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中国感染与化疗杂志 2020年第2期20卷 157-162页

作者：丁丽吴旸李培林东昉复旦大学附属华山医院抗生素研究所国家卫健委抗生素临床药理重点实验室上海200040 复旦大学基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室

目的了解肠球菌属生物膜形成能力及其毒力基因携带率,分析生物膜的形成能力与毒力基因间的相关性。方法收集复旦大学附属华山医院2015-2017年临床分离自无菌体液的肠球菌属细菌,使用结晶紫染色法测定肠球菌的生物膜形成能力并进行形成... 详细信息

目的了解肠球菌属生物膜形成能力及其毒力基因携带率,分析生物膜的形成能力与毒力基因间的相关性。方法收集复旦大学附属华山医院2015-2017年临床分离自无菌体液的肠球菌属细菌,使用结晶紫染色法测定肠球菌的生物膜形成能力并进行形成能力的强弱分级,采用PCR方法筛查7种常见的肠球菌毒力基因以及Fsr群体感应系统基因(fsrA、fsrB、fsrC)。结果共收集了112株肠球菌菌株,其中粪肠球菌52株,屎肠球菌60株;两者生物膜形成的阳性率分别为63.46%和13.33%,差异具有统计学意义(P<0.001)。52株粪肠球菌毒力基因携带率分别为:esp 40.38%、gelE 69.23%、sprE 73.08%、asa157.69%、cylA 46.15%、cylB 48.08%、cylM 50.00%、fsrA 40.38%、fsrB 42.31%、fsrC 80.77%,携带esp、asa1、cylA、cylB、cylM和fsrB基因的菌株更易形成生物膜。60株屎肠球菌毒力基因携带率分别为:esp 65.00%、gelE 10.00%。结论粪肠球菌比屎肠球菌更容易形成生物膜;多种毒力基因与生物膜形成相关,提示生物膜的形成并不是由单一基因调控,而是由多个基因多系统调控。

关键词：肠球菌生物膜毒力基因

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CD137^(+)T细胞效应功能研究进展

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生命的化学 2023年第6期43卷 915-921页

作者：姬雪娇沈洪波王菲菲郑碧英广东医科大学检验医学研究所临床免疫学研究室东莞523808 同济大学附属上海市肺科医院结核病临床研究中心上海200433 复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系、教育部、卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032

CD137^(+)(又称4-1BB、TNFRSF9)T细胞亚群是一类抗原特异性活化的效应细胞。CD137^(+)T细胞产生细胞毒效应因子以及在抗原刺激后进行增殖的能力较强,使其在多种疾病中发挥免疫调节作用,其中CD137^(+)调节性T细胞分泌的分泌型CD137具有... 详细信息

CD137^(+)(又称4-1BB、TNFRSF9)T细胞亚群是一类抗原特异性活化的效应细胞。CD137^(+)T细胞产生细胞毒效应因子以及在抗原刺激后进行增殖的能力较强,使其在多种疾病中发挥免疫调节作用,其中CD137^(+)调节性T细胞分泌的分泌型CD137具有重要的免疫抑制作用。因此,全面了解CD137^(+)T细胞在疾病中的作用,对开发有效的疾病免疫防治策略至关重要。本文通过介绍CD137相关信号对T细胞尤其是CD8^(+)T细胞功能的调控机制、CD137^(+)T细胞的特征和效应功能、CD137^(+)T细胞在多种疾病进展中的免疫调控作用,为靶向CD137^(+)T细胞的免疫治疗提供参考。

关键词： CD137^(+)T细胞抗原特异性T细胞免疫微环境免疫治疗

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英国等地不明原因儿童肝炎的暴发情况及病因

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微生物与感染 2022年第3期17卷 184-187页

作者：谢幼华陈捷亮王勇翔袁正宏复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

2022年3月31日,苏格兰首先报告了5例患有不明原因重症肝炎的儿童。世界卫生组织(World Health Organization,WHO)于4月15日就不明原因儿童肝炎发布指导性意见,对确诊病例、可疑病例和流行病学相关病例进行了定义。截至4月21日,已有12个... 详细信息

