检索结果-内蒙古大学图书馆

遗传 2014年第9期36卷 864-870页

作者：吕垣澄吴晓晖复旦大学生命科学学院、遗传工程国家重点实验室及发育与疾病国际联合研究中心、遗传与发育协同创新中心上海200433

动物隐花色素(Cryptochrome)分为I型和II型,对生物钟的调控作用广为人知。I型隐花色素可以感受光信号而介导转录抑制物降解,II型隐花色素不需感受光而直接充当转录抑制物。近期研究发现,动物隐花色素还参与免疫应答和糖代谢,并为果蝇等... 详细信息

动物隐花色素(Cryptochrome)分为I型和II型,对生物钟的调控作用广为人知。I型隐花色素可以感受光信号而介导转录抑制物降解,II型隐花色素不需感受光而直接充当转录抑制物。近期研究发现,动物隐花色素还参与免疫应答和糖代谢,并为果蝇等动物光信号诱导的化学磁感知所必需。对动物隐花色素的进一步研究将增加对动物感知磁场过程的了解,也将帮助开发针对糖尿病等疾病的干预方法。文章重点综述了动物隐花色素的克隆与表达、结构特征、生理功能及作用机制,为这一领域的研究提供参考。

关键词：动物隐花色素生物钟化学磁感知

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使用差异定位SunTag组件实现对细胞质内高含量蛋白的活细胞观察（英文）

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复旦学报（自然科学版） 2017年第5期56卷 594-601页

作者：姚龙芳周黎王洁蔡亮复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室遗传与发育协同创新中心上海200438

生物过程由数百万个蛋白质驱动.蛋白质结构和蛋白质定位是蛋白质行使功能的关键.在过去的研究中,快速发展的荧光显微镜成像技术使研究人员可以直接观察蛋白质在活细胞内的定位.然而,对细胞质内高含量蛋白的活细胞观察仍然存在技术障碍.... 详细信息

生物过程由数百万个蛋白质驱动.蛋白质结构和蛋白质定位是蛋白质行使功能的关键.在过去的研究中,快速发展的荧光显微镜成像技术使研究人员可以直接观察蛋白质在活细胞内的定位.然而,对细胞质内高含量蛋白的活细胞观察仍然存在技术障碍.我们通过改进SunT ag标记技术,使用差异定位的SunT ag组件:一方面,在研究目的蛋白(POI)上标记多个V4抗原;另一方面,将识别V4抗原的抗体GCN4融合的绿色荧光蛋白(GCN4-GFP)通过差异定位后限制其与抗原的结合量.我们的方法大大降低了背景荧光信号,实现了对dynamin膜上功能单位的直接可视化.

关键词：活细胞观察荧光细胞生物学过程

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细胞纤毛在信号转导与器官发育中的作用与机制

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中国科学：生命科学 2016年第4期46卷 354-362页

作者：孙建建武子涵钟涛复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室遗传与发育协同创新中心上海200438

纤毛(cilia)是细胞表面的突起状细胞器,几乎存在于所有细胞表面,且广泛分布于组织和器官的上皮.纤毛由外部的纤毛膜和内部的轴丝组成,结构在进化上十分保守.根据微管组成和排列方式的不同,纤毛可分为9+2型运动纤毛与9+0型基本纤毛或非... 详细信息

纤毛(cilia)是细胞表面的突起状细胞器,几乎存在于所有细胞表面,且广泛分布于组织和器官的上皮.纤毛由外部的纤毛膜和内部的轴丝组成,结构在进化上十分保守.根据微管组成和排列方式的不同,纤毛可分为9+2型运动纤毛与9+0型基本纤毛或非运动纤毛.作为一种特殊的感受器,纤毛通过影响细胞信号通路参与胚胎形成、心脏等内脏器官发育及人体重要生理活动.本课题组在国际上首次把前列腺素信号通路与纤毛生长及心脏发育相联系.研究发现,ABCC4/LKT前列腺素转运蛋白从细胞内运输前列腺素E2(PGE2)至细胞外,并通过结合位于纤毛膜上的G蛋白偶联受体EP4影响细胞内c AMP浓度,调节纤毛内运输蛋白的正向速率,进而调控纤毛生长与心脏等器官的左右不对称性发育.纤毛生长或功能缺陷会引发先天性心脏病、多囊肾、视网膜变性等多种疾病.本文主要介绍纤毛参与调控细胞内信号转导与器官发育及相关纤毛疾病.

