检索结果-内蒙古大学图书馆

县级实验室结核病检测方法的诊断效果分析:一项基于真实世界数据的回顾性研究

中国防痨杂志 2025年第2期47卷 181-188页

作者：邱勇权卓屈榕田发君李蒙王更生王娅郭明成高谦四川省广安市武胜县疾病预防控制中心结核病防治科广安638401 复旦大学上海市重大传染病和生物安全研究院基础医学院教育部、卫健委、医科院医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的:利用县级实验室常规结核病检测数据,评估固体培养、GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)和GeneXpert MTB/RIF Ultra(简称“Xpert Ultra”)在基层定点医疗机构诊断结核病患者的实际效果。方法:纳入2018年7月至2024年1月期间,就诊于武... 详细信息

目的:利用县级实验室常规结核病检测数据,评估固体培养、GeneXpert MTB/RIF(简称“Xpert”)和GeneXpert MTB/RIF Ultra(简称“Xpert Ultra”)在基层定点医疗机构诊断结核病患者的实际效果。方法:纳入2018年7月至2024年1月期间,就诊于武胜县疾病预防控制中心结核病防治门诊的疑似肺结核患者及其首诊痰标本。就诊患者被要求采集3份痰标本开展涂片、培养和分子生物学检测,用于结核病诊断。以液体培养结果为标准,计算固体培养、Xpert和Xpert Ultra诊断结核病的敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值;同时基于涂片结果进行亚组分析,计算3种检测方法分别诊断涂阳和涂阴患者的敏感度。结果:共2769例疑似肺结核患者纳入研究,其中24.56%(680/2769)为女性。涂片、固体培养、液体培养、Xpert和Xpert Ultra的阳性率分别为10.36%(286/2761)、23.66%(362/1530)、29.31%(730/2491)、28.06%(275/980)和35.33%(254/719)。以液体培养结果为标准,固体培养、Xpert和Xpert Ultra的敏感度分别为84.55%(80.53%~88.03%)、91.19%(86.72%~94.54%)和96.20%(92.32%~98.46%),特异度分别为99.00%(98.17%~99.52%)、92.62%(90.27%~94.54%)和86.65%(83.05%~89.73%)。在涂阴但液体培养阳性的患者中,固体培养、Xpert和Xpert Ultra的敏感度分别为76.08%(69.71%~81.69%)、83.74%(76.01%~89.78%)和94.17%(88.35%~97.62%)。Xpert或Xpert Ultra阳性但培养阴性的患者中,49.51%(51/103)的患者就诊前2周内服用过抗结核药物或有结核病病史。Xpert Ultra检测为痕量(Trace)的患者中,74.19%(23/31)可判断为活动性结核病。结论:液体培养和分子诊断工具在真实基层结核病诊断中具有较高敏感度,特别是Xpert Ultra,可以有效实现对当地低菌量患者的快速诊断。加快液体培养和Xpert Ultra在基层实验室的普及可以显著提升患者检出率,并有助于实现结核病的早期诊断和治疗。

关键词：结核实验室诊断敏感性与特异性回顾性研究

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细胞外囊泡在呼吸系统感染性疾病中的作用

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生命的化学 2025年第2期45卷 191-198页

作者：徐巍周珈羽杨敏巫媛李一秋程训佳王菲菲复旦大学上海医学院基础医学院病原生物学系教育部/卫健委/中国医学科学院医学分子病毒学重点实验室上海200032 上海市重大传染病和生物安全研究院上海200032

细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)作为膜包被的特殊颗粒,广泛存在于多种体液中,具有多重效应功能。呼吸系统发生感染性疾病时,感染部位产生的EVs既包含了宿主细胞的成分,如蛋白质、核酸、脂质等,也包含了病原体的组分,因此在组... 详细信息

细胞外囊泡(extracellular vesicles,EVs)作为膜包被的特殊颗粒,广泛存在于多种体液中,具有多重效应功能。呼吸系统发生感染性疾病时,感染部位产生的EVs既包含了宿主细胞的成分,如蛋白质、核酸、脂质等,也包含了病原体的组分,因此在组成和功能上具有明显的异质性。同时,EVs具有较好的结构稳定性、良好的生物相容性以及自然的转运能力,作为呼吸系统感染性疾病的新型免疫辅助治疗载体,也备受关注。本文主要综述了EVs在呼吸系统细菌性感染和病毒性感染中的作用机制,以期为利用EVs诊断、治疗呼吸系统感染性疾病提供思路。

