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生物化学与生物物理进展 2024年第5期51卷 985-999页

作者：芦鑫荣童永亮孔维溧邹琳沈旦枫吕绍衔刘瑞杰张绍兴张瑜芯侯琳琳孙桂芹陈力复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生健康委员会重点实验室上海200032 浙江中医药大学医学技术与信息工程学院杭州310053 青岛农业大学动物医学院青岛266106

N-乙酰氨基葡萄糖苷内切酶(endo-beta-N-acetylglucosaminidase,ENGase)广泛分布于各种生物中,主要通过降解错误折叠的糖蛋白,参与细胞和生命的调控。ENGase也是糖链编辑的有效工具酶,可专一性水解游离寡糖链及糖肽或糖蛋白上核心五糖... 详细信息

N-乙酰氨基葡萄糖苷内切酶(endo-beta-N-acetylglucosaminidase,ENGase)广泛分布于各种生物中,主要通过降解错误折叠的糖蛋白,参与细胞和生命的调控。ENGase也是糖链编辑的有效工具酶,可专一性水解游离寡糖链及糖肽或糖蛋白上核心五糖的N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)之间的β-14糖苷键。其水解产物是寡糖链和一个GlcNAc,或带有一个GlcNAc的糖肽或糖蛋白。本文对ENGase的发现、分布、蛋白质结构、酶学反应及生物学功能进行阐述,为ENGase的生物学研究提供思路,为糖生物学与糖组学的应用研究奠定基础。

关键词： N-乙酰氨基葡萄糖苷内切酶 N-糖基化游离寡糖糖链编辑糖生物学

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N-糖蛋白去糖基化酶(PNGase)的研究进展

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生物化学与生物物理进展 2022年第9期49卷 1630-1637页

作者：陈妍雯袁舒颖刘瑞杰张绍兴邹琳芦鑫荣孔维溧陈力孙桂芹浙江中医药大学医学技术与信息工程学院杭州310053 复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生健康委员会重点实验室上海200032

N-糖蛋白去糖基化酶(PNGase)是一种广泛存在于真菌、植物、哺乳动物中的去糖基化酶,可以水解N-糖蛋白或N-糖肽上天冬酰胺与寡糖链连接的化学键,并释放出完整的N-寡糖。PNGase在生物体内参与蛋白质降解、器官发育、个体生长等过程。人PNG... 详细信息

N-糖蛋白去糖基化酶(PNGase)是一种广泛存在于真菌、植物、哺乳动物中的去糖基化酶,可以水解N-糖蛋白或N-糖肽上天冬酰胺与寡糖链连接的化学键,并释放出完整的N-寡糖。PNGase在生物体内参与蛋白质降解、器官发育、个体生长等过程。人PNGase基因功能缺陷会导致先天性去糖基化障碍,小鼠PNGase缺陷会导致胚胎致死性,线虫PNGase缺陷使其寿命下降。本文对PNGase在不同物种的分布、蛋白质结构、酶学功能及生物学功能进行阐述,为PNGase的生理病理功能及致病机制的基础研究提供思路,为PNGase作为糖生物学工具酶或药物开发的创新应用研究奠定基础。

关键词： N-糖蛋白去糖基化酶分布蛋白质结构酶学功能生物学功能

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糖蛋白过敏原N-糖链与过敏的相关性研究

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生物化学与生物物理进展 2024年第5期51卷 1023-1033页

作者：张瑜芯刘瑞杰张绍兴袁舒颖陈妍雯叶以琳林谦阁芦鑫荣童永亮陈力孙桂芹浙江中医药大学医学技术与信息工程学院杭州310053 嘉兴妇幼保健院检验科嘉兴314009 上海交通大学医学院附属仁济医院宁波医院宁波市杭州湾医院中心实验室宁波315336 复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生健康委员会重点实验室上海200032

糖蛋白是一种含有寡糖链的蛋白质,糖链与蛋白质之间以共价键相连。N-糖蛋白为常见过敏原之一,主要来源于食物、吸入物、昆虫毒素等,能够引起过敏反应。N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构影响过敏原与IgE的结合,影响抗原提呈细胞(APC)对过敏原... 详细信息

糖蛋白是一种含有寡糖链的蛋白质,糖链与蛋白质之间以共价键相连。N-糖蛋白为常见过敏原之一,主要来源于食物、吸入物、昆虫毒素等,能够引起过敏反应。N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构影响过敏原与IgE的结合,影响抗原提呈细胞(APC)对过敏原的识别和提呈。本文在介绍与过敏相关的N-糖蛋白、常见N-糖蛋白过敏原的N-糖链结构及与过敏相关的糖基化酶的基础上,进一步分析过敏原N-糖链影响过敏的机制,为临床预防与治疗过敏性疾病提供新的思路。

