检索结果-内蒙古大学图书馆

微生物学报 2016年第9期56卷 1496-1503页

作者：施旭骏赵超牛辰高谦复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴... 详细信息

【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库对差异蛋白进行生物信息学分析。【结果】共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7)。生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能。其中Des A3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能。【结论】通过i TRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础。

关键词：分枝杆菌定量蛋白质组学 iTRAQ mkl基因

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海分枝杆菌ppk基因的生物学功能研究

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复旦学报（医学版） 2016年第6期43卷 649-656页

作者：祝琳施旭骏高谦复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032

目的构建海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)ppk基因敲除株,对其生物学功能进行研究。方法利用基因同源重组技术,构建了海分枝杆菌ppk基因敲除株;使用DAPI染色法检测细菌胞内多聚无机磷酸盐(poly inorganic phosphate,poly-Pi)浓度;比... 详细信息

目的构建海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)ppk基因敲除株,对其生物学功能进行研究。方法利用基因同源重组技术,构建了海分枝杆菌ppk基因敲除株;使用DAPI染色法检测细菌胞内多聚无机磷酸盐(poly inorganic phosphate,poly-Pi)浓度;比较野生株及突变株在不同环境压力下的生存能力;用野生株和突变株分别感染斑马鱼成鱼,通过观察斑马鱼的存活情况,研究ppk基因对海分枝杆菌毒力的影响。将野生株和突变株分别感染小鼠来源的巨噬细胞系RAW267.4,检测其在巨噬细胞内的增殖。结果 ppk突变株胞内polyPi浓度明显下降;在斑马鱼成鱼感染模型中出现显著减毒表型;其在小鼠来源的巨噬细胞感染模型中的增殖较野生型菌株明显减弱;在营养缺陷、抗生素(利福平、左氧氟沙星)等环境压力下,其生存能力下降。结论 ppk基因影响分枝杆菌在环境压力下的生存,并且在其致病中发挥重要作用。

关键词：分枝杆菌多聚磷酸盐激酶多聚无机磷酸盐

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高内涵筛选结合活细胞实时成像技术分析谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡

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复旦学报（医学版） 2015年第4期42卷 538-542页

作者：乔可崔士超胡捷先陈献华复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032 复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部医学神经生物学国家重点实验室上海200032

目的利用高内涵筛选(high-content screening,HCS)技术结合活细胞实时成像技术研究谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡的形态学变化特征。方法用HCS技术分析摸索不同浓度谷氨酸诱导的N2a细胞早期凋亡百分比的变化,同时结合活细胞实时... 详细信息

目的利用高内涵筛选(high-content screening,HCS)技术结合活细胞实时成像技术研究谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡的形态学变化特征。方法用HCS技术分析摸索不同浓度谷氨酸诱导的N2a细胞早期凋亡百分比的变化,同时结合活细胞实时成像技术追踪谷氨酸诱导的N2a凋亡的形态学变化特征。结果当谷氨酸浓度为750μg/mL时,发生早期凋亡的N2a细胞比例达到峰值(42.07%)。对同一谷氨酸浓度,随着拍摄追踪时间的增加,凋亡细胞数目逐渐增多,胞核荧光强度的变异系数逐渐增大,胞核面积逐渐缩小,胞核逐渐出现碎片化。结论使用HCS结合活细胞实时成像技术能直观清晰地捕捉谷氨酸诱导N2a细胞凋亡的形态学变化特征,是一种体外追踪单一细胞凋亡形态学变化的可靠方法。该方法也可应用于药物对细胞凋亡的促进或抑制作用的形态学变化特征的研究。

关键词：谷氨酸神经瘤母细胞N2a 高内涵筛选变异系数

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结核分枝杆菌利福平耐药菌株补偿性突变的系统性鉴定

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中华结核和呼吸杂志 2018年第3期41卷 207-212页

作者：左天宇柳清云甘明宇高谦复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的系统性鉴定MTB利福平耐药菌株rpoA、rpoB及rpoC基因补偿性突变的类型，评估不同rpoB基因耐药突变类型及MTB遗传背景对补偿性突变发生的影响。方法搜索并下载已发表的MTB全基因组测序数据，根据已知的利福平耐药突变从中鉴定出利福... 详细信息