关键词：细胞外囊泡呼吸系统感染肺炎结核分枝杆菌 COVID-19

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基因芯片分析干扰素对乙型肝炎病毒转染细胞基因表达的影响(英文)

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Acta Biochimica et Biophysica Sinica 2003年第12期35卷 1053-1060页

作者：熊炜王迅刘晓颖项黎郑玲洁刘江霞袁正宏复旦大学上海医学院教育部医学分子病毒学重点实验室复旦大学上海医学院教育部医学分子病毒学重点实验室上海200032

乙型肝炎病毒 (HepatitisBvirus ,HBV)的持续性感染是影响人类健康的重大问题 ,而α 干扰素 (IFN α)和γ 干扰素(IFN γ)分别具有抗HBV的作用。为了研究HBV持续存在对IFN效应基因表达的影响 ,将HepG2细胞和来源于HepG2细胞并整合有HBV... 详细信息

乙型肝炎病毒 (HepatitisBvirus ,HBV)的持续性感染是影响人类健康的重大问题 ,而α 干扰素 (IFN α)和γ 干扰素(IFN γ)分别具有抗HBV的作用。为了研究HBV持续存在对IFN效应基因表达的影响 ,将HepG2细胞和来源于HepG2细胞并整合有HBV基因组的HepG2 .2 .15细胞经IFN α或IFN γ处理 6h后 ,用含 14 112个靶基因的人cDNA基因芯片检测了各组基因表达谱的差异。结果证实 ,许多与细胞周期、增殖、凋亡相关的基因及部分EST和功能未知基因受IFN调节 ;IFN诱导后 ,一些与激酶和信号转导、转录调节、抗原递呈和处理相关的基因在两株细胞间表达存在差异 ,提示HBV影响IFN诱导的细胞基因的表达。进一步挑选部分显著差异表达的基因 ,研究其对HBV复制的影响 ,结果发现在两个细胞株中IFN诱导后基因表达差异的双遍在蛋白 (Diubiquitin)和髓样细胞分化蛋白 (MyD88)均可显著降低HBV抗原表达 ,并证实MyD88能抑制HBV复制。这有助于揭示IFN抗病毒效应及HBV持续性感染机制 ,为分子水平寻找新型抗HBV药物的靶点打下基础。

关键词：基因芯片乙型肝炎病毒干扰素细胞基因表达谱

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应用iTRAQ定量蛋白质组学研究海分枝杆菌mkl的基因功能

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微生物学报 2016年第9期56卷 1496-1503页

作者：施旭骏赵超牛辰高谦复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴... 详细信息

【目的】通过分离海分枝杆菌野生株和mkl突变株的全菌蛋白,并进行差异蛋白质组分析,以期为探索分枝杆菌重要毒力基因mkl的功能提供新思路。【方法】以海分枝杆菌野生株和mkl突变株为研究材料,提取全菌蛋白,i TRAQ试剂标记后进行质谱鉴定和定量分析,并利用Uni Prot数据库对差异蛋白进行生物信息学分析。【结果】共鉴定出在野生株和mkl突变株中差异表达蛋白566个,其中在突变株中上调表达蛋白232个(比值≥1.4),下调表达蛋白334个(比值≤0.7)。生物信息学预测这些蛋白主要参与细菌脂质代谢、细胞壁和细胞进程、中间代谢、呼吸作用等生物学功能。其中Des A3下调最显著,其功能为脂肪酸去饱和酶,与油酸合成相关,进一步验证发现mkl突变株在不含油酸的固体培养基中生长受限,提示mkl可能在油酸的生物合成通路中发挥功能。【结论】通过i TRAQ分析了海分枝杆菌mkl突变株和野生株的差异表达蛋白谱,发现可能影响分枝杆菌油酸、脂质等合成代谢通路,为进一步研究mkl基因在分枝杆菌致病中发挥作用的相关机制奠定了基础。

关键词：分枝杆菌定量蛋白质组学 iTRAQ mkl基因

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海分枝杆菌ppk基因的生物学功能研究

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复旦学报（医学版） 2016年第6期43卷 649-656页

作者：祝琳施旭骏高谦复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032

目的构建海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)ppk基因敲除株,对其生物学功能进行研究。方法利用基因同源重组技术,构建了海分枝杆菌ppk基因敲除株;使用DAPI染色法检测细菌胞内多聚无机磷酸盐(poly inorganic phosphate,poly-Pi)浓度;比... 详细信息