关键词：过敏反应 N-糖基化 N-糖链结构糖基化相关酶过敏机制

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糖苷酶抑制剂的基础与临床应用研究

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中国新药与临床杂志 2023年第3期42卷 145-152页

作者：刘瑞杰陈妍雯袁舒颖张绍兴芦鑫荣孔维溧陈力孙桂芹浙江中医药大学医学技术与信息工程学院浙江杭州310053 复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生健康委员会重点实验室上海200032

糖苷酶可水解含糖化合物的糖苷键,在细胞代谢和病毒识别中发挥着重要作用。糖苷酶异常与多种疾病相关,如病毒感染、糖尿病、溶酶体贮积症和癌症等。糖苷酶抑制剂可调控糖苷酶活性,用于疾病治疗。现已从植物和微生物中分离出上百种糖苷... 详细信息

糖苷酶可水解含糖化合物的糖苷键,在细胞代谢和病毒识别中发挥着重要作用。糖苷酶异常与多种疾病相关,如病毒感染、糖尿病、溶酶体贮积症和癌症等。糖苷酶抑制剂可调控糖苷酶活性,用于疾病治疗。现已从植物和微生物中分离出上百种糖苷酶抑制剂,其中α-葡糖苷酶抑制剂阿卡波糖、葡糖神经酰胺合成酶抑制剂麦格司他等已应用于临床。此外,糖苷酶在一些疾病中表达下调或缺失,其激活剂的研发也值得重视。

关键词：糖苷酶糖苷水解酶抑制剂药理作用机制糖尿病癌治疗

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学生结核病传播特点:一项12年的全人群前瞻性分子流行病学研究

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中华结核和呼吸杂志 2023年第1期46卷 19-26页

作者：李蒙郭明成邱勇张书张泽军陈闯高谦复旦大学基础医学院教育部、国家卫生健康委员会、中国医学科学院医学分子病毒学重点实验室上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032 四川省广安市武胜县疾病预防控制中心结核病防治科广安638401 四川省疾病预防控制中心结核病预防控制所成都610041

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态... 详细信息

目的利用在四川省武胜县开展的一项前瞻性结核病分子流行病学研究的数据,从全人群的角度分析学生结核病的传播。方法2009年7月1日至2020年12月31日,收集武胜县培养阳性肺结核患者的菌株进行全基因组测序,以菌株之间相差≤12单核苷酸多态性(SNP)判断簇菌株;使用logistic回归分析学生肺结核患者(简称学生患者)的成簇风险;对成簇患者进行流行病学调查以明确流行病学联系;基于全基因组测序数据和患者确诊时间,使用phybreak方法推断簇病例的传播方向。结果研究期间武胜县培养阳性患者共计1289例,其中7.6%(98/1289)为学生。学生患者中71.4%(70/98)是高中生,高三学生的比例为45.9%(45/98),初一和高一新生的比例为16.3%(16/98)。学生患者的成簇率为59.2%(58/98),其成簇风险是非学生患者的4.54倍(95%CI:2.44~8.45)。在涉及学生患者的传播事件中,33.3%(11/33)是学生之间的传播,66.7%(22/33)是学生与非学生之间的传播;学生与非学生之间的传播事件中只有5次(22.7%,5/22)是发生在家庭,其余的17次(77.3%,17/22)均发生在家庭外;学生患者之间的确诊间隔时间为1.3(0.4,2.7)年,学生与非学生之间的确诊间隔时间为5.3(1.9,6.8)年,两者差异有统计学意义(Z=2.86,P=0.004)。结论学生结核病主要是近期传播导致的;大部分的传播发生在学生和非学生之间,且主要发生在家庭外;学校结核病筛查策略显著缩短了患者发现时间;学校结核病防控必须与社区防控策略相结合才能取得理想的效果。

关键词：结核病分子流行病学基因组学生传播

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细菌鞭毛蛋白免疫调节作用及机制的研究进展

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中华微生物学和免疫学杂志 2021年第5期41卷 395-399页

作者：肖振明赵超邬永琳徐俊复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫生健康委员会/医科院医学分子病毒学重点实验室 200032 复旦大学附属华山医院国家老年疾病临床医学研究中心上海200040 上海交通大学附属第六人民医院骨科 200233