2022年3月31日,苏格兰首先报告了5例患有不明原因重症肝炎的儿童。世界卫生组织(World Health Organization,WHO)于4月15日就不明原因儿童肝炎发布指导性意见,对确诊病例、可疑病例和流行病学相关病例进行了定义。截至4月21日,已有12个国家报告169例确诊病例,从1月龄至16岁不等。临床表现为急性肝炎,谷草转氨酶(aspartate aminotransferase,AST)或谷丙转氨酶(alanine aminotransferase,ALT)>500 IU/L,多数患儿有黄疸、恶心、腹痛、乏力、嗜睡和胃肠道症状,包括腹泻和呕吐,大多数患儿无发热。17例接受了肝移植,至少报告1例死亡。考虑到流行病学特点和患儿的临床特征,感染性因素导致该疾病的可能性更大。病例的实验室检查结果均排除了甲、乙、丙、丁和戊型肝炎,并提示腺病毒可能与不明原因儿童肝炎有关,但其他感染性因素或环境因素仍不能完全排除。本文对此次不明原因儿童肝炎的发展情况及其可能病因进行了介绍。该疾病存在输入性风险,我国应对此早做准备。

关键词：不明原因肝炎腺病毒严重急性呼吸综合征冠状病毒2 谷丙转氨酶

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射击/射箭运动员与普通人焦虑状态差异研究

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体育科研 2022年第2期43卷 98-104页

作者：魏玉环火少晔赵蕴华王利红薛琨陈姜枫苏健光马妮娜赵超邵春海复旦大学附属上海市第五人民医院临床营养科上海200240 复旦大学公共卫生学院营养与食品卫生教研室上海200032 复旦大学附属华山医院临床营养科上海200040 复旦大学基础医学院教育部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的:对射击/射箭运动员和普通人焦虑状态进行横断面调查,初步探索运动员焦虑的原因,为运动员减轻焦虑、提高竞技水平提供参考依据。方法:选择运动员和普通人各52名,进行问卷调查和人体测量。结果:运动员的蛋白质摄入量、便秘发生率和... 详细信息

目的:对射击/射箭运动员和普通人焦虑状态进行横断面调查,初步探索运动员焦虑的原因,为运动员减轻焦虑、提高竞技水平提供参考依据。方法:选择运动员和普通人各52名,进行问卷调查和人体测量。结果:运动员的蛋白质摄入量、便秘发生率和焦虑水平均高于普通人,膳食纤维摄入量低于普通人(P<0.05);对运动员的焦虑因素分析发现焦虑运动员吸烟和已戒烟的比例高于非焦虑运动员(P<0.05);对运动员及普通人建立多重线性回归模型进行多因素分析发现,女性、体重水平高和排便频率低,可预测较高的状态-特质焦虑问卷特质部分(State-Trait Anxiety Inventory-Trait version,STAI-T)评分(P<0.05)。结论:运动员和普通人焦虑的危险因素可能为女性、体重偏重和排便频率低,而高膳食纤维摄入则可能是焦虑的保护因素。建议:运动员增加膳食纤维的摄入,以改善便秘状况,戒烟,以改变不良生活方式,有助于运动员降低焦虑状态和提高竞技水平。

关键词：运动员焦虑广泛性焦虑障碍量表状态-特质焦虑问卷膳食纤维

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利用基因组和空间分析研究上海市结核病传播模式：一项为期10年的前瞻性全人群研究

利用基因组和空间分析研究上海市结核病传播模式：一项为期10年的...