目的构建海分枝杆菌(Mycobacterium marinum)ppk基因敲除株,对其生物学功能进行研究。方法利用基因同源重组技术,构建了海分枝杆菌ppk基因敲除株;使用DAPI染色法检测细菌胞内多聚无机磷酸盐(poly inorganic phosphate,poly-Pi)浓度;比较野生株及突变株在不同环境压力下的生存能力;用野生株和突变株分别感染斑马鱼成鱼,通过观察斑马鱼的存活情况,研究ppk基因对海分枝杆菌毒力的影响。将野生株和突变株分别感染小鼠来源的巨噬细胞系RAW267.4,检测其在巨噬细胞内的增殖。结果 ppk突变株胞内polyPi浓度明显下降;在斑马鱼成鱼感染模型中出现显著减毒表型;其在小鼠来源的巨噬细胞感染模型中的增殖较野生型菌株明显减弱;在营养缺陷、抗生素(利福平、左氧氟沙星)等环境压力下,其生存能力下降。结论 ppk基因影响分枝杆菌在环境压力下的生存,并且在其致病中发挥重要作用。

关键词：分枝杆菌多聚磷酸盐激酶多聚无机磷酸盐

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高内涵筛选结合活细胞实时成像技术分析谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡

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复旦学报（医学版） 2015年第4期42卷 538-542页

作者：乔可崔士超胡捷先陈献华复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部/卫生部重点实验室上海200032 复旦大学基础医学院医学分子病毒学教育部医学神经生物学国家重点实验室上海200032

目的利用高内涵筛选(high-content screening,HCS)技术结合活细胞实时成像技术研究谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡的形态学变化特征。方法用HCS技术分析摸索不同浓度谷氨酸诱导的N2a细胞早期凋亡百分比的变化,同时结合活细胞实时... 详细信息

目的利用高内涵筛选(high-content screening,HCS)技术结合活细胞实时成像技术研究谷氨酸诱导的小鼠神经瘤母细胞N2a凋亡的形态学变化特征。方法用HCS技术分析摸索不同浓度谷氨酸诱导的N2a细胞早期凋亡百分比的变化,同时结合活细胞实时成像技术追踪谷氨酸诱导的N2a凋亡的形态学变化特征。结果当谷氨酸浓度为750μg/mL时,发生早期凋亡的N2a细胞比例达到峰值(42.07%)。对同一谷氨酸浓度,随着拍摄追踪时间的增加,凋亡细胞数目逐渐增多,胞核荧光强度的变异系数逐渐增大,胞核面积逐渐缩小,胞核逐渐出现碎片化。结论使用HCS结合活细胞实时成像技术能直观清晰地捕捉谷氨酸诱导N2a细胞凋亡的形态学变化特征,是一种体外追踪单一细胞凋亡形态学变化的可靠方法。该方法也可应用于药物对细胞凋亡的促进或抑制作用的形态学变化特征的研究。

关键词：谷氨酸神经瘤母细胞N2a 高内涵筛选变异系数

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“御敌于国门之外”——病毒入侵抑制剂的研究进展

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复旦学报(医学版) 2017年第6期44卷 773-785页

作者：姜世勃苏珊夏帅邹鹏陆路复旦大学基础医学院病原生物系复旦大学医学分子病毒学教育部/卫计委重点实验室

25年前,我们在国际上开辟了研发人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)融合/入侵抑制剂和抗HIV多肽药物的全新领域。近6年来,我们在HIV、中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)、埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)和寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)入侵抑制剂的研发工作中取得了一系列重要研究成果。本文概要性地综述了相关高致病性病毒入侵抑制剂的研究进展。

关键词：高致病性病毒病毒入侵抑制剂病毒灭活剂

来源：评论

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干扰素和核苷(酸)类似物治疗对HBV cccDNA的影响与慢性乙型肝炎的功能性治愈

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临床肝胆病杂志 2019年第6期35卷 1181-1187页

作者：陈捷亮袁正宏复旦大学上海医学院基础医学院教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室

目前临床治疗慢性乙型肝炎的药物主要包括干扰素和核苷(酸)类似物两大类,但均无法有效清除病毒和治愈乙型肝炎。HBV共价闭合环状DNA(cccDNA)作为HBV转录复制的模板,以微小染色体形式持续存在于细胞核内,被认为是HBV慢性感染和难以治愈... 详细信息

