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第二届传染病诊治高峰论坛暨2009年浙江省感染病、肝病学术年会

作者：闻玉梅复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学实验室

流感病毒的致病性可从群体、个体及分子不同水平来分析:1.群体水平主要是从传播性、群体发病的严重性及群体对该病毒株的免疫保护性等方面综合评估。至8月底"甲流"确诊已达20.9余万例,死亡2185例,传播性极高。在所有死亡病例... 详细信息

流感病毒的致病性可从群体、个体及分子不同水平来分析:1.群体水平主要是从传播性、群体发病的严重性及群体对该病毒株的免疫保护性等方面综合评估。至8月底"甲流"确诊已达20.9余万例,死亡2185例,传播性极高。在所有死亡病例中40%年龄为青少

关键词：流感病毒传播性几个问题

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肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族研究进展

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微生物与感染 2010年第2期5卷 100-105页

作者：张俊琪瞿涤复旦大学上海医学院病原生物系上海200032 复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族(SPATE)蛋白是指致病性肠道杆菌通过自动转运方式产生的一类毒性蛋白。此类蛋白的氨基酸同源性可达35%～55%,均由3个部分组成:N端信号肽序列,协助分泌性毒性蛋白穿越细菌内膜;中部载乘区域,是发挥各种... 详细信息

肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族(SPATE)蛋白是指致病性肠道杆菌通过自动转运方式产生的一类毒性蛋白。此类蛋白的氨基酸同源性可达35%～55%,均由3个部分组成:N端信号肽序列,协助分泌性毒性蛋白穿越细菌内膜;中部载乘区域,是发挥各种生物学功能的主要结构域;C端转运单位,促使载乘结构域自细菌周浆间隙向胞外分泌。α螺旋的铰链区连接载乘区域和C端转运单位,其中14个氨基酸残基的组成序列EVNNLNKRMGDLRD非常保守,是蛋白酶水解位点,也是整个蛋白中最长的保守氨基酸序列,在SPATE蛋白的分泌和成熟过程中起着十分重要的作用,其改变往往会引起该蛋白家族不能正常分泌和成熟。目前,有研究将其作为药物作用的新靶点。

关键词：肠杆菌科丝氨酸蛋白酶自动转运家族结构转运分泌功能

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表皮葡萄球菌磷酸盐转运相关蛋白PhoU2生物学功能的研究

表皮葡萄球菌磷酸盐转运相关蛋白PhoU2生物学功能的研究

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中华医学会2016年全国临床微生物与免疫学术年会暨第十二次全球华人临床微生物学与感染症学术年会

作者：王小飞韩海燕吴旸瞿涤复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学实验室 200032

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以临床-实验室-临床模式研究抗原-抗体复合物型治疗性乙型肝炎疫苗

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传染病信息 2010年第4期23卷 193-195,226页

作者：汪萱怡闻玉梅复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学开放实验室 200032 复旦大学生物医学研究院

寻找新的治疗慢性乙型肝炎(乙肝)的途径,首先须要综合乙肝慢性化的机制。本研究选择以消除对乙肝病毒免疫耐受性为目标的治疗策略,通过对鸭乙肝病毒感染的幼鸭及乙肝表面抗原阳性的转基因小鼠的研究,发现注射特定比例的乙肝表面抗原-抗... 详细信息

寻找新的治疗慢性乙型肝炎(乙肝)的途径,首先须要综合乙肝慢性化的机制。本研究选择以消除对乙肝病毒免疫耐受性为目标的治疗策略,通过对鸭乙肝病毒感染的幼鸭及乙肝表面抗原阳性的转基因小鼠的研究,发现注射特定比例的乙肝表面抗原-抗体复合物可在部分动物模型中逆转免疫耐受性。用此策略在获得国家食品药品监督管理局批准后,进行了Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ期临床研究。本文报告了相应结果(Ⅲ期临床结果将于2010年底揭盲),并讨论了根据临床研究出现的问题进一步开展实验室研究的内容。

关键词：肝炎乙型慢性抗原抗体复合物临床试验疫苗

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临床堪萨斯分枝杆菌89株的鉴定和分型研究

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中华检验医学杂志 2009年第1期32卷 73-75页

作者：陈超徐鹏高谦姜平梅建南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 200095 上海市疾病预防控制中心结核病防制科复旦大学上海医学院教育部医学分子病毒学重点实验室

