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中国防痨杂志 2020年第6期42卷 583-589页

作者：洪创跃杨婷婷李金莉李霜君吴利凯杨争谭卫国深圳市慢性病防治中心实验室研究所和结核病防治科 518020 复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生健康委员会、医科院医学分子病毒学重点实验室

目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株... 详细信息

目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株进行全基因组测序,经与结核分枝杆菌标准菌株(H37Rv)基因组模板序列比对后获得447株满足分析要求的全基因组测序菌株。每株菌株经单核苷酸多态性(SNP)鉴定后与H37Rv各基因型和亚型的特异性突变和对11种抗结核药品已知的耐药基因突变进行比对,获得各菌株独属的基因型或亚型和耐药基因突变,并分析不同药品耐药基因中的主要耐药突变类型不同基因型或亚型间的相关性。结果447株MDR-MTB中全基因组测序结果显示,432株(96.6%)发生基因突变,MTB对11种药品主要的耐药突变类型分别为katG-315-S/T[INH,81.7%(353/432)]、rpoB-450-S/L[RFP,59.7%(258/432)]、rpsL-43-K/R[Sm,66.0%(198/300)]、embB-306-M/V[EMB,35.5%(94/265)]、pncA启动子-11-T/C[PZA,8.9%(11/123)]、gyrA-90-A/V[Ofx,31.5%(39/124)]、rrs-1401-A/G[Am,48.1%(25/52)]、rrs-1401-A/G[Cm,100.0%(27/27)]、rrs-1401-A/G[Km,84.4%(27/32)]、inhA-15-C/T[Eto,84.2%(48/57)]、thyA-75-H/N[PAS,31.3%(10/32)],且发现存在2种及2种以上联合突变者有对INH、RFP、EMB和Sm耐药的菌株。深圳市MDR-MTB菌株的3个基因型为L1[0.4%(2/447)]、L2[84.6%(378/447)]和L4[15.0%(67/447)]型,其中L2型又分为3个亚型[L2.1型:1.9%(7/378)、L2.2型:37.0%(140/378)、L2.3型:61.1%(231/378)]。突变类型为katG-315-S/T、rpsL-43-K/R和embB-306-M/V在L2型菌株中的突变率[分别为79.6%(301/378)、50.5%(191/378)、23.0%(87/378)]明显高于L4型菌株[分别为61.2%(41/67)、10.4%(7/67)、10.4%(7/67)](χ~2值分别为10.874、37.021、5.396,P值分别为0.001、0.000、0.020),且PAS耐药突变类型folC43-I/T和thyA-75-H/N仅出现在L2型菌株中;其中katG-315-S/T在L2.2型菌株中突变频率[88.6%(124/140)]高于L2.3型[74.5%(172/231)](χ~2=10.764,P=0.000),而inhA-15-C/T(INH)、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R和inhA-15-C/T(Eto)在L2.3型菌株中的突变频率[分别为8.2%(19/231)、61.9%(143/231)、59.3%(137/231)、15.6%(36/231)]明显高于L2.2型[分别为2.9%(4/140)、49.3%(69/140)、37.9%(53/140)、3.6%(5/140);χ~2值分别为4.319、5.668、16.053、12.797,P值分别为0.038、0.017、0.000、0.000)]。结论深圳市MDR-MTB菌株中11种药品耐药基因主要突变类型分别为katG-315-S/T、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R、embB-306-M/V、pncA启动子-11-T/C、gyrA-90-A/V、rrs-1401-A/G、inhA-15-C/T、thyA-75-H/N;基因型为L1、L2和L4型,以L2.2型、L2.3型和L4型为主。

关键词：结核,抗多种药物性基因组,细菌高通量核苷酸测序基因型寡核苷酸序列分析深圳

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基于gp41近膜端外部区域中和表位天然构象的人类免疫缺陷病毒1型疫苗的设计

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微生物与感染 2021年第3期16卷 145-163页

作者：曹妙苏珊叶玲陆路杨庆来姜世勃复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032 埃默里大学医学院微生物与免疫学系埃默里疫苗中心美国亚特兰大GA30322