关键词：纤毛信号转导心脏器官发育 PGE2 纤毛疾病

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代谢物感知失调的分子致病机理

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中国科学：生命科学 2016年第4期46卷 392-396页

作者：赵健元赵世民复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室遗传与发育协同创新中心上海200438

代谢是最基础的生命活动.生物代谢网络由代谢酶和代谢物共同构成.相对于对代谢酶性质的深刻认识,对代谢物生理重要性的认识停留在物质代谢与能量代谢的水平.近年来,本研究组及国际上其他实验室的工作发现,代谢物具有信号传导功能.细胞... 详细信息

代谢是最基础的生命活动.生物代谢网络由代谢酶和代谢物共同构成.相对于对代谢酶性质的深刻认识,对代谢物生理重要性的认识停留在物质代谢与能量代谢的水平.近年来,本研究组及国际上其他实验室的工作发现,代谢物具有信号传导功能.细胞内的代谢物水平通过不同的机制被感知,其信号通过不同的化学基础在蛋白质间相互传递并调控包括代谢、表观遗传和信号通路等重要生理过程.代谢物的失调也因此通过这些生理改变而导致人类疾病.本文对本研究组近年来在该领域的相关进展进行综述并讨论其理论及转化价值.

关键词：代谢物感知中间代谢物信号通路

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保留型与反转型β-木糖苷酶活性位点的分子动力学模拟

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物理化学学报 2015年第6期31卷 1169-1178页

作者：张俊威周峻岗吕红黄强复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室上海工业菌株工程技术研究中心上海200433 上海生物制造技术协同创新中心上海200237

木聚糖是潜在的重要可再生能源,如何提高其降解效率已成为近年来的研究热点.β-木糖苷酶是木聚糖降解过程中的关键酶之一,按其水解机制可分为保留型与反转型酶.目前虽然对于这两种催化机制的研究不断深入,但很少有工作从溶液环境的角度... 详细信息

木聚糖是潜在的重要可再生能源,如何提高其降解效率已成为近年来的研究热点.β-木糖苷酶是木聚糖降解过程中的关键酶之一,按其水解机制可分为保留型与反转型酶.目前虽然对于这两种催化机制的研究不断深入,但很少有工作从溶液环境的角度出发探究它们的差异.本文采用分子动力学模拟方法,对4个典型的β-木糖苷酶进行了显式溶剂模拟研究,详细分析了酶的催化氨基酸间的距离和质子供体氨基酸p Ka值的动态变化.结果显示,反转型酶催化氨基酸间的距离约为0.8-1.0 nm,大于保留型的0.5-0.6 nm,与先前对糖苷酶晶体结构的统计分析结果一致.令人意外的是,保留型酶的质子供体通过与其附近组氨酸的相互作用,其p Ka在两个不同的高、低值之间交替变换,使保留型酶的双取代反应得以发生;而反转型酶的质子供体则由附近的天冬氨酸调节,其p Ka稳定在某个较高值,这可能有利于其在反应p H值下获得水溶液中的氢离子,进行反转型酶特有的单取代反应.因此,本工作加深了人们对β-木糖苷酶保留型与反转型水解机制的认识,并为后续酶的理性改造与高效利用提供具有指导价值的结构与机理信息.