目前临床治疗慢性乙型肝炎的药物主要包括干扰素和核苷(酸)类似物两大类,但均无法有效清除病毒和治愈乙型肝炎。HBV共价闭合环状DNA(cccDNA)作为HBV转录复制的模板,以微小染色体形式持续存在于细胞核内,被认为是HBV慢性感染和难以治愈的关键核心。鉴于cccDNA很难被彻底清除,近年来以cccDNA持续沉默为基础的慢性乙型肝炎功能性治愈已成为临床和基础研究的主要目标。从现有治疗手段对cccDNA的影响切入,介绍当前对cccDNA含量和活性受控因素的认知,探讨cccDNA池难以清除的关键特性环节,在此基础上展望功能性治愈慢性乙型肝炎目标下研究cccDNA的重点。

关键词：乙型肝炎病毒抗病毒药共价闭合环状DNA

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分枝杆菌glpX基因的功能

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微生物学报 2014年第3期54卷 285-291页

作者：王歆玮任道元高谦牛辰复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

【目的】构建耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)glpX基因敲除株,研究其在生理代谢中的功能。【方法】利用分枝杆菌噬菌体Che9c重组系统构建耻垢分枝杆菌glpX基因敲除株;比较野生株及突变株在不同碳源培养条件下的生长差异;通过荧... 详细信息

【目的】构建耻垢分枝杆菌(Mycobacterium smegmatis)glpX基因敲除株,研究其在生理代谢中的功能。【方法】利用分枝杆菌噬菌体Che9c重组系统构建耻垢分枝杆菌glpX基因敲除株;比较野生株及突变株在不同碳源培养条件下的生长差异;通过荧光实时定量PCR,比较野生株在以葡萄糖或油酸为唯一碳源培养下,glpX基因的表达水平。【结果】glpX突变株在以甘油或油酸为唯一碳源的培养基中无法生长;野生株在以油酸为唯一碳源培养下,glpX基因表达上调。【结论】glpX基因编码了分枝杆菌糖异生途径必需的和非冗余的果糖1,6-二磷酸酶(fructose 1,6-bisphosphatase,FBPase)。

关键词：分枝杆菌基因glpX 果糖1 6-二磷酸酶碳源代谢糖异生

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结核分枝杆菌利福平耐药菌株补偿性突变的系统性鉴定

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中华结核和呼吸杂志 2018年第3期41卷 207-212页

作者：左天宇柳清云甘明宇高谦复旦大学基础医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室上海200032

目的系统性鉴定MTB利福平耐药菌株rpoA、rpoB及rpoC基因补偿性突变的类型，评估不同rpoB基因耐药突变类型及MTB遗传背景对补偿性突变发生的影响。方法搜索并下载已发表的MTB全基因组测序数据，根据已知的利福平耐药突变从中鉴定出利福... 详细信息

目的系统性鉴定MTB利福平耐药菌株rpoA、rpoB及rpoC基因补偿性突变的类型，评估不同rpoB基因耐药突变类型及MTB遗传背景对补偿性突变发生的影响。方法搜索并下载已发表的MTB全基因组测序数据，根据已知的利福平耐药突变从中鉴定出利福平耐药的MTB株，构建系统发育树并利用平行进化的筛选标准鉴定出可能的补偿性突变；统计不同rpoB基因耐药突变类型和不同型的利福平耐药菌株携带补偿性突变的比例，利用卡方检验进行统计学分析。结果从欧洲核酸序列数据库共获得全球8 453株MTB全基因组测序数据（覆盖12个国家），其中1 749株为利福平耐药菌株。通过系统发育分析共鉴定出60种补偿性突变类型（rpoA基因上的突变6种，rpoB基因上的突变16种，rpoC基因上的突变38种）；携带rpoB S450L突变的利福平耐药菌株（41.7%，279/669）比其他利福平耐药突变积累补偿性突变的比例更高[8.0%（31/388），χ2＝378.5，P〈0.000 1]；2型的利福平耐药菌株（34.0%）比其他型的菌株积累补偿性突变的比例更高[1型：4.7%（2/43），3型：12.5%（4/32），4型：15.1%（78/517）；χ2＝238.5，P〈0.000 1]。结论本研究系统性鉴定了MTB利福平耐药相关的补偿性突变类型，并发现携带rpoB基因S450L突变或属于2型的利福平耐药菌株更容易积累补偿性突变。

关键词：分枝杆菌结核抗药性利福平突变

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