疫苗一直被视为终结人类免疫缺陷病毒1型和2型(human immunodeficiency virus type 1/2,HIV-1/2)最有力的武器。位于HIV-1gp41胞外域C末端的近膜端外部区域(membrane-proximal external region,MPER)是一个重要的抗原位点,但糖蛋白41(glycoprotein 41,gp41)在野生型HIV-1的包膜蛋白中并未充分暴露,单独的gp41或MPER多肽无法模拟gp120/gp41包膜蛋白在病毒包膜上的天然状态。本研究以HIV-1gp41MPER为抗原进行疫苗设计,以期能诱导产生具有强效中和作用的MPER特异性抗体。通过在gp41的N末端七肽重复域(N-terminal heptad repeat,NHR)和C末端七肽重复域(C-terminal heptad repeat,CHR)引入突变,阻断二者相互作用形成6螺旋(6-helix bundle,6-HB)构象;使用不同来源的流感病毒HA1亚基替代gp120,以防止机体产生大量针对HA1的抗体,并构建一系列包含不同HA1亚基的HA/gp41-1605嵌合DNA。结果发现,在细胞上表达的嵌合疫苗抗原能更好地展示MPER上的中和表位,但不显示gp41上免疫优势抗原表位。使用构建的HA/gp41嵌合DNA疫苗对新西兰大耳兔进行肌肉内序贯免疫,提示该疫苗策略的确不可诱生高滴度的HA抗体或gp41的loop及6-HB特异性抗体,而能诱生MPER特异性抗体。然而,该抗体对HIV-1不具有中和作用,说明该疫苗策略还有待进一步优化。

关键词：人类免疫缺陷病毒1型疫苗糖蛋白41 近膜端外部区域天然构象

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脑膜炎败血伊丽莎白菌及其感染的研究进展

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微生物与感染 2021年第2期16卷 110-116页

作者：陆怡凯袁舒颖杨源博巫祺乐方子璇刘岩陈力孙桂芹浙江中医药大学医学技术与信息工程学院浙江杭州310053 复旦大学基础医学院病原生物学系教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032

脑膜炎败血伊丽莎白菌(Elizabethkingia meningoseptica,EM)是一种非发酵革兰氏阴性杆菌,为医院感染的重要病原菌之一,近年来其检出率呈上升趋势。EM易感人群主要为有基础疾病、免疫功能低下或缺陷、长期使用抗生素及有侵入性操作等的患... 详细信息

脑膜炎败血伊丽莎白菌(Elizabethkingia meningoseptica,EM)是一种非发酵革兰氏阴性杆菌,为医院感染的重要病原菌之一,近年来其检出率呈上升趋势。EM易感人群主要为有基础疾病、免疫功能低下或缺陷、长期使用抗生素及有侵入性操作等的患者,可引起脑膜炎、菌血症、肺部感染、眼部感染等,其多重耐药性给临床治疗带来了严峻挑战。EM除感染人类,还可感染蛙、鱼、龟、猪、犬类等动物。本文从EM的生物学特性、引发的感染类型、检测方法、感染危险因素等方面进行综述,以期对其有较全面的、新的认识,从而加强临床对其分离及检测的重视,为医院感染的预防与控制提供参考。

关键词：脑膜炎伊丽莎白菌生物学特性感染临床表现检测危险因素

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结核病比较免疫学,应对全球结核病挑战的技术关键

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结核与肺部疾病杂志 2023年第4期4卷 261-271页

作者：朱国峰余卫业汪源刘晓清高谦李亮卢洪洲深圳市第三人民医院/国家感染性疾病临床医学研究中心深圳518112 深圳市卫生经济协会深圳518020 国家科学技术部重大科技专项司北京100862 中国医学科学院北京协和医学院/北京协和医院内科学系感染内科/疑难重症及罕见病国家重点实验室北京100730 复旦大学基础医学院教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032 首都医科大学附属北京胸科医院北京101149

2013年MVA85A临床实验的失败,标志着全球结核病疫苗和药物研究进入一个全新的历史时代。以结核病比较免疫学竞争为核心的全球结核病防治创新理论研究和新型技术产品研发,是决定未来每个国家在全球结核病防治领域话语权和影响力的关键。... 详细信息

2013年MVA85A临床实验的失败,标志着全球结核病疫苗和药物研究进入一个全新的历史时代。以结核病比较免疫学竞争为核心的全球结核病防治创新理论研究和新型技术产品研发,是决定未来每个国家在全球结核病防治领域话语权和影响力的关键。这其中的关键,就是能否牢牢把握结核病比较免疫学的核心技术竞争实力,举得起结核病比较免疫学新技术时代的高科技大旗,并籍此抓实结核病临床负担向科研资源转型的机遇,抓实中外传染病防控政策交流关口转型的历史机遇。

