤链霉菌Streptomyces ***76323有丰富的次级代谢产物生物合成基因簇,能产生多种次级代谢产物,具有进一步发掘新抗生素的价值。

关键词：柽柳根际链霉菌全基因组测序次级代谢产物

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不同生长阶段胡杨树离子分布、吸收和运移特征及其与土壤盐分的关系

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西北农业学报 2025年第1期34卷 140-152页

作者：王杰黄文娟姚诗雨彭承志宋双飞塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 塔里木盆地生物资源保护利用省部共建国家重点实验室新疆阿拉尔843300

为探讨胡杨适应盐渍环境的生理机制,探究不同生长阶段胡杨各器官离子分布与土壤离子的关系。以不同生长阶段的胡杨为试材,采用对幼苗、幼木、近熟木及过熟木的各器官离子含量进行分析比较方法,并通过各离子含量研究了胡杨各器官对土壤... 详细信息

为探讨胡杨适应盐渍环境的生理机制,探究不同生长阶段胡杨各器官离子分布与土壤离子的关系。以不同生长阶段的胡杨为试材,采用对幼苗、幼木、近熟木及过熟木的各器官离子含量进行分析比较方法,并通过各离子含量研究了胡杨各器官对土壤离子的选择性吸收、分布以及运输特征,以期了解土壤离子对胡杨不同生长阶段的影响。结果表明:(1)随着胡杨生长发育阶段的变化,胡杨各器官中的Na^(+)、Cl^(-)、HCO_(3)^(-)、Ca^(2+)含量普遍增加,而K^(+)、Mg^(2+)、SO_(4)^(2-)含量则呈现出不同变化趋势。这表明胡杨通过调节各离子之间的平衡来维持生理稳定。(2)胡杨各发育阶段的Na^(+)、K^(+)、Ca^(2+)、Cl^(-)主要分布在叶片和根系中,而Mg^(2+)、SO_(4)^(2-)、HCO_(3)^(-)则在不同器官间有所差异。这说明胡杨通过不同器官的离子分配来提高盐分排除或耐受能力。(3)胡杨各发育阶段,离子由根系向叶片运输的过程中,运输能力也存在差异,其中幼苗和幼木具有较强的K^(+)吸收和运输能力,而近熟木和成熟木则具有较强的Ca^(2+)运输能力。说明胡杨在不同生长阶段对不同离子的需求和利用程度不同,增强对盐渍环境的适应性,形成了适应逆境的离子调节机制。

关键词：胡杨离子分布离子吸收离子运输土壤盐渍化

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塔克拉玛干沙漠北缘发现红沙蚺兼记繁殖数量新纪录

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野生动物学报 2024年第1期45卷 222-225页

作者：夏可心史楠楠王智超程勇塔里木大学生命科学与技术学院阿拉尔843300 兵团塔里木盆地生物资源保护利用省部共建国家重点实验室培育基地阿拉尔843300

2017年5月—2021年10月,在塔克拉玛干沙漠北缘进行动物学野外实习和项目调研过程中,多次发现并采集到一种中小型蛇类。依据2017、2018年采集固定的2号标本及2020年采集到的母蛇,鉴定为红沙蚺(Eryx miliaris)。2020年采集到的母蛇产子16... 详细信息

2017年5月—2021年10月,在塔克拉玛干沙漠北缘进行动物学野外实习和项目调研过程中,多次发现并采集到一种中小型蛇类。依据2017、2018年采集固定的2号标本及2020年采集到的母蛇,鉴定为红沙蚺(Eryx miliaris)。2020年采集到的母蛇产子16条。本次在塔克拉玛干沙漠北缘发现红沙蚺及其繁殖数量为其分布和繁殖数量新纪录。标本保存于塔里木大学生命科学与技术学院动物学标本室(R-2017-1,R-2018-1)。

关键词：红沙蚺繁殖数量新疆塔里木盆地

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白麻NAC基因家族全基因组鉴定及其干旱胁迫下表达分析

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干旱地区农业研究 2025年第2期43卷 54-65页

作者：谢文龙王彦芹塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护与利用重点实验室新疆阿拉尔843300

基于白麻基因组数据,在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员,并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析,并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示,白麻的A... 详细信息

基于白麻基因组数据,在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员,并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析,并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示,白麻的ApNAC基因家族分布在10条染色体中,包括7对片段复制形成的共线性基因对和2对串联重复基因对。53个ApNAC家族成员可以分为15个亚家族,每个成员都含有5个以上的保守基序,同一个亚家族成员有着相似的基因结构。白麻NAC蛋白属于亲水性蛋白,亚细胞定位结果显示其以转录因子的形式发挥功能,并富集在DNA特异性结合功能以及木质部、叶片和细胞壁的发育调节功能中。启动子区域的顺式作用元件分析表明,ApNAC基因家族与脱落酸、干旱胁迫以及光响应调控相关。在30%PEG-6000诱导的干旱胁迫下,26个ApNAC成员在不同阶段发生差异表达,其中21个基因整体上调,5个基因下调。

