检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物与感染 2023年第1期18卷 2-12页

作者：石慧春焦凡珂徐巍陈永康陆路邹鹏复旦大学附属公共卫生临床中心上海201508 复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)感染所致的2019冠状病毒病(coronavirus disease 2019,COVID-19)给人民的生命健康造成了严重的威胁,目前该病毒仍然在广泛传播,针对SARS-CoV-2有效的治疗方法仍有限,因此寻找广谱中和抗体阻断SARS-CoV-2感染具有重要的意义。本文成功表达并纯化了3株靶向SARS-CoV-2的受体结合结构域(receptor-binding domain,RBD)的人鼠嵌合抗体,并且检测了这几株抗体对多种SARS-CoV-2假病毒和活病毒的中和活性。本研究表明这3株抗体能特异性地中和SARS-CoV-2野生型假病毒,IC 50分别为0.03μg/mL、0.06μg/mL、0.03μg/mL。此外,这3株抗体对Alpha株假病毒、Delta株假病毒和Lambda株假病毒也具有广谱中和活性,并可以抑制SARS-CoV-2 Delta株活病毒的复制。机制研究表明,这些抗体可以阻断SARS-CoV-2的S蛋白介导的细胞-细胞融合,且RBD上的K417、E484和N501位点可能是其与这3株抗体结合的关键位点。

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒2 受体结合结构域嵌合抗体中和抗体

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细胞因子在慢性乙型肝炎治疗中的研究进展

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临床肝胆病杂志 2022年第8期38卷 1710-1715页

作者：高子翔沈忠良刘晶谢幼华复旦大学教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海医学院基础医学院病原生物学系上海200032 复旦大学附属华山医院感染科上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室国家传染病医学中心上海200040 复旦大学生物医学研究院上海200032 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

目前,全球范围内仍有约2.5亿人慢性感染HBV,严重威胁人类的生命健康。慢性乙型肝炎(CHB)可进一步发展为肝纤维化、肝硬化和肝细胞癌等肝脏疾病,而现有的临床抗病毒治疗药物有限,治愈率很低,急需研发新型抗病毒药物。HBV具有强嗜肝性,自... 详细信息

目前,全球范围内仍有约2.5亿人慢性感染HBV,严重威胁人类的生命健康。慢性乙型肝炎(CHB)可进一步发展为肝纤维化、肝硬化和肝细胞癌等肝脏疾病,而现有的临床抗病毒治疗药物有限,治愈率很低,急需研发新型抗病毒药物。HBV具有强嗜肝性,自然情况下只感染人、黑猩猩等少数灵长类动物。免疫反应(固有免疫与适应性免疫)能否有效识别并清除或抑制HBV是导致病毒感染后不同结局的重要因素。其中,细胞因子发挥了重要的免疫调节作用。本文就一些关键细胞因子在CHB感染及治疗中的研究进展进行了总结与讨论。

关键词：乙型肝炎病毒细胞因子类乙型肝炎,慢性治疗学

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基于微滴数字PCR技术建立单细胞水平研究HBV的方法

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微生物与感染 2023年第5期18卷 269-277页

作者：马华杰邬敏张占卿袁正宏易志刚张小楠复旦大学附属上海市公共卫生临床中心上海201508 复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室上海200032 堪培拉大学生物医学系理学部澳大利亚首都直辖区2617

在单细胞水平研究肝组织内乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是十分重要的,但相关研究技术尚处于推进阶段,不能满足临床需要。基于微滴数字聚合酶链反应技术(digital droplet polymerase chain reaction,ddPCR),本研究建立了一套单... 详细信息