鞭毛是位于某些细菌菌体表面细长呈波状弯曲的具有运动功能的蛋白质附属丝状物,不仅在细菌的运动与致病能力中起到重要作用,而且参与宿主多种免疫调节。鞭毛蛋白(flagellin)是形成鞭毛细丝主要部分的结构蛋白,可以被宿主细胞的Toll样受... 详细信息

鞭毛是位于某些细菌菌体表面细长呈波状弯曲的具有运动功能的蛋白质附属丝状物,不仅在细菌的运动与致病能力中起到重要作用,而且参与宿主多种免疫调节。鞭毛蛋白(flagellin)是形成鞭毛细丝主要部分的结构蛋白,可以被宿主细胞的Toll样受体5(TLR5)等受体识别,诱导机体免疫应答。目前,鞭毛蛋白因其免疫激活作用被广泛应用于新型免疫佐剂的研究,而其炎症抑制作用也在对抗免疫病理损伤方面具有良好前景。本文将对鞭毛蛋白的基本结构功能、宿主识别机制及其对宿主免疫系统起到的调节作用的研究进展作一概述。

关键词：细菌鞭毛蛋白 TLR5 免疫调节炎性抑制

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深圳市耐多药结核分枝杆菌耐药基因突变特征分析

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中国防痨杂志 2020年第6期42卷 583-589页

作者：洪创跃杨婷婷李金莉李霜君吴利凯杨争谭卫国深圳市慢性病防治中心实验室研究所和结核病防治科 518020 复旦大学上海医学院基础医学院教育部、卫生健康委员会、医科院医学分子病毒学重点实验室

目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株... 详细信息

目的利用全基因组序列分析方法研究深圳市耐多药结核分枝杆菌(MDR-MTB)的耐药基因突变类型特点,为耐药结核病的快速分子检测提供依据。方法对2013—2017年深圳市慢性病防治中心及各区慢性病防治院门诊收集的所有449株MDR-MTB临床分离株进行全基因组测序,经与结核分枝杆菌标准菌株(H37Rv)基因组模板序列比对后获得447株满足分析要求的全基因组测序菌株。每株菌株经单核苷酸多态性(SNP)鉴定后与H37Rv各基因型和亚型的特异性突变和对11种抗结核药品已知的耐药基因突变进行比对,获得各菌株独属的基因型或亚型和耐药基因突变,并分析不同药品耐药基因中的主要耐药突变类型不同基因型或亚型间的相关性。结果447株MDR-MTB中全基因组测序结果显示,432株(96.6%)发生基因突变,MTB对11种药品主要的耐药突变类型分别为katG-315-S/T[INH,81.7%(353/432)]、rpoB-450-S/L[RFP,59.7%(258/432)]、rpsL-43-K/R[Sm,66.0%(198/300)]、embB-306-M/V[EMB,35.5%(94/265)]、pncA启动子-11-T/C[PZA,8.9%(11/123)]、gyrA-90-A/V[Ofx,31.5%(39/124)]、rrs-1401-A/G[Am,48.1%(25/52)]、rrs-1401-A/G[Cm,100.0%(27/27)]、rrs-1401-A/G[Km,84.4%(27/32)]、inhA-15-C/T[Eto,84.2%(48/57)]、thyA-75-H/N[PAS,31.3%(10/32)],且发现存在2种及2种以上联合突变者有对INH、RFP、EMB和Sm耐药的菌株。深圳市MDR-MTB菌株的3个基因型为L1[0.4%(2/447)]、L2[84.6%(378/447)]和L4[15.0%(67/447)]型,其中L2型又分为3个亚型[L2.1型:1.9%(7/378)、L2.2型:37.0%(140/378)、L2.3型:61.1%(231/378)]。突变类型为katG-315-S/T、rpsL-43-K/R和embB-306-M/V在L2型菌株中的突变率[分别为79.6%(301/378)、50.5%(191/378)、23.0%(87/378)]明显高于L4型菌株[分别为61.2%(41/67)、10.4%(7/67)、10.4%(7/67)](χ~2值分别为10.874、37.021、5.396,P值分别为0.001、0.000、0.020),且PAS耐药突变类型folC43-I/T和thyA-75-H/N仅出现在L2型菌株中;其中katG-315-S/T在L2.2型菌株中突变频率[88.6%(124/140)]高于L2.3型[74.5%(172/231)](χ~2=10.764,P=0.000),而inhA-15-C/T(INH)、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R和inhA-15-C/T(Eto)在L2.3型菌株中的突变频率[分别为8.2%(19/231)、61.9%(143/231)、59.3%(137/231)、15.6%(36/231)]明显高于L2.2型[分别为2.9%(4/140)、49.3%(69/140)、37.9%(53/140)、3.6%(5/140);χ~2值分别为4.319、5.668、16.053、12.797,P值分别为0.038、0.017、0.000、0.000)]。结论深圳市MDR-MTB菌株中11种药品耐药基因主要突变类型分别为katG-315-S/T、rpoB-450-S/L、rpsL-43-K/R、embB-306-M/V、pncA启动子-11-T/C、gyrA-90-A/V、rrs-1401-A/G、inhA-15-C/T、thyA-75-H/N;基因型为L1、L2和L4型,以L2.2型、L2.3型和L4型为主。