关键词：白麻 NAC基因家族干旱胁迫基因差异表达

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碱胁迫下从布顿大麦分离的香柱菌属内生真菌对小黑麦生长和光合作用的影响

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菌物学报 2023年第7期42卷 1551-1557页

作者：王晓茜王凯陈锐路化乐刘嘉霏陈水红杜文华塔里木大学生命科学与技术学院塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 甘肃农业大学草业学院甘肃兰州730070

本研究以布顿大麦Hordeum bogdanii为材料,从中分离出香柱菌属内生真菌,经纯化后接种到小黑麦植株体内,检测接菌成功后,对获得的内生真菌-小黑麦共生体以非共生体为对照进行混合碱胁迫实验,研究内生真菌对小黑麦的耐碱性生长和光合作用... 详细信息

本研究以布顿大麦Hordeum bogdanii为材料,从中分离出香柱菌属内生真菌,经纯化后接种到小黑麦植株体内,检测接菌成功后,对获得的内生真菌-小黑麦共生体以非共生体为对照进行混合碱胁迫实验,研究内生真菌对小黑麦的耐碱性生长和光合作用的影响。混合碱胁迫下接种内生真菌的小黑麦植株与未接种植株相比,内生真菌具有促进小黑麦植株生长,光合色素的合成,对叶片相对含水量影响显著,增强植株的根系活力的作用,可以提高小黑麦植株对混合碱胁迫的耐受能力。这将有助于培育耐盐碱品种,为盐碱地的合理利用和草产业的可持续发展提供重要的理论依据。

关键词：内生真菌耐碱性光合作用

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添加抗生素对新疆特殊生境微生物分离培养的影响

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微生物学通报 2023年第8期50卷 3314-3329页

作者：文凤宋迎张珍李丽霞罗晓霞万传星夏占峰塔里木大学生命科学与技术学院新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室新疆阿拉尔843300

【背景】新疆特殊生境罗布泊及温宿峡谷凭借其特殊的地理位置、极端的周边自然生态环境及较少的人为活动影响,促成了其独特的微生物优质资源。【目的】为探索添加抗生素对微生物选择性分离培养的作用,优化改良新疆特殊生境微生物选择性... 详细信息

【背景】新疆特殊生境罗布泊及温宿峡谷凭借其特殊的地理位置、极端的周边自然生态环境及较少的人为活动影响,促成了其独特的微生物优质资源。【目的】为探索添加抗生素对微生物选择性分离培养的作用,优化改良新疆特殊生境微生物选择性分离培养,以减少对菌株的重复分离,还可以选择性培养更多耐受此类抗生素的微生物,发现更多生物活性产物。【方法】以高氏一号培养基为基础,添加不同浓度的β-内酰胺类抗生素阿莫西林(amoxicillin)、氨基糖苷类抗生素卡那霉素(kanamycin)、安莎大环内酯类抗生素利福平(rifampicin)、喹诺酮类抗生素诺氟沙星(norfloxacin)、酰胺醇类抗生素氯霉素(chloramphenicol)、氨基糖苷类抗生素链霉素(streptomycin),分离新疆特殊生境罗布泊及温宿峡谷土壤样品中的微生物。【结果】添加诺氟沙星分离获得的微生物种类和数量最多,其次是卡那霉素和阿莫西林,再次是利福平和氯霉素。所选用的大多抗生素在1/10 MIC和1/15 MIC浓度时分离效果最好。罗布泊土样共分离到19株菌,分布在8个属。其中芽孢杆菌属6株、链霉菌属5株、类芽孢杆菌属3株、根瘤菌属1株、副芽孢杆菌属1株、原小单孢菌属1株、海洋杆菌属1株、野野村氏菌属1株,分离获得了5株新物种。温宿峡谷土样共分离获得73个菌株,分布在27个属。其中链霉菌属33株、鞘氨醇单胞菌属1株、假黄单胞菌属2株、假诺卡氏菌5株、假节杆菌1株、原小单孢菌2株、普里斯特氏菌属1株、植物放线孢菌1株、副球菌属1株、类芽孢杆菌属2株、类节杆菌属2株、诺卡氏菌属1株、小单胞菌属1株、红色甲基杆菌属1株、甲基杆菌属1株、副芽孢杆菌属5株、伦茨氏菌属1株、克里布所菌属2株、耐盐白蚁菌属1株、剑菌属1株、博斯氏菌属1株、节杆菌属1株、壤霉菌属2株、土壤球菌属1株、放线动孢菌属1株、异壁放线菌属1株、芽孢杆菌属1株,分离获得了14株新物种。【结论】添加诺氟沙星和卡那霉素有利于微生物的选择性分离培养,有利于发掘新菌种,本研究的开展为选择性分离培养特殊环境中的稀有微生物提供了指导。