关键词： β-木糖苷酶催化机制分子建模质子供体 p Ka值

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A型流感病毒基质蛋白M1的二聚化机制

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复旦学报（自然科学版） 2016年第3期55卷 388-395页

作者：张一堪曹密刘建平黄强复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室上海200438 国家蛋白质科学中心(上海) 上海201203 上海生物制造技术协同创新中心上海200237

流感病毒基质蛋白1(matrix protein 1,M1)位于病毒包膜之下,形成一层壳状结构(衣壳),可与病毒的血凝素、神经氨酸酶、包膜和病毒遗传物质发生相互作用,在病毒的组装与复制过程中起着关键作用.不过,除N端有晶体结构外,全长M1蛋白的结构... 详细信息

流感病毒基质蛋白1(matrix protein 1,M1)位于病毒包膜之下,形成一层壳状结构(衣壳),可与病毒的血凝素、神经氨酸酶、包膜和病毒遗传物质发生相互作用,在病毒的组装与复制过程中起着关键作用.不过,除N端有晶体结构外,全长M1蛋白的结构尚未解析.因此,人们对全长M1蛋白如何二聚化、然后多聚化形成病毒衣壳的过程知之甚少.为了解M1蛋白的二聚化机制,首先从M1的N端片段晶体结构出发,用蛋白质结构预测方法获得M1的全长结构模型;其次,对可能的M1二聚体进行分子动力学模拟,分析其二聚化界面的氨基酸,由此发现了一种通过M1蛋白C端片段结合而形成的二聚体;最后,为验证模拟结果,用电镜三维重构方法分析了全长M1二聚体的构象,并提出了M1多聚化的机理模型.

关键词： A型流感病毒基质蛋白M1 二聚化分子建模单颗粒三维重构

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吃掉自己：细胞自噬的历史与展望

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科学 2017年第1期69卷 12-14页

作者：刘晗戚昀林鑫华复旦大学生命科学学院遗传学研究所遗传工程国家重点实验室遗传与发育协同创新中心上海200438

2016年度的诺贝尔生理学或医学奖颁发给日本的分子生物学家大隅良典，以表彰他在“细胞自噬机制发现”方面做出的贡献。自噬参与生物体的众多生理机能，是细胞质量控制的重要组成部分，也是人类很多疾病发生发展的重要风险因子。

关键词：自噬诺贝尔生理学或医学奖大隅良典

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哺乳动物与肠道菌群的共代谢相互作用

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生命科学 2017年第7期29卷 687-694页

作者：唐惠儒王玉兰复旦大学附属中山医院及生命科学学院上海分子表型组国际研究中心遗传工程国家重点实验室遗传与发育协同创新中心中国科学院武汉物理与数学研究所中国科学院生物磁共振分析重点实验室波谱与原子分子物理国家重点实验室武汉磁共振中心浙江大学感染性疾病诊治协同创新中心

哺乳动物的消化道居住着数以万亿的,数千种共生微生物或者肠道菌群。肠道菌群与动物宿主通过共进化而共生并经过相互作用而影响其生理与病理生理过程。胆汁酸、胆碱、膳食纤维及芳香类代谢物等多种物质的共代谢是该相互作用的关键分子过... 详细信息

哺乳动物的消化道居住着数以万亿的,数千种共生微生物或者肠道菌群。肠道菌群与动物宿主通过共进化而共生并经过相互作用而影响其生理与病理生理过程。胆汁酸、胆碱、膳食纤维及芳香类代谢物等多种物质的共代谢是该相互作用的关键分子过程,肝肠循环是上述物质交换与调控相互作用的主要途径。肠道菌群组成与代谢组的关系及其功能的精确刻画是急需解决的科学问题。

关键词：肠道菌群哺乳动物肝肠循环共代谢组代谢组学

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水稻PBZ1基因启动子对烯丙异噻唑的诱导响应性分析

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南京农业大学学报 2015年第5期38卷 720-726页

作者：朱政王迟早高炯丁雨龙蒯本科南京林业大学南方现代林业协同创新中心江苏南京210037 南京林业大学生物与环境学院江苏南京210037 复旦大学生命科学学院/遗传工程国家重点实验室上海200438 南京林业大学竹类研究所江苏南京210037