分枝杆菌属内除了结核分枝杆菌复合群和麻风分枝杆菌外统称为非结核分枝杆菌（non—tuberculosis mycobacteria，NTM），其数目迄今报道已达150种以上，且有不断增加的趋势。目前的研究表明NTM是一类广泛存在的环境分枝杆菌，人可从环... 详细信息

分枝杆菌属内除了结核分枝杆菌复合群和麻风分枝杆菌外统称为非结核分枝杆菌（non—tuberculosis mycobacteria，NTM），其数目迄今报道已达150种以上，且有不断增加的趋势。目前的研究表明NTM是一类广泛存在的环境分枝杆菌，人可从环境中感染NTM而患病。我国结核病流行病学调查显示，在肺病患者标本中检出NTM的比例呈现逐年增加的趋势。

关键词：非结核分枝杆菌 tuberculosis 结核分枝杆菌复合群分型鉴定萨斯临床麻风分枝杆菌

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上海松江2006-2011年新登记肺结核时空分布规律及影响因素

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中华疾病控制杂志 2014年第8期18卷 709-714页

作者：路丽苹洪建军高谦王伟炳上海市松江区疾病预防控制中心结核病防制科上海201620 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室上海200032 复旦大学上海医学院教育部卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的了解上海市松江区2006-2011年新登记肺结核(tuberculosis,TB)的时空分布规律及其影响因素。方法收集2006-2011年TB相关信息,应用时空扫描统计量探测TB的时空聚集区,应用Logistic回归模型分析影响TB聚集区形成的危险因素。结果松江区... 详细信息

目的了解上海市松江区2006-2011年新登记肺结核(tuberculosis,TB)的时空分布规律及其影响因素。方法收集2006-2011年TB相关信息,应用时空扫描统计量探测TB的时空聚集区,应用Logistic回归模型分析影响TB聚集区形成的危险因素。结果松江区2006-2011年新登记2 916例TB,单纯空间扫描统计显示全部TB及全部菌阳TB均在车墩镇聚集,本地TB及本地菌阳TB的空间聚集区为西南部的五个镇(新浜、石湖荡、小昆山、泖港和永丰),流动TB的聚集区为车墩镇,流动菌阳TB的聚集区为车墩镇、叶榭镇和泖港镇。时空扫描统计量显示松江区肺结核病例在2007-2008年出现聚集现象,聚集区域为工业区所在地的车墩镇和新桥镇。对于本地患者,农民职业者及就诊延误与空间聚集区呈独立相关;流动患者中,职业为蓝领工人、年龄小于60岁及来源于中国中西部地区是形成空间聚集区的危险因素。结论松江区TB的分布具有一定的时空聚集性。东部工业区是流动TB的聚集区域,西南五镇是本地TB的聚集区域,TB防控的工作重点应聚焦于这些区域;流动人口是TB聚集的重要因素,应重点关注。

关键词：结核,肺危险因素流行病学

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HBV感染与天然免疫

HBV感染与天然免疫

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第二届全国病毒感染与器官功能衰竭学术会议

作者：袁正宏复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室

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非霍奇金淋巴瘤患者脑膜脓毒黄杆菌肺部感染1例

非霍奇金淋巴瘤患者脑膜脓毒黄杆菌肺部感染1例

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2012全国临床微生物与感染免疫学术研讨会

作者：孙桂芹李蒙王蕾陈力复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室

目的阐述脑膜脓毒黄杆菌对免疫功能低下患者的1例肺部感染,以期临床能够重视该菌的分离、鉴定,在治疗时应根据药敏结果,合理选用抗生素。方法以一个非霍奇金淋巴瘤患者的肺部感染脑膜脓毒黄杆菌的病例分析为出发点,讨论脑膜脓毒黄杆菌... 详细信息

目的阐述脑膜脓毒黄杆菌对免疫功能低下患者的1例肺部感染,以期临床能够重视该菌的分离、鉴定,在治疗时应根据药敏结果,合理选用抗生素。方法以一个非霍奇金淋巴瘤患者的肺部感染脑膜脓毒黄杆菌的病例分析为出发点,讨论脑膜脓毒黄杆菌临床分离率增加、治疗困难的现状。结果脑膜脓毒黄杆菌感染因其多重耐药给临床治疗带来困难,使得该菌感染的死亡率升高,不合理使用抗生素和免疫抑制剂的使用给脑膜脓毒黄杆菌感染创造了条件,静脉导管、气管插管、呼吸机的广泛应用增加了脑膜脓毒黄杆菌接触感染的机率。结论脑膜脓毒性黄杆菌广泛存在,并引起人不同部位的感染,尤其随着广谱抗生素的广泛应用及导管在治疗时应根据药敏结果,合理选用抗生素。临床医务工作者应对脑膜炎脓毒黄杆菌有较全面的、新的认识,重视该菌的分离、鉴定及药敏实验,从而采取合理措施,控制该菌的感染,提高治疗效果。