关键词：抗生素特殊生境选择性分离

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碱胁迫下内生真菌共生对布顿大麦抗氧化酶和ASA-GSH循环的影响

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山东农业科学 2024年第5期56卷 80-86页

作者：户萌菲龙凤陈胜宋瑶瑶陈水红王娟塔里木大学生命科学与技术学院/塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 阿克苏市农业农村局新疆阿克苏843000

内生真菌能够提高宿主植物的抗逆性,而碱胁迫使植物体内积累大量的活性氧,加速植物衰老和死亡。为探究碱胁迫下内生真菌对宿主布顿大麦抗氧化酶和抗坏血酸-谷胱甘肽(ASA-GSH)循环系统的影响,本试验以带内生真菌(E+)和不带内生真菌(E-)... 详细信息

内生真菌能够提高宿主植物的抗逆性,而碱胁迫使植物体内积累大量的活性氧,加速植物衰老和死亡。为探究碱胁迫下内生真菌对宿主布顿大麦抗氧化酶和抗坏血酸-谷胱甘肽(ASA-GSH)循环系统的影响,本试验以带内生真菌(E+)和不带内生真菌(E-)的布顿大麦为材料,设置0、25、50、100、150、200 mmol/L混合碱(Na_(2)CO_(3)+NaHCO_(3))胁迫处理,研究碱胁迫下内生真菌对布顿大麦过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)、超氧化物歧化酶(SOD)活性及叶片ASA-GSH循环中抗坏血酸过氧化物酶(APX)、谷胱甘肽还原酶(GR)、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)活性和谷胱甘肽(GSH)含量变化的影响。结果表明,在碱胁迫下,抗氧化酶和ASA-GSH循环系统均受内生真菌影响,E+布顿大麦中的POD和GR活性低于E-布顿大麦,而CAT、SOD和APX活性及GSH含量显著高于E-布顿大麦;低浓度碱胁迫下,E+布顿大麦叶片的GPX活性高于E-布顿大麦,但当碱浓度大于100 mmol/L时,则表现为E-高于E+。说明碱胁迫下内生真菌能够提高布顿大麦的抗氧化性,改变ASA-GSH循环,增强植株的抗逆性。本研究结果可为合理利用内生真菌进行布顿大麦抗逆新种质创新和新品种选育提供理论基础。

关键词：内生真菌布顿大麦碱胁迫抗氧化酶 ASA-GSH循环

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肿瘤干细胞生物学特性及其干性维持机制的研究进展

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生物工程学报 2024年第2期40卷 391-418页

作者：张文静赵可旭张可越陈晓阳郝明炫杨昭北京化工大学生命科学与技术学院分子诊断技术创新研究中心北京100029 塔里木大学生命科学与技术学院新疆生产建设兵团塔里木盆地生物资源保护利用重点实验室新疆阿拉尔843300

肿瘤是威胁人类健康和社会发展最为严重的疾病之一,也是全球第二大常见疾病死因。最新统计数据显示,恶性肿瘤在发达国家已取代心血管疾病成为第一大疾病死因。肿瘤的耐药、转移和复发,仍然是临床治疗中亟需解决的难题。肿瘤干细胞(tumor... 详细信息

肿瘤是威胁人类健康和社会发展最为严重的疾病之一,也是全球第二大常见疾病死因。最新统计数据显示,恶性肿瘤在发达国家已取代心血管疾病成为第一大疾病死因。肿瘤的耐药、转移和复发,仍然是临床治疗中亟需解决的难题。肿瘤干细胞(tumor stem cells,TSCs)是一类具有自我更新、分化潜能、高致瘤性和高耐药性等特征的细胞亚群,能够抵抗放化疗等非特异性治疗手段,在肿瘤发生、转移、耐药和复发中发挥关键作用。肿瘤干细胞标志物、干性维持机制、微环境和代谢重编程等领域已成为了研究热点,最新研究成果为肿瘤干细胞的鉴定和靶向治疗提供了新的靶标和策略。本文对肿瘤干细胞的表面标志物(CD133和CD44等)、自我更新和上皮细胞间充质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)信号通路(Wnt/β-catenin和Hedgehog等)、微环境特征、代谢重编程(糖酵解和氧化磷酸化等),及其在肿瘤的起始、发展、转移和耐药中的作用进行了综述。