目的系统性鉴定MTB利福平耐药菌株rpoA、rpoB及rpoC基因补偿性突变的类型，评估不同rpoB基因耐药突变类型及MTB遗传背景对补偿性突变发生的影响。方法搜索并下载已发表的MTB全基因组测序数据，根据已知的利福平耐药突变从中鉴定出利福平耐药的MTB株，构建系统发育树并利用平行进化的筛选标准鉴定出可能的补偿性突变；统计不同rpoB基因耐药突变类型和不同型的利福平耐药菌株携带补偿性突变的比例，利用卡方检验进行统计学分析。结果从欧洲核酸序列数据库共获得全球8 453株MTB全基因组测序数据（覆盖12个国家），其中1 749株为利福平耐药菌株。通过系统发育分析共鉴定出60种补偿性突变类型（rpoA基因上的突变6种，rpoB基因上的突变16种，rpoC基因上的突变38种）；携带rpoB S450L突变的利福平耐药菌株（41.7%，279/669）比其他利福平耐药突变积累补偿性突变的比例更高[8.0%（31/388），χ2＝378.5，P〈0.000 1]；2型的利福平耐药菌株（34.0%）比其他型的菌株积累补偿性突变的比例更高[1型：4.7%（2/43），3型：12.5%（4/32），4型：15.1%（78/517）；χ2＝238.5，P〈0.000 1]。结论本研究系统性鉴定了MTB利福平耐药相关的补偿性突变类型，并发现携带rpoB基因S450L突变或属于2型的利福平耐药菌株更容易积累补偿性突变。

关键词：分枝杆菌结核抗药性利福平突变

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RNA编辑酶ADAR1对EV71感染及变异的影响

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复旦学报（医学版） 2017年第3期44卷 253-260页

作者：刘晴晴常章梅白金金王艳龙健儿复旦大学基础医学院病原生物学系-卫生部、教育部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的研究RNA编辑酶腺苷酸脱氨酶(adenosine deaminase acting on RNA,ADAR1)对新型肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染及变异的影响。方法运用RNAi技术筛选ADAR1基因沉默稳定细胞株,通过MTT分析病毒感染后细胞活力变化、噬斑形成分... 详细信息

目的研究RNA编辑酶腺苷酸脱氨酶(adenosine deaminase acting on RNA,ADAR1)对新型肠道病毒71型(enterovirus 71,EV71)感染及变异的影响。方法运用RNAi技术筛选ADAR1基因沉默稳定细胞株,通过MTT分析病毒感染后细胞活力变化、噬斑形成分析病毒滴度及细胞对病毒的敏感性,以及Western blot测定病毒蛋白表达水平等,分析ADAR1对EV71感染的影响。由于ADAR1介导的RNA编辑可使基因形成A-G或T-C突变,为确定ADAR1影响EV71感染是否与其编辑EV71基因组导致病毒变异有关,对EV71流行区EV71的突变特征进行分析;并利用EV71感染ADAR1基因沉默细胞,通过对病毒基因组测序分析,研究ADAR1是否直接编辑EV71基因组。结果 ADAR1基因沉默后,与对照细胞相比,病毒感染细胞的存活率下降更快,并形成更多、更大的噬斑。病毒感染细胞中的VP1蛋白和细胞培养基上清中的病毒滴度均明显增加。EV71突变特征分析表明,虽然A-G和T-C之间的变异是病毒突变的主要类型,但EV71感染实验初步证明,ADAR1并不直接编辑EV71病毒基因组。结论 ADAR1可能具有抗EV71感染的作用,但ADAR1可能并不直接编辑EV71基因组。

关键词： EV71 ADAR1 RNA编辑病毒突变

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病毒IRES的结构及IRES介导的蛋白质翻译研究进展

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生命科学 2021年第4期33卷 407-418页

作者：傅美贤龙健儿复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032

核糖体进入位点(internal ribosome entry sites,IRES)常见于许多正链RNA病毒基因组以及部分细胞基因。在营养缺乏、内质网应激、缺氧和病毒感染等不利条件下,细胞翻译也能够从经典的帽子依赖型翻译转换为依赖于IRES的翻译机制。事实上,... 详细信息