在单细胞水平研究肝组织内乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)是十分重要的,但相关研究技术尚处于推进阶段,不能满足临床需要。基于微滴数字聚合酶链反应技术(digital droplet polymerase chain reaction,ddPCR),本研究建立了一套单细胞水平绝对定量HBV DNA和RNA的单细胞微滴数字PCR方法(single-cell ddPCR,sc-ddPCR)。通过混合不同比例的HBV阳性和阴性细胞来模拟HBV慢性感染状态下的肝脏,分析此方法检测HBV DNA的线性和检测下限。以cccDNA来源RNA(episome-derived RNA,eRNA)为例,进一步设计针对eRNA的sc-ddPCR检测方案。利用不同来源转录本在结构上的差异,设计针对eRNA的特异性引物探针体系,在HBV肝癌细胞系中验证此引物和探针体系的特异度,并利用梯度稀释的HBV细胞株分析此方法检测eRNA的线性和检测下限。结果显示,本研究建立了基于ddPCR的DNA和RNA的单细胞水平检测方法,该方法表现出良好的线性(HBV DNA:R^(2)=0.9987;eRNA:R^(2)=0.9425),梯度稀释的HBV细胞株均能准确检测出阳性信号,具有高灵敏度(检测下限:HBV DNA为0.16%,eRNA为0.2%)。本研究建立的sc-ddPCR方法可针对多种DNA和RNA进行检测,为进一步研究肝组织内HBV病毒学活动提供了良好的技术支撑,可以更深入地分析肝组织内HBV的病毒学特征,从而有利于HBV治疗策略的优化和研发,具有广阔的应用前景。

关键词： HBV DNA cccDNA来源RNA 微滴数字PCR 单细胞

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鼠肝炎病毒A59毒株感染性克隆的构建及应用

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微生物与感染 2022年第3期17卷 139-147页

作者：于尹冯飞马艳龙朱云凯叶荣张荣复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032

鼠肝炎病毒(mouse hepatitis virus,MHV)是研究冠状病毒的模式病毒,但传统的病原学研究方法局限于自然界分离的病毒,不利于研究的开展。反向遗传操作系统可快速获得研究所需的重组病毒,为研究MHV及其他冠状病毒的基因组功能开辟了新途... 详细信息

鼠肝炎病毒(mouse hepatitis virus,MHV)是研究冠状病毒的模式病毒,但传统的病原学研究方法局限于自然界分离的病毒,不利于研究的开展。反向遗传操作系统可快速获得研究所需的重组病毒,为研究MHV及其他冠状病毒的基因组功能开辟了新途径。本研究通过反转录聚合酶链式反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)将MHV的原始毒株A59全长基因组分成6个片段进行扩增,分别克隆到质粒载体,经酶切、体外连接和转录获得全长基因组RNA,然后电转细胞并进行病毒扩增。结果显示,重组病毒rA59与原始毒株的复制特性相似,其为研究MHV的生物学特性提供了实验工具。为方便检测病毒的复制水平,在病毒基因组开放阅读框4(open reading frame 4,ORF4)内分别插入绿色荧光蛋白ZsGreen(Zoanthus *** fluorescent protein)和荧光素酶Nluc(NanoLuc luciferase)报告基因,获得rA59-ZsGreen和rA59-Nluc重组报告病毒。结果显示,报告病毒所携带的报告基因并不影响病毒复制,可很好地反映病毒的复制特性。使用这两种病毒验证瑞德西韦(remdesivir)的抗病毒活性,分别检测药物处理后病毒的荧光亮度和荧光素酶活性。结果表明,rA59-ZsGreen和rA59-Nluc重组报告病毒适用于高通量药物筛选,具有重要的应用前景。综上所述,本研究成功建立了MHV A59毒株六质粒反向遗传操作系统,为研究MHV的生物学特性和测试抗病毒药物等提供了有力的工具。

关键词：鼠肝炎病毒感染性克隆病毒拯救报告病毒

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SrrAB在葡萄球菌生长代谢及存活中的作用研究进展

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微生物学通报 2021年第2期48卷 596-605页

作者：孟媛媛乾莲郭姝蓉武有聪瞿涤大理大学基础医学院病原生物学综合实验室云南大理671000 大理大学基础医学院医学微生物学及免疫学教研室云南大理671000 复旦大学教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室上海200032

双组分信号转导系统SrrAB能够感应外界环境中氧浓度的变化,通过磷酸化水平的改变来调控靶基因的转录,进而影响葡萄球菌的多种生物学特性。研究发现SrrAB与葡萄球菌的毒力、生物膜的形成密切相关,而且有氧及厌氧条件下的调控机制不尽相... 详细信息