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中国防痨协会2023年第34届全国学术大会暨结核病诊防治新技术推广应用论坛

作者：李蒙路丽苹江琦杨崇广郭晓芹沈鑫高谦复旦大学基础医学院教育部卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室上海市松江区疾病预防控制中心上海市疾病预防控制中心结核病实验室

【目的】流动人口给中国大城市的结核病防控带来巨大挑战。我们旨在通过长期的结核病基因组流行病学研究揭示城市地区结核病的特点和传播规律以及动态变化情况,为制定有效措施进一步降低大城市结核病负担提供理论依据。【方法】2011年1... 详细信息

【目的】流动人口给中国大城市的结核病防控带来巨大挑战。我们旨在通过长期的结核病基因组流行病学研究揭示城市地区结核病的特点和传播规律以及动态变化情况,为制定有效措施进一步降低大城市结核病负担提供理论依据。【方法】2011年1月1日至2020年12月31日,我们在上海市松江区开展了基于人群的前瞻性结核病基因组流行病学研究。对培养阳性的临床菌株进行全基因组测序。当菌株之间的SNP小于等于12,认为菌株基因组成簇,并利用logistic回归分析成簇的风险因素。利用phybreak推断每个基因簇内的传播关系。我们计算了患者之间成对的家庭住址之间的直线距离,并分析与对应患者菌株之间SNP距离的关系。绘制核密度图分析患者的空间分布热点。【结果】研究期间松江共2299例培养阳性肺结核患者,排除菌株复苏失败和比对失败的患者后,有2212例患者及其菌株纳入本研究,其中74.7%(1652/2212)是流动人口。松江区整体成簇率为25.2%(558/2212)。我们以3年的患者为一个样本集,计算了每3年的成簇率,发现研究期间成簇率未发生显著改变。在流动人口患者中仅男性(aOR 1.59,95%CI 1.23-2.06)是成簇的高危人群,而在常住人口患者中年轻人(<25岁:aOR 2.63,95%CI1.11-6.27;25-44岁:aOR 2.40,95%CI 1.23-4.69)和从事体力劳动者(aOR 2.94,95%CI 1.47-5.85)是成簇的高危人群。传播推断表明77.9%(212/272)的传播发生在常住人口患者或流动人口患者内部,仅22.1%(60/272)的传播发生在常住人口患者和流动人口患者之间;进一步分析发现常住人口更容易传播给流动人口:常住人口作为指示病例的76次传播事件中,29次(38.2%)传播给流动人口;流动人口作为指示病例的196次传播事件中,31次(15.5%)传播给常住人口(p<0.001)。空间分析发现,随着患者之间空间距离的增加,成簇风险迅速降低,但超过一半的传播事件发生在居住相聚5公里以上的患者之间。核密度图显示成簇患者与不成簇患者的空间热点基本一致,集中在松江区中部和东部,而且研究期间空间分布没有显著改变。【结论】近期传播是松江区结核病的一个重要来源。随着患者居住空间距离的增加,近期传播的风险迅速降低。近十年,松江区成簇率和患者空间分布均未发生显著变化。目前,上海市结核病防控工作遭遇瓶颈,现行的防控策略可能很难使上海的结核病负担进一步下降。因此,迫切需要新的策略,加强患者发现,阻断结核病的传播,达到降低疫情的目的。

关键词：结核病传播全基因组测序流动人口空间分析

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类器官组织在感染性疾病研究中的应用

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微生物与感染 2021年第3期16卷 196-207页

作者：张舒心蔡启良朱彩霞复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系医学分子病毒学教育部/卫健委/医科院重点实验室上海200032

类器官(organoid)是体外3D培养组织干细胞所形成的多功能细胞团,具有自身增殖和多向分化的能力,在空间和结构上与来源器官组织的基因、结构和功能相似,可用于模拟体内组织细胞生长、分化及器官形成过程,在药物筛选与评价、生物医学材料... 详细信息

类器官(organoid)是体外3D培养组织干细胞所形成的多功能细胞团,具有自身增殖和多向分化的能力,在空间和结构上与来源器官组织的基因、结构和功能相似,可用于模拟体内组织细胞生长、分化及器官形成过程,在药物筛选与评价、生物医学材料及组织工程等方面具有重要的应用潜能。当前在感染性疾病研究方面,越来越多数据表明不同类器官组织可用于在体外模拟病原入侵和引发疾病过程。鉴于此,本文对类器官组织在病原感染相关疾病模型上的研究进展及其应用前景进行综述。