核糖体进入位点(internal ribosome entry sites,IRES)常见于许多正链RNA病毒基因组以及部分细胞基因。在营养缺乏、内质网应激、缺氧和病毒感染等不利条件下,细胞翻译也能够从经典的帽子依赖型翻译转换为依赖于IRES的翻译机制。事实上,自IRES被发现以来,其相关的翻译机制调控被认为是病毒感染的关键步骤,对病毒毒力、组织靶向性和致病性具有重要作用。因此,研究IRES的结构及其功能有助于揭示病毒致病的机制,对发展有效的病毒预防或控制策略具有重要意义。该文主要对RNA病毒中目前发现的IRES结构、类型及其相关的反式调控因子和作用机制作一综述。

关键词： IRES依赖型蛋白翻译 IRES结构 IRES反式调控因子

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CpG岛岸甲基化调控人T细胞系中lag3表达

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中华微生物学和免疫学杂志 2015年第7期35卷 491-495页

作者：郝书民仇超张林霞张晓燕徐建青复旦大学附属公共卫生临床中心上海201508 复旦大学生物医学研究院复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室

目的探讨表观遗传因素DNA甲基化对人T细胞系中淋巴细胞活化基因3（1ympho—cyteactivationgene3，lag3）表达的影响。方法检测不同T细胞系中lag3的表达水平，选定lag3表达高低相对的细胞系组成研究系统。分析lag3启动子和转录区的CpG分... 详细信息

目的探讨表观遗传因素DNA甲基化对人T细胞系中淋巴细胞活化基因3（1ympho—cyteactivationgene3，lag3）表达的影响。方法检测不同T细胞系中lag3的表达水平，选定lag3表达高低相对的细胞系组成研究系统。分析lag3启动子和转录区的CpG分布以确定潜在表观调控区（CpG岛和CpG岛岸），分别测定各T细胞系中相关区段的DNA甲基化水平。用5-杂氮胞苷（5-Aza．2＇-deoxycytidine，5-Aza-2’-dc）对细胞系做去甲基化处理，检测z0邸表达水平及DNA甲基化水平的变化。结果lag3表达水平在***1．6和CEM细胞中极低，在JurkatE6-1细胞中相对较高。不同细胞系中，CpG岛均高度甲基化；CpG岛岸在***1．6和CEM细胞中高度甲基化，但在JurkatE6—1细胞中甲基化水平较低。5-Aza-2’-dc处理后，***1．6和CEM细胞中lag3mRNA和蛋白质的表达均显著上调，且伴随CpG岛岸去甲基化；而JurkatE6-1细胞中，未见CpG岛岸甲基化和lag3表达水平的显著变化。5-Aza-2＇-dc处理不能使CpG岛去甲基化。结论CpG岛岸的甲基化与去甲基化是lag3转录的表观调控开关。

关键词： DNA甲基化 CpG岛岸 lag3 人T细胞系

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活细胞成像技术实时追踪荧光蛋白标记的分枝杆菌的胞内增殖

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复旦学报（医学版） 2014年第3期41卷 384-388页

作者：乔可王晴岚李紫煜牛辰复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032 北京东胜创新生物科技有限公司分子影像部北京100085

目的利用绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）标记和活细胞显微成像的方法,实时追踪分枝杆菌在巨噬细胞内的增殖过程。方法用经GFP标记的野生型海分枝杆菌（Mycobacterium marinum,Mm）分别侵染未激活和γ-干扰素激活的巨... 详细信息

目的利用绿色荧光蛋白（green fluorescent protein,GFP）标记和活细胞显微成像的方法,实时追踪分枝杆菌在巨噬细胞内的增殖过程。方法用经GFP标记的野生型海分枝杆菌（Mycobacterium marinum,Mm）分别侵染未激活和γ-干扰素激活的巨噬细胞,使用活细胞显微成像系统连续记录胞内分枝杆菌的增殖动态,同时优化不同细胞接种浓度和感染复数（multiplicity of infection,MOI）对胞内菌增殖动态的追踪效果。结果使用GFP标记和活细胞成像的方法可以实时追踪胞内分枝杆菌的增殖过程和形态学变化。γ干扰素对Mm在巨噬细胞中的增殖有抑制作用。当接种巨噬细胞浓度为1×105/孔,MOI为1时,可直观清晰地分析实时追踪图像中胞内菌的增殖过程。结论通过活细胞成像技术分析荧光蛋白标记的分枝杆菌,可实时追踪巨噬细胞内分枝杆菌增殖过程和形态学变化,是一种体外分析胞内分枝杆菌增殖的理想方法,可应用于其他相关病原菌和宿主相互作用及影响因素的研究。