双组分信号转导系统SrrAB能够感应外界环境中氧浓度的变化,通过磷酸化水平的改变来调控靶基因的转录,进而影响葡萄球菌的多种生物学特性。研究发现SrrAB与葡萄球菌的毒力、生物膜的形成密切相关,而且有氧及厌氧条件下的调控机制不尽相同。然而,SrrAB与葡萄球菌的生长、代谢及其在病原体-宿主互作中的机制尚不清楚。结合课题组研究,本文就近年来SrrAB在葡萄球菌生长、代谢及其在葡萄球菌与宿主固有免疫细胞相互作用中的研究进展进行综述,为控制葡萄球菌引起的感染提供理论依据。

关键词：双组分信号转导系统 SrrAB 生长代谢葡萄球菌

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严重急性呼吸综合征冠状病毒2环境稳定性的研究进展

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微生物与感染 2022年第4期17卷 239-252页

作者：孙志平瞿涤复旦大学生物安全三级实验室上海200032 复旦大学上海医学院基础医学院医学分子病毒学教育部/卫健委/医科院重点实验室上海200032

2019冠状病毒病疫情席卷全球,其病原体严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)主要通过呼吸道飞沫以及密切接触(直接或间接接触)传播。接触病毒污染物体导致感染的风险也受到了广泛... 详细信息

2019冠状病毒病疫情席卷全球,其病原体严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)主要通过呼吸道飞沫以及密切接触(直接或间接接触)传播。接触病毒污染物体导致感染的风险也受到了广泛关注。本文对SARS-CoV-2在环境中稳定性的相关研究进行了综述。对SARS-CoV-2不同变异毒株的环境稳定性研究发现,在室温和常规湿度条件下,不同毒株在环境中的存活时间均与病毒滴度有关,低滴度(<104.0TCID50)病毒可在不同材料表面存活1~3 d,高滴度(>105.0TCID50)病毒可存活3~7 d。各种毒株在低温条件下均更加稳定。此外,研究未发现不同毒株对消毒剂的敏感性存在差异,醇基消毒剂、含氯消毒剂、表面活性剂等均能有效灭活SARS-CoV-2的不同变异株。当面临可能被病毒污染的环境时,应注意做好个人防护和手卫生,及时对环境表面进行消毒灭菌,以降低感染的风险。

关键词：严重急性呼吸综合征冠状病毒2 病毒存活消毒 2019冠状病毒病疫情防控

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Hepatology|不同表观转录状态下HBV cccDNA微染色体的稳定性差异

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临床肝胆病杂志 2022年第6期38卷 1382-1382页

作者：王洋陈捷亮 WANG Y LI Y ZAI W 复旦大学基础医学院病原生物学系暨医学分子病毒学教育部/卫健委重点实验室不详

HBV感染肝细胞后在细胞核形成共价闭合环状DNA(cccDNA)并以微染色体形式长期存留。由于cccDNA难以被现有药物有效靶向和清除,被认为是HBV感染慢性化和乙型肝炎难治愈的核心分子基础。

关键词： cccDNA 乙型肝炎 HBV感染肝细胞微染色体靶向

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学生结核病传播特点:一项12年的全人群前瞻性分子流行病学研究

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中华结核和呼吸杂志 2023年第1期46卷 19-26页

作者：李蒙郭明成邱勇张书张泽军陈闯高谦复旦大学基础医学院教育部、国家卫生健康委员会、中国医学科学院医学分子病毒学重点实验室上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032 四川省广安市武胜县疾病预防控制中心结核病防治科广安638401 四川省疾病预防控制中心结核病预防控制所成都610041