关键词：类器官感染性疾病疾病模型应用

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布鲁氏菌及其疫苗的相关研究

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中国比较医学杂志 2020年第2期30卷 114-120页

作者：韩文东瞿涤上海复旦大学三级生物安全防护实验室上海200032 复旦大学基础医学院教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室上海200032

布鲁氏菌病是全球常见的危害人类与动物的主要的人畜共患病。目前,我国人群新发布病呈上升趋势,且尚无针对人类布病的有效疫苗。布鲁氏菌感染宿主后,可通过调节自身基因的表达调控适应宿主巨噬细胞内环境,保证其静息存活然后大量复制,... 详细信息

布鲁氏菌病是全球常见的危害人类与动物的主要的人畜共患病。目前,我国人群新发布病呈上升趋势,且尚无针对人类布病的有效疫苗。布鲁氏菌感染宿主后,可通过调节自身基因的表达调控适应宿主巨噬细胞内环境,保证其静息存活然后大量复制,从而阻碍了布病的有效药物治疗。本综述重点介绍了布鲁氏菌生物种及其宿主范围、动物感染模型及疫苗研究等问题,分析了布鲁氏菌宿主胞内存活的机制,为布病防控提出了下一步研究的建议。

关键词：布鲁氏菌胞内存活动物模型疫苗

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基于TaqMan探针多重实时荧光PCR的肠道特殊菌群绝对定量方法的建立

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微生物与感染 2022年第3期17卷 129-138页

作者：王虹施美芳杨浩邬永琳肖振明谯鹏屈一帆荣星喻赵超复旦大学基础医学院教育部医学分子病毒学重点实验室上海200032 上海市宝山区友谊社区街道卫生服务中心检验科上海201999 国家老年疾病临床医学研究中心(复旦大学附属华山医院) 上海200040

本研究旨在建立对肠道主要共生菌的快速定量方法。根据细菌16S rRNA基因的保守序列并参考相关研究,设计针对总肠道菌群的通用引物和探针,以及针对双歧杆菌属、肠球菌属和肠杆菌科的特异性引物和探针,采用引物设计工具(Primer-BLAST)以... 详细信息

本研究旨在建立对肠道主要共生菌的快速定量方法。根据细菌16S rRNA基因的保守序列并参考相关研究,设计针对总肠道菌群的通用引物和探针,以及针对双歧杆菌属、肠球菌属和肠杆菌科的特异性引物和探针,采用引物设计工具(Primer-BLAST)以及聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增以验证引物和探针的特异性。通过分子克隆技术,构建各目标菌属目的基因的重组质粒作为qPCR检测的标准模板,选择标准模板进行重复性实验,并计算组内和组间重复变异系数。用所建立的方法对不同年龄段的临床粪便标本进行3类细菌的检测,并初步分析这些菌群与增龄的关系。结果显示,引物和探针具有较高的特异性;各目的细菌标准曲线在一定范围内线性关系良好,总菌群或各目标菌属的线性范围分别为:总菌群2.9×103~2.9×10^(12)copies/μL、双歧杆菌3.1×10^(2)~3.1×10^(9)copies/μL、肠球菌5.9×10^(2)~5.9×10^(9)copies/μL、肠杆菌6.3×10^(2)~6.3×10^(9)copies/μL,决定系数R2≥0.995;检测的最低拷贝数为总菌群7.5×10^(2)copies/μL、双歧杆菌46 copies/μL、肠球菌37 copies/μL、肠杆菌51 copies/μL;重复性实验变异系数在1.32%以下,具有良好的可重复性。对不同年龄段临床粪便标本检测的结果显示,肠球菌和肠杆菌含量随增龄呈增长趋势,且老年组含量显著高于青年组,但在高龄老年人中未发现肠球菌数量增加。双歧杆菌含量随增龄减少,且各组间差异显著,在高龄老年人中也未观察到双歧杆菌显著减少。结果提示,本研究建立了一种可供临床推广的菌群绝对定量方法,能够同时检测3类细菌和菌群总量,对于菌群定量研究具有实际意义。