关键词：海分枝杆菌(Mm) 巨噬细胞活细胞成像细菌增殖感染复数(MOI)

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分枝杆菌经宿主GPR84促进感染诱导的脂滴生成并加速传染进程

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现代免疫学 2025年第1期45卷 7-13页

作者：周静热孜亚·吾买尔陈紫涵刘建新王德成晏博三峡大学基础医学院肿瘤微环境与免疫治疗湖北省重点实验室宜昌443002 三峡大学基础医学院宜昌市感染与炎症损伤研究所宜昌443002 上海市复旦大学附属公共卫生临床中心结核病研究中心上海201508 复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032 西藏民族大学医学部生命科学高校重点实验室咸阳712082

为探讨G蛋白偶联受体84(G-protein-coupled receptor 84,GPR84)基因在分枝杆菌感染中的作用,研究首先构建GPR84基因突变型斑马鱼,观察海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)感染后斑马鱼体内细菌的增殖情况及宿主生存期表型,机制上首先采... 详细信息

为探讨G蛋白偶联受体84(G-protein-coupled receptor 84,GPR84)基因在分枝杆菌感染中的作用,研究首先构建GPR84基因突变型斑马鱼,观察海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)感染后斑马鱼体内细菌的增殖情况及宿主生存期表型,机制上首先采用中性红染色及苏丹黑染色分别排除了GPR84对巨噬细胞和中性粒细胞发育的影响,并通过斑马鱼切尾实验评估GPR84缺失对中性粒细胞募集的影响。进一步通过油红O染色评估了染菌斑马鱼体内脂滴生成情况,并通过qRT-PCR检测感染后斑马鱼脂质代谢相关基因及炎性因子基因的转录水平。以上实验结果显示,斑马鱼瞬时敲除GPR84后能抑制体内分枝杆菌的增殖,延长宿主生存期,但GPR84缺失不影响巨噬细胞和中性粒细胞的发育,且不影响中性粒细胞的募集;GPR84突变型斑马鱼在分枝杆菌感染后脂滴生成减少,并且伴随着胆固醇的外排泵ATP结合盒转运蛋白G1(ATP-binding cassette transporter G1,ABCG1)基因表达下调,而炎性因子的mRNA表达上调。该研究提示分枝杆菌可能通过宿主GPR84诱导脂滴生成以抑制分枝杆菌感染过程中宿主炎性因子的表达,最终促进细菌传染进程。

关键词：分枝杆菌 G蛋白偶联受体84 脂滴斑马鱼

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逆转录聚合酶链反应、间接免疫荧光试验和酶联免疫吸附试验检测严重急性呼吸综合征相关冠状病毒感染的探讨

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上海医学 2004年第12期27卷 936-938页

作者：周志统蒋伟伦袁正宏沈芳瞿涤顾仕民傅龙亭张仁芳上海市传染病医院 200083 复旦大学上海医学院教育部/卫生部分子病毒重点实验室

严重急性呼吸综合征(SARS)是2002年底首先在我国南部地区爆发流行的一种新型传染病,2003年4月经世界卫生组织(WHO)组织的国际多中心合作网络研究确定,该病由新发现的SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)所致.目前虽已初步建立了包括逆转录聚合... 详细信息

严重急性呼吸综合征(SARS)是2002年底首先在我国南部地区爆发流行的一种新型传染病,2003年4月经世界卫生组织(WHO)组织的国际多中心合作网络研究确定,该病由新发现的SARS相关冠状病毒(SARS-CoV)所致.目前虽已初步建立了包括逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)、免疫荧光试验(IFA)和酶联免疫吸附试验(ELISA)的特异性检测方法,对SARS的诊断起到重要作用,但均存在一定的局限性,尚不能充分满足早期诊断和防治的需要.为此,WHO建议对SARS的诊断仍以流行病学和临床的发现为主,并积极推动实验室诊断水平的进一步提高.2003年3～6月上海市传染病医院,承担了上海市SARS临床诊断和疑似病例的收治,并对临床诊断SARS病例、部分疑似病例和密切接触者的各类标本先后进行了相应的RT-PCR、IFA和ELISA检测,现报道如下.……

关键词：相关冠状病毒逆转录聚合酶链反应严重急性呼吸综合征酶联免疫吸附试验诊断 SARS 爆发流行南部地区月经

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