关键词：结核免疫学技术疾病模型,动物疫苗比较免疫学

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葡萄球菌万古霉素耐药相关双组分系统VraSR研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2019年第2期39卷 150-156页

作者：陈红玲孟媛媛武有聪白丽瞿涤大理大学基础医学院病原生物学综合实验室 671000 大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室 671000 复旦大学上海医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室 200032

葡萄球菌万古霉素耐药相关(vancomycin-resistance associated sensor/regulator,VraSR)双组分系统能感应细胞壁的损伤,并将此信号传至胞内,调控下游相关基因的转录,以应对外界环境压力的变化。有研究表明,金黄色葡萄球菌VraSR通过调控... 详细信息

葡萄球菌万古霉素耐药相关(vancomycin-resistance associated sensor/regulator,VraSR)双组分系统能感应细胞壁的损伤,并将此信号传至胞内,调控下游相关基因的转录,以应对外界环境压力的变化。有研究表明,金黄色葡萄球菌VraSR通过调控一系列与肽聚糖合成相关基因的转录引起耐药性增加。表皮葡萄球菌中也存在类似的双组分系统,而且与金黄色葡萄球菌VraSR具有较高同源性,但是目前尚不清楚两者在耐药性及致病性上有什么异同。本文结合课题组研究工作,简要综述葡萄球菌VraSR双组分系统的调控机制。

关键词：双组分系统 VraSR 葡萄球菌

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我国甲型肝炎疫苗的研制及应用历程

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国际流行病学传染病学杂志 2021年第4期48卷 334-338页

作者：宋洁玉王松梅汪萱怡复旦大学附属华山医院感染科上海200040 复旦大学生物医学研究院暨教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032 复旦大学基础医学院医学实验教学中心上海200032 上海市重大传染病和生物安全研究院 200032 复旦大学附属儿科医院上海201102

甲型肝炎是一种古老的疾病,主要通过粪-口途径传播,人群对其普遍易感。甲型肝炎在世界各地均有流行,我国曾属于甲型肝炎高度流行区。1988年,由于江苏吕泗港海域毛蚶被污染,导致上海甲型肝炎大流行,发病率超过4%,总临床病例数高达29.2万... 详细信息

甲型肝炎是一种古老的疾病,主要通过粪-口途径传播,人群对其普遍易感。甲型肝炎在世界各地均有流行,我国曾属于甲型肝炎高度流行区。1988年,由于江苏吕泗港海域毛蚶被污染,导致上海甲型肝炎大流行,发病率超过4%,总临床病例数高达29.2万,之后,在党和政府的大力支持和推动下,我国甲型肝炎疫苗的研制开始加速,并获得了成功,有效地控制了甲型肝炎在我国的流行。

关键词：甲型肝炎疫苗流行模式影响中国免疫消除

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以质粒为基础的同源重组技术在葡萄球菌基因敲除中的应用

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中国人兽共患病学报 2019年第7期35卷 581-586页

作者：武有聪孟媛媛丁百兴韩海燕瞿涤白丽大理大学基础医学院病原生物学综合实验室大理671000 复旦大学医学分子病毒学教育部/卫健委重点实验室上海200032

葡萄球菌是医院内感染的重要病原菌,通过同源重组敲除葡萄球菌的靶基因是研究其功能的重要方法。以质粒为基础的重组系统是外源基因序列传递,发生同源重组的重要载体。近年来,葡萄球菌基因敲除所用的重组质粒的特性取得不断改进。结合... 详细信息

葡萄球菌是医院内感染的重要病原菌,通过同源重组敲除葡萄球菌的靶基因是研究其功能的重要方法。以质粒为基础的重组系统是外源基因序列传递,发生同源重组的重要载体。近年来,葡萄球菌基因敲除所用的重组质粒的特性取得不断改进。结合本课题组工作,简要综述以质粒为基础的同源重组技术在葡萄球菌基因敲除中的应用及技巧,重点比较不同质粒的特点及使用条件,对于葡萄球菌致病机制研究具有借鉴意义。