关键词：肠道菌群绝对定量 TaqMan探针多重实时定量PCR 肠杆菌科

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绿色荧光蛋白分裂肽基因重组乙型肝炎病毒复制子模型的建立

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微生物与感染 2021年第2期16卷 79-87页

作者：田青右朱园飞常豪于琳邓强复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系教育部/卫健委/医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032

为构建一种重组乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)复制子模型,使其能够在病毒感染的细胞中表达可视化报告基因蛋白,本研究删除HBV基因组核心蛋白(HBV core,HBc)编码区部分序列,构建HBV1.1-ΔHBc113复制子载体。利用内含肽(intein)介... 详细信息

为构建一种重组乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)复制子模型,使其能够在病毒感染的细胞中表达可视化报告基因蛋白,本研究删除HBV基因组核心蛋白(HBV core,HBc)编码区部分序列,构建HBV1.1-ΔHBc113复制子载体。利用内含肽(intein)介导蛋白拼接的特性,选取加强绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)和超级折叠绿色荧光蛋白(super folder green fluorescent protein,sfGFP)作为外显肽,建立EGFP^(N1-8)/EGFP^(C9-11)和sfGFP^(N1-10)/sfGFP^(C11)蛋白分裂系统。基于ΔHBc113载体,分别构建EGFP^(C9-11)和sfGFP^(C11)重组HBV复制子;应用DNA印迹法(Southern blotting)验证两种rHBV载体的细胞内复制能力。结果显示,构建的HBV1.1-ΔHBc113复制子载体能够在HBc反式互补条件下在转染细胞中形成病毒复制。构建的EGFP^(C9-11)和sfGFP^(C11)重组HBV复制子能够支持HBc互补条件下的细胞内病毒复制,并产生子代病毒颗粒;HBV重组复制子表达的EGFP^(C9-11)或sfGFP^(C11)蛋白在共表达氮端蛋白EGFP^(N)/sfGFP^(N)细胞中,通过intein介导的蛋白质高效拼接,能够形成完整的、有功能的GFP。结果表明,构建的荧光蛋白重组HBV复制子系统能够为HBV高通量药物筛选和HBV易感性研究提供实验工具,具有重要的病毒学意义和应用前景。

关键词：乙型肝炎病毒复制子内含肽绿色荧光蛋白分裂肽

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影像导航技术在鼻内镜手术中的应用

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河南大学学报（医学版） 2022年第1期41卷 1-7页

作者：胡贤洋田腾飞张雪琰复旦大学上海医学院基础医学院医学微生物与寄生虫学教研室暨医学分子病毒学教育部/国家卫生健康委/中国医学科学院重点实验室上海200030 复旦大学附属华东医院耳鼻咽喉头颈外科上海200040 复旦大学附属眼耳鼻喉科医院耳鼻喉科头颈外科上海200030

随着鼻内镜手术的使用范围不断扩大,手术的适应证不断增加,所牵涉的重要结构越来越多,随之而来的是并发症的风险越来越高。影像导航系统作为一种手术辅助系统,能够帮助术者在术中追踪和判断重要结构,节省手术时间,降低手术风险,已经在... 详细信息

随着鼻内镜手术的使用范围不断扩大,手术的适应证不断增加,所牵涉的重要结构越来越多,随之而来的是并发症的风险越来越高。影像导航系统作为一种手术辅助系统,能够帮助术者在术中追踪和判断重要结构,节省手术时间,降低手术风险,已经在鼻窦和颅底的鼻内镜手术中得到广发的应用。同时,当前影像导航系统仍存在许多亟待解决的问题。希望在各方的共同努力下,影像导航系统会变得越来越成熟,在鼻内镜手术中发挥越来越重要的作用。

关键词：影像导航系统(IGS) 鼻内镜外科手术

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