[目的]依据水稻PBZ1基因对一种环境友好型化学诱导剂烯丙异噻唑(3-allyloxy-1,2-benzisothiazole-1,1-dioxide,PBZ)的高响应性,旨在分析该基因启动子作为一种新型化学诱导启动子的应用潜力。[方法]首先构建PBZ1启动子与GUS的融合报告载... 详细信息

[目的]依据水稻PBZ1基因对一种环境友好型化学诱导剂烯丙异噻唑(3-allyloxy-1,2-benzisothiazole-1,1-dioxide,PBZ)的高响应性,旨在分析该基因启动子作为一种新型化学诱导启动子的应用潜力。[方法]首先构建PBZ1启动子与GUS的融合报告载体PPBZ1-1942bp::GUS,分别采用烟草叶片瞬时表达及转基因水稻稳定表达系统,检测PBZ1启动子对PBZ的诱导响应性;并且利用水稻原生质体瞬时表达系统,进一步分析不同长度的PBZ1启动子片段的诱导响应性。[结果]无论是在瞬时还是稳定表达系统中检测,PBZ1启动子均可以有效响应PBZ的诱导。本研究还首次证明水稻PBZ1基因响应PBZ诱导很大程度上依赖于茉莉酸(JA)信号途径。因此,在水稻原生质体瞬时表达系统中,我们采用茉莉酸甲酯(Me JA)作为诱导剂,替代不适用于水稻原生质体体系的PBZ,有效地验证了1 053和608 bp长度的启动子片段具有更好的诱导响应性。[结论]水稻PBZ1启动子具备作为一种基于PBZ诱导系统的新型化学诱导启动子的潜力。

关键词：烯丙异噻唑 PBZ1 化学诱导剂化学诱导启动子

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泰兴市2000-2017年上消化系统肿瘤发病趋势分析

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中国预防医学杂志 2020年第4期21卷 361-364页

作者：蔡宁刘振球索晨袁子宇刘红建范敏俞顺章张铁军陈兴栋复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室上海200032 复旦大学生命科学学院遗传工程国家重点实验室、遗传与发育协同创新中心复旦大学泰州健康科学研究院泰兴市疾病预防控制中心复旦大学人类表型组研究院

目的分析江苏省泰兴市食管癌、胃癌和肝癌三种上消化道肿瘤发病的变化趋势,为预防与控制肿瘤提供理论依据。方法从2000-2017年泰兴市肿瘤登记数据中收集每年食管癌、胃癌和肝癌的新发病例数据,并收集泰兴市人口数据。采用世界标准人口... 详细信息

目的分析江苏省泰兴市食管癌、胃癌和肝癌三种上消化道肿瘤发病的变化趋势,为预防与控制肿瘤提供理论依据。方法从2000-2017年泰兴市肿瘤登记数据中收集每年食管癌、胃癌和肝癌的新发病例数据,并收集泰兴市人口数据。采用世界标准人口和中国标准人口分别计算世界人口标化发病率和中国人口标化发病率;计算发病率年估计变化百分率(estimated annual percent change,EAPC),评估泰兴市上消化道肿瘤发病趋势。结果2000-2017年泰兴市食管癌、胃癌和肝癌的年龄标准化发病率(世界人口标化发病率)分别从2000年的90.20/10万、50.85/10万、89.72/10万下降至2017年的36.90/10万、29.78/10万、30.03/10万;EAPC分别为-6.83(95%CI:-9.03^-4.58)、-5.13(95%CI:-8.30^-1.84)、-8.57(95%CI:-10.84^-6.25);2000-2004年发病趋势波动程度较大,2005-2014年波动平稳,2015-2017年缓慢上升。结论泰兴市2000-2017年食管癌、胃癌和肝癌发病趋势总体上呈现下降趋势,但是近年来发病率的缓慢上升值得后续进一步研究。

关键词：食管癌胃癌肝癌年估计变化百分率年龄标准化发病率

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