关键词：质粒同源重组基因敲除葡萄球菌

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糖相关分子在疾病中作用的研究进展

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药学进展 2021年第11期45卷 804-817页

作者：沈旦枫芦鑫荣邹琳王蕾孔维溧袁舒颖陈妍雯孙桂芹陈力复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032 永道致远科学技术有限公司上海200120 先思达生物科技有限公司江苏南京211800 浙江中医药大学医学技术与信息工程学院浙江杭州310053

生命体中的糖链及相关分子如糖基转移酶、糖苷水解酶和糖链结合蛋白等与健康和疾病密切相关。蛋白质和脂类糖基化是细胞内存在的重要的翻译后修饰过程,由糖基转移酶和糖苷水解酶协同完成。其过程与感染、肿瘤和其他疾病的相关性正日益... 详细信息

生命体中的糖链及相关分子如糖基转移酶、糖苷水解酶和糖链结合蛋白等与健康和疾病密切相关。蛋白质和脂类糖基化是细胞内存在的重要的翻译后修饰过程,由糖基转移酶和糖苷水解酶协同完成。其过程与感染、肿瘤和其他疾病的相关性正日益得到关注和重视。研究显示在癌症的进展过程中,糖基化相关基因表达水平有显著的变化,聚糖的生物合成通路为癌症、感染及遗传性疾病的诊治提供了新的思路。综述了糖相关分子在各类疾病中作用的研究进展。

关键词：糖相关分子血清标志物糖蛋白甘露糖糖苷酶感染肿瘤遗传性疾病

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单克隆抗体药物自主研发加速

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前沿科学 2020年第2期 77-81页

作者：王应丹傅琪情吴凡黄竞荷复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室上海公共卫生临床中心

自2019年12月以来,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情给人类健康和全球公共卫生安全带来严峻挑战.目前全球的科研机构和制药企业都在全力研究和开发用于预防和治疗新型冠状病毒的抗病毒药物,中和抗体是...

自2019年12月以来,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情给人类健康和全球公共卫生安全带来严峻挑战.目前全球的科研机构和制药企业都在全力研究和开发用于预防和治疗新型冠状病毒的抗病毒药物,中和抗体是研究的主要热点之一.

关键词：

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分枝杆菌经宿主GPR84促进感染诱导的脂滴生成并加速传染进程

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现代免疫学 2025年第1期45卷 7-13页

作者：周静热孜亚·吾买尔陈紫涵刘建新王德成晏博三峡大学基础医学院肿瘤微环境与免疫治疗湖北省重点实验室宜昌443002 三峡大学基础医学院宜昌市感染与炎症损伤研究所宜昌443002 上海市复旦大学附属公共卫生临床中心结核病研究中心上海201508 复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032 西藏民族大学医学部生命科学高校重点实验室咸阳712082

为探讨G蛋白偶联受体84(G-protein-coupled receptor 84,GPR84)基因在分枝杆菌感染中的作用,研究首先构建GPR84基因突变型斑马鱼,观察海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)感染后斑马鱼体内细菌的增殖情况及宿主生存期表型,机制上首先采... 详细信息

为探讨G蛋白偶联受体84(G-protein-coupled receptor 84,GPR84)基因在分枝杆菌感染中的作用,研究首先构建GPR84基因突变型斑马鱼,观察海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)感染后斑马鱼体内细菌的增殖情况及宿主生存期表型,机制上首先采用中性红染色及苏丹黑染色分别排除了GPR84对巨噬细胞和中性粒细胞发育的影响,并通过斑马鱼切尾实验评估GPR84缺失对中性粒细胞募集的影响。进一步通过油红O染色评估了染菌斑马鱼体内脂滴生成情况,并通过qRT-PCR检测感染后斑马鱼脂质代谢相关基因及炎性因子基因的转录水平。以上实验结果显示,斑马鱼瞬时敲除GPR84后能抑制体内分枝杆菌的增殖,延长宿主生存期,但GPR84缺失不影响巨噬细胞和中性粒细胞的发育,且不影响中性粒细胞的募集;GPR84突变型斑马鱼在分枝杆菌感染后脂滴生成减少,并且伴随着胆固醇的外排泵ATP结合盒转运蛋白G1(ATP-binding cassette transporter G1,ABCG1)基因表达下调,而炎性因子的mRNA表达上调。该研究提示分枝杆菌可能通过宿主GPR84诱导脂滴生成以抑制分枝杆菌感染过程中宿主炎性因子的表达,最终促进细菌传染进程。

关键词：分枝杆菌 G蛋白偶联受体84 脂滴斑马鱼

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