关键词：结核,抗多种药物性基因组,细菌高通量核苷酸测序基因型寡核苷酸序列分析深圳

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细胞因子风暴易发因素的检测和动态监测对重型和危重型新型冠状病毒肺炎的防控作用

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中华传染病杂志 2020年第3期38卷 189-192页

作者：严雨晨赵超牛辰杨浩荣星喻邬永琳复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫生健康委员会/医科院医学分子病毒学重点实验室 200032 国家老年疾病临床医学研究中心(复旦大学附属华山医院) 上海200041

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)与2003年发生的严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)有相似之处,但前者发生机制尚未阐明。现有证据提示,细胞因子风暴暴发过程与病毒感染的重症肺炎患者临床进程有潜在关联。现尝试... 详细信息

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)与2003年发生的严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome,SARS)有相似之处,但前者发生机制尚未阐明。现有证据提示,细胞因子风暴暴发过程与病毒感染的重症肺炎患者临床进程有潜在关联。现尝试借鉴SARS研究经验,结合细胞因子风暴暴发过程,探索COVID-19重型患者的临床进程。探讨动态监测细胞因子风暴对评估COVID-19患者病情的作用;并检测细胞因子风暴易发因素,用于及早预测病情由轻型转化为重型的潜在风险,从而为早期诊断和提早干预重型COVID-19提供线索。

关键词：冠状病毒感染肺炎新型冠状病毒肺炎细胞因子风暴病情评估病情恶化预测

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原发性EB病毒感染患儿的临床和实验室检查特征分析

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中华传染病杂志 2020年第5期38卷 279-282页

作者：沈军曹凌峰施鹏蔡启良俞蕙复旦大学附属儿科医院感染科上海201102 复旦大学附属儿科医院病毒实验室上海201102 复旦大学附属儿科医院信息中心上海201102 复旦大学基础医学院教育部/卫生健康委员会医学分子病毒学重点实验室上海201102

目的:了解原发性EB病毒感染患儿的临床和实验室检查特征。方法:回顾性分析2016年9月至2017年3月上海复旦大学附属儿科医院感染科诊治的210例原发性EB病毒感染患儿的临床特征(发热、皮疹等)及相关实验室检查结果(包括肝功能、EB病毒血清... 详细信息

目的:了解原发性EB病毒感染患儿的临床和实验室检查特征。方法:回顾性分析2016年9月至2017年3月上海复旦大学附属儿科医院感染科诊治的210例原发性EB病毒感染患儿的临床特征(发热、皮疹等)及相关实验室检查结果(包括肝功能、EB病毒血清学及分子生物学)。结果:210例原发性EB病毒感染患儿的年龄为(4.2±2.4)岁。发热187例(89.0%),扁桃体和(或)咽峡部渗出130例(61.9%),颈部淋巴结肿大204例(97.1%),眼睑水肿95例(45.2%),皮疹21例(10.0%),120例(57.1%)患儿有传染性单核细胞增多症典型三联症(发热、咽扁桃体炎和颈部淋巴结肿大)表现。实验室检查结果显示,177例(84.3%)患儿淋巴细胞计数≥5.0×10^9/L,184例(87.6%)患儿异型淋巴细胞比例≥0.10。96例(45.7%)患儿转氨酶升高,对72例患儿随访至转氨酶恢复正常,6周内恢复正常占97.2%(70/72)。EB病毒衣壳抗原IgM抗体阳性192例(91.4%),EB病毒衣壳抗原IgG抗体阳性182例(86.7%),EB病毒早期抗原IgG抗体阳性62例(29.5%),EB病毒核心抗原IgG抗体均为阴性。199例患儿完成EB病毒DNA检测,阳性122例(61.3%)。结论:原发性EB病毒感染以学龄前儿童为主,大部分患儿有颈部淋巴结肿大伴发热,且EB病毒血清学指标阳性,部分患儿出现转氨酶一过性升高。

关键词： EB病毒原发性感染儿童

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