关键词：脑膜脓毒黄杆菌非霍奇金淋巴瘤感染多重耐药

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脑膜脓毒黄杆菌的全基因组de novo测序及生物信息学分析

脑膜脓毒黄杆菌的全基因组de novo测序及生物信息学分析

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中华医学会第十次全国临床微生物学术年会暨第九届全球华人临床微生物与感染症学术论坛暨2013年浙江省医学微生物与免疫学及医学病毒学学术年会

作者：孙桂芹李蒙王蕾陈力复旦大学上海医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室

目的:脑膜脓毒黄杆菌(Elizabethkingiameningosepticum)又称脑膜炎败血伊丽莎白杆菌,引起人不同部位的感染,其多重耐药性给临床治疗带来严峻挑战。针对脑膜脓毒黄杆菌的研究主要是病例报道和耐药性分析,对该菌致病机制、毒力因子等方面... 详细信息

目的:脑膜脓毒黄杆菌(Elizabethkingiameningosepticum)又称脑膜炎败血伊丽莎白杆菌,引起人不同部位的感染,其多重耐药性给临床治疗带来严峻挑战。针对脑膜脓毒黄杆菌的研究主要是病例报道和耐药性分析,对该菌致病机制、毒力因子等方面缺乏研究,高通量测序技术的发展,不同微生物物种的基因组测序陆续完成,而脑膜脓毒黄杆菌的全基因组仍未完成,本研究对临床分离的1株引起呼吸道感染的脑膜脓毒黄杆菌进行全基因组从头测序(denovo测序),并进行生物信息学分析,为该菌的致病机制、耐药机制等研究奠定基础。方法:利用IlluminaHiseq2000测序平台,200倍的测序深度,用SOAPdenov(oV1.05)短序列组装软件进行组装,再用PCR补洞和验证。用Glimmer3.0软件进行基因预测,将基因的序列与KEGG、COG、GO等数据库进行比对,得到对应的功能注释信息。结果:经过denovo测序得到1条contig的序列,基因组大小为3,938,967bp,G+C含量35.63%,基因预测3,625个ORFs占基因组长度的88.39%,tRNA和rRNA分别占基因组长度的0.1016%和0.5566%。对耐药基因初步分析,发现有11个与β-内酰胺类抗生素耐药相关的候选基因。CRISPRFinder软件分析发现该菌基因组有一个与细菌的免疫相关CRISPR/Cas系统(clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats/CRISPR-associated)。结论:脑膜脓毒黄杆菌为条件致病菌,对健康人难以致病,易被临床重视,然而抗生素的广泛使用、免疫抑制剂使用量的增加及气管插管等,给脑膜脓毒黄杆菌感染创造了条件。本研究通过denovo测序国际上首次得到了脑膜脓毒黄杆菌全基因组信息的完成图,并进行了生物信息学分析,该序列信息已提交GeneBank数据库,为脑膜脓毒黄杆菌的致病机制、耐药机制等基础研究提供信息。

关键词：全基因组黄杆菌 de novo 生物信息学分析

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葡萄球菌基因组研究及其启示

葡萄球菌基因组研究及其启示

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中华医学会第八次全国感染病暨首届SARS专题学术会议

作者：闻玉梅复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室

基因组研究是指对研究对象的全部染色体或DNA染色体外遗传物质的核苷核进行测序,并作其功能预测或分析.葡萄球菌属中共有20余种,其中金葡菌引起的皮肤感染,全身性感染及毒素致病与表葡因生物膜引起的机会性感染最为常见.金葡被列为致病... 详细信息

基因组研究是指对研究对象的全部染色体或DNA染色体外遗传物质的核苷核进行测序,并作其功能预测或分析.葡萄球菌属中共有20余种,其中金葡菌引起的皮肤感染,全身性感染及毒素致病与表葡因生物膜引起的机会性感染最为常见.金葡被列为致病菌,而表葡则被列为条件致病菌.表葡菌中TIGR已对生物膜形成菌株RP62A进行了测序和分析,但尚未作报道.该室对不形成生物膜的表葡ATCC 12228株完成了基因组测序,分析.

关键词：葡萄球菌基因组测序致病基因组

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