关键词：肿瘤干细胞表面标志物自我更新转移微环境代谢重编程耐药

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布顿大麦TB1基因的克隆及内生真菌对其表达量的影响

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草业学报 2023年第8期32卷 176-185页

作者：韩丹龙凤陈胜户萌菲王栋陈水红塔里木大学生命科学与技术学院塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 塔里木大学动物科学与技术学院新疆阿拉尔843300 中国科学院深圳先进技术研究院广东深圳518055

分蘖生长在茎基部不伸长的节间,有不定根,能独立于主茎存活,禾本科作物布顿大麦主要通过分蘖来提高产量;内生真菌和基因均能调控布顿大麦分蘖,为了探究内生真菌对宿主植物分蘖相关基因TB1的影响,本研究利用RT-PCR法对布顿大麦TB1基因进... 详细信息

分蘖生长在茎基部不伸长的节间,有不定根,能独立于主茎存活,禾本科作物布顿大麦主要通过分蘖来提高产量;内生真菌和基因均能调控布顿大麦分蘖,为了探究内生真菌对宿主植物分蘖相关基因TB1的影响,本研究利用RT-PCR法对布顿大麦TB1基因进行克隆并测序,采用生物信息学方法对该基因的序列结果进行分析,用SYBR Green荧光染料法对新疆温宿县和青海柴达木盆地带内生真菌(E+)和不带内生真菌(E-)的布顿大麦TB1基因进行q-PCR相对表达量分析。结果显示,克隆的TB1基因蛋白质编码区(CDS)全长为804 bp,编码267个氨基酸残基;TB1基因无启动子和PolyA位点;经亚细胞定位,TB1蛋白预计在液泡,TB1蛋白无跨膜结构域、无信号肽、不属于跨膜蛋白、存在于TCP家族;推测TB1蛋白为不稳定蛋白质。布顿大麦TB1基因与大麦亚种的TB1同源性最高,为96.72%,且与大麦亚种的TB1处于同一支系。温宿县和柴达木盆地布顿大麦根、茎、叶中TB1基因表达量趋势一致,内生真菌显著降低了植株分蘖发生部位茎基部的TB1基因表达量,表明内生真菌侵染影响了宿主TB1基因表达进而调控宿主植物分蘖。研究结果为后续布顿大麦分蘖机制研究奠定了理论基础。

关键词：内生真菌布顿大麦 TB1基因荧光定量PCR

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乌恰县退牧还草工程对草地植被恢复贡献评估

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中国草地学报 2025年第1期47卷 13-26页

作者：周梦雪梁继业李郭杨赵平柴春强塔里木大学生命科学与技术学院新疆阿拉尔843300 右江民族医学院广西百色533000 塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室新疆阿拉尔843300 乌恰县草原工作站新疆乌恰县845450

以乌恰县的草地为研究对象,利用2008—2022年MODISMOD13Q1植被指数产品和同时期气象数据,采用Theil-Sen Median斜率估计、Mann-Kendall检验、相关性分析、标准化降水指数、残差分析方法等评估了乌恰县退牧还草成效。研究表明:(1)2008—2... 详细信息

以乌恰县的草地为研究对象,利用2008—2022年MODISMOD13Q1植被指数产品和同时期气象数据,采用Theil-Sen Median斜率估计、Mann-Kendall检验、相关性分析、标准化降水指数、残差分析方法等评估了乌恰县退牧还草成效。研究表明:(1)2008—2022年,乌恰草地植被指数呈逐年上升趋势,恢复面积约占草地总面积的97.59%,退化面积约占2.22%;(2)乌恰县草地增绿面积的贡献达53.49%,是国土增绿贡献比例最大的生态系统;(3)相关性分析表明,降水、云量与草地归一化植被指数(NDVI)呈显著正相关(P<0.05),气温与草地NDVI呈显著负相关(P<0.05);(4)标准化降水指数表明,在退牧还草等政策实施后草地NDVI没有受干旱的影响而下降,其抗旱能力有所加强;(5)残差分析表明,气候变化和人类活动的共同作用是草地恢复的主要驱动因素,约占86.62%,单独由气候变化和人类活动影响的区域约为0.81%和10.45%;(6)从贡献率上看,气候变化和人类活动对草地NDVI增加的贡献率约为16.83%和83.17%。综上,退牧还草工程有效减轻了乌恰县畜牧业对草地资源带来的负担,促进了草地植被的恢复,提高了草地对干旱环境的抵抗力。

关键词： NDVI 草地植被恢复残差分析人类活动气候变化

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