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态... 详细信息

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态性(SNP)判断簇菌株;使用logistic回归分析学生肺结核患者(简称学生患者)的成簇风险;对成簇患者进行流行病学调查以明确流行病学联系;基于全基因组测序数据和患者确诊时间,使用phybreak方法推断簇病例的传播方向。结果研究期间武胜县培养阳性患者共计1289例,其中7.6%(98/1289)为学生。学生患者中71.4%(70/98)是高中生,高三学生的比例为45.9%(45/98),初一和高一新生的比例为16.3%(16/98)。学生患者的成簇率为59.2%(58/98),其成簇风险是非学生患者的4.54倍(95%CI:2.44~8.45)。在涉及学生患者的传播事件中,33.3%(11/33)是学生之间的传播,66.7%(22/33)是学生与非学生之间的传播;学生与非学生之间的传播事件中只有5次(22.7%,5/22)是发生在家庭,其余的17次(77.3%,17/22)均发生在家庭外;学生患者之间的确诊间隔时间为1.3(0.4,2.7)年,学生与非学生之间的确诊间隔时间为5.3(1.9,6.8)年,两者差异有统计学意义(Z=2.86,P=0.004)。结论学生结核病主要是近期传播导致的;大部分的传播发生在学生和非学生之间,且主要发生在家庭外;学校结核病筛查策略显著缩短了患者发现时间;学校结核病防控必须与社区防控策略相结合才能取得理想的效果。

关键词：结核病分子流行病学基因组学生传播

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新冠病毒疫苗安全性和有效性的展望

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中国科学基金 2020年第5期34卷 581-587页

作者：王宾钟一维复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫健委重点实验室上海200032

2019年12月起,新型冠状病毒(以下简称"新冠病毒")率先在国内被检测出,随即在全球蔓延、爆发,虽然目前国内病毒传播得到了控制,但世界其他国家仍处于疫情的高发或平台期。截止到2020年7月26日,世界卫生组织报告新型冠状病毒肺... 详细信息

2019年12月起,新型冠状病毒(以下简称"新冠病毒")率先在国内被检测出,随即在全球蔓延、爆发,虽然目前国内病毒传播得到了控制,但世界其他国家仍处于疫情的高发或平台期。截止到2020年7月26日,世界卫生组织报告新型冠状病毒肺炎(以下简称"新冠肺炎")确诊病例15 581 009例,死亡病例635 173例,然而目前仍没有有效的预防和治疗手段。疫苗被认为是人类面对病毒感染最有效的预防手段,因此,世界各国都在加紧开发新冠病毒疫苗。据世界卫生组织统计,当前已有18款疫苗进入临床Ⅰ期,12款进入临床Ⅱ期,4款进入临床Ⅲ期。在临床研究中,评价疫苗在人体上的安全性和有效性是疫苗临床研究的关键点,同时也是难点。本篇综述将围绕着评估新冠疫苗安全性和有效性的几个关键问题展开讨论。由于前期对SARS和MERS疫苗的研发成果对于新冠疫苗也有一定的借鉴意义,因此,本文将这些成果与目前观察到的新冠病毒感染的临床免疫学特点相结合,以预测新冠疫苗研发可能的瓶颈以及解决思路。

关键词：新型冠状病毒肺炎疫苗免疫病理免疫持久性

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细菌鞭毛蛋白免疫调节作用及机制的研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2021年第5期41卷 395-399页

作者：肖振明赵超邬永琳徐俊复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫生健康委员会/医科院医学分子病毒学重点实验室 200032 复旦大学附属华山医院国家老年疾病临床医学研究中心上海200040 上海交通大学附属第六人民医院骨科 200233

鞭毛是位于某些细菌菌体表面细长呈波状弯曲的具有运动功能的蛋白质附属丝状物,不仅在细菌的运动与致病能力中起到重要作用,而且参与宿主多种免疫调节。鞭毛蛋白(flagellin)是形成鞭毛细丝主要部分的结构蛋白,可以被宿主细胞的Toll样受... 详细信息

鞭毛是位于某些细菌菌体表面细长呈波状弯曲的具有运动功能的蛋白质附属丝状物,不仅在细菌的运动与致病能力中起到重要作用,而且参与宿主多种免疫调节。鞭毛蛋白(flagellin)是形成鞭毛细丝主要部分的结构蛋白,可以被宿主细胞的Toll样受体5(TLR5)等受体识别,诱导机体免疫应答。目前,鞭毛蛋白因其免疫激活作用被广泛应用于新型免疫佐剂的研究,而其炎症抑制作用也在对抗免疫病理损伤方面具有良好前景。本文将对鞭毛蛋白的基本结构功能、宿主识别机制及其对宿主免疫系统起到的调节作用的研究进展作一概述。

关键词：细菌鞭毛蛋白 TLR5 免疫调节